The peroxidases and oxidases database
Entry information : SkoPxd02
Entry ID 7622
Creation 2010-10-01 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2010-10-01 (Marcel Zamocky)
Sequence status partial
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2010-10-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: SkoPxd02
Name SkoPxd02
Class Peroxidasin     [Orthogroup: Pxd001]*
Taxonomy Eukaryota Metazoa Hemichordata Enteropneusta Harrimaniidae Saccoglossus
Organism Saccoglossus kowalevskii    [TaxId: 10224 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value SkoPxd02
start..stop		 S start..stop
SpurPxd01 1256 0 1..997 342..1326
SpurPxd01 149 2e-36 2..253 245..500
SpurPxd01 134 7e-32 18..253 159..410
XtPxd 1200 0 1..1055 334..1384
XtPxd 138 3e-33 2..253 239..493
EcabPxd01 1199 0 2..1055 294..1354
EcabPxd01 150 6e-37 2..253 198..452
EcabPxd01 63 0.0000000004 1..93 476..566
CjaPxd01 1194 0 2..1055 440..1500
CjaPxd01 140 1e-33 2..253 344..598
CjaPxd01 64 0.0000000002 1..93 622..712
Literature and cross-references SkoPxd02
DNA ref. GenBank:   NW_003119961.1 (16020..3540)
mRNA ref. GenBank:   XM_002733465
Protein sequence: SkoPxd02
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1055 (306)
PWM (Da):   %s   115993.44 (33628.0)  
PI (pH):   %s   5.45 (8.38) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-325
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
SPAFSYRPED TEVREGESVV LHCSATGYPR PTITWTKSDE IIPNGKTEKF NVSPSGSLQI LNVERNDHGT YECLAANGLD SITAVAQLIV LIPPGFDRRP SDQIAVEGRT IEFICRAYGN  PEPVIAWTKM GNPLPEDRRH TLLPDGTLRI ARVTKDDEGS YECQAINTAG HRQSTANLEV SKRVPPVFLI TPTDLDVVSG SDVQIPCNAN GYPLPTITWS KDGIQISESN KFYINPDGFL  IIRDAGRIDQ GRYxxxxxxx xxxxxxxxxx WYKLQSDFGK LSANTEYPGD NIVNQSINEA IANVDRAFNS TRTSLFDKSK PRTPSDLLTL FKFPTPEAIE IARAAEIFET TLEIIHESVE  NGMRVNLSHV GYKNLFNNIV SPDHLEIIAN LSGCTTHRSA INCSDMCYHQ KYRSYDGTCN NLQHVTRGSA LTAFSRILKP IYENGFNTPV GWNHSQLYYG VSKPSARLVS IHVAASPQVE  NDEKFTHMLM QWGQFTDHDL DLTVLSPSKV QFIDGQRCNE TCDNQPPCFP IPIPEGDPRI VRSTCMEFTR SSAVCGSGST SVFFNTVMPR EQINSITSYI DASNVYGSSK SLTDELRDFA  SERGLLRTGN IVASSGKPLL PFNRNTPIDC LRDENASPVP CFLAGDARAN EQLGLLSMHT IWMRESNRIA TQLLNLNPHW DGETLFQESR KIVGAQMQHI TYTHWLPKIL GPHGMQLMGE  YTGYNPNTDS SIINAFATAA FRFGHGIVNP VIYRLNSTFQ PIPEGNIPLH RAFFSPYRIV DEGGIDPVLR GLFGTPAKDL NSEQVLNTEL TEHLFEMVHH VALDLAALNI QRGRDHALPG  YNDWRVYCNM SAVSSFNELK DEISNADVRD KLERLYHHPG NVDLWVAGMV EDPLPGGILG PTFTCIIAKQ FQRTRDGDRF WYENPGVFTA AQLTQIKQTS LSSVICENSD HINRIQKDVF 
LKATYPTGYL KCEEITAMDL RVWTDCCEDC SNNNDYSVTQ LFRFKKSDKF TPAVDENKIN DKEKTDTQQS MGNAMEHLTD IVTELQQTVQ DLLNQ 

Retrieve as FASTA  
Remarks partial sequence from genomic (chromosome unknown), no EST.
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGTCACCAGC ATTTTCTTAC AGACCAGAAG ATACTGAAGT ACGAGAAGGA GAGAGTGTTG TATTACATTG TAGTGCTACC GGTTACCCAA GACCCACGAT TACATGGACT AAATCGGATG  AAATAATACC TAATGGAAAA ACAGAAAAGT TTAATGTTTC ACCCTCTGGC TCATTACAAA TATTGAATGT AGAACGAAAT GACCATGGTA CATATGAATG TCTGGCGGCT AATGGATTGG  ATAGTATAAC AGCTGTGGCA CAACTCATTG TACTCATTCC ACCTGGCTTT GATCGTAGAC CGTCTGACCA GATTGCAGTA GAAGGAAGAA CTATTGAGTT TATTTGTAGA GCATATGGTA  ACCCTGAACC GGTTATAGCA TGGACCAAGA TGGGTAATCC TCTTCCTGAA GATCGACGTC ACACTTTACT ACCGGATGGC ACACTGAGAA TTGCCAGGGT CACAAAAGAT GATGAAGGTT  CTTATGAATG TCAAGCTATT AATACAGCTG GTCACAGACA AAGTACTGCA AACTTAGAAG TATCTAAAAG AGTGCCACCA GTGTTCTTAA TAACCCCCAC TGACCTTGAT GTTGTGAGTG  GATCTGATGT TCAGATACCA TGTAACGCCA ATGGATATCC TCTACCCACC ATTACATGGA GCAAAGATGG TATACAAATC AGTGAAAGTA ACAAGTTTTA CATAAATCCT GATGGATTTT  TGATTATCAG AGATGCCGGT CGTATTGATC AAGGAAGATA CGnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnTGGTATAA ATTGCAATCT GATTTTGGGA  AATTATCTGC GAATACTGAG TATCCAGGAG ACAACATTGT AAACCAGTCA ATCAATGAAG CCATTGCCAA TGTGGATAGA GCTTTCAACT CGACTAGAAC CTCACTCTTT GATAAATCCA  AGCCAAGAAC ACCAAGTGAT TTATTGACGC TGTTTAAATT TCCAACACCG GAAGCCATTG AGATTGCTAG AGCAGCAGAA ATATTTGAGA CTACTTTAGA AATAATTCAT GAAAGTGTTG  AGAATGGGAT GAGAGTTAAT CTTAGTCATG TGGGATATAA AAATTTGTTT AATAACATAG TGTCCCCGGA TCATCTCGAG ATTATTGCCA ATTTATCTGG TTGTACAACT CATCGCTCTG  CTATCAATTG TTCTGATATG TGTTATCATC AAAAGTATCG CTCTTATGAC GGTACATGTA ATAACTTACA ACATGTCACT AGGGGGTCAG CTCTCACTGC TTTTAGCAGG ATTTTAAAAC  CAATTTATGA AAATGGATTC AACACCCCGG TTGGTTGGAA TCATTCTCAG CTCTATTACG GTGTATCAAA ACCGAGTGCA AGGCTTGTGT CGATACATGT GGCTGCATCA CCTCAAGTAG  AAAATGATGA GAAATTCACT CACATGTTAA TGCAGTGGGG GCAATTCACA GACCATGATT TGGACTTAAC AGTGCTCAGT CCTAGTAAAG TACAATTTAT CGATGGACAG CGATGTAACG  AAACATGTGA TAATCAACCT CCTTGTTTTC CGATACCTAT TCCGGAGGGT GATCCACGGA TAGTACGCAG TACATGTATG GAATTCACTA GATCCAGCGC CGTGTGTGGC AGCGGCAGTA  CATCGGTGTT TTTCAATACA GTCATGCCAC GGGAACAAAT CAACTCAATC ACATCGTATA TCGATGCATC AAATGTTTAT GGGAGCTCTA AAAGCCTAAC CGATGAACTA CGTGACTTCG  CAAGTGAAAG AGGACTTCTT AGGACTGGTA ATATTGTTGC GTCATCTGGC AAGCCGCTTC TCCCATTCAA CAGAAATACA CCAATTGATT GCTTACGGGA TGAGAATGCT AGTCCTGTCC  CTTGCTTCTT AGCTGGTGAT GCTAGAGCCA ATGAACAGTT GGGTTTGCTA TCAATGCATA CAATATGGAT GAGGGAAAGT AATCGTATTG CCACTCAATT ATTAAATCTC AATCCACATT  GGGATGGGGA GACTCTATTT CAGGAATCAC GTAAGATTGT AGGTGCTCAG ATGCAGCACA TCACGTATAC ACACTGGTTG CCTAAAATCC TGGGACCACA TGGTATGCAA CTGATGGGGG  AATACACTGG GTATAACCCC AATACAGATT CTTCTATCAT CAATGCATTT GCTACTGCTG CATTCCGATT TGGACATGGA ATTGTAAATC CTGTCATCTA CCGACTTAAT TCAACTTTCC  AGCCAATACC CGAAGGAAAT ATTCCACTCC ATCGTGCATT CTTTTCGCCA TATCGAATTG TTGATGAGGG CGGTATTGAT CCGGTTCTAC GAGGATTATT TGGTACTCCT GCAAAGGATC  TAAATTCAGA GCAAGTTTTA AACACTGAGC TTACCGAGCA TTTATTTGAG ATGGTACACC ATGTAGCATT AGACCTAGCG GCTTTAAATA TTCAACGTGG ACGTGATCAT GCTCTGCCGG  GCTACAATGA TTGGCGTGTG TATTGTAATA TGTCAGCGGT TAGTTCATTC AATGAATTGA AAGATGAGAT ATCTAATGCG GACGTACGTG ATAAATTGGA AAGATTATAT CACCATCCTG  GCAATGTAGA TTTGTGGGTA GCTGGAATGG TGGAAGACCC TCTTCCTGGT GGAATCCTTG GACCAACGTT TACTTGTATC ATTGCAAAAC AATTTCAAAG AACTCGAGAT GGAGACAGGT  TTTGGTATGA GAATCCTGGT GTGTTTACGG CAGCTCAGTT AACACAAATA AAACAGACAT CATTGTCCAG TGTGATCTGT GAGAATTCAG ATCATATCAA TAGGATACAA AAGGATGTCT  TCCTGAAAGC AACTTATCCT ACAGGCTATC TTAAATGTGA AGAAATTACT GCTATGGATC TTAGAGTGTG GACTGATTGT TGTGAAGACT GCAGCAATAA CAATGATTAT TCTGTAACTC  AACTGTTCAG ATTTAAGAAA TCTGACAAAT TTACACCAGC TGTGGATGAA AATAAAATAA ATGATAAAGA GAAGACAGAC ACTCAGCAAT CAATGGGAAA TGCAATGGAA CATCTCACAG 
ACATAGTGAC TGAATTACAA CAGACTGTAC AAGACCTCTT AAACCAA 

Retrieve as FASTA