Entry information : NtPrx32-1B(Nitab4.5_0000273g0080)
Entry ID 8246
Creation 2011-04-11 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-17 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx32-1B(Nitab4.5_0000273g0080)
Name NtPrx32-1B(Nitab4.5_0000273g0080)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx145]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx32-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx32-2B 654 0 1..346 1..346
NtPrx32-1A 642 0 1..346 1..346
StPrx46 547 0 1..346 1..334
LePrx21 546 0 1..346 1..334
Literature and cross-references NtPrx32-1B(Nitab4.5_0000273g0080)
EST ref. GenBank:   FG156034.1 [5' end]   EH665279.1 [Sequencing error]   FG159341.1 [Sequencing error]
Protein sequence: NtPrx32-1B(Nitab4.5_0000273g0080)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (326)
PWM (Da):   %s   37631.62 (35575.6)  
PI (pH):   %s   5.75 (5.81) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-346
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGCGATHLSL ALSLMALALA GISIYKNTHV ATVMEDFDTK IESESNILEQ NSDMLSQDFC IFAAVGSVVA EAIRRERRMG ASLIRLFFHD CFVDGCDGGI LLNDIPGRFQ GEKSSPPNDN  SVRGYEVIDQ AKQRIKNLCP GKAVSCADIL ALAARDSVAL LGGIPYPVRL GRRDARTANF TGSLTQLPAP FDDLNTQLKK FRAKGMSPRE MVALAGAHTI GFARCVTMCD DNNINPAMKS 
TLKCNCPVNN NDTNLVPLDL VTPNFFDKAY YDDLNRNQGL LFSDQVLTGN STTNDFVRSY SNNGFLFLRD FNAAMTKMGD LPPSPGAQLE IRDVCSRVNG NSIADM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 3 ESTs. Uncorrect prediction from SGN (exon 1 is missing)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTGTG GTGCAACTCA TTTGAGCTTG GCACTTAGCC TTATGGCTCT TGCCCTTGCT GGCATCTCTA TATACAAGAA CACACATGTA GCCACAGTTA TGGAAGATTT TGATACGAAA  ATAGAGTCAG AGAGCAATAT TTTGGAGCAA AATTCAGACA TGTTATCTCA GGATTTTTGC ATATTTGCAG CTGTTGGATC AGTTGTGGCT GAAGCCATTA GGAGAGAGAG GCGAATGGGT  GCGTCTCTCA TTCGTCTCTT CTTCCACGAT TGCTTTGTCG ATGTAAGTTC TTTCGTCCTC TTAACATCGA TAGTGTGAAG AATTTTATAA TATCATCATA TTTTACCTTA TTTTAGCTAG  CTGATAACTA CTTTATTTTC AAGTTATCAA TCTCGTATTT TATAAATGGT AAGTTGTAAT AATCTTTCGG ATGAGATGAT AGTATAAGAG CCCGTTTGGC CCTGTCAAAA TCTGCTTATT  TTGAAAAGTA TTTTTTTCAG AAGTACTTTT TTTAGAAGTA CTTTTGAAAA ACACTATTTG TGTTTGGCCA ATTTATTTAA GAAGTATTTT TTTTGCAATA TTTGGTAAAG AAATTGTGTT  TGGCCAATTT TTTAAAAAAG TACTTTTGAG TGTTAAATTA CCAAAAAGAA AGTACCAAGG TCTTATAATT CTTTTAAACA GAAAAATGAA CTTAAATATT TATCGTAAGA GACTTTTATT  ATTATTTTAT TTTATTTAAT TAAAATATAA AATATAAAGT AAACAAATAT ATTACAGATT TAAATCAATT TTACATATAT AGTCATACCA AAGCATATGA TATTATCTAG TATAATTACT  TATTGTTATA TGATGATTTG AATAACTAAA AATACACCAT TCAGTATAAA TTAGAAGTCT GTCCACAAAT TACTATATAT TGATAATCTA TCATGAAATA ATAAGTAAAG TCACTCACAC  ATGATAATAT TTTTCAACAA TTTCATCTCT ACTTCTATCA CACAATGCCT CCATATTAGT AGAAGACTTT CCTGCATTTC TAAAGGAATA TCAGAAGACT CATCTCCTTC ATCAATCTCT  CCAGTATTGT CTTCATTAGC ATAATAGTTG GATTTTTTAT TGGTAGAAGA ATATGTCGTC GGATAAAATT ATGTATAGCC ATGGTAGTTA TAACCAGTGT TTTAAAAGGC GTTGGCGTAA  GGCGAGGCGT TTTACATATG CCTCAGCGGG GCATAAGCCC CGAGGCACGG GGCGTAAGCC CCATAGGTAT TAAATTTTTA ATATTTTATA AAATAATATA ATGACAGTAA ATATTTATAA  ACAGGTAAAA TTGCATAAAA ATTGAAGAAA ATTATATATA TGTGTGCTCC ATTCCCACAA AAACTAATCA AAATAATCTA TTATACGCTA CTTACAAGCA CAAGTAATAT GAGTGTAAAA  GAATAAAGTT TTCTATATGG AAGAACAAAA AGGATAATTA ACCTGCAATT TGAACTTTGA ATTTGCTGCT ATAAAGAAGA ATGTAGTTCT CTTTGTATTT GTAAAAAAAA TTAAATATTC  GTTGCTATTA GGAGATATTA GCAGACTAGC GGACAAGATA AATAATTGAA AAAACCATGA ATTAGGGCTT AAATAAATAA AAAAAGGTTT TGACTTTTAA ATTTAATACT TTTGAGTTCC  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TGGAAATTCG CGATGTCTGC AGCAGGGTCA ATGGGAATTC GATCGCGGAC ATGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGTTGTG GTGCAACTCA TTTGAGCTTG GCACTTAGCC TTATGGCTCT TGCCCTTGCT GGCATCTCTA TATACAAGAA CACACATGTA GCCACAGTTA TGGAAGATTT TGATACGAAA  ATAGAGTCAG AGAGCAATAT TTTGGAGCAA AATTCAGACA TGTTATCTCA GGATTTTTGC ATATTTGCAG CTGTTGGATC AGTTGTGGCT GAAGCCATTA GGAGAGAGAG GCGAATGGGT  GCGTCTCTCA TTCGTCTCTT CTTCCACGAT TGCTTTGTCG ATGGATGTGA TGGGGGTATT CTTCTAAATG ATATTCCCGG AAGATTTCAA GGAGAAAAAT CTTCGCCACC AAATGATAAT  TCAGTAAGAG GTTATGAAGT AATAGATCAG GCTAAACAAA GGATAAAAAA TTTGTGCCCT GGCAAAGCTG TTTCTTGTGC AGATATCCTA GCTCTTGCTG CTCGCGACTC TGTTGCTTTG  CTGGGAGGAA TACCATACCC AGTGCGACTA GGCCGAAGAG ACGCAAGAAC TGCAAATTTC ACAGGCTCAT TAACACAACT TCCTGCACCA TTCGACGATC TCAACACCCA ATTAAAGAAA  TTCCGCGCAA AGGGAATGTC GCCCAGGGAA ATGGTAGCGT TGGCCGGAGC ACATACGATA GGTTTCGCGA GGTGCGTTAC AATGTGTGAC GACAACAATA TCAATCCAGC TATGAAATCA  ACACTAAAGT GTAATTGCCC TGTCAATAAC AACGACACCA ATTTGGTACC ACTAGATTTG GTAACTCCTA ATTTTTTCGA CAAGGCTTAT TACGATGATT TAAACAGGAA TCAGGGACTT  CTTTTTTCGG ACCAAGTGCT TACAGGGAAT AGTACTACTA ATGACTTTGT TAGAAGCTAT AGTAACAATG GTTTTCTTTT CTTACGTGAC TTCAATGCTG CCATGACTAA AATGGGGGAC 
TTGCCTCCCT CTCCTGGTGC TCAATTGGAA ATTCGCGATG TCTGCAGCAG GGTCAATGGG AATTCGATCG CGGACATGTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAAGAAAATC ATCCCAAAAA GCAATTGCTC CTAATTAAAA TCCTCTCTTT AATTCACTTG AATCATGGGT TGTGGTGCAA CTCATTTGAG CTTGGCACTT AGCCTTATGG CTCTTGCCCT  TGCTGGCATC TCTATATACA AGAACACACA TGTAGCCACA GTTATGGAAG ATTTTGATAC GAAAATAGAG TCAGAGAGCA ATATTTTGGA GCAAAATTCA GACATGTTAT CTCAGGATTT  TTGCATATTT GCAGCTGTTG GATCAGTTGT GGCTGAAGCC ATTAGGAGAG AGAGGCGAAT GGGTGCGTCT CTCATTCGTC TCTTCTTCCA CGATTGCTTT GTCGATGGAT GTGATGGGGG  TATTCTTCTA AATGATATTC CCGGAAGATT TCAAGGAGAA AAATCTTCGC CACCAAATGA TAATTCAGTA AGAGGTTATG AAGTAATAGA TCAGGCTAAA CAAAGGATAA AAAATTTGTG  CCCTGGCAAA GCTGTTTCTT GTGCAGATAT CCTAGCTCTT GCTGCTCGCG ACTCTGTTGC TTTGCTGGGA GGAATACCAT ACCCAGTGCG ACTAGGCCGA AGAGACGCAA GAACTGCAAA  TTTCACAGGC TCATTAACAC AACTTCCTGC ACCATTCGAC GATCTCAACA CCCAATTAAA GAAATTCCGC GCAAAGGGAA TGTCGCCCAG GGAAATGGTA GCGTTGGCCG GAGCACATAC  GATAGGTTTC GCGAGGTGCG TTACAATGTG TGACGACAAC AATATCAATC CAGCTATGAA ATCAACACTA AAGTGTAATT GCCCTGTCAA TAACAACGAC ACCAATTTGG TACCACTAGA  TTTGGTAACT CCTAATTTTT TCGACAAGGC TTATTACGAT GATTTAAACA GGAATCAGGG ACTTCTTTTT TCGGACCAAG TGCTTACAGG GAATAGTACT ACTAATGACT TTGTTAGAAG  CTATAGTAAC AATGGTTTTC TTTTCTTACG TGACTTCAAT GCTGCCATGA CTAAAATGGG GGACTTGCCT CCCTCTCCTG GTGCTCAATT GGAAATTCGC GATGTCTGCA GCAGGGTCAA  TGGGAATTCG ATCGCGGACA TGTGAAAAAA GAAAGAAATT TTAAAAAAAT CTTTGAAATT TTCAACTTCT ATTTTCCTAA ATAAACAACG TATGGCTGAC TTCTTGAATG ATAATCTTTT  CAGTGCTGTT GTGATTATGC TCGTCTTGAG CGGAGAATCT ATCAGAAATT GTCTCTTTAT CTTTATAAGA TAGGGGTAAA GTTCACAGAC TCTATTTGTA GTATTACACT GGGTTAATTT 
ATTGTTATTA TTGTTGTTGT ATGTCCATTG CCTTCTATAT GTACCTTTGT ATTTTGTTAT ACATGTAATA CAAAATAACG GAAATGTCCT TGTCCATGGA CCGTGGACGC ACTATCTTA 

Retrieve as FASTA