The peroxidases and oxidases database
Entry information : CcriRboh (Ccrboh)
Entry ID 7626
Creation 2010-10-06 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2010-10-06 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2010-10-06 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CcriRboh (Ccrboh)
Name (synonym) CcriRboh (Ccrboh)
Class Respiratory burst oxidase homolog    [Orthogroup: Rboh003]
Taxonomy Eukaryota Florideophyceae Gigartinaceae Chondrus
Organism Chondrus crispus    [TaxId: 2769 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CcriRboh
start..stop		 S start..stop
ThasRboh04-1 157 1e-39 4..363 361..763
MtRboh05 150 1e-37 4..369 359..768
PtRboh06 150 2e-37 67..382 382..757
DdNOx01 145 3e-37 49..374 36..386
DdNOx01 58 0.000000007 673..784 388..512
Literature and cross-references CcriRboh (Ccrboh)
Literature Herve,C., Tonon,T., Collen,J., Corre,E. and Boyen,C. NADPH oxidases in Eukaryotes: red algae provide new hints! Curr. Genet. 49 (3), 190-204 (2006).
mRNA ref. GenBank:   DQ131542.1
Protein sequence: CcriRboh (Ccrboh)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   825
PWM (Da):   %s   93089.44 Transmb domain:   %s   i23-45o65-87i116-138o148-170i182-204o524-543i562-584o604-623i630-652o
PI (pH):   %s   7.9
Sequence
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MIPRSKPDVA RPSARIEAYL STHAFKVLFF AFYGAAVTLM FAWGFKAEFT FEDNFDMPHF NTVRWFIGIA RGMGYTLNLN TAFVILLASR LLFTKLRDSP LQLVLPFDAA FPALHIVVGY  TIFFAVLVHG SFHFVWLITW DAWTWGLWSF NMSVITGFLL AIVFGTMLVL ARPSVRKNNF RLFYAVHIIG ATLFFGLLII HGMFRQVPYT YKWVIPPLIL YAIDRFLRRR KVSAVELFLS  AENAVLKDGD ILELRVPKAF SYQAGQYAEV QVPFINREWH PFTIASAPQD KTMCFYIKAL GDWTKELRGA FQARVDGAVT DSLQVNIRGP YGAPAQHVGL YERVVLISGG IGSTPFTSIC  KDLHHRKVKE NATSATGFEP STSTLLKRIE SRVSTAISTL YGVDISNAKD INQEEEEKRV YLANMLNLTA PGSGSSSGET TELEVEMVDA SKQADESSSD SDRSTSMESY NVKNMLRKEQ  DEEYILDDIK NSANARRGNR ERLSHLYEGR SKVLEFLHTS RVNLLLLFVL IARIFFICIS SIIKADYIMI NAEPHAIESG LWIVIVDTVL SIIFAIVLPL TIFLELSYMG SRFFRTVGRT  LDFFVFLPLT ITSASLGIKA LVTERTDEQI VLFLHYIVFL PTLFVLLAVR MYRALGKRTL LTDAPCHCSH RDIVPNVDFV WTVPHENDDE WLRSELEPLA DGTELKLHRY VTRAKEVDME 
AGSEFITSSN TGRPEWDEIF GKIAAEAPSN SVVGVFFCGP HKMGDSVQSA MRRAEINSNL RGAYLRSTKE KTLMKDLGLP QRGLIKMLMG TGCSVRFVFR EENFG 

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Remarks Complete sequence from mRNA.
CDS►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTCCCA GATCCAAGCC CGACGTCGCC CGTCCCAGCG CCCGCATCGA GGCATACCTC TCCACCCACG CATTCAAAGT CCTCTTCTTT GCTTTCTATG GCGCCGCCGT CACCCTCATG  TTCGCTTGGG GTTTCAAGGC CGAGTTCACC TTCGAGGACA ACTTCGACAT GCCCCACTTC AACACCGTCC GTTGGTTCAT CGGCATTGCC CGTGGCATGG GCTACACCCT TAACCTCAAC  ACCGCTTTCG TGATCCTCCT CGCCTCGCGC CTGCTTTTCA CCAAGCTTCG CGACTCACCC CTTCAGCTCG TCCTGCCGTT CGATGCAGCT TTCCCGGCCC TCCACATCGT CGTCGGCTAC  ACCATCTTCT TTGCCGTTCT CGTCCATGGT TCCTTCCATT TCGTCTGGCT CATTACCTGG GATGCCTGGA CTTGGGGCCT CTGGAGCTTC AACATGAGCG TCATCACTGG CTTCTTGCTC  GCCATCGTCT TCGGTACCAT GCTCGTTCTT GCTCGCCCGT CCGTCCGTAA GAACAACTTC CGCCTCTTCT ATGCGGTTCA TATCATCGGC GCCACTCTTT TCTTCGGCCT CCTCATCATC  CACGGTATGT TCCGGCAGGT TCCGTATACC TACAAGTGGG TCATTCCCCC GCTCATCCTC TACGCCATCG ACAGGTTCCT CCGCCGCAGG AAGGTATCCG CTGTCGAACT CTTCCTCTCC  GCTGAGAACG CAGTCCTCAA GGACGGTGAC ATCCTCGAAC TCCGAGTCCC CAAGGCTTTC AGTTACCAAG CCGGTCAGTA CGCAGAGGTC CAGGTCCCCT TCATTAACCG TGAGTGGCAC  CCCTTCACCA TTGCTTCGGC TCCTCAGGAC AAGACTATGT GCTTCTACAT CAAGGCCCTC GGTGACTGGA CCAAGGAGCT CCGCGGCGCC TTCCAAGCGC GTGTTGACGG TGCCGTCACC  GATTCCCTCC AAGTCAATAT TCGCGGCCCG TACGGCGCCC CCGCTCAGCA CGTCGGCCTC TACGAGCGAG TCGTTCTCAT CTCCGGTGGT ATTGGCTCTA CTCCATTCAC CTCTATCTGC  AAGGACTTGC ACCACCGCAA GGTCAAGGAG AACGCTACCA GCGCCACCGG CTTCGAGCCC TCTACCTCCA CTCTGCTCAA GCGCATTGAA TCCCGCGTCA GTACTGCTAT CTCTACTTTG  TACGGTGTGG ACATTTCTAA TGCCAAGGAC ATCAATCAGG AAGAGGAGGA GAAGAGGGTC TACCTCGCCA ACATGCTCAA CTTGACTGCT CCTGGCTCCG GCTCCAGCTC AGGTGAAACC  ACCGAGCTCG AAGTGGAGAT GGTCGATGCC TCCAAGCAAG CTGACGAGTC TTCTTCCGAC TCTGACCGCA GCACCTCGAT GGAGTCTTAC AACGTCAAGA ACATGCTCCG TAAAGAACAG  GATGAGGAAT ACATTCTCGA TGACATCAAG AATTCTGCCA ACGCACGCCG TGGAAACCGT GAACGTCTCT CCCACTTGTA TGAAGGCCGC TCCAAGGTGC TGGAGTTCCT CCATACCTCC  CGCGTCAACC TGCTGCTCCT CTTTGTGCTC ATTGCCCGCA TCTTCTTCAT TTGCATCTCC TCCATCATCA AGGCTGACTA CATCATGATC AACGCCGAGC CGCACGCTAT CGAGTCTGGC  CTCTGGATTG TGATTGTCGA CACTGTACTC AGCATCATCT TCGCCATTGT GCTCCCGCTC ACCATCTTCC TCGAGCTGAG CTACATGGGC TCTCGTTTCT TCCGCACCGT CGGTCGCACA  CTCGACTTCT TCGTCTTCCT CCCGCTCACC ATCACTAGTG CCAGCCTTGG CATCAAGGCT CTCGTCACCG AGCGCACTGA CGAACAAATC GTGCTCTTCC TGCACTACAT CGTCTTCCTG  CCGACGCTTT TCGTCCTCCT TGCTGTTCGC ATGTACCGCG CCCTTGGCAA GAGGACGCTC CTCACTGACG CTCCCTGCCA TTGCTCGCAT CGCGATATCG TCCCCAACGT CGACTTTGTT  TGGACTGTCC CGCACGAGAA TGACGACGAG TGGCTACGCT CCGAACTCGA ACCGCTCGCC GACGGTACTG AGCTCAAGCT CCACCGCTAC GTCACTCGCG CTAAGGAAGT CGACATGGAA  GCCGGCTCTG AATTCATCAC CAGCTCCAAC ACTGGTCGCC CCGAATGGGA TGAGATCTTT GGCAAGATTG CCGCCGAAGC TCCCTCCAAC TCTGTAGTGG GCGTGTTCTT CTGCGGACCT  CACAAGATGG GCGATTCTGT GCAATCAGCG ATGCGCAGGG CTGAGATTAA CAGCAACTTG AGAGGTGCCT ACTTGAGGAG TACTAAGGAG AAGACCTTGA TGAAGGACCT CGGTCTGCCT 
CAGCGAGGGC TTATTAAGAT GCTGATGGGA ACCGGTTGCA GTGTGCGCTT CGTGTTCCGG GAGGAAAACT TCGGCTAA 

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cDNA►
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GACACTCACT CATCTACTCA TTCACTCACT CACTCACTCA CTCACTCACT CACTCAATCC TCACACCCAA CTCACAATGA TTCCCAGATC CAAGCCCGAC GTCGCCCGTC CCAGCGCCCG  CATCGAGGCA TACCTCTCCA CCCACGCATT CAAAGTCCTC TTCTTTGCTT TCTATGGCGC CGCCGTCACC CTCATGTTCG CTTGGGGTTT CAAGGCCGAG TTCACCTTCG AGGACAACTT  CGACATGCCC CACTTCAACA CCGTCCGTTG GTTCATCGGC ATTGCCCGTG GCATGGGCTA CACCCTTAAC CTCAACACCG CTTTCGTGAT CCTCCTCGCC TCGCGCCTGC TTTTCACCAA  GCTTCGCGAC TCACCCCTTC AGCTCGTCCT GCCGTTCGAT GCAGCTTTCC CGGCCCTCCA CATCGTCGTC GGCTACACCA TCTTCTTTGC CGTTCTCGTC CATGGTTCCT TCCATTTCGT  CTGGCTCATT ACCTGGGATG CCTGGACTTG GGGCCTCTGG AGCTTCAACA TGAGCGTCAT CACTGGCTTC TTGCTCGCCA TCGTCTTCGG TACCATGCTC GTTCTTGCTC GCCCGTCCGT  CCGTAAGAAC AACTTCCGCC TCTTCTATGC GGTTCATATC ATCGGCGCCA CTCTTTTCTT CGGCCTCCTC ATCATCCACG GTATGTTCCG GCAGGTTCCG TATACCTACA AGTGGGTCAT  TCCCCCGCTC ATCCTCTACG CCATCGACAG GTTCCTCCGC CGCAGGAAGG TATCCGCTGT CGAACTCTTC CTCTCCGCTG AGAACGCAGT CCTCAAGGAC GGTGACATCC TCGAACTCCG  AGTCCCCAAG GCTTTCAGTT ACCAAGCCGG TCAGTACGCA GAGGTCCAGG TCCCCTTCAT TAACCGTGAG TGGCACCCCT TCACCATTGC TTCGGCTCCT CAGGACAAGA CTATGTGCTT  CTACATCAAG GCCCTCGGTG ACTGGACCAA GGAGCTCCGC GGCGCCTTCC AAGCGCGTGT TGACGGTGCC GTCACCGATT CCCTCCAAGT CAATATTCGC GGCCCGTACG GCGCCCCCGC  TCAGCACGTC GGCCTCTACG AGCGAGTCGT TCTCATCTCC GGTGGTATTG GCTCTACTCC ATTCACCTCT ATCTGCAAGG ACTTGCACCA CCGCAAGGTC AAGGAGAACG CTACCAGCGC  CACCGGCTTC GAGCCCTCTA CCTCCACTCT GCTCAAGCGC ATTGAATCCC GCGTCAGTAC TGCTATCTCT ACTTTGTACG GTGTGGACAT TTCTAATGCC AAGGACATCA ATCAGGAAGA  GGAGGAGAAG AGGGTCTACC TCGCCAACAT GCTCAACTTG ACTGCTCCTG GCTCCGGCTC CAGCTCAGGT GAAACCACCG AGCTCGAAGT GGAGATGGTC GATGCCTCCA AGCAAGCTGA  CGAGTCTTCT TCCGACTCTG ACCGCAGCAC CTCGATGGAG TCTTACAACG TCAAGAACAT GCTCCGTAAA GAACAGGATG AGGAATACAT TCTCGATGAC ATCAAGAATT CTGCCAACGC  ACGCCGTGGA AACCGTGAAC GTCTCTCCCA CTTGTATGAA GGCCGCTCCA AGGTGCTGGA GTTCCTCCAT ACCTCCCGCG TCAACCTGCT GCTCCTCTTT GTGCTCATTG CCCGCATCTT  CTTCATTTGC ATCTCCTCCA TCATCAAGGC TGACTACATC ATGATCAACG CCGAGCCGCA CGCTATCGAG TCTGGCCTCT GGATTGTGAT TGTCGACACT GTACTCAGCA TCATCTTCGC  CATTGTGCTC CCGCTCACCA TCTTCCTCGA GCTGAGCTAC ATGGGCTCTC GTTTCTTCCG CACCGTCGGT CGCACACTCG ACTTCTTCGT CTTCCTCCCG CTCACCATCA CTAGTGCCAG  CCTTGGCATC AAGGCTCTCG TCACCGAGCG CACTGACGAA CAAATCGTGC TCTTCCTGCA CTACATCGTC TTCCTGCCGA CGCTTTTCGT CCTCCTTGCT GTTCGCATGT ACCGCGCCCT  TGGCAAGAGG ACGCTCCTCA CTGACGCTCC CTGCCATTGC TCGCATCGCG ATATCGTCCC CAACGTCGAC TTTGTTTGGA CTGTCCCGCA CGAGAATGAC GACGAGTGGC TACGCTCCGA  ACTCGAACCG CTCGCCGACG GTACTGAGCT CAAGCTCCAC CGCTACGTCA CTCGCGCTAA GGAAGTCGAC ATGGAAGCCG GCTCTGAATT CATCACCAGC TCCAACACTG GTCGCCCCGA  ATGGGATGAG ATCTTTGGCA AGATTGCCGC CGAAGCTCCC TCCAACTCTG TAGTGGGCGT GTTCTTCTGC GGACCTCACA AGATGGGCGA TTCTGTGCAA TCAGCGATGC GCAGGGCTGA  GATTAACAGC AACTTGAGAG GTGCCTACTT GAGGAGTACT AAGGAGAAGA CCTTGATGAA GGACCTCGGT CTGCCTCAGC GAGGGCTTAT TAAGATGCTG ATGGGAACCG GTTGCAGTGT  GCGCTTCGTG TTCCGGGAGG AAAACTTCGG CTAAGGTGCT ACACCACCGA GAAGCCCACT TTAGATTTTG GCTAACTCAC TCACCCTAGC TTGATAGAGA GTCCCGCAAA CACAACAACT 
TTGACAAGAA AATAATAATT TTAGATGAGA CATATACCAA CATTGAGATG TAAATTATTC TGACATTC 

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