Entry information : CorAPx06
Entry ID 7716
Creation 2010-11-02 (Qiang Li)
Last sequence changes 2010-11-02 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2010-12-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CorAPx06
Name CorAPx06
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Coleochaetophyceae Coleochaetaceae Coleochaete
Organism Coleochaete orbicularis    [TaxId: 3124 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CorAPx06
start..stop
S start..stop
CscAPx01 535 0 7..272 1..266
CirAPx03 399 7e-142 7..290 1..284
AfiliAPx01 400 8e-142 3..293 2..288
SmAPx02-1_0 400 9e-142 3..290 2..294
Literature and cross-references CorAPx06
Literature R.Timme, C.Delwiche Personal data.
Protein sequence: CorAPx06
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   243
PWM (Da):   %s   26099.25 Transmb domain:   %s   o264-286i
PI (pH):   %s   6.49
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPTPLVVDD AYRKSIEKAR QLLRGLISEK HCAPIMLRLA WHDAGTYDVH TRTGGPNGSI KAEKELNHGA NNGLVIAVQL CESIKEKVPT VSYADLYQLA GVVAVEITGG PSIDYQPGRR  DSLAVPPEGR LPDAKQGAPH LRDIFHRMGL SDQDIVALSG AHTLGRAHKD RSGFEGAWTR EPLKFDNSYF IELLDMESKG LLKLPTDKCL VGDPLFKPIL ERYAKDQDEF FRDYAVSHKK 
LSELGWNNLG KPVGTVEELV SPSTILWQSA AGVAAAAIVV AVSYFYEVRR LAKK 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from EST (corb-Contig816).
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCAA CCCCTCTTGT TGTGGATGAT GCGTACAGGA AGAGCATTGA GAAGGCAAGG CAATTACTGC GGGGCCTCAT TTCTGAGAAA CATTGTGCAC CTATCATGCT ACGACTCGCA  TGGCATGATG CTGGCACCTA CGATGTCCAT ACAAGGACTG GGGGCCCCAA TGGTTCCATC AAGGCTGAGA AAGAACTAAA TCATGGAGCC AACAATGGTC TGGTAATTGC CGTGCAATTA  TGTGAGTCAA TCAAGGAGAA GGTTCCGACT GTTTCATATG CTGACTTGTA TCAGTTGGCT GGAGTTGTCG CCGTGGAAAT CACTGGTGGG CCGTCAATTG ACTACCAACC TGGTCGAAGG  GATTCCCTTG CTGTACCCCC TGAAGGCAGG CTGCCTGATG CTAAACAAGG AGCTCCGCAT CTTCGAGACA TTTTTCACAG AATGGGACTT TCTGACCAGG ACATTGTGGC TCTTTCTGGA  GCACATACTT TGGGCAGAGC TCACAAGGAC CGATCTGGTT TTGAGGGAGC TTGGACACGA GAGCCGCTCA AGTTTGACAA CTCATACTTT ATAGAATTGC TGGACATGGA ATCAAAGGGG  TTGCTGAAGT TGCCCACAGA CAAGTGCCTT GTTGGAGATC CTTTGTTTAA GCCAATTCTG GAGCGCTATG CCAAGGACCA GGACGAATTC TTCCGCGATT ATGCTGTGTC GCACAAGAAA  CTCTCAGAGC TTGGTTGGAA CAACCTTGGT AAGCCAGTCG GCACTGTTGA GGAGCTAGTG AGCCCATCAA CAATCCTCTG GCAAAGTGCC GCTGGAGTGG CTGCAGCCGC AATTGTCGTG 
GCTGTGAGCT ACTTCTATGA GGTTCGGAGG CTTGCAAAGA AGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGTACTTTGC GAAGGCATAA GCGCATTCTA ACTTTGCAAA ATGGCTCCAA CCCCTCTTGT TGTGGATGAT GCGTACAGGA AGAGCATTGA GAAGGCAAGG CAATTACTGC GGGGCCTCAT  TTCTGAGAAA CATTGTGCAC CTATCATGCT ACGACTCGCA TGGCATGATG CTGGCACCTA CGATGTCCAT ACAAGGACTG GGGGCCCCAA TGGTTCCATC AAGGCTGAGA AAGAACTAAA  TCATGGAGCC AACAATGGTC TGGTAATTGC CGTGCAATTA TGTGAGTCAA TCAAGGAGAA GGTTCCGACT GTTTCATATG CTGACTTGTA TCAGTTGGCT GGAGTTGTCG CCGTGGAAAT  CACTGGTGGG CCGTCAATTG ACTACCAACC TGGTCGAAGG GATTCCCTTG CTGTACCCCC TGAAGGCAGG CTGCCTGATG CTAAACAAGG AGCTCCGCAT CTTCGAGACA TTTTTCACAG  AATGGGACTT TCTGACCAGG ACATTGTGGC TCTTTCTGGA GCACATACTT TGGGCAGAGC TCACAAGGAC CGATCTGGTT TTGAGGGAGC TTGGACACGA GAGCCGCTCA AGTTTGACAA  CTCATACTTT ATAGAATTGC TGGACATGGA ATCAAAGGGG TTGCTGAAGT TGCCCACAGA CAAGTGCCTT GTTGGAGATC CTTTGTTTAA GCCAATTCTG GAGCGCTATG CCAAGGACCA  GGACGAATTC TTCCGCGATT ATGCTGTGTC GCACAAGAAA CTCTCAGAGC TTGGTTGGAA CAACCTTGGT AAGCCAGTCG GCACTGTTGA GGAGCTAGTG AGCCCATCAA CAATCCTCTG  GCAAAGTGCC GCTGGAGTGG CTGCAGCCGC AATTGTCGTG GCTGTGAGCT ACTTCTATGA GGTTCGGAGG CTTGCAAAGA AGTAACCAGC GGGCGATTGC TTGTGCAATA GGATGCCAGT  TGTATTGTTT CAAGGTTGTG AGGTTTCCCT CCATTGTGCA CAGTGTCTAG TTTAAGCTCT CTTCAAACTG AGTCCCCTCA TGCTCATTGT ATACTGCATG CAATATGTGG AGCGTCTATT  GAGTCCCATT TGTTTTCGCT GATAATATCT GCCGTGCCAA GCATGCGCAT GCCATGGTTT GCATGCAGCC GTCTCGTCCC CACACCTATG TGCAGCCTGC AATTTGTGCA TGTCAATGGT  TACCTTATGA CATTGTTCCC AATGTTTGGT CAGCCTTCAA GTCCAGAGCT GTGTTTGGTA GTTTGGACAA CTGGACAACT CTCATTAATC TGTCCTTTGC AGCAAAGTCA TACAGTTGTG  AAGCCAGCCA CCCTTCAATG TATTAGTATC ATTTGTCTTT CAGGACTTGC CCCTACCATG GCAACGTTGG ATAGTAATTT GGGAAAAGAA ATCTTGTATT ATTTTTTGTC ACCTGCATGT  CAGCTTGCTG ACTTCACATG TAGGATTGGC GCCACCTTCG CATTTTGTAA AGCTGCCAGC TGAACCATTC CCAAGCATTT TAAAAGTAAC GAAGCTTCAA GTGAACGATG CTCAAGTGCT  TTCCATGGAG TTCTGAAAAG TTCGAAGTCA AACTGGAGAT GATCGCAATG CACCTGTCCA TGATGGGTGT ATTGTTCCAG TGTACATGAT ACCTTTGAAA GTGATTACTT AAGAATTCAA 
ATTCTTCTCT GGAACGATCT CAAATGTGTG AACTGCTGGA GACGGATCTT GTTTGCTCTA TTGAGTTGTG GAACTGTGTT TGCTTGTTTT ATAAAGATTG CAGGCTAAAC TTGAAGGG 

Retrieve as FASTA