Entry information : NtPrx27-1B(Nitab4.5_0007158g0010)
Entry ID 7253
Creation 2010-02-24 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx27-1B(Nitab4.5_0007158g0010)
Name NtPrx27-1B(Nitab4.5_0007158g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx047]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx27-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx27-1A 672 0 1..358 1..358
NtPrx13-1A 603 0 1..358 1..360
NtPrx13-1B 584 0 1..358 1..360
StPrx72 579 0 1..358 1..363
Literature and cross-references NtPrx27-1B(Nitab4.5_0007158g0010)
EST ref. GenBank:   FG145150.1 [5' end]   FH186870.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx27-1B(Nitab4.5_0007158g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358 (195)
PWM (Da):   %s   38215.86 (20813.3) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   4.83 (4.52) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-215
Sequence 0
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAFRASHLSL ALSLVALALA GVAIYRNTYE AMNMGLQKLS PNFELSESAV SILTLNNNVD QQNSHELSQQ SPESCVFSAV RGVVDSAIDT ERRMGASLIR LHFHDCFVDG CDGGILLDDI  AGSFQGEQTS PPNDNSARGY EVIAQAKQSV KDTCPNISVS CADILAIAAR DSVVKLGGQT YNIALGRRDA RTANFTGALT QLPAPFDNLT VQITKFSDKN FTVREMVALA GAHTVGFTRC 
VTVCNSNNVN PAASLSCNCS VTQNNTNLQQ LDTTPTVFDK VYYEDLNRNQ GILFSDQVLT GNTTTAAIVT TYSNDSNVLF GDFAAAMIKM GNLPPSQGVQ LEIRDVCSRV NPSSVASM 

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Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs (FH728062.1).
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTC GTGCAAGTCA TTTGAGCCTT GCCCTGAGCC TTGTGGCACT TGCACTAGCA GGTGTTGCTA TTTATAGGAA CACTTATGAA GCCATGAATA TGGGACTCCA AAAGCTCTCT  CCTAATTTTG AGTTGTCGGA GTCGGCAGTC AGCATTTTAA CTCTAAATAA TAATGTTGAT CAGCAAAATT CACACGAGTT GAGTCAGCAA TCTCCAGAAT CATGCGTCTT CTCAGCTGTT  CGAGGAGTTG TGGATAGTGC TATTGACACA GAAAGACGCA TGGGAGCTTC TCTCATTCGT CTCCATTTCC ACGACTGCTT TGTTGATGTA AATAATTCCT TCACCTCTTC AATTTCTACT  GCTCTCGACG TTTTTTACTC TCTACCCTTT CTACTTTTTT AAAAAAATGT GACACTAAAT ACTTGATTTA TCATTAGCTC GTTTTTATTA TTCTCATCCT GACTTTCTGT GTAGCTATGC  TGACCAAAGC TTACACTTCG ATCATTTTAT TATTACTTCA TGTCACATTG GTTAACCAGC TTAAAGCGAC ATTAGATAGT TGACTAATAA CTACTCCTAT GTTTTATTAA CTAGGGTTGC  GATGGAGGTA TTCTTCTAGA TGATATTGCT GGATCATTCC AAGGAGAACA AACCTCACCA CCCAACGACA ACTCAGCCAG AGGTTATGAA GTCATAGCAC AAGCTAAACA AAGTGTAAAA  GATACTTGTC CCAACATATC TGTTTCTTGT GCAGACATCT TAGCCATTGC TGCTCGTGAT TCTGTTGTTA AAGTAAGTCC ATTATTTTCT ATCACGTTGC TTAGAGTTTA TGTTGACATA  CAACAATAGG TAATTAGTAT TGGTAATTTG AAAAATAAAG TAAATAACCG TTATAGTCGG TAAAAATTAT ATTGATAGTG TGAAAAACCA TTCTAATTGT ACCGAGTAGC CTCTTAATGT  TTATCAGAAA AATCATCTAT AATTATGTAT AACTAATTTA TATACCATCG GTACAGTATT TAAGCTTGCA ACTTAAACTC TGTGTTTTGA TTGACAGCTA GGAGGACAAA CCTATAACAT  TGCACTGGGG AGAAGAGATG CAAGAACGGC CAACTTCACC GGTGCTTTAA CTCAGCTTCC AGCTCCATTC GACAACCTTA CCGTCCAAAT CACGAAATTC AGTGACAAAA ACTTTACTGT  CCGGGAAATG GTGGCGCTAG CCGGTGCACA CACTGTGGGA TTCACCAGAT GTGTCACTGT GTGCAACAGC AACAATGTTA ACCCGGCTGC AAGTCTTTCC TGCAACTGCT CCGTCACTCA  AAACAATACG AACTTGCAAC AATTGGACAC CACTCCTACT GTGTTCGACA AAGTATACTA CGAGGACTTA AACAGGAACC AGGGGATACT ATTCTCTGAT CAAGTATTGA CGGGGAATAC  CACAACTGCT GCTATTGTAA CAACCTATAG CAATGATAGT AACGTTTTAT TTGGAGATTT TGCAGCTGCC ATGATCAAGA TGGGAAACTT GCCTCCCTCA CAGGGCGTTC AATTGGAAAT 
TCGTGATGTT TGCAGCAGAG TCAATCCCAG TTCTGTGGCT TCTATGTGA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTTTC GTGCAAGTCA TTTGAGCCTT GCCCTGAGCC TTGTGGCACT TGCACTAGCA GGTGTTGCTA TTTATAGGAA CACTTATGAA GCCATGAATA TGGGACTCCA AAAGCTCTCT  CCTAATTTTG AGTTGTCGGA GTCGGCAGTC AGCATTTTAA CTCTAAATAA TAATGTTGAT CAGCAAAATT CACACGAGTT GAGTCAGCAA TCTCCAGAAT CATGCGTCTT CTCAGCTGTT  CGAGGAGTTG TGGATAGTGC TATTGACACA GAAAGACGCA TGGGAGCTTC TCTCATTCGT CTCCATTTCC ACGACTGCTT TGTTGATGGT TGCGATGGAG GTATTCTTCT AGATGATATT  GCTGGATCAT TCCAAGGAGA ACAAACCTCA CCACCCAACG ACAACTCAGC CAGAGGTTAT GAAGTCATAG CACAAGCTAA ACAAAGTGTA AAAGATACTT GTCCCAACAT ATCTGTTTCT  TGTGCAGACA TCTTAGCCAT TGCTGCTCGT GATTCTGTTG TTAAACTAGG AGGACAAACC TATAACATTG CACTGGGGAG AAGAGATGCA AGAACGGCCA ACTTCACCGG TGCTTTAACT  CAGCTTCCAG CTCCATTCGA CAACCTTACC GTCCAAATCA CGAAATTCAG TGACAAAAAC TTTACTGTCC GGGAAATGGT GGCGCTAGCC GGTGCACACA CTGTGGGATT CACCAGATGT  GTCACTGTGT GCAACAGCAA CAATGTTAAC CCGGCTGCAA GTCTTTCCTG CAACTGCTCC GTCACTCAAA ACAATACGAA CTTGCAACAA TTGGACACCA CTCCTACTGT GTTCGACAAA  GTATACTACG AGGACTTAAA CAGGAACCAG GGGATACTAT TCTCTGATCA AGTATTGACG GGGAATACCA CAACTGCTGC TATTGTAACA ACCTATAGCA ATGATAGTAA CGTTTTATTT 
GGAGATTTTG CAGCTGCCAT GATCAAGATG GGAAACTTGC CTCCCTCACA GGGCGTTCAA TTGGAAATTC GTGATGTTTG CAGCAGAGTC AATCCCAGTT CTGTGGCTTC TATGTGA 

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cDNA
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AAACATGGGT CTAGGGGAAA GGAGAGAATC ATAAAATAAA ATATTTTTTT AAAAGGAAAT TTCTGCTCTT TAACCAAAGA AAAATATTTT CGAAATTTCT TTTCCACTCA CCAACCAAAC  AAAAAATAAA TAAATGATGA AATCACTCAT TTTTCATGAA ACAATATTTT TCATACCAAA CACACCCATG GTAAAGAAGC ACACCTAACA CGGTTGAACG ACAATAGTAA TAAAAGACAA  TTCTACACCA ATGGATTCTT AGTTTATTTG TTCTTTTACT TTCAATTAAT TTTAAAGCAG AATAATGACT AATTGTTAGC TAGTCCTCAC TAGCTCCCTA CAAATAGAAG CAAAAATAAA  AGCAAAATCA TCCGCAAAGA CACATATCCT CAAGAAGCTA GCTTTTGGTT TCTTAGATAT TCCATAGACA ATTCATTGAT CACTAGATCA TGGCTTTTCG TGCAAGTCAT TTGAGCCTTG  CCCTGAGCCT TGTGGCACTT GCACTAGCAG GTGTTGCTAT TTATAGGAAC ACTTATGAAG CCATGAATAT GGGACTCCAA AAGCTCTCTC CTAATTTTGA GTTGTCGGAG TCGGCAGTCA  GCATTTTAAC TCTAAATAAT AATGTTGATC AGCAAAATTC ACACGAGTTG AGTCAGCAAT CTCCAGAATC ATGCGTCTTC TCAGCTGTTC GAGGAGTTGT GGATAGTGCT ATTGACACAG  AAAGACGCAT GGGAGCTTCT CTCATTCGTC TCCATTTCCA CGACTGCTTT GTTGATGGTT GCGATGGAGG TATTCTTCTA GATGATATTG CTGGATCATT CCAAGGAGAA CAAACCTCAC  CACCCAACGA CAACTCAGCC AGAGGTTATG AAGTCATAGC ACAAGCTAAA CAAAGTGTAA AAGATACTTG TCCCAACATA TCTGTTTCTT GTGCAGACAT CTTAGCCATT GCTGCTCGTG  ATTCTGTTGT TAAACTAGGA GGACAAACCT ATAACATTGC ACTGGGGAGA AGAGATGCAA GAACGGCCAA CTTCACCGGT GCTTTAACTC AGCTTCCAGC TCCATTCGAC AACCTTACCG 
TCCAAATCAC GAAA 

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