Entry information : NtPrx42-1A(Nitab4.5_0006899g0020)
Entry ID 8242
Creation 2011-04-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-11 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-23 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx42-1A(Nitab4.5_0006899g0020)
Name NtPrx42-1A(Nitab4.5_0006899g0020)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx42-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx42-1B 631 0 1..316 1..316
LePrx03 598 0 1..316 1..317
StPrx35 573 0 1..310 1..313
CroPrx21 496 2e-179 7..316 3..312
Literature and cross-references NtPrx42-1A(Nitab4.5_0006899g0020)
Protein sequence: NtPrx42-1A(Nitab4.5_0006899g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   316
PWM (Da):   %s   34448.83  
PI (pH):   %s   10.09
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAHLVPLLST LLIFCIYSQG NALSSNYYAK TCPQAEDIVM QVVKKESKKD KTVPAALLRM HFHDCFLRGC DASILLSSKG KNTAEKDAPP NGSMHGFYVI NGAKRAVEAI CPGIVSCADI  LAFAARDAVV LSGGPYWEVP KGRKDGRISR ASETTLLPKP TFNISQLQQS FHQRGLSTDD LVALLGAHTL GFSHCSSFIS RIYNFNATHD IDPTLRRSFA ASLKSICPLK NRAKNAGISN 
DPSPTTFDNT HYRIILQKKS LFSSDHALLT APKTKKLVYK FATSKAAFHK AFANSMIKMS SLTGGQEVRK DCRVVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST (frame shift after QKKS 52 extra t). Uncorrect prediction from SGN (the sequence contains 2 CIII Prx ORFs)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACATT TAGTTCCATT GTTGAGCACA TTGCTTATTT TCTGCATCTA CTCTCAAGGG AATGCACTTA GTTCAAATTA CTATGCAAAA ACATGCCCTC AAGCTGAAGA CATAGTAATG  CAGGTTGTTA AGAAGGAATC AAAGAAAGAC AAAACGGTGC CCGCAGCACT TCTGAGGATG CATTTCCATG ATTGTTTCCT ACGGGTATAC AAATAACATT TAATTTCTTC TATGGTTATC  TTCCTGTGTA GTAGCTAAAC TTTCTTAAAA TATTTCCCTG TTATTGCTAC GCATATTATA TTAGTTATAC TTACCTACTT CCTCCGTTCT ATCTTCTTGA AGGGCTGTGA TGCTTCTATT  TTGTTGAGCT CCAAGGGGAA AAACACTGCA GAAAAAGATG CCCCTCCTAA TGGTTCTATG CACGGATTCT ATGTTATTAA CGGTGCAAAG AGAGCAGTTG AAGCTATATG TCCTGGCATT  GTTTCTTGCG CTGATATTCT AGCGTTTGCT GCAAGAGATG CAGTCGTGTT AGTAAGTACC CCTGCTAGGA AAAAGGACAT AAAAAAGCAT ATAAATAGGT ACTGTAGCCG TAGAATCAGC  CACTAAATGT TTGTATTAGG CTAAGCTGTT TGCATCACAT TACTTGGATG CAACCCTTCC GTAGACCCTG CGTTAACGCG GAATACTTTG TGCACTAGAC TGTCATTATT AACATATGAG  TATAGTAAAT AAGTGCTGCT AAAACTTGCT CAAGATGGCC TAAAAGTGTA GACATATATG GACTACGGCA TACATGTTAA CAAAATCGAA ATTCCATTAA AATCGGTACT CCTAAATTAG  AAACTCCCAA AATAAGGACT AATTGTGTTG ATGTTTCAGT CAGGTGGGCC TTACTGGGAG GTGCCAAAAG GAAGAAAAGA TGGGAGAATA TCCAGGGCAA GTGAAACAAC ACTGCTGCCC  AAACCTACAT TCAACATTTC TCAACTGCAA CAAAGCTTCC ATCAGAGAGG TTTATCAACC GATGATTTGG TGGCTCTTTT AGGTCAACAT ATATAACAAT GCTCCAAAAT TTTCTCGAAT  TAATTTCTTA AATGGTCATC TAACGGCTAT ATATTCTCTT TGACAGGTGC GCACACTTTA GGATTTTCCC ATTGCTCATC CTTTATTAGC CGCATATACA ACTTCAATGC CACACATGAC  ATCGATCCTA CACTACGTCG ATCGTTTGCA GCAAGCTTGA AGAGCATATG TCCACTCAAA AACAGGGCTA AGAATGCAGG AATAAGCAAT GATCCTTCTC CAACGACATT TGATAATACT  CATTACAGGA TAATTCTCCA AAAGAAGAGT TTGTTCTCTT CAGATCATGC TTTGCTCACT GCTCCAAAAA CAAAGAAGCT AGTTTATAAG TTTGCTACCT CAAAAGCAGC TTTTCATAAG 
GCTTTTGCTA ATTCCATGAT TAAGATGAGT AGCCTTACAG GTGGTCAAGA AGTTAGAAAA GATTGCAGGG TAGTAAACTG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCACATT TAGTTCCATT GTTGAGCACA TTGCTTATTT TCTGCATCTA CTCTCAAGGG AATGCACTTA GTTCAAATTA CTATGCAAAA ACATGCCCTC AAGCTGAAGA CATAGTAATG  CAGGTTGTTA AGAAGGAATC AAAGAAAGAC AAAACGGTGC CCGCAGCACT TCTGAGGATG CATTTCCATG ATTGTTTCCT ACGGGGCTGT GATGCTTCTA TTTTGTTGAG CTCCAAGGGG  AAAAACACTG CAGAAAAAGA TGCCCCTCCT AATGGTTCTA TGCACGGATT CTATGTTATT AACGGTGCAA AGAGAGCAGT TGAAGCTATA TGTCCTGGCA TTGTTTCTTG CGCTGATATT  CTAGCGTTTG CTGCAAGAGA TGCAGTCGTG TTATCAGGTG GGCCTTACTG GGAGGTGCCA AAAGGAAGAA AAGATGGGAG AATATCCAGG GCAAGTGAAA CAACACTGCT GCCCAAACCT  ACATTCAACA TTTCTCAACT GCAACAAAGC TTCCATCAGA GAGGTTTATC AACCGATGAT TTGGTGGCTC TTTTAGGTGC GCACACTTTA GGATTTTCCC ATTGCTCATC CTTTATTAGC  CGCATATACA ACTTCAATGC CACACATGAC ATCGATCCTA CACTACGTCG ATCGTTTGCA GCAAGCTTGA AGAGCATATG TCCACTCAAA AACAGGGCTA AGAATGCAGG AATAAGCAAT  GATCCTTCTC CAACGACATT TGATAATACT CATTACAGGA TAATTCTCCA AAAGAAGAGT TTGTTCTCTT CAGATCATGC TTTGCTCACT GCTCCAAAAA CAAAGAAGCT AGTTTATAAG 
TTTGCTACCT CAAAAGCAGC TTTTCATAAG GCTTTTGCTA ATTCCATGAT TAAGATGAGT AGCCTTACAG GTGGTCAAGA AGTTAGAAAA GATTGCAGGG TAGTAAACTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAGAAAAAGA TGCCCCTCCT AATGGTTCTA TGCACGGATT CTATGTTATT AACGGTGCAA AGAGAGCAGT TGAAGCTATA TGTCCTGGCA TTGTTTCTTG CGCTGATATT CTAGCGTTTG  CTGCAAGAGA TGCAGTCGTG TTATCAGGTG GGCCTTACTG GGAGGTGCCA AAAGGAAGAA AAGATGGGAG AATATCCAGG GCAAGTGAAA CAACACTGCT GCCCAAACCT ACATTCAACA  TTTCTCAACT GCAACAAAGC TTCCATCAGA GAGGTTTATC AACCGATGAT TTGGTGGCTC TTTTAGGTGC GCACACTTTA GGATTTTCCC ATTGCTCATC CTTTATTAGC CGCATATACA  ACTTCAATGC CACACATGAC ATCGATCCTA CACTACGTCG ATCGTTTGCA GCAAGCTTGA AGAGCATATG TCCACTCAAA AACAGGGCTA AGAATGCAGG AATAAGCAAT GATCCTTCTC  CAACGACATT TGATAATACT CATTACAGGA TAATTCTCCA AAAGAAGAGT TGTTCTCTTC AGATCATGCT TTGCTCACTG CTCCAAAAAC AAAGAAGCTA GTTTATAAGT TTGCTACCTC  AAAAGCAGCT TTTCATAAGG CTTTTGCTAA TTCCATGATT AAGATGAGTA GCCTTACAGG TGGTCAAGAA GTTAGAAAAG ATTGCAGGGT AGTAAACTGA TGATTGCTCC ATTGTTAATT  AATTCTACTT AGCAGTTTAA TATCTGTATA ATTGTAATTA GATGATCCAG GAAAATGGGT TGTCTATCAC TTCCTATATT GTCTTAGTTT CATTTTATTG ATTATAGTAC TAGGAAAACT 
TA 

Retrieve as FASTA