Entry information : EgrAPx10 ( Eucgr.J00965 / Egrandis_v1_0.024164m)
| Entry ID | 8123 |
|---|---|
| Creation | 2011-02-04 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-12-08 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2016-01-15 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: EgrAPx10 ( Eucgr.J00965 / Egrandis_v1_0.024164m)
| Name (synonym) | EgrAPx10 ( Eucgr.J00965 / Egrandis_v1_0.024164m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Eucalyptus grandis [TaxId: 71139 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8123' 'join(10501325..10501443,10501554..10501728,10501900..10501965,10502765..10502813,10502912..10502997,10503212..10503291,10503386..10503488,10503563..10503621,10503719..10503734)' |
Exons►
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Literature and cross-references EgrAPx10 ( Eucgr.J00965 / Egrandis_v1_0.024164m)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_10 (10501325..10503734) |
|---|
Protein sequence: EgrAPx10 ( Eucgr.J00965 / Egrandis_v1_0.024164m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic. Correct prediction from phytozome. Two other alternative transcript predicted by phytozome (Egrandis_v1_0.024171m (100% identical) and Egrandis_v1_0.024783m (last exon is missing)). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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