Entry information : NtPrx27-1A(Nitab4.5_0001223g0020)
Entry ID 7251
Creation 2010-02-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-02-24 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx27-1A(Nitab4.5_0001223g0020)
Name NtPrx27-1A(Nitab4.5_0001223g0020)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx047]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx27-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx27-1B 673 0 1..358 1..358
NtPrx13-1A 593 0 1..358 1..360
NtPrx13-1B 575 0 1..358 1..360
StPrx72 563 0 1..358 1..363
Literature and cross-references NtPrx27-1A(Nitab4.5_0001223g0020)
EST ref. GenBank:   FG162989.1 [5' end]   FG163061.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx27-1A(Nitab4.5_0001223g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358 (338)
PWM (Da):   %s   38192.96 (36255.9) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   5.32 (5.09) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-358
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFGASHLSL ALSLVALALA GVAIYRNTYE AMNMGLQKLS PNFDLSESSV SILTLNNNVD QQNSHKLSQQ SPESCVFSAV RGVVDSAIDT ERRMGASLIR LHFHDCFVDG CDGGILLDDI  AGSFQGEQTS IPNNNSVRGF AVIAQAKQSV KDTCPNTSVS CADILAIAAR DSVVKLGGQT YDIALGRRDA RTANFTGALT QLPAPFDNLT VQITKFSDKN FTVREMVALV GAHTVGFTRC 
VTVCVSTNVN PAARLSCNCS VTQNNTNLQQ LDTTPTVFDK VYYEDLNRNQ GILFSDQVLT GNTTTAAIVT TYSNDSNVFF GDFAAAMIKM GNLPPSQGVQ LEIRDVCSRV NPSSLASM 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and 9 ESTs (FG161949.1, FG158108.1, FG152699.1, FS434435.1). Cultivar="Hicks Broadleaf".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTG GTGCGAGTCA TTTGAGCCTT GCACTGAGCC TTGTGGCACT TGCACTTGCA GGTGTTGCTA TTTATAGGAA CACTTATGAA GCCATGAATA TGGGACTCCA AAAGCTCTCT  CCAAATTTTG ATTTGTCGGA GTCATCAGTC AGCATTTTAA CTCTAAATAA TAATGTCGAT CAGCAAAATT CACACAAGTT GAGCCAGCAA TCTCCAGAAT CATGCGTCTT CTCAGCTGTT  CGCGGAGTTG TAGACAGTGC TATTGACACA GAAAGACGCA TGGGAGCTTC TCTCATTCGT CTCCATTTCC ACGACTGCTT TGTTGATGTA AATTCCTTCA CCTCTTTAAT TTAATTTCCA  CTGCTCTCGG CGTTCTTTAC TCTCTTTACC CTTTCTAATT TATAAAACAA TGAGCCACTA AATACTTGAT TTATCACTAG CTCTTTTTCA TTATTCTCAT CCTGACTTTC TGTGCAGCTA  TATGCTGACC AAGCTTACAC TTCGTTCTTT TTATTACTTC ATGTCACATT CGTTTACCAG CTTAAACCGA CATTAAGGCT TATTTACAAT TTACTTATGT AACATGAGAT CAGATAGTTG  ACTAATAACT ACTCCTATCT TTTATTAACT AGGGTTGCGA TGGAGGTATT CTTCTAGATG ATATTGCTGG ATCATTCCAA GGAGAACAAA CCTCAATACC CAACAACAAC TCAGTCAGAG  GTTTTGCAGT CATAGCACAA GCTAAACAAA GTGTAAAGGA TACTTGTCCC AACACATCTG TTTCTTGTGC AGACATCTTA GCCATTGCTG CTCGTGATTC TGTTGTTAAA GTAAGTCCAT  TGTTCTCTTT CCCTTACATC CCAAATGTTA CTTTAACACA TATTACCGCC ACTCAAATAT CAAGCACATA GTGTTGCTTA GAGCTTATCT TGAAATACAA CAGCAGGTAA TTGGTATTAT  TGGTATTTGA TAATTTGAAA AATAAAGTAA ATAACCTCTA TAATCGGTAC AGTGTAAAAT TTTATTACAA CATCAATGTA TATCATAAAG AGTTATCTAT AGTTATATAT AAATAAAGAG  TTTAAGCTTG TAACTTAGAC TCTGTTTTTT GATTGACAGC TAGGAGGACA AACCTATGAC ATTGCTCTGG GGAGAAGAGA TGCAAGAACG GCCAACTTCA CTGGTGCTTT AACTCAACTT  CCAGCTCCAT TCGACAACCT AACAGTTCAA ATCACGAAAT TCAGTGACAA AAACTTTACT GTCCGGGAAA TGGTGGCGCT AGTCGGTGCA CACACTGTGG GATTCACCAG GTGTGTCACT  GTGTGCGTCA GCACCAACGT TAACCCGGCT GCACGTCTTT CCTGCAACTG CTCCGTCACT CAAAACAACA CCAACTTGCA ACAATTGGAC ACCACTCCTA CTGTGTTCGA CAAAGTATAC  TACGAGGATT TAAACAGGAA CCAGGGGATA CTTTTCTCTG ATCAAGTATT GACGGGGAAT ACCACAACTG CTGCTATTGT AACAACCTAT AGCAATGATA GTAACGTTTT CTTTGGAGAT 
TTTGCAGCTG CCATGATCAA GATGGGAAAC TTGCCTCCCT CACAGGGCGT TCAATTGGAA ATTCGTGATG TTTGCAGCAG AGTCAATCCC AGTTCTCTAG CTTCTATGTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTG GTGCGAGTCA TTTGAGCCTT GCACTGAGCC TTGTGGCACT TGCACTTGCA GGTGTTGCTA TTTATAGGAA CACTTATGAA GCCATGAATA TGGGACTCCA AAAGCTCTCT  CCAAATTTTG ATTTGTCGGA GTCATCAGTC AGCATTTTAA CTCTAAATAA TAATGTCGAT CAGCAAAATT CACACAAGTT GAGCCAGCAA TCTCCAGAAT CATGCGTCTT CTCAGCTGTT  CGCGGAGTTG TAGACAGTGC TATTGACACA GAAAGACGCA TGGGAGCTTC TCTCATTCGT CTCCATTTCC ACGACTGCTT TGTTGATGGT TGCGATGGAG GTATTCTTCT AGATGATATT  GCTGGATCAT TCCAAGGAGA ACAAACCTCA ATACCCAACA ACAACTCAGT CAGAGGTTTT GCAGTCATAG CACAAGCTAA ACAAAGTGTA AAGGATACTT GTCCCAACAC ATCTGTTTCT  TGTGCAGACA TCTTAGCCAT TGCTGCTCGT GATTCTGTTG TTAAACTAGG AGGACAAACC TATGACATTG CTCTGGGGAG AAGAGATGCA AGAACGGCCA ACTTCACTGG TGCTTTAACT  CAACTTCCAG CTCCATTCGA CAACCTAACA GTTCAAATCA CGAAATTCAG TGACAAAAAC TTTACTGTCC GGGAAATGGT GGCGCTAGTC GGTGCACACA CTGTGGGATT CACCAGGTGT  GTCACTGTGT GCGTCAGCAC CAACGTTAAC CCGGCTGCAC GTCTTTCCTG CAACTGCTCC GTCACTCAAA ACAACACCAA CTTGCAACAA TTGGACACCA CTCCTACTGT GTTCGACAAA  GTATACTACG AGGATTTAAA CAGGAACCAG GGGATACTTT TCTCTGATCA AGTATTGACG GGGAATACCA CAACTGCTGC TATTGTAACA ACCTATAGCA ATGATAGTAA CGTTTTCTTT 
GGAGATTTTG CAGCTGCCAT GATCAAGATG GGAAACTTGC CTCCCTCACA GGGCGTTCAA TTGGAAATTC GTGATGTTTG CAGCAGAGTC AATCCCAGTT CTCTAGCTTC TATGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGATCAAGA AGCTAGCTAG CTTTGGTTTC TTAGATATAT ATTCCTTAGA CATTTCATTG ATCACTAGAT CATGGCTTTT GGTGCGAGTC ATTTGAGCCT TGCACTGAGC CTTGTGGCAC  TTGCACTTGC AGGTGTTGCT ATTTATAGGA ACACTTATGA AGCCATGAAT ATGGGACTCC AAAAGCTCTC TCCAAATTTT GATTTGTCGG AGTCATCAGT CAGCATTTTA ACTCTAAATA  ATAATGTCGA TCAGCAAAAT TCACACAAGT TGAGCCAGCA ATCTCCAGAA TCATGCGTCT TCTCAGCTGT TCGCGGAGTT GTAGACAGTG CTATTGACAC AGAAAGACGC ATGGGAGCTT  CTCTCATTCG TCTCCATTTC CACGACTGCT TTGTTGATGG TTGCGATGGA GGTATTCTTC TAGATGATAT TGCTGGATCA TTCCAAGGAG AACAAACCTC AATACCCAAC AACAACTCAG  TCAGAGGTTT TGCAGTCATA GCACAAGCTA AACAAAGTGT AAAGGATACT TGTCCCAACA CATCTGTTTC TTGTGCAGAC ATCTTAGCCA TTGCTGCTCG TGATTCTGTT GTTAAACTAG  GAGGACAAAC ATATGACATT GCTCTGGGGA GAAGAGATGC AAGAACGGCC AACTTCACTG GTGCTTTAAC TCAACTTCCA GCTCCATTCG ACAACCTAAC AGTTCAAATC ACGAAATTCA  GTGACAAAAA CTTTACTGTC CGGGAAATGG TGGCGCTAGT CGGTGCACAC ACTGTGGGAT TCACCAGGTG TGTCACTGTG TGCGTCAGCA CCAACGTTAA CCCGGCTGCA CGTCTTTCCT  GCAACTGCTC CGTCACTCAA AACAACACCA ACTTGCAACA ATTGGACACC ACTCCTACTG TGTTCGACAA AGTATACTAC GAGGATTTAA ACAGGAACCA GGGGATACTT TTCTCTGATC  AAGTATTGAC GGGGAATACC ACAACTGCTG CTATTGTAAC AACCTATAGC AATGATAGTA ACGTTTTCTT TGGAGATTTT GCAGCTGCCA TGATCAAGAT GGGAAACTTG CCTCCCTCAC  AGGGCGTTCA ATTGGAAATT CGTGATGTTT GCAGCAGAGT CAATCCCAGT TCTCTAGCTT CTATGTGAAA GGAACACTTG AATTTGGAAA AAAGGAACTA AACTCGTTAT TAGTTGCTTG 
CTTGGTGTTT TCTTCAAAAT AAAAGAATCA CTGTCTCCAG AATGTTGCTC TAGT 

Retrieve as FASTA