Entry information : BdiPrx143(Bradi1g20026)
Entry ID 7998
Creation 2011-02-08 (Toky Ramarohetra)
Last sequence changes 2014-01-08 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BdiPrx143(Bradi1g20026)
Name BdiPrx143(Bradi1g20026)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx089]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Brachypodium
Organism Brachypodium distachyon    [TaxId: 15368 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BdiPrx143
start..stop
S start..stop
BdiPrx16 577 0 372..637 1..266
TaPrx63-1A 478 3.12e-166 344..636 65..362
TaPrx124-1D 478 4.77e-166 342..636 82..382
TaPrx63-1D 476 1.21e-165 344..636 64..361
Literature and cross-references BdiPrx143(Bradi1g20026)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_124 (291..1186)
Protein sequence: BdiPrx143(Bradi1g20026)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   637 (617)
PWM (Da):   %s   64542.9 (62406.6)  
PI (pH):   %s   7.34 (7.04) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-637
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKLLVALAV LLVALMGCVA RPCQAGYGYP NPMPPAPGRP NLPPPAQGPK APCHPPPGPR APMRPPPPSS PPPPAPISTP SSPPPAPIST PSPPPPVPIT TPSPPPPAPI SPSSPPPPAP  ISTPSPPPPT LSPPPPAPIS THSPPSPTAS PPPPAPISTP SPPPPAPVST SNPPPPVPIS TPSSLPPTPS PPPPVPISTP SPPPPAPIST PSPPPPAPIS TTSPPPPTPS PPPPAPISTP  GPPPPTPSPP PPAPVSTPSP PPPTPSPPPP APISTPSPPP PTPSLPPPAP ISTPSPPPPT PSPPPPSPIS TPSPPPPTPS PPPPPPSTPS PPLPTPSPLP PQGLTVGHYN NICLQAEAIV  RNAVSAASAG TMAGLIRLFF HDCFIRGCDA SVLLDQTDPN NPPEKLGVPN LTLRGFEVID AASAKILEAC GNVVSCADIL AFASRDATFF LSGRKVDFDM PAGRFDGNVS LASETLPNLP  PPFATVNDLK ANFASKGLTA DEMVTLSGAH TIGVSHCSSF SSRLTSTSDM EPGLKSSLQS QCSSNTGSDN TVSQDLRTPD QLDNQYYKNV LSRQVLFESD AALLTATDTS AAVRANAGDT 
GQWEEKFKAA MVKMGAIEVK SRANGEIRRS CRVVNTR* 

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Remarks Complete sequence from genomic (intron 1).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAGC TGTTGGTCGC GCTGGCCGTG TTGCTGGTCG CGTTAATGGG CTGCGTGGCG CGGCCTTGCC AAGCAGGGTA CGGGTATCCC AACCCGATGC CGCCCGCCCC GGGGAGGCCC  AATCTTCCGC CTCCTGCCCA GGGGCCCAAG GCACCTTGCC ATCCACCACC TGGTCCAAGG GCGCCGATGA GACCTCCGCC GCCAAGCTCT CCCCCACCGC CCGCTCCGAT AAGCACACCC  AGCTCACCGC CACCTGCTCC CATAAGCACA CCCAGTCCTC CGCCCCCTGT CCCAATAACC ACACCAAGCC CTCCGCCTCC TGCCCCGATA AGCCCATCGA GTCCACCGCC ACCCGCACCG  ATAAGCACAC CCAGCCCACC TCCGCCCACA CTCAGCCCTC CACCGCCTGC CCCGATAAGC ACACACAGCC CTCCTTCGCC CACAGCAAGC CCTCCGCCGC CCGCCCCGAT AAGCACACCA  AGTCCACCTC CACCAGCCCC GGTAAGCACG TCCAACCCAC CCCCACCCGT CCCTATAAGC ACACCGAGCT CACTGCCGCC CACACCGAGC CCTCCGCCTC CCGTCCCGAT AAGCACACCC  AGCCCTCCGC CACCCGCCCC AATAAGCACA CCCAGCCCTC CGCCTCCCGC CCCAATAAGC ACCACCAGCC CACCGCCGCC CACACCTAGC CCTCCGCCTC CCGCCCCGAT AAGCACACCG  GGCCCACCTC CGCCGACCCC GAGCCCTCCG CCGCCCGCCC CGGTAAGCAC ACCCAGCCCA CCGCCACCCA CACCTAGCCC CCCGCCGCCC GCCCCGATAA GCACACCGAG CCCACCGCCT  CCCACACCCA GCCTTCCACC TCCCGCCCCA ATAAGCACAC CGAGCCCACC GCCACCCACA CCTAGCCCTC CGCCGCCCTC CCCGATAAGC ACACCGAGCC CACCGCCGCC AACACCTAGC  CCTCCGCCTC CTCCACCATC CACGCCTAGC CCCCCGCTGC CGACCCCGAG CCCACTGCCT CCACAGGGAC TCACCGTCGG CCACTACAAC AATATATGTC TCCAAGCAGA AGCCATTGTC  AGAAATGCTG TCAGTGCGGC TAGCGCCGGC ACCATGGCCG GGCTCATCCG TCTCTTCTTC CATGACTGCT TCATCCGGGT AAGATTTATC TTGCTAATGC ATTTTCATGC ATATGCATGC  AAACAAATAT CACCATATAT ACCGTTGATC GACGGTTGAA CGTTACCTGC AGGGTTGCGA TGCCTCCGTG CTGCTTGACC AGACCGATCC CAACAACCCG CCGGAGAAGC TCGGCGTCCC  AAACCTGACC TTGCGAGGGT TCGAGGTGAT CGACGCGGCC AGCGCCAAGA TCCTGGAGGC ATGCGGCAAT GTCGTCTCAT GCGCCGACAT CCTGGCCTTC GCCAGCCGCG ACGCCACCTT  CTTCCTCAGC GGCAGGAAGG TCGACTTCGA CATGCCTGCC GGCCGCTTCG ACGGGAACGT GTCCTTGGCC AGCGAGACGC TCCCGAACCT GCCGCCGCCA TTCGCCACCG TGAACGACCT  CAAGGCCAAT TTTGCCTCCA AGGGGCTCAC CGCCGACGAG ATGGTCACCC TCTCCGGCGC ACACACCATC GGAGTCTCCC ACTGCTCGTC CTTCTCCAGC CGCCTCACCA GCACTTCCGA  CATGGAACCT GGGCTCAAAA GCTCCCTGCA GAGTCAATGC AGTTCCAACA CCGGCAGCGA CAACACGGTC TCACAAGACT TGAGGACCCC CGACCAGCTG GACAACCAGT ACTACAAGAA  CGTGCTCAGC CGCCAGGTGC TCTTCGAGTC AGACGCCGCG CTCTTGACGG CGACGGACAC AAGCGCGGCA GTGCGCGCCA ACGCCGGGGA CACGGGCCAG TGGGAGGAGA AGTTCAAGGC 
AGCCATGGTG AAGATGGGTG CCATCGAGGT CAAGAGCAGA GCCAACGGCG AGATCAGGAG GAGCTGTCGC GTCGTTAACA CAAGATAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAAGC TGTTGGTCGC GCTGGCCGTG TTGCTGGTCG CGTTAATGGG CTGCGTGGCG CGGCCTTGCC AAGCAGGGTA CGGGTATCCC AACCCGATGC CGCCCGCCCC GGGGAGGCCC  AATCTTCCGC CTCCTGCCCA GGGGCCCAAG GCACCTTGCC ATCCACCACC TGGTCCAAGG GCGCCGATGA GACCTCCGCC GCCAAGCTCT CCCCCACCGC CCGCTCCGAT AAGCACACCC  AGCTCACCGC CACCTGCTCC CATAAGCACA CCCAGTCCTC CGCCCCCTGT CCCAATAACC ACACCAAGCC CTCCGCCTCC TGCCCCGATA AGCCCATCGA GTCCACCGCC ACCCGCACCG  ATAAGCACAC CCAGCCCACC TCCGCCCACA CTCAGCCCTC CACCGCCTGC CCCGATAAGC ACACACAGCC CTCCTTCGCC CACAGCAAGC CCTCCGCCGC CCGCCCCGAT AAGCACACCA  AGTCCACCTC CACCAGCCCC GGTAAGCACG TCCAACCCAC CCCCACCCGT CCCTATAAGC ACACCGAGCT CACTGCCGCC CACACCGAGC CCTCCGCCTC CCGTCCCGAT AAGCACACCC  AGCCCTCCGC CACCCGCCCC AATAAGCACA CCCAGCCCTC CGCCTCCCGC CCCAATAAGC ACCACCAGCC CACCGCCGCC CACACCTAGC CCTCCGCCTC CCGCCCCGAT AAGCACACCG  GGCCCACCTC CGCCGACCCC GAGCCCTCCG CCGCCCGCCC CGGTAAGCAC ACCCAGCCCA CCGCCACCCA CACCTAGCCC CCCGCCGCCC GCCCCGATAA GCACACCGAG CCCACCGCCT  CCCACACCCA GCCTTCCACC TCCCGCCCCA ATAAGCACAC CGAGCCCACC GCCACCCACA CCTAGCCCTC CGCCGCCCTC CCCGATAAGC ACACCGAGCC CACCGCCGCC AACACCTAGC  CCTCCGCCTC CTCCACCATC CACGCCTAGC CCCCCGCTGC CGACCCCGAG CCCACTGCCT CCACAGGGAC TCACCGTCGG CCACTACAAC AATATATGTC TCCAAGCAGA AGCCATTGTC  AGAAATGCTG TCAGTGCGGC TAGCGCCGGC ACCATGGCCG GGCTCATCCG TCTCTTCTTC CATGACTGCT TCATCCGGGG TTGCGATGCC TCCGTGCTGC TTGACCAGAC CGATCCCAAC  AACCCGCCGG AGAAGCTCGG CGTCCCAAAC CTGACCTTGC GAGGGTTCGA GGTGATCGAC GCGGCCAGCG CCAAGATCCT GGAGGCATGC GGCAATGTCG TCTCATGCGC CGACATCCTG  GCCTTCGCCA GCCGCGACGC CACCTTCTTC CTCAGCGGCA GGAAGGTCGA CTTCGACATG CCTGCCGGCC GCTTCGACGG GAACGTGTCC TTGGCCAGCG AGACGCTCCC GAACCTGCCG  CCGCCATTCG CCACCGTGAA CGACCTCAAG GCCAATTTTG CCTCCAAGGG GCTCACCGCC GACGAGATGG TCACCCTCTC CGGCGCACAC ACCATCGGAG TCTCCCACTG CTCGTCCTTC  TCCAGCCGCC TCACCAGCAC TTCCGACATG GAACCTGGGC TCAAAAGCTC CCTGCAGAGT CAATGCAGTT CCAACACCGG CAGCGACAAC ACGGTCTCAC AAGACTTGAG GACCCCCGAC  CAGCTGGACA ACCAGTACTA CAAGAACGTG CTCAGCCGCC AGGTGCTCTT CGAGTCAGAC GCCGCGCTCT TGACGGCGAC GGACACAAGC GCGGCAGTGC GCGCCAACGC CGGGGACACG 
GGCCAGTGGG AGGAGAAGTT CAAGGCAGCC ATGGTGAAGA TGGGTGCCAT CGAGGTCAAG AGCAGAGCCA ACGGCGAGAT CAGGAGGAGC TGTCGCGTCG TTAACACAAG ATAG 

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