Entry information : GgaPOX03 (TPO-like)
| Entry ID | 7969 |
|---|---|
| Creation | 2011-02-02 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-02-03 (Catherine Mathe) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2011-08-12 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: GgaPOX03 (TPO-like)
| Name (synonym) | GgaPOX03 (TPO-like) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Non mammalian vertebrate peroxidase [Orthogroup: POX001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Metazoa Chordata Aves Phasianidae Gallus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Gallus gallus [TaxId: 9031 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '7969' 'join(1..94,1742..1826,6686..6855,9094..9226,13516..13645,16212..16418,22645..23160,30127..30385,30897..31067,32521..32758,34997..35205,35719..35889,39917..40077) ' |
Exons►
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Literature and cross-references GgaPOX03 (TPO-like)
| Literature | Beck V., Roelens S.A., Grommen S.V., Schepens P., Darras V.M. Exposure to PCB 77 inhibits TPO gene expression during the final stages of chicken embryonic development. |
|---|---|
| Protein ref. | UniProtKB: Q2WBI1 [Fragment] |
| DNA ref. | GenBank: NW_001471671.1 (34697366..34737442) |
| mRNA ref. | GenBank: AM167549.1 |
Protein sequence: GgaPOX03 (TPO-like)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (chromo 3). No EST. Sequence from Ensembl ENSGALG00000016370. There exist some discrepancies between NCBI and Ensembl genomic sequences | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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