Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
324 (303) |
PWM (Da): |
35118.93 (32796.6) |
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PI (pH): |
7.31 (7.31) |
Peptide Signal: |
cut: 22 range:22-324 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MEINVLIVISLSLMLIPFAKPQGGLKTGFYSSTCPKAEAIVRSTV EAHFKDDPTVAAGLLRLHFHDCFVEGCDGSILIKGKSAEITALANLGLRGFEVIDDAKTQLEALCPGVVSCADILALAARDSVDLSDGPNWPVPTGRRDGRVSLASKVSSLPSPLDSVDTQRSKFAAKGLDDKDLVTLSGAHTIG QTDCRFFRYRLYNFTTTGNSDPSLSQSALAQFQSLCPKNTDGTERVALDKDSPTKFDVNYFKNVRDGNGVLESDQRLWGDPTTQKIVRNYAGTFRGLLGLRFDFEFKNSMIQMSSIEVKT GTQGEIRKVCSKIN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Partial sequence from genomic and 4 ESTs (BQ969053.1, BQ916832.1, BQ967363.1). Cultivar="RHA801". |
DNA ►
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGAGATTAATGTCCTCATTGTCATTAGTTTGAGTTTAATGTTAATCCCTTTTGCTAAACCTCAAGGAGGATTAAAAACCGGGTTTTACTCGTCTACATGTCCCAAAGCTGAAGCGATA GTGAGATCAACGGTTGAGGCACACTTCAAGGATGATCCTACTGTTGCTGCTGGACTTCTCAGGCTTCATTTTCATGATTGCTTTGTTGAGGTACTTGTTTACTTAAAAGGGTGTTTTTGG AATGAAAAAAAGTTTTAAACTTTATTAATAGGGTTGTAATCAAGCCGAGTTGTGCTGAACCAGGTTGAGATCAAGCTCGAGCTCGAACTTAAACGAGTCATCTCAACTTGGCTCATTTAT TTTATGGAGCTGAAAAGTTGAGCTTGACTCGTAAAATGTTCGAGCCAGCTCGAGCCAAATCAAGTTGGCTCGTTAATTTGTTTTACTTTTTTCTTTGATTGTTTTTGGAAATATTGATAA CATAAGAAACAAAAGATAATAAAAAATACACATATATGGTATATCTATATGTGTTATTTTTATTTTTCTAATATTTTAAATACGAAAGACATTAAAAGTATTATATGTATATGTTATTAA TCAATTAAACTTAAAATGTTAACACTTCAACCCCTCTCACATATTTTTTATTTTAATACATTTAAAATTAAAATTCATCTATATTAGTAGAATAATTTGAGCCGGCTCGTGAGCTCACGA GCCAAGTCGGCTCAGTATTTTTCGAGGTTTTTTTTTTAGCTAGCTGCGAGCTTTTTGAACACCCCTGTTTATTAATTGTTTATTAATGGATTTTCCTTTTTAGGGGGCTGTGATGGGTCA ATCTTGATCAAGGGAAAATCTGCTGAGATTACTGCACTGGCTAATCTTGGATTAAGAGGATTTGAAGTCATTGATGATGCTAAGACACAACTAGAAGCTTTGTGCCCTGGTGTTGTTTCT TGTGCTGATATTCTTGCATTGGCTGCGCGCGATTCGGTTGATTTGGTAATCTTTTTGTCCTTGATTGCTAAATATATATAGTGAAAGTTTTAAATACAAACGAGTTTTAACGTGCGACAG TACGAAGTGACCAAAATAACGTGCGTAATTATGTATAAAGCATGCGTTATTAGGGTGAGTTTTAACCATGCGTAATATTCATGTTTGATGGCATGCAAGATTTGAATTTTATAACATGCG TAATTATATATATGATGCGTAATTACGAAATGTGGACTTCGTATTCTTCGCACGTTAAGGGGCTATTGTACGATAACCCACCCCTATATATAATCCTGATTATGATTATCTTATGTATTT TATGTCACGTTTAAGAGAGTGACGGCCCAAATTGGCCGGTACCAACGGGGAGACGAGATGGCAGAGTATCATTGGCTTCTAAAGTATCAAGTTTACCATCACCGTTAGATTCGGTTGACA CCCAAAGAAGCAAGTTTGCTGCTAAAGGCCTTGACGATAAAGATTTAGTGACACTATCTGGTACGTTACATCATATCCTCACAAACATGACACCTTAGATGAATCTTACATCATTATGTT TTGGTCCTTAGTAAAGATATCGGGCCACAAAATATCATTTCTTAAATATCAACAACGCGTTTTTAGGCACACCAACTGTAAATAAGAAAAAACTTTACGGGTAAGCGTGCACAAAACAGA CAATATTGGTTGATATGAGTGGTCAGATGTTACATAAACCTACCATATATAATCTTACATTTGATTATTGTAACTTCACTATGAAAAAGCATATATAATTTTGTGATGTAGGTGTGCACA TACAATAGGCCAAACAGATTGTAGATTCTTTCGATACCGTCTATACAACTTCACAACAACAGGGAATTCAGACCCGAGCTTGAGCCAGTCGGCTCTAGCCCAGTTCCAGAGCTTGTGTCC AAAGAACACCGATGGCACAGAACGAGTGGCATTGGATAAAGACAGCCCAACAAAGTTTGATGTTAACTATTTCAAGAACGTGCGCGATGGAAATGGTGTTTTGGAGTCGGATCAGAGATT ATGGGGCGACCCGACGACTCAAAAGATTGTGAGAAACTATGCAGGAACATTTAGAGGGTTGTTGGGATTGAGATTCGATTTCGAGTTTAAAAATTCTATGATCCAAATGAGTAGCATTGA AGTAAAAACTGGTACACAAGGGGAAATTAGAAAGGTTTGTTCCAAGATCAACTAA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGAGATTAATGTCCTCATTGTCATTAGTTTGAGTTTAATGTTAATCCCTTTTGCTAAACCTCAAGGAGGATTAAAAACCGGGTTTTACTCGTCTACATGTCCCAAAGCTGAAGCGATA GTGAGATCAACGGTTGAGGCACACTTCAAGGATGATCCTACTGTTGCTGCTGGACTTCTCAGGCTTCATTTTCATGATTGCTTTGTTGAGGGCTGTGATGGGTCAATCTTGATCAAGGGA AAATCTGCTGAGATTACTGCACTGGCTAATCTTGGATTAAGAGGATTTGAAGTCATTGATGATGCTAAGACACAACTAGAAGCTTTGTGCCCTGGTGTTGTTTCTTGTGCTGATATTCTT GCATTGGCTGCGCGCGATTCGGTTGATTTGAGTGACGGCCCAAATTGGCCGGTACCAACGGGGAGACGAGATGGCAGAGTATCATTGGCTTCTAAAGTATCAAGTTTACCATCACCGTTA GATTCGGTTGACACCCAAAGAAGCAAGTTTGCTGCTAAAGGCCTTGACGATAAAGATTTAGTGACACTATCTGGTGCACATACAATAGGCCAAACAGATTGTAGATTCTTTCGATACCGT CTATACAACTTCACAACAACAGGGAATTCAGACCCGAGCTTGAGCCAGTCGGCTCTAGCCCAGTTCCAGAGCTTGTGTCCAAAGAACACCGATGGCACAGAACGAGTGGCATTGGATAAA GACAGCCCAACAAAGTTTGATGTTAACTATTTCAAGAACGTGCGCGATGGAAATGGTGTTTTGGAGTCGGATCAGAGATTATGGGGCGACCCGACGACTCAAAAGATTGTGAGAAACTAT GCAGGAACATTTAGAGGGTTGTTGGGATTGAGATTCGATTTCGAGTTTAAAAATTCTATGATCCAAATGAGTAGCATTGAAGTAAAAACTGGTACACAAGGGGAAATTAGAAAGGTTTGT TCCAAGATCAACTAA |
Retrieve as FASTA
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cDNA►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
AAAGAAACTT AAACCGCGTT AAGTTGGAGC AAAAGCGCCA CCATTACACT ATCGAAAAAG ACACCAAATC TGTTGTATCA ACTCCTTGTC TTTTCCTCTT TATTGGTTCG ATGAGTCAGT
CGATCGATCG AGCTCCACTA ATATTAATGG GCTTGAACTA GTCAGCTACT AGCACTATAT ATAGAGCTTG TTAGATAGAA CATTAGAACC ATACTGTATA CAAAAATGGA GATTAATGTC
CTCATTGTCA TTAGTTTGAG TTTAATGTTA ATCCCTTTTG CTAAACCTCA AGGAGGATTA AAAACCGGGT TTTACTCGTC TACATGTCCC AAAGCTGAAG CGATAGTGAG ATCAACGGTT
GAGGCACACT TCAAGGATGA TCCTACTGTT GCTGCTGGAC TTCTCAGGCT TCATTTTCAT GATTGCTTTG TTGAGGGCTG TGATGGGTCA ATCTTGATCA AGGGAAAATC TGCTGAGATT
ACTGCACTGG CTAATCTTGG ATTAAGAGGA TTTGAAGTCA TTGATGATGC TAAGACACAA CTAGAAGCTT TGTGCCCTGG TGTTGTTTCT TGTGCTGATA TTCTTGCATT GGCTGCGCGC
GATTCGGTTG ATTTGAGTGA CGGCCCAAAT TGGCCGGTAC CAACGGGGAG ACGAGATGGC AGAGTATCAT TGGCTTCTAA AGTATCAAGT TTACCATCAC CGTTAGATTC GGTTGACACC
CAAAGAAGCA AGTTTGCTGC TAAAGGCCTT GACGATAAAG ATTTAGTGAC ACTATCTGGT GCACATACAA TAGGCCAAAC AGATTGTAGA TTCTTTCGAT ACCGTCTATA CAACTTCACA
ACAACAGGGA ATTCAGACCC GAGCTTGAGC CAGTCGGCTC TAGCCCAGTT CCAGAGCTTG TGTCCAAAGA ACACCGATGG CACAGAACGA GTGGCATTGG ATAAAGACAG CCCAACAAAG
TTTGATGTTA ACTATTTCAA GAACGTGCGC GATGGAAATG GTGTTTTGGA GTCGGATCAG AGATTATGGG GCGACCCGAC GACTCAAAAG ATTGTGAGAA ACTATGCAGG AACATTTAGA
GGGTTGTTGG GATTGAGATT CGATTTCGAG TTTAAAAATT CTATGATCCA AATGAGTAGC ATTGAAGTAA AAACTGGTAC ACAAGGGGAA ATTAGAAAGG TTTGTTCCAA GATCAACTAA
ATATTGTGTA AAGATTAAAG AACAGGTTGT TTATGGTTAA CTGTTTTAAC GGTATTGTAT CTTGTGTATT GTGCAATAAA AGTGATTAGT TTGGACAGTG TATCTTTTGT TTTGATGAAG
TTTTTGTATG GTTGTATTGA AAACTTTGTT GAAAATGTAC ATAAATCCC
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Retrieve as FASTA
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