Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
355 (323) |
PWM (Da): |
38778.48 (35410.8) |
Transmb domain: |
o10-32i |
PI (pH): |
8.14 (8.21) |
Peptide Signal: |
cut: 33 range:33-355 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MKFSASSSSTSLTWTTLITLGCLMLYASLSDAQLTPTFYDNSCPN VTNIVRDTIVNELRSDPRIAASILRLHFHDCFVNGCDASILLDNTTSFRTEKDAFGNANSARGFPVIDRMKAAIETACPRTVSCADMLTIAAQQSVTLAGGPSWRVPLGRRDSLQAFLQLANANLPGPSSTLPQLKDRFKNVGLNRPSDLVALSGGHTFGKNQCRFIMNRLYNFSNTGLPDPSLNTTYLQTLRGLCPRNGNLSALVDFDLRTPTVFDNKYYVNLGERKGLIQSDQELFSSPNATDTIPLVRSYANSTQTFFNAFVEAMNRMGNI TPLTGTQGQIRLNCRVVNSNSLLHDVVDIVDFVSSM |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (chromo 6, 3 introns). |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAGTTCTCTGCTTCTTCTTCTTCTACTTCACTCACTTGGACAACCTTAATCACATTGGGATGTCTTATGCTATATGCCTCTTTGTCCGATGCTCAACTTACCCCTACCTTCTACGAC AATTCATGTCCTAATGTTACTAACATCGTACGAGATACCATTGTCAACGAGTTAAGGTCAGACCCTCGTATCGCCGCGAGCATCCTCCGTCTTCATTTCCACGACTGCTTTGTAAATGTA AGATATTACTTTTTATCACGTTGCTAATTATTGTATGTAACTATGTATCATATTAGTGATTTTTTCATGTTTATTTATTCATATTATTTTATTGCATTTATTATTTGAATTTGATTATAT AACCATTTTAATGAGATTATATATAAAACATTTCAATAGTCTAGTTTATTCAAGATATTTTATCTTTATTGCCTAAAGTATATATGGTTTTTATGGATTACAAAAAAAGAAAATTGATGT TACATCGTTACTGGTAGTAAAGATTCAACTATATATTTGAGGATGTAATACACTGACTAACAATTTGGTTAATTTTTTTTTTGGACTTTTGAAAGGGGGTTGTGACGCATCGATCTTGTT AGACAACACGACATCATTTCGAACAGAGAAAGATGCATTTGGAAACGCAAATTCGGCTCGGGGATTTCCCGTGATTGATAGAATGAAAGCCGCAATAGAGACGGCTTGCCCAAGAACCGT TTCATGCGCAGATATGCTCACCATCGCGGCTCAACAATCTGTTACTTTGGTATTTGCTACACTTTATCATTCATTTATTCATTACTGTATATAATAATGATATAGTTACTTAACAAATTA AACACGACCTAAGTTTGTTTGGGAAGTCTGTCAGTTGGGCCAAGGCCCAACTGGTTTACCTGGTAGCCAGAAATGCAGGCGGCCTGACTACCCCCTGGCACTTAGTCGGAAGGCATTCCA AACTCGGGATAGGCAGAGTGGTAGCCCGTAAGGGCCTAACCGTTAACACGGTGGACTAGTCCACTATGTAGCACCTCGGTGCGTTCCTACCGGGGCCGACCGGATAGCCGATAGGGTTTG AAAATAAGATATATATTTTTGTTTGTTTGAGAAGGTCGCACTCCATATCCATATTAATTAGTATCACAATCAACCTTTCAACCTTATGACCAAGAATTCAAAATTATTAGGGAAATATTC AAAACGCGTGGTCCCGTAAAGAAATTTTGATAGGTTTACTATTATTGGAAACAAACAAGTAGATCTCATCACAATAATGTAATTGGTAAGACTACGTTTTACGTTAACCAAGAATATTTA ATTATATCTTCATATTTTTCAAGAAAATATTGGAGATTAAAAAAAACTTCCTTAGCTTTGACTATAAATCATCTATGAATTTATATAACATGTTTTTTTCCTCTTTCCTTATTGGAATTT CTGAATGATATCATAGGCGCGGGAGGTCCTTCTTGGAGAGTTCCTTTGGGAAGAAGAGACAGCTTACAAGCATTTTTGCAACTCGCTAATGCAAATCTTCCTGGTCCATCCTCCACACTT CCACAACTTAAAGATAGATTTAAAAATGTTGGCCTCAACCGTCCTTCTGATCTCGTAGCTCTTTCCGGTAATTAACAAAAGGATATTACACACCATTTGATATAGTTGTAATCAGCTGAG TTTTTTATTTATTGATATTGATCTTATGGTCTTTCTTTTGTTAGGTGTGGCCACACATTTGGTAAAAACCAGTGCCGGTTTATTATGAACAGACTATACAACTTCAGCAACACCGGTTTA CCCGACCCTTCTCTCAACACTACTTACCTACAAACTCTCCGCGGATTATGTCCCCGTAATGGTAATCTAAGTGCCTTGGTGGATTTTGATCTACGTACACCTACGGTTTTTGACAACAAA TACTATGTGAACCTTGGTGAGCGGAAAGGTCTTATCCAGAGCGACCAAGAATTGTTCTCTAGCCCCAATGCCACGGACACAATCCCTTTGGTGAGATCATATGCTAATAGCACACAAACC TTCTTCAATGCGTTTGTGGAGGCAATGAATAGGATGGGAAATATCACACCTCTCACAGGAACTCAAGGACAAATCAGGTTGAATTGTAGGGTGGTGAATTCCAACTCTCTACTCCATGAT GTGGTTGATATTGTTGACTTTGTTAGCTCTATGTGA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAAGTTCTCTGCTTCTTCTTCTTCTACTTCACTCACTTGGACAACCTTAATCACATTGGGATGTCTTATGCTATATGCCTCTTTGTCCGATGCTCAACTTACCCCTACCTTCTACGAC AATTCATGTCCTAATGTTACTAACATCGTACGAGATACCATTGTCAACGAGTTAAGGTCAGACCCTCGTATCGCCGCGAGCATCCTCCGTCTTCATTTCCACGACTGCTTTGTAAATGGT TGTGACGCATCGATCTTGTTAGACAACACGACATCATTTCGAACAGAGAAAGATGCATTTGGAAACGCAAATTCGGCTCGGGGATTTCCCGTGATTGATAGAATGAAAGCCGCAATAGAG ACGGCTTGCCCAAGAACCGTTTCATGCGCAGATATGCTCACCATCGCGGCTCAACAATCTGTTACTTTGGCGGGAGGTCCTTCTTGGAGAGTTCCTTTGGGAAGAAGAGACAGCTTACAA GCATTTTTGCAACTCGCTAATGCAAATCTTCCTGGTCCATCCTCCACACTTCCACAACTTAAAGATAGATTTAAAAATGTTGGCCTCAACCGTCCTTCTGATCTCGTAGCTCTTTCCGGT GGCCACACATTTGGTAAAAACCAGTGCCGGTTTATTATGAACAGACTATACAACTTCAGCAACACCGGTTTACCCGACCCTTCTCTCAACACTACTTACCTACAAACTCTCCGCGGATTA TGTCCCCGTAATGGTAATCTAAGTGCCTTGGTGGATTTTGATCTACGTACACCTACGGTTTTTGACAACAAATACTATGTGAACCTTGGTGAGCGGAAAGGTCTTATCCAGAGCGACCAA GAATTGTTCTCTAGCCCCAATGCCACGGACACAATCCCTTTGGTGAGATCATATGCTAATAGCACACAAACCTTCTTCAATGCGTTTGTGGAGGCAATGAATAGGATGGGAAATATCACA CCTCTCACAGGAACTCAAGGACAAATCAGGTTGAATTGTAGGGTGGTGAATTCCAACTCTCTACTCCATGATGTGGTTGATATTGTTGACTTTGTTAGCTCTATGTGA |
Retrieve as FASTA
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