Entry information : AlyPrx53
| Entry ID | 7549 |
|---|---|
| Creation | 2010-08-11 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2010-08-11 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Achraf Jemmat |
| Last annotation changes | 2016-01-07 (Achraf Jemmat) |
Peroxidase information: AlyPrx53
| Name | AlyPrx53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Class III peroxidase [Orthogroup: Prx003] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Arabidopsis lyrata [TaxId: 59689 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichier |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references AlyPrx53
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_6 (2547741..2546432) |
|---|
Protein sequence: AlyPrx53
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence 496 Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 6, 3 introns). Probable sequencing error between GNI and SPL (3'end) => extra 4 nt (agtc) which induce a shift and incorrect prediction from Phytozome. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
