Entry information : EgrPrx123 (Eucgr.H01218 / Egrandis_v1_0.023465m)
| Entry ID | 8128 |
|---|---|
| Creation | 2011-02-04 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-02-09 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Qiang Li |
| Last annotation changes | 2012-03-09 (Qiang Li) |
Peroxidase information: EgrPrx123 (Eucgr.H01218 / Egrandis_v1_0.023465m)
| Name (synonym) | EgrPrx123 (Eucgr.H01218 / Egrandis_v1_0.023465m) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Class III peroxidase [Orthogroup: Prx011] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Myrtaceae Eucalyptus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Eucalyptus grandis [TaxId: 71139 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8128' 'complement(join(14643307..14643710,14644062..14644227,14644922..14645113,14645920..14646147))' |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references EgrPrx123 (Eucgr.H01218 / Egrandis_v1_0.023465m)
| DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_8 (14646147..14643307) |
|---|
Protein sequence: EgrPrx123 (Eucgr.H01218 / Egrandis_v1_0.023465m)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from Phytozome (large part of exon 1 is missing). | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
