Entry information : ZmPrx35
Entry ID 731
Creation 2009-01-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2009-01-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Cyril Jourda
Last annotation changes 2010-12-23 (Marie Brette (Scipio))
Peroxidase information: ZmPrx35
Name ZmPrx35
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx017]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea
Organism Zea mays    [TaxId: 4577 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ZmPrx35
start..stop
S start..stop
ZmPrx22 619 0 1..339 1..338
ZmPrx146 619 0 1..339 1..338
SiPrx107 596 0 1..339 1..333
SiPrx108 591 0 3..339 4..336
Gene structure Fichier Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 86284386..86285405 1020  
complement(join(86284386..86285405))


exon

Literature and cross-references ZmPrx35
Protein ref. UniProtKB:   B6T173 [Mismatch]
DNA ref. GenBank:   AC188742.3 (13224..12198)
Protein sequence: ZmPrx35
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   339 (317)
PWM (Da):   %s   36609.08 (34448.0) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   6.43 (6.43) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-339
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MSSTWLAFAW AAAALVVAAA TAHAPHHPSS LQVGFYKHSC PQAEDIVRNA VRRGLVRDPG VGAGLIRMHF HDCFVRGCDA SILINSTPGN LAEKDSVANN PSMRGFDVID DAKAALEAHC  PRTVSCADIV AFAARDSACS AGGLEYEVPS GRRDGRVSRQ DEVLDNNVPT PTDVVAELIE SFKRKGLSAD DMVTLSGAHT IGRSHCSSFT QRLYNFSGQL GWTDPSLDPA YAGHLKARCP 
WPSSDDQMDP TVVPQDPVTP ATFDNQYFKN VLAHKVLFVS DNTLLDNPWT AGIVQFNAAV EKAWQVRFAK AMVKMGKVQV LTGDEGEIRE KCFVVNPHY 

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Remarks Complete sequence from genomic (chromo 10, no intron). No EST.
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGCTCGA CGTGGCTGGC TTTTGCATGG GCGGCGGCCG CCCTCGTCGT GGCGGCGGCC ACGGCGCACG CCCCGCACCA CCCGTCGTCG CTGCAGGTCG GTTTCTACAA GCACTCGTGC  CCACAGGCCG AGGACATCGT GCGCAACGCC GTCCGCCGCG GTCTGGTCCG CGACCCGGGC GTTGGCGCGG GACTCATCCG CATGCACTTC CACGACTGCT TCGTCCGGGG CTGCGACGCC  TCAATCCTCA TCAACTCCAC GCCGGGCAAC CTAGCCGAGA AGGACTCCGT GGCCAACAAC CCCAGCATGC GCGGCTTCGA CGTCATCGAC GACGCCAAGG CCGCCCTCGA GGCGCACTGC  CCGCGCACCG TCTCCTGCGC CGACATCGTC GCGTTCGCGG CCCGCGACAG CGCCTGCTCC GCCGGCGGCC TCGAGTACGA GGTCCCCTCG GGGCGCCGCG ACGGCCGAGT TTCCAGACAA  GACGAGGTGC TCGACAACAA TGTCCCCACA CCGACCGACG TCGTCGCCGA GCTCATCGAG AGCTTCAAGC GCAAGGGGCT GTCCGCCGAC GACATGGTCA CGCTCTCCGG CGCGCACACC  ATCGGCCGCT CCCACTGCTC CTCCTTCACG CAGCGGCTAT ACAACTTCAG CGGGCAGCTG GGGTGGACGG ACCCGTCCCT CGACCCCGCC TACGCCGGGC ACCTCAAGGC GCGGTGCCCT  TGGCCGTCCA GCGACGACCA GATGGACCCC ACGGTGGTGC CGCAGGACCC AGTCACGCCG GCGACCTTCG ACAACCAGTA CTTCAAGAAC GTGCTTGCGC ACAAGGTCCT GTTCGTCTCC  GACAACACGC TGCTCGACAA CCCCTGGACG GCCGGGATCG TCCAATTTAA CGCCGCAGTC GAGAAGGCGT GGCAGGTCAG GTTCGCCAAG GCCATGGTCA AGATGGGCAA GGTGCAGGTG 
CTCACCGGCG ATGAGGGAGA GATCAGGGAA AAGTGCTTCG TCGTCAACCC ACACTACTAG 

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CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAGCTCGA CGTGGCTGGC TTTTGCATGG GCGGCGGCCG CCCTCGTCGT GGCGGCGGCC ACGGCGCACG CCCCGCACCA CCCGTCGTCG CTGCAGGTCG GTTTCTACAA GCACTCGTGC  CCACAGGCCG AGGACATCGT GCGCAACGCC GTCCGCCGCG GTCTGGTCCG CGACCCGGGC GTTGGCGCGG GACTCATCCG CATGCACTTC CACGACTGCT TCGTCCGGGG CTGCGACGCC  TCAATCCTCA TCAACTCCAC GCCGGGCAAC CTAGCCGAGA AGGACTCCGT GGCCAACAAC CCCAGCATGC GCGGCTTCGA CGTCATCGAC GACGCCAAGG CCGCCCTCGA GGCGCACTGC  CCGCGCACCG TCTCCTGCGC CGACATCGTC GCGTTCGCGG CCCGCGACAG CGCCTGCTCC GCCGGCGGCC TCGAGTACGA GGTCCCCTCG GGGCGCCGCG ACGGCCGAGT TTCCAGACAA  GACGAGGTGC TCGACAACAA TGTCCCCACA CCGACCGACG TCGTCGCCGA GCTCATCGAG AGCTTCAAGC GCAAGGGGCT GTCCGCCGAC GACATGGTCA CGCTCTCCGG CGCGCACACC  ATCGGCCGCT CCCACTGCTC CTCCTTCACG CAGCGGCTAT ACAACTTCAG CGGGCAGCTG GGGTGGACGG ACCCGTCCCT CGACCCCGCC TACGCCGGGC ACCTCAAGGC GCGGTGCCCT  TGGCCGTCCA GCGACGACCA GATGGACCCC ACGGTGGTGC CGCAGGACCC AGTCACGCCG GCGACCTTCG ACAACCAGTA CTTCAAGAAC GTGCTTGCGC ACAAGGTCCT GTTCGTCTCC  GACAACACGC TGCTCGACAA CCCCTGGACG GCCGGGATCG TCCAATTTAA CGCCGCAGTC GAGAAGGCGT GGCAGGTCAG GTTCGCCAAG GCCATGGTCA AGATGGGCAA GGTGCAGGTG 
CTCACCGGCG ATGAGGGAGA GATCAGGGAA AAGTGCTTCG TCGTCAACCC ACACTACTAG 

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