The peroxidases and oxidases database
Entry information : PhucoPxd01
Entry ID 7677
Creation 2010-11-02 (Marcel Zamocky)
Last sequence changes 2016-02-16 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-02-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: PhucoPxd01
Name PhucoPxd01
Class Peroxidasin    [Orthogroup: Pxd001]
Taxonomy Fungi/Metazoa; Metazoa; Bilateria; Ecdysozoa
Organism Pediculus humanus corporis (human body louse)    [TaxId: 121224 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value PhucoPxd01
start..stop		 S start..stop
TcasPxd01 1365 0 1..1179 216..1384
AgaPxd01 1355 0 1..1258 207..1496
AaePxd 1347 0 4..1263 203..1518
AaePxd 62 0.000000000838 275..379 189..297
CquPxd01 1343 0 1..1266 85..1339
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 514650..514698 49 N° 2 514439..514556 118 N° 3 514183..514352 170 N° 4 513941..514092 152
N° 5 513727..513847 121 N° 6 512076..512231 156 N° 7 511601..511999 399 N° 8 511214..511489 276
N° 9 510907..511140 234 N° 10 510432..510829 398 N° 11 510192..510369 178 N° 12 509980..510119 140
N° 13 509701..509920 220 N° 14 509283..509627 345 N° 15 509077..509194 118 N° 16 508760..508968 209
N° 17 508527..508672 146 N° 18 508203..508457 255 N° 19 508001..508117 117  
complement(join(508001..508117,508203..508457,508527..508672,508760..508968,5090 77..509194,509283..509627,509701..509920,509980..510119,510192..510369,510432..5 10829,510907..511140,511214..511489,511601..511999,512076..512231,513727..513847 ,513941..514092,514183..514352,514439..514556,514650..514698))


exon

Literature and cross-references PhucoPxd01
Literature Kirkness,E., Hannick,L., Hass,B., Bruggner,R., Lawson,D., Bidwell,S., Joardar,V., Caler,E., Walenz,B., Inman,J., Schobel,S., Galinsky,K., Amedeo,P. and Strausberg R. Annotation of Pediculus humanus corporis strain USDA. (Unpublished since 2008)
Protein ref. GenBank:   XP_002431634.1
DNA ref. GenBank:   DS235854.1 (514698..508001)
mRNA ref. GenBank:   XM_002431589.1
Protein sequence: PhucoPxd01
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   1266 (297)
PWM (Da):   %s   142301.68 (30896.3)  
PI (pH):   %s   7.07 (7.98) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-325
Sequence 1782
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MEGRELATMSEDDFHCRKPEIVEEPRDVEVSFGGSASFHCKVDGDPAPEVIWLRNSNEINANDGRHSILKDGTLMIESTLDEDLGTYECVAKSPLGQIKSKQVRMDKVRTTEGKPHFERTPLDWSANIGDTVQLVCSANGDPRPHISWYFGESHLSNSHKYIEDNGVLIIFNAQPQDAGIYRCTAANSLGVISSVSRLRVNVAPTFSTHPENLTLKSGEMAELVCAADGEPVPSISWYKGGRLLATGGRTYVLGQKLRIEHVKESDSGLYVCRADNRAGQAETTARILVKDYRERLPPKFIHTPYNLDVPAGSTIEIPCKADGEPAPVMVWRKDGNVISESKGHYRLSSHGSLYIHSVSFQDAGTYECSAVNDFGKVVANGVLKVKGKPQPASPGDKFVQKAFEEASRDIDHAVDNTLKTFVHRPRNGPPLSAGELMRLVRFPNAAARQVARAAEVYERTLYLIRKHVESGMKVKPEKDFSYKDILSPEKLTIIANLSGCMIHRPAINCSDMCFHNKYRTIDGTCNNMKHPMWGASLTGFDRILSPVYEDGFSMPVGWTKSIKYHGFSKPSARLISTRLIRTDEITPDDHVTHMLMQWGQFLDHDLDHAIPSVSSESWGGINCKKSCDYAAPCYPIEVPPNDPRVTNRRCIDVVRSSAICGSGQTSVLWADVQPREQINQLTAFIDASVYGFSTDVANILRNFTNDYGRLREGISYPNGKPLLPFAENHPNDCRRDPGESEIECFIAGDIRSNEQIGLLAMHTIWFREHNRIASELRHLNTHWDGDTIYYEARIVGAEMQHITYNHWLPLVLGEKGMEMLGKYKSYDPNISPGISNVFATAALRFGHSLINPVLERLNSSFQPIPEGHLLLQKAFFSPWRLVDEGGVDPLMRGLFTAPAKLKTPTQNLNSELTEHLFEFAHAVALDLAAINIQRGRDHALPEYNAFRKYCNLTVAETFDDLRGEISSQSVRNELEALYGHPGNIDVWVGGILEDQIDGAKVGPTFRCLLVEQFKRLRDGDRFWYENNGVFKPEQLTEIKQSSLARVLCDNGDDIRDVTRNVFVLPRKQGGYLPCAKIPQIDLRFWTECSDCQGPRIFDGISNSISRTRRSSSGSSMVKKRQTNSQMNQLNELNRFYNVQMDDEVNEDRIEGMETVLEEFQKTLKQIKRKMRKLSYQCQMNLNKKNSTQSHGSHHHNQCNDNGHKRINGEHWSKDACTQCVCQEKQITCTKILCPKMICSKPETKPDECCPVCPKDDNKNQ*

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete from genomic (18 introns). No EST found. Strain="USDA". In GenBank annotated as "thyroid peroxidase precursor".
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGAAGGAAGAGAATTGGCAACAATGTCAGAAGATGATTTTCACTGTCGTAAGTTTTTTAATTAATTAATTAATTAATTTCATTGGAAAATCGATTGCGTATTGATGGAATACCCCCGT
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CAAACGACGGTAGGCATTCGATACTTAAAGATGGAACGTTAATGATTGAAAGTACTCTGGACGAAGATTTAGGAACGTACGAATGCGTTGCAAAAAGTCCATTAGGACAAATAAAATCGA
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TTGGAGAATCTCATTTATCCAATTCGCACAAGTACAGAGTTAGTAGTATAGCATCGAATCATTATTATTATTATTATTAAGTCGTGGCACCAGCCGAAAAAAAAAAAAATTAATTTCATC
AAATATTACAGATCGAAGATAATGGAGTTTTAATCATTTTCAACGCGCAACCTCAAGATGCTGGAATATATCGGTGCACGGCAGCAAATTCTTTAGGTGTTATTTCATCTGTGTCACGTC
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AAAAAAAGCAGTAGTAGTAATAATAATAATAATAAATTTAATTATGTGCACACATTCATTTAGTAGCCTTTAGCCAGAAAAAAAAATGAAAAAAAAAAACATTTTATTAAATAAAATTAT
TATTATTATTTTAATTATTCGTTTTTGCTGCGGTTTACATTTTATGTTTTTTTTTAACTAAATTTTTATTAGTCTCTCATTATTATTATTATTATCATCATTATTATTAATATTGTTAGT
GCGGTTTAAAAAAGAAAATAAAATAAAAACTTTTCTTTTTTCTTTTTTTTTTTTCGTCACCTTTTTCACAGTAATAATAAAAGAAAAAAAAAGGAAATTTATAAAGTAAACACTTTTCCC
TCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTCTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTTTTTTTTCTCTCTCTCTTTCTCTTTTTTTTCTCTCTCTCTCTTTATATTTCATCCTCTTTG
TTGTTTTTCCCGGAAATTTTATTTTAATTGCGTTTTTTTTAAATATTGAAAAAATTGAATTTTTTTTTCTTTTCCAAAGCGTACGATTAAAAATAATAATAATAATAATAATAATAATAA
TATTAGCATGAAAATGGTGGGAGGGCTGGATAAGTGGATACATGTTTATGATAATTAAAGGGAGGGGGAGGGGGGGAGACTTTTCCGATCGTAAACGTGCGTGTCATATTTATAATAAAT
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AAAATTAGGGGGAGGGGAGTGAGAGGGAAAAAATACAAATAAAAAAAATAAATTAATAATTTTCCAGTGGCTCCGACATTTTCAACGCATCCGGAAAATTTGACGCTTAAATCTGGTGAA
ATGGCGGAATTAGTTTGTGCTGCTGATGGTGAACCCGTGCCATCGATATCTTGGTACAAAGGTGGAAGATTGTTGGCTACAGGAGGACGAACTTATGTTTTGGGTAATTTTTTTTTGTCC
GCTTTATTTTATTTCGTTTGTTTTTAAATGTTTCATGGATTTTTTTATTTATTTTTCAGGTCAAAAATTAAGGATCGAACACGTTAAAGAATCCGATTCTGGACTTTATGTTTGCAGAGC
GGATAATCGTGCGGGTCAAGCAGAAACGACAGCAAGAATTTTAGTTAAAGATTATCGCGAACGGCTACCACCAAAATTTATTCACACCCCGTATAATTTAGACGTACCTGCAGGTTCGAC
TATTGAAATACCGTGTAAAGCCGATGGAGAACCTGCACCCGTTATGGTTTGGAGAAAAGATGGAAATGTCATATCGGAAAGCAAAGGTCATTATAGATTATCATCACACGGTAGTTTGTA
CATTCATAGTGTGTCTTTTCAAGATGCCGGAACGTACGAATGTTCTGCCGTTAATGATTTTGGAAAAGTTGTTGCCAATGGAGTGCTTAAAGTCAAAGGTCAGCAAAGGATTTTCCTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTATAAACTGAAGCTCGAGACGTGACGAGAAAAAATTGTTTTTAATTTAAAAAAAAAAAAAACAGGAAAACCTCAACCGGCCAGTCCGGGAGATAA
ATTCGTTCAGAAAGCATTCGAAGAAGCTTCAAGAGATATCGATCATGCTGTTGACAACACTTTGAAAACATTCGTTCATCGTCCACGTAACGGTCCTCCTCTTTCAGCCGGCGAATTAAT
GAGATTGGTTAGATTTCCAAACGCTGCAGCACGACAGGTTGCCAGAGCAGCAGAAGTTTATGAGCGTACGCTTTATTTGATAAGAAAACATGTTGAATCTGGAATGAAAGTCAAACCTGA
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GGGGAGCATCACTTACAGGTTTCGATCGTATTCTTAGTCCTGTTTACGAAGATGGATTTTCCATGCCAGTCGGTGAGTAGTAATCATTACAAATACCCCCCAAAAAAAAGGAAAAATTTC
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AGACGATCACGTGACCCACATGCTCATGCAATGGGGACAGTTTTTAGATCACGATTTAGATCACGCGATACCCTCAGTTTCAAGCGAAAGTTGGGGAGGTATAAATTGTAAAAAATCGTG
CGATTATGCAGCACCCTGTTATCCTATCGAAGTACCACCGAACGATCCAAGGGTTACCAACAGAAGATGCATAGACGTTGTCCGATCGAGTGCGATTTGCGGTTCCGGTCAAACTTCCGT
ACTATGGGCCGACGTTCAACCCCGAGAACAAATCAATCAATTGACGGCGTTTATTGATGCTTCCCAGGTACGTATATACGAGCACGAGTTCCAAAGTACGTAGGTACTAAGAAATGAAAT
TAATTTCAGGTTTATGGTTTTTCAACTGACGTCGCAAACATTTTAAGAAATTTCACAAACGATTATGGTCGTTTAAGAGAAGGTATTTCTTATCCGAACGGTAAACCGTTATTGCCATTT
GCCGAAAATCATCCCAACGATTGCAGACGTGATCCTGGAGAAAGCGAAATCGAATGTTTCATAGCAGGTACAAATAAAAGAATTTTTCCCGAAGTGGATTTTTATCCAAATAATCTGATC
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CATTGGGATGGAGATACCATTTATTACGAAGCGAGAAAGGTATGAAAATTATAACAAAAGGCGATGAATTATTTTTTTTAAAATTTTAAAATGTTTAGATTGTAGGAGCCGAAATGCAAC
ACATAACTTACAATCATTGGTTACCCCTGGTTTTGGGAGAAAAAGGTATGGAAATGTTGGGTAAATATAAAAGTTACGATCCAAACATAAGTCCTGGAATATCAAACGTATTTGCAACTG
CTGCGTTAAGGTTCGGACATTCACTTATAAATCCAGTTTTGGAAAGGTTGAATAGTTCGTTTCAACCCATTCCAGAAGGTACAACTCATAAACAACAACACAACACAACGTTTTAGAATT
GTTTTTTAAATTGTTTGTTTTGTTTTTCTAGGACATTTACTTCTCCAAAAGGCATTTTTTTCACCCTGGAGACTCGTCGACGAAGGCGGTGTGGATCCTTTGATGAGAGGACTTTTCACG
GCACCGGCAAAATTAAAAACTCCGACGCAAAATTTAAATTCAGAACTCACGGAACATTTATTTGAATTTGCACATGCCGTGGCATTAGATTTAGCAGCTATTAACATACAGAGAGGAAGA
GATCACGCATTGCCGGAATACAACGCATTTAGAAAATATTGTAATTTGACGGTCGCGGAAACTTTTGACGATTTGAGAGGGGAAATATCGAGTCAAAGCGTTAGAAACGAACTTGAAGCT
TTGTACGGTCATCCAGGTACCAACAGAACAAAAAAAAAAAAAATTATTGTTTATTAAAATCTTCAAAATTTTTTTTTATTTAATTCAAATTTTTTTTTACAAAGGAAATATTGACGTTTG
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AATTTATTCTTTTTAAATGTAAAAATCTCATACGTCACACCCATCTTCTCGTCGCACCCTTTTGAAAAAAAAAAAAATGTTTTTTTTTAGATTTTGGTATGAAAACAATGGAGTTTTCAA
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AAAAAAAAATTTTTTTTCGTATGTAGATTGTCAAGGTCCGAGAATCTTCGATGGTATATCAAATTCAATATCGAGAACGAGAAGATCTTCTTCAGGTTCGTCGATGGTAAAAAAACGTCA
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GGTTCAAATGGATGACGAAGTTAACGAAGATAGAATCGAAGGTATGGAAACGGTTTTAGAAGAATTTCAAAAAACTCTTAAACAAATAAAAAGAAAAATGAGAAAATTATCTTATCAATG
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CGAAAATTCTCTGCCCGAAAATGATTTGTTCGAAACCGGAAACGAAACCGGATGAATGTTGTCCAGTTTGTCCAAAGGATGATAATAAAAATCAGTGA

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CDS►
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CGAGTCAACGTGGCTCCGACATTTTCAACGCATCCGGAAAATTTGACGCTTAAATCTGGTGAAATGGCGGAATTAGTTTGTGCTGCTGATGGTGAACCCGTGCCATCGATATCTTGGTAC
AAAGGTGGAAGATTGTTGGCTACAGGAGGACGAACTTATGTTTTGGGTCAAAAATTAAGGATCGAACACGTTAAAGAATCCGATTCTGGACTTTATGTTTGCAGAGCGGATAATCGTGCG
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TGTAAAGCCGATGGAGAACCTGCACCCGTTATGGTTTGGAGAAAAGATGGAAATGTCATATCGGAAAGCAAAGGTCATTATAGATTATCATCACACGGTAGTTTGTACATTCATAGTGTG
TCTTTTCAAGATGCCGGAACGTACGAATGTTCTGCCGTTAATGATTTTGGAAAAGTTGTTGCCAATGGAGTGCTTAAAGTCAAAGGAAAACCTCAACCGGCCAGTCCGGGAGATAAATTC
GTTCAGAAAGCATTCGAAGAAGCTTCAAGAGATATCGATCATGCTGTTGACAACACTTTGAAAACATTCGTTCATCGTCCACGTAACGGTCCTCCTCTTTCAGCCGGCGAATTAATGAGA
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GATTTTAGCTATAAGGACATTCTATCACCGGAAAAATTGACAATAATAGCAAATCTTTCCGGATGCATGATTCATAGGCCTGCGATAAATTGTTCAGACATGTGCTTTCACAATAAGTAC
AGAACCATCGATGGTACTTGCAACAACATGAAACATCCGATGTGGGGAGCATCACTTACAGGTTTCGATCGTATTCTTAGTCCTGTTTACGAAGATGGATTTTCCATGCCAGTCGGTTGG
ACAAAATCAATAAAATATCACGGATTTTCAAAACCTAGCGCAAGGTTAATTTCAACACGTTTAATACGTACGGATGAAATAACTCCAGACGATCACGTGACCCACATGCTCATGCAATGG
GGACAGTTTTTAGATCACGATTTAGATCACGCGATACCCTCAGTTTCAAGCGAAAGTTGGGGAGGTATAAATTGTAAAAAATCGTGCGATTATGCAGCACCCTGTTATCCTATCGAAGTA
CCACCGAACGATCCAAGGGTTACCAACAGAAGATGCATAGACGTTGTCCGATCGAGTGCGATTTGCGGTTCCGGTCAAACTTCCGTACTATGGGCCGACGTTCAACCCCGAGAACAAATC
AATCAATTGACGGCGTTTATTGATGCTTCCCAGGTTTATGGTTTTTCAACTGACGTCGCAAACATTTTAAGAAATTTCACAAACGATTATGGTCGTTTAAGAGAAGGTATTTCTTATCCG
AACGGTAAACCGTTATTGCCATTTGCCGAAAATCATCCCAACGATTGCAGACGTGATCCTGGAGAAAGCGAAATCGAATGTTTCATAGCAGGTGATATACGTTCGAACGAACAAATCGGA
CTTTTGGCAATGCATACCATTTGGTTTAGAGAACATAATCGTATAGCATCGGAACTACGTCATTTGAACACTCATTGGGATGGAGATACCATTTATTACGAAGCGAGAAAGATTGTAGGA
GCCGAAATGCAACACATAACTTACAATCATTGGTTACCCCTGGTTTTGGGAGAAAAAGGTATGGAAATGTTGGGTAAATATAAAAGTTACGATCCAAACATAAGTCCTGGAATATCAAAC
GTATTTGCAACTGCTGCGTTAAGGTTCGGACATTCACTTATAAATCCAGTTTTGGAAAGGTTGAATAGTTCGTTTCAACCCATTCCAGAAGGACATTTACTTCTCCAAAAGGCATTTTTT
TCACCCTGGAGACTCGTCGACGAAGGCGGTGTGGATCCTTTGATGAGAGGACTTTTCACGGCACCGGCAAAATTAAAAACTCCGACGCAAAATTTAAATTCAGAACTCACGGAACATTTA
TTTGAATTTGCACATGCCGTGGCATTAGATTTAGCAGCTATTAACATACAGAGAGGAAGAGATCACGCATTGCCGGAATACAACGCATTTAGAAAATATTGTAATTTGACGGTCGCGGAA
ACTTTTGACGATTTGAGAGGGGAAATATCGAGTCAAAGCGTTAGAAACGAACTTGAAGCTTTGTACGGTCATCCAGGAAATATTGACGTTTGGGTCGGTGGAATATTAGAAGATCAAATT
GATGGTGCTAAAGTAGGACCAACGTTTAGATGTTTGTTAGTCGAACAATTTAAAAGATTAAGAGATGGCGACAGATTTTGGTATGAAAACAATGGAGTTTTCAAACCTGAACAATTAACC
GAAATAAAACAATCGAGTTTGGCACGAGTTCTTTGCGACAATGGAGACGACATTCGAGACGTTACACGAAACGTGTTTGTTTTACCGAGAAAACAGGGAGGATACCTGCCGTGTGCAAAA
ATACCACAAATCGATTTAAGATTTTGGACGGAATGTTCTCACGATTGTCAAGGTCCGAGAATCTTCGATGGTATATCAAATTCAATATCGAGAACGAGAAGATCTTCTTCAGGTTCGTCG
ATGGTAAAAAAACGTCAAACAAATTCACAAATGAATCAATTAAACGAATTAAATCGATTTTACAATGAGGTTCAAATGGATGACGAAGTTAACGAAGATAGAATCGAAGGTATGGAAACG
GTTTTAGAAGAATTTCAAAAAACTCTTAAACAAATAAAAAGAAAAATGAGAAAATTATCTTATCAATGTCAAATGAATTTAAATAAGAAAAATTCAACTCAGTCTCATGGATCCCATCAT
CACAATCAATGCAACGATAACGGTCATAAAAGAATTAACGGTGAACATTGGTCGAAAGATGCATGCACTCAATGCGTTTGTCAGGAAAAACAAATAACTTGCACGAAAATTCTCTGCCCG
AAAATGATTTGTTCGAAACCGGAAACGAAACCGGATGAATGTTGTCCAGTTTGTCCAAAGGATGATAATAAAAATCAGTGA

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