Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
334 (305) |
PWM (Da): |
36135.12 (33055.4) |
Transmb domain: |
i7-29o |
PI (pH): |
6.61 (5.93) |
Peptide Signal: |
cut: 30 range:30-334 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MARSSTLSSPTVVALFAAALLFLLHPLNAELTADFYAKTCPDVSSIVQTVIHEALQYDPRITASLLRLHFHDCFVQGCDGSVLLDNSPTIKSEKDAAPNFNSARGFGVVDKIKAAIESTC PETVSCADILALAANASVYLSGGPYWTVLLGRRDSLTANQGLANTSIPSPFESYANLTSKFYVLGLDITDLVTLSGAHTFGRAHCKSFTPRLYNFTKNGGPDPTLSPWYLTALQKLCPPN FNPKVITDLDPTTPNLFDNHYYSNLQKNDGLFETDQELYSTAGAATVPIVNSFSADQSAFFKSFTRSIVNMGNISPLTGSNGEIRCNCRKVNKS* |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Complete sequence from genomic (scaffold_1: 35254008 - 35256987, Egrandis_v1_0.018850m), It very similar to EgraPrx107 (scaffold_1:35,263,534..35,266,207, Egrandis_v1_0.018837m). Correct prediction from phytozome. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCCCGTTCTTCTACTCTTTCGTCACCAACGGTGGTGGCCCTTTTTGCCGCCGCCTTGTTGTTTCTCCTCCATCCATTGAATGCTGAACTAACCGCTGATTTTTATGCAAAGACATGC CCGGACGTGTCCAGCATCGTCCAGACCGTGATTCATGAGGCCCTTCAATATGACCCACGCATCACCGCCAGCCTCCTCCGTCTCCATTTCCACGATTGCTTCGTCCAGAGGTGAGTCCCT ACACTAGATCAATTCCCATTGACAATGAGTTCCAACTTACCGCATTCTTTTTACAGTACTTTCGATCTGATTATCGAGTTATTAGTCACGTAACCTAATGCTTGAGCATGACGTGTTTAA AGGGGTGTGATGGATCGGTATTGCTGGACAATAGCCCAACCATAAAGAGCGAGAAAGATGCTGCTCCGAATTTTAATTCCGCAAGAGGGTTCGGTGTGGTGGACAAGATCAAAGCGGCTA TTGAGAGCACTTGTCCTGAGACTGTGTCTTGCGCTGACATCCTCGCCTTGGCTGCTAACGCTTCCGTTTATTTGTGGTATGTGTCGTTTTAGTCAAAGAAACATAAAACATATTTAAAGT ATACTTAGGATTCATTATTGTCACTTGGCCTACACGAATTATAATTGTGTTTCTCTTGATTATCACATTTATGAAATTGCAGTCAGGAGGTCCATATTGGACGGTGCTCTTGGGGAGGAG GGACAGCTTGACGGCGAACCAAGGACTAGCGAACACATCGATACCCTCCCCTTTTGAGAGCTATGCCAACCTCACTTCCAAGTTCTATGTTTTGGGCTTGGACATCACCGACCTTGTCAC ACTTTCCGCGGTAAAACAGAACAGTTGGACTTGCATTTTGATACGAACATGCAACTACAGATATTGATGCACAAAATAGATTAACAGAGTGAAATGTCGGATTTTTGTCACATAAGTTAT CGGCACAAACATCGCATCACTTTCATTTAGCACATTTCAACTTCCTAATATGATCAAGGTCTCTTCTTCATTGAGATCAACTGACAGGCATGGGCTGTGCATGTGCATGGGCCGTGCCCC GGCAATGCTATCTACTAGAAGGAATTTTAGTCAAGGATTAAGGGTTAAATTTTTTTTTTATCTAAAATTGAATTTAAGTAAAGAATCGTCCTAAAACATGTGATCGACTAAAGTGCATGT GTTGTGCCTAGGCTGTACCTGGGTCGTGCATGGGCTATGCACATTTACTAGAAGGAATTTTGACTGAGGATTAATGATTTCTTTTTTACCAAAAATTGAAAAAGTAAAGGATTGCCCTTC ACTTGAGATCAACTGACGTGCATGCGTTGTGCCTGGGCCATGCCATGTTGTGCATGGGTATATAGATATATTAGAAGGAAGTTTAGCTAAAGGATTAAGGGTTTCTTTTCAATCTAAAAT TGAATAAGTAAAGGATTGCCCCGACTTAATTTCAGGAGTAGTTGTGTATCATCACTACTCTAAAAAAGATAGATTATTTAAAAACAATTTTTTGCATGACCGAGACTTATCTCCTCGGTA AATTCAAAAAGGAGAGGAAGCCGATGATATGCAATTTCATTAAATTAGAAATTATGGGTTCATACATTTGCAGGTCCATAATTTGCTAGTCCTTGATAAAAATGGTAATTCAATAGGGTT AGTTTGATTGAACTGAATGAGTATAGTTAAAATCTCCTTGCGTGGATCCCACTTATCTTTAATTCAAATGGATCTAAATCAAGCCCGTATCAGCAACTCTTTAAGTCTTATCTAGTATAA CTTCTGCTATCAAGACGAAGAAGTGGTCAATGATGACACTTCATCGTTCAATTCATGATGAGGTTCATAGCGTTGAAACCATCGAATTAATGTAATATTTTCTTTGTTGTGATTTGTTTT CAATCAAACTAGTGTACTTTTATGTGTAATTTTTTTATTACAAATTTGAAAAATATATTCGTGTTCAATGGGTAATTTTATATTCCTAATATCATTACAAGAGTATAAATATTGGAGGAG GATGCTATCAAAATTTGCATGCCCCTCACATACTTGTATGAGAAATGCCAAGTATACTGAGGTCATTTGATAGAATCAATAAAATAAGTGATGTCACATATCACTATTATTTATTTATAT TTTTACTAACGAGTGTGTTGCATATGTTTAGTATACAAATTCTATTAAGCATTCCTAGTATTGGTCTATTTATCCACCTTCACAATTGAGCTATGCAGATATTTTGTTCTCTTAGCTAAT TATTCGTGCATATGATAATAAAACAGGAGCTCACACCTTTGGACGTGCACATTGCAAGTCATTCACCCCTAGGCTGTACAACTTCACCAAAAATGGTGGCCCCGATCCCACCCTAAGCCC GTGGTACTTGACGGCTCTCCAGAAACTTTGCCCTCCAAACTTCAATCCTAAAGTCATCACCGACCTCGATCCGACGACCCCGAACTTGTTTGACAACCACTACTACTCCAACCTCCAGAA AAATGACGGGCTTTTTGAGACTGATCAAGAGCTGTACTCGACAGCCGGTGCTGCGACAGTACCCATCGTCAACAGCTTCAGTGCCGACCAGAGTGCCTTCTTCAAGAGCTTCACTCGGTC GATAGTAAACATGGGAAACATAAGTCCTCTCACCGGAAGTAACGGGGAGATCAGGTGCAATTGCAGGAAGGTCAATAAGAGTTGA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCCCGTTCTTCTACTCTTTCGTCACCAACGGTGGTGGCCCTTTTTGCCGCCGCCTTGTTGTTTCTCCTCCATCCATTGAATGCTGAACTAACCGCTGATTTTTATGCAAAGACATGC CCGGACGTGTCCAGCATCGTCCAGACCGTGATTCATGAGGCCCTTCAATATGACCCACGCATCACCGCCAGCCTCCTCCGTCTCCATTTCCACGATTGCTTCGTCCAGGGGTGTGATGGA TCGGTATTGCTGGACAATAGCCCAACCATAAAGAGCGAGAAAGATGCTGCTCCGAATTTTAATTCCGCAAGAGGGTTCGGTGTGGTGGACAAGATCAAAGCGGCTATTGAGAGCACTTGT CCTGAGACTGTGTCTTGCGCTGACATCCTCGCCTTGGCTGCTAACGCTTCCGTTTATTTGTCAGGAGGTCCATATTGGACGGTGCTCTTGGGGAGGAGGGACAGCTTGACGGCGAACCAA GGACTAGCGAACACATCGATACCCTCCCCTTTTGAGAGCTATGCCAACCTCACTTCCAAGTTCTATGTTTTGGGCTTGGACATCACCGACCTTGTCACACTTTCCGGAGCTCACACCTTT GGACGTGCACATTGCAAGTCATTCACCCCTAGGCTGTACAACTTCACCAAAAATGGTGGCCCCGATCCCACCCTAAGCCCGTGGTACTTGACGGCTCTCCAGAAACTTTGCCCTCCAAAC TTCAATCCTAAAGTCATCACCGACCTCGATCCGACGACCCCGAACTTGTTTGACAACCACTACTACTCCAACCTCCAGAAAAATGACGGGCTTTTTGAGACTGATCAAGAGCTGTACTCG ACAGCCGGTGCTGCGACAGTACCCATCGTCAACAGCTTCAGTGCCGACCAGAGTGCCTTCTTCAAGAGCTTCACTCGGTCGATAGTAAACATGGGAAACATAAGTCCTCTCACCGGAAGT AACGGGGAGATCAGGTGCAATTGCAGGAAGGTCAATAAGAGTTGA |
Retrieve as FASTA
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