Entry information : NtPrx45-1A(Nitab4.5_0000832g0040)
Entry ID 8258
Creation 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx45-1A(Nitab4.5_0000832g0040)
Name NtPrx45-1A(Nitab4.5_0000832g0040)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx033]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx45-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx45-1B 630 0 1..323 1..323
LePrx34 556 0 1..323 1..317
StPrx74 555 0 1..323 1..317
CroPrx34 523 0 11..323 5..317
Literature and cross-references NtPrx45-1A(Nitab4.5_0000832g0040)
Protein sequence: NtPrx45-1A(Nitab4.5_0000832g0040)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (166)
PWM (Da):   %s   35165.69 (17275.8)  
PI (pH):   %s   7.99 (5.21) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-185
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPLSLQIIF SATIFLLLLT ISQSNATLGA NYYDQTCPQA EDIIYQAVRN ASSYDPKVPA RLLRMFFHDC FIRGCDASVL LDSTPGNKAE KDGPPNVSLR AFYVIDDAKT KLEKSCPRTV  SCADIVAIAA RDVVAMSGGP HWNVLKGRKD GRISRANETI NLPAPSFNTS QLIQSFAKRG LGMKDLVALS GGHTLGFSHC SSFEARLHNF SAVHDTDPSL NAVFAESLKK NCPKPNRDSN 
AGQFLDPTSL VFDNNYYKQI VAGKGVFASD QSLLNDYRTG WIVKAFANDQ ASFFWEFAAS MVKLGNVGVQ EDGEVRLNCR AVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Uncorrect predcition from SGN (splicing error intron 2)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TGTCTCTCCA GATAATCTTT TCTGCAACCA TATTTCTTCT TTTGTTAACA ATCTCTCAGT CCAACGCAAC TCTTGGAGCT AACTACTATG ATCAAACATG TCCTCAAGCT  GAAGATATTA TCTATCAAGC TGTTCGCAAC GCTTCGTCTT ATGATCCTAA AGTCCCAGCA CGTCTTCTGA GGATGTTCTT TCATGATTGT TTCATTAGAG TACTCTCTCG CCCTCTCTCT  CTACATATGT ATGTGTCTTG TTTGCACATA ATGCAAGTCA ATTATCATTA CACACTGTTT TGTTAATGAT TACAGGGATG TGATGCATCT GTTCTATTGG ACTCAACTCC AGGAAACAAA  GCAGAGAAAG ATGGTCCGCC CAACGTCTCT CTTAGAGCCT TCTACGTGAT TGATGATGCC AAAACTAAGC TCGAAAAGTC TTGCCCAAGA ACTGTTTCTT GTGCTGATAT AGTTGCCATT  GCAGCTAGAG ACGTCGTGGC TATGGTACGT AGTACATCAT CCTCCCTATT AAATAAAAGA TTTAACTTAT ACACACTTAC ACCATCAATA ACATGCTATA GCAGGTATCC GTCTTATTTT  CAAGATTACT AATCGTGCAT TTTTCCAATC AAGCTCATAA ATACGTCATG TTTGACAATT TTGTAGTCTG GAGGTCCACA TTGGAACGTA CTAAAAGGAA GGAAAGATGG GAGAATATCA  AGGGCAAATG AGACAATCAA CTTACCAGCT CCATCATTTA ACACGAGCCA ACTCATTCAA AGCTTTGCCA AGAGGGGATT GGGAATGAAA GATTTGGTTG CTCTCTCTGG TGGACATACA  CTTGGATTTT CACACTGCTC TTCTTTTGAA GCCAGGCTTC ATAACTTCAG CGCAGTGCAT GACACTGACC CAAGCTTGAA CGCAGTATTT GCAGAGAGCC TAAAGAAGAA CTGCCCCAAA  CCAAACAGAG ATAGCAATGC AGGACAATTC TTGGACCCAA CTTCATTAGT GTTCGACAAC AACTATTACA AGCAAATTGT TGCAGGCAAA GGTGTTTTTG CATCAGACCA GAGTTTGTTG  AATGACTATA GGACTGGTTG GATTGTTAAA GCATTTGCCA ATGACCAAGC TTCGTTTTTC TGGGAGTTTG CGGCATCAAT GGTCAAGCTC GGAAATGTTG GTGTTCAAGA AGATGGTGAA 
GTTAGACTCA ACTGCAGAGC TGTTAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TGTCTCTCCA GATAATCTTT TCTGCAACCA TATTTCTTCT TTTGTTAACA ATCTCTCAGT CCAACGCAAC TCTTGGAGCT AACTACTATG ATCAAACATG TCCTCAAGCT  GAAGATATTA TCTATCAAGC TGTTCGCAAC GCTTCGTCTT ATGATCCTAA AGTCCCAGCA CGTCTTCTGA GGATGTTCTT TCATGATTGT TTCATTAGAG GATGTGATGC ATCTGTTCTA  TTGGACTCAA CTCCAGGAAA CAAAGCAGAG AAAGATGGTC CGCCCAACGT CTCTCTTAGA GCCTTCTACG TGATTGATGA TGCCAAAACT AAGCTCGAAA AGTCTTGCCC AAGAACTGTT  TCTTGTGCTG ATATAGTTGC CATTGCAGCT AGAGACGTCG TGGCTATGTC TGGAGGTCCA CATTGGAACG TACTAAAAGG AAGGAAAGAT GGGAGAATAT CAAGGGCAAA TGAGACAATC  AACTTACCAG CTCCATCATT TAACACGAGC CAACTCATTC AAAGCTTTGC CAAGAGGGGA TTGGGAATGA AAGATTTGGT TGCTCTCTCT GGTGGACATA CACTTGGATT TTCACACTGC  TCTTCTTTTG AAGCCAGGCT TCATAACTTC AGCGCAGTGC ATGACACTGA CCCAAGCTTG AACGCAGTAT TTGCAGAGAG CCTAAAGAAG AACTGCCCCA AACCAAACAG AGATAGCAAT  GCAGGACAAT TCTTGGACCC AACTTCATTA GTGTTCGACA ACAACTATTA CAAGCAAATT GTTGCAGGCA AAGGTGTTTT TGCATCAGAC CAGAGTTTGT TGAATGACTA TAGGACTGGT  TGGATTGTTA AAGCATTTGC CAATGACCAA GCTTCGTTTT TCTGGGAGTT TGCGGCATCA ATGGTCAAGC TCGGAAATGT TGGTGTTCAA GAAGATGGTG AAGTTAGACT CAACTGCAGA 
GCTGTTAACT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTTATTGAG TGACTTGAAA GTATTAAATC TCCATGCACC AAACATGAAA ATTGCTGTTT GTTTATTGCC TCATTCCGAG CTATATATAC CCAAACCTGT TGCACGACTA TCGCATCATC  CTTCTAAATT GTAATTAAGT CATTAATTAT ATACAATTCA TCAGCTTAAT CTTCTTCAAG TGTAGTGTCC AATGGCTCCT TTGTCTCTCC AGATAATCTT TTCTGCAACC ATATTTCTTC  TTTTGTTAAC AATCTCTCAG TCCAACGCAA CTCTTGGAGC TAACTACTAT GATCAAACAT GTCCTCAAGC TGAAGATATT ATCTATCAAG CTGTTCGCAA CGCTTCGTCT TATGATCCTA  AAGTCCCAGC ACGTCTTCTG AGGATGTTCT TTCATGATTG TTTCATTAGA GGATGTGATG CATCTGTTCT ATTGGACTCA ACTCCAGGAA ACAAAGCAGA GAAAGATGGT CCGCCCAACG  TCTCTCTTAG AGCCTTCTAC GTGATTGATG ATGCCAAAAC TAAGCTCGAA AAGTCTTGCC CAAGAACTGT TTCTTGTGCT GATATAGTTG CCATTGCAGC TAGAGACGTC GTGGCTATGT  CTGGAGGTCC ACATTGGAAC GTACTAAAAG GAAGGAAAGA TGGGAGAATA TCAAGGGCAA ATGAGACAAT CAACTTACCA GCTCCATCAT TTAACACGAG CCAACTCATT CAAAGCTTTG  CCAAGAGGGG ATTGGGAATG AAAGATTTGG TTGCTCTCTC TGGTGGACAT ACACTTGGAT TTTCACACTG CTCTTCTTTT GAAGCCAGGC TTCATAACTT CAGCGCAGTG CATGACACTG  ACCCAAGCTT GAACGCAGTA TTTGCAGAGA GCCTAAAGAA GAACTGCCCC AAACCAAACA GAGATAGCAA TGCAGGACAA TTCTTGGACC CAACTTCATT AGTGTTCGAC AACAACTATT  ACAAGCAAAT TGTTGCAGGC AAAGGTGTTT TTGCATCAGA CCAGAGTTTG TTGAATGACT ATAGGACTGG TTGGATTGTT AAAGCATTTG CCAATGACCA AGCTTCGTTT TTCTGGGAGT  TTGCGGCATC AATGGTCAAG CTCGGAAATG TTGGTGTTCA AGAAGATGGT GAAGTTAGAC TCAACTGCAG AGCTGTTAAC TGAGAAACCG GCCTTCCATT AGTGAAGTAT GTTTGAAAAT  GAGTGTTTTG CGTACCCTTG TTTGTTTGTT TTCCCTAGTT AATAATTCTC TAAATTGTGA GGCTTGATGC AGAGGTAGCA TAGGAAGAAT AACTTCATCG CAATGTTAAA TGTTGTTCAT 
ATCTCTTCTT TTGGTTTGTA TTGAATAAAC ATGAACTAAT TTCTTTTCAA A 

Retrieve as FASTA