Entry information : NtPrx28-1B(Nitab4.5_0002518g0050)
Entry ID 7264
Creation 2010-02-25 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-01-19 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx28-1B(Nitab4.5_0002518g0050)
Name NtPrx28-1B(Nitab4.5_0002518g0050)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx019]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx28-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx28-1A 617 0 45..361 1..317
StPrx07 537 0 43..351 3..313
LePrx19 537 0 51..361 19..327
PpePrx32 427 4e-151 63..352 22..317
Literature and cross-references NtPrx28-1B(Nitab4.5_0002518g0050)
DNA ref. GenBank:   ET685082.1 [3' end]
EST ref. GenBank:   FG145964.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx28-1B(Nitab4.5_0002518g0050)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   361 (300)
PWM (Da):   %s   39403.11 (32445.6)  
PI (pH):   %s   8.94 (9.42) Peptide Signal:   %s   cut: 18 range:18-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDLKQTECAK TLLHKVADYE TQIAYKRSTT HDRTLSETSF CSVKMILPLI FLCCVFHLVS AQLRVGFYNS TCPQAETIVR QAVQKQFNSD RSITAALLRM HFHDCFVRGC DASILIKSTK  SKQSERNAGP NQTVRGFELI DNIKKSIEIS CPSTVSCADI ITLATRDAVA LVGGPTYAIP TGRRDGLVSN AADVNLPGPS FTVPQALQSF TNKGLSLNDM VTLLGAHTVG VAHCNFFQNR  LSPVPDNTMD PTLAAQLLKT CSKSTATAFL DQNTSFTIDN QFFRQIMLKK GILKIDQELT LDKSSASIVS GFASNENTFR QSFANAMIKM ASIDILVGRA GEIRNNCGVF NPPNQKGRKV 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (introns 1 and 2) and ESTs. Cultivar="Hicks Broadleaf"
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGATCTGA AACAGACTGA ATGTGCCAAA ACGTTGCTTC ATAAGGTGGC TGATTATGAG ACACAAATTG CTTACAAGAG ATCGACTACA CATGATAGGT GTAAGCCAGG AGAAGACATG  TCTTCTATGT GGTATGCATG ATGAAACAAT CCAGCACTTA TACTTTGAGT GCCAATTCTC AAGAAGAACT GTGGAGGAAT TATGCATATG GCTGGGTTTA AAGATCAACC ATTTAGATCA  ACACAACATA TGGAGGAAGA TAAGAAGAGG CATCAAAGGA AGAATATGCA GAGGATTTGG TGCTGCCATC ATAGTAGCAG TCATGTATGG AATATGGAAA GCAAGAAATG AAGCTTTATG  GAACCAAAAA GTGCCAATAC CAGGAAAGAT GTGACAGAGT ATCAAAGAGG ATAGCAAGCA CATAATTCAA TTGATTGGTG ACAATAGGAA AAATAGGAAA GAAAAGGAAT GGATAAACCT  CTTGTATAGA TAGTATACTA TAGAGCAAAC CTACCTAGTA GGGATGCATA GAAGTAAGCT AAAGTAGAAT AGCTTATAGT TATAGTTGGT GACAAATTGT AAATATTCTT GTCAGGTGGA  GATCAATAAA GTTTTCTTTC ACCAAAAAAA AAATATTGTT TGATGTAGTG TATTAAAAAT TAAAATGCAT TGCATAATTT TTAAGAAAAT TAGTCGTTTA CTAAAATAAA CTCCATATTC  TTTAGCTTTA AGGGACTTTA AAGATAATTT TGTCTTTAAT CATGCTAATG CATGCATTAA TAGCCTTGGT ATTTCTAACA CCATGGTTTA CTATGCATTA TTTACCCATA GAATAATACC  AAATAGGTTA TATAATTAAT AATTGCATTA GTACCACATA TATGTTAAAA AATGTACCAA AGAAGAAAAA CATACCAATA ACTAATGCAT ACATTATTTT CTCTAATAAT CGTGCCACCC  TAAGACGTTA TGTAAGAAGC CACTTGGATG CATTTAGCCA TTTGTGCATT AACGCGTAGG AGAATGTGAA CCGAATAAAC TATTTTTGAC ATGCCCACTA GGTGTCCGTT GACGATGCAT  GTGGCCAGCG TCAGAACCCC CTTCTCCTGC ATCTATATAT ATTTCTTGAA TGGCTTTGAT CAGCTTCATC ACTAGCTAGT AGGGAAAACC CAGAATAGAC TGTACAAACT ATCTTCAATT  AGTAGAACTC TCTCAGAAAC ATCCTTCTGT TCTGTGAAAA TGATATTACC ATTAATATTT CTCTGTTGTG TTTTTCATTT AGTTTCAGCT CAACTTCGAG TTGGCTTTTA CAATTCTACG  TGTCCACAAG CTGAAACTAT TGTTCGACAA GCTGTGCAAA AGCAGTTCAA TAGCGACCGT TCCATCACTG CAGCTCTGCT TCGCATGCAT TTTCATGACT GCTTTGTGAG AGTAAGTGTA  GTACTTCAAG TTTTACTTTT TCTTCTCTAA CTGCTACTCC CTCCGTTTAG AAATAGAATG AATCTTTAAT TTTACTATTT AAAAAATCAA ATAAGGTTTT TTTGATCCTG TTTTTTTGCT  AATATTTTAG ATCAATTCGT ATACTGGAAA TAAATTAATT TAACTTCGTA CTCCGAAAAG CTTCAAACAA ATTAAAACGG GGAATGGCTT TCTTGATCAA ATAGACTCGC ACAACCTTCT  TTTAGCGTTC TCCTCCAACA CCCACGACCA TATTTATCAT TTCGTGGTGG GCTCTTATAT TGTCGGGTAA ATTGCATCAA TGATCATTCA AGTTAAGCTT GTAATACAAA AGTCTTTTTC  GCAGAAGCTC ATTCCTATAT ATAAGAAATA CGTAATAATC ATATTTCACG TCGATAATCA TGTGATCTCC CGCAACTCAC ACAAGAAAAG ATACTAAATT ATACTTAAAA ACATGCACTT  TTTCTCATTT ATCAATTTAC TTTGTATTAT TTTTATACAA TGTCTATGTA TCTATATACA TATAGTGTGT AGAAAAAAAA TGTATTTACT TACAAAATGA AAAATATATA ATTGAGAAAC  AGTGACGAAT AGCACCCCGT ACAAAACAGT ACCTCTACCT GGTTCTATGC AAGCATTATT CCAGAGTTAA TGCGCAGAGA GCAATATCTC GTATnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnA  TACAAATGTC TATGTATCTA TATACATATA GTGTGTAGAA AAAAAATGTA TTTACTTACA AAATGAAAAA TATATAATTG AGAAACAGTG ACGAATAGCA CCCCGTACAA AACAGTACCT  CTACCTGGTT CTATGCAAGC ATTATTCCAG AGTTAATGCG CAGAGAGCAA TATCTCGTAT ATTCATTTTA TCGTTAGAGG CACTTTCACC TGGAAATGGA AAATATATTT TGCCAACATC  GTTTCCCATT GCTCGTAATT TTAATTGTTA GAATATATTT TCTATTTTGT ATTCAAGATA CTTATAAATT CAAAAAATTG CTTCTAATTG TGCTCGTTTA CGTAACGTAA AACTGAACTT  CAGGGTTGTG ATGCATCCAT ACTTATAAAG TCAACAAAGT CTAAGCAATC GGAAAGAAAC GCTGGACCAA ATCAAACAGT ACGAGGTTTC GAGCTTATAG ATAATATTAA AAAAAGCATA  GAAATATCAT GTCCATCAAC TGTTTCATGC GCTGACATAA TAACACTAGC AACCCGGGAT GCAGTAGCGC TAGTTGGAGG TCCTACCTAT GCCATTCCAA CTGGAAGGAG AGATGGCCTG  GTTTCAAATG CAGCAGATGT AAACTTGCCA GGTCCATCAT TTACAGTTCC ACAAGCCCTC CAATCGTTCA CAAACAAAGG GCTGTCCTTA AATGATATGG TGACCCTATT AGGAGCTCAC  ACTGTCGGAG TTGCACACTG TAATTTTTTC CAAAATAGGC TTTCTCCGGT ACCTGATAAC ACCATGGATC CTACTTTGGC TGCCCAACTC TTGAAAACTT GTTCGAAAAG CACCGCAACA  GCGTTTTTGG ATCAGAATAC ATCTTTCACG ATAGACAACC AGTTCTTTAG ACAGATTATG TTAAAAAAAG GCATTCTGAA GATTGATCAA GAGCTTACCT TGGATAAGTC TAGTGCTTCA  ATTGTTTCAG GTTTTGCTTC CAACGAGAAT ACCTTCAGAC AGAGTTTCGC AAATGCAATG ATAAAAATGG CAAGTATTGA TATTCTCGTT GGACGCGCTG GAGAAATTAG AAATAATTGT 
GGGGTCTTTA ACCCGCCAAA TCAGAAGGGT CGCAAGGTTC TTTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCGGTCCGGA TTCCCGGGAT AAAACCCAGA ATAGACTGTA CAAACTATCT TCAATTAGTA GAACTCTCTC AGAAACATCC TTCTGTTCTG TGAAAATGAT ATTACCATTA ATATTTCTCT  GTTGTGTTTT TCATTTAGTT TCAGCTCAAC TTCGAGTTGG CTTTTACAAT TCTACGTGTC CACAAGCTGA AACTATTGTT CGACAAGCTG TGCAAAAGCA GTTCAATAGC GACCGTTCCA  TCACTGCAGC TCTGCTTCGC ATGCATTTTC ATGACTGCTT TGTGAGAGGT TGTGATGCAT CCATACTTAT AAAGTCAACA AAGTCTAAGC AATCGGAAAG AAACGCTGGA CCAAATCAAA  CAGTACGAGG TTTCGAGCTT ATAGATAATA TTAAAAAAAG CATAGAAATA TCATGTCCAT CAACTGTTTC ATGCGCTGAC ATAATAACAC TAGCAACCCG GGATGCAGTA GCGCTAGTTG  GAGGTCCTAC CTATGCCATT CCAACTGGAA GGAGAGATGG CCTGGTTTCA AATGCAGCAG ATGTAAACTT GCCAGGTCCA TCATTTACAG TTCCACAAGC CCTCCAATCG TTCACAAACA  AAGGGCTGTC CTTAAATGAT ATGGTGACCC TATTAGGAGC TCACACTGTC GGAGTTGCAC ACTGTAATTT TTTCCAAAAT AGGCTTTCTC CGGTACCTGA TAACACCATG GATCCTACTT  TGGCTGCCCA ACTCTTGAAA ACTTGTTCGA AAAGCACCGC AACAGCGTTT TTGGATCAGA ATACATCTTT CACGATAGAC AACCAGTTCT TTAGACAGAT TATGTTAAAA AAAGGCATTC  TGAAGATTGA TCAAGAGCTT ACCTTGGATA AGTCTAGTGC TTCAATTGTT TCAGGTTTTG CTTCCAACGA GAATACCTTC AGACAGAGTT TCGCAAATGC AATGATAAAA ATGGCAAGTA 
TTGATATTCT CGTTGGACGC GCTGGAGAAA TTAGAAATAA TTGTGGGGTC TTTAACCCGC CAAATCAGAA GGGTCGCAAG GTTCTTTAG 

Retrieve as FASTA