Entry information : NtPrx45-1B(Nitab4.5_0004911g0010)
Entry ID 8259
Creation 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-19 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx45-1B(Nitab4.5_0004911g0010)
Name NtPrx45-1B(Nitab4.5_0004911g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx033]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx45-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx45-1A 630 0 1..323 1..323
StPrx74 552 0 1..323 1..317
LePrx34 546 0 1..323 1..317
PpePrx62 525 0 8..323 9..324
Literature and cross-references NtPrx45-1B(Nitab4.5_0004911g0010)
Protein sequence: NtPrx45-1B(Nitab4.5_0004911g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (124)
PWM (Da):   %s   35285.86 (12924.5) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   8.06 (6.49) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-147
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAPLSLHIIF STTIFLLLLT ISPSKATLEA HYYDQTCPQA EDIIYQVVRN ASSYDPKVPA RLLRMFFHDC FIRGCDASVL LDSTPGNKAE KDGPPNISLR AFYVIDDAKT KLEKACPRTV  SCADIVAIAA RDVVAMSGGP HWNVLKGRKD GRISRANETI NLPAPSFNTS QLIQSFAKRG LGVKDLVALS GGHTLGFSHC SSFEARLRNF SSVHDTDPSL NAVFAESLKK NCPKPNRDSN 
AGQLLDTTSS VFDNNYYKQI VAGKGVFASD QSLLNDYRTG WIVTAFANDQ SSFFWEFAAS MVKLGNVGVQ ENDEVRLNSR AVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Uncorrect predcition from SGN (splicing error intron 1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TGTCTCTCCA CATAATCTTT TCTACAACCA TATTTCTTCT TTTGTTAACA ATCTCTCCGT CTAAAGCAAC TCTTGAAGCT CATTACTATG ATCAAACATG TCCTCAAGCC  GAAGATATTA TCTATCAAGT TGTTCGCAAC GCTTCGTCTT ATGATCCTAA AGTCCCAGCA CGTCTTCTGA GGATGTTCTT CCATGATTGT TTCATTAGAG TACTACTCTC TCACCCTCTC  TCTCTCTCTA CATATATTGT GTCTTGTTTG CACATAATGC AAGTCAATAT ATTATCACGA ACTGTTTTGT TAATGATTAC AGGGATGTGA TGCATCAGTT TTGTTGGACT CAACACCAGG  AAACAAAGCA GAGAAAGATG GTCCTCCTAA CATCTCTCTT AGAGCCTTCT ACGTGATTGA TGATGCCAAA ACTAAGCTCG AAAAGGCTTG CCCAAGAACT GTTTCTTGTG CTGATATAGT  TGCCATTGCA GCTAGAGACG TCGTGGCTAT GGTAGGTAGT CCATCATCCT CTCAATTATA TACGGTCAGA CCTCTTTATA ACAGCTAGTT ATTCACTATA AAAGTCAAGT TTTTTATAAA  ACCTATATTA ATACTATGTT ATAATATATG TTCTCTACAA CAACACTTCG TTATCTATAT CTATATTATT ATAATTAACG TAGCCTACCA AGTCTACAAA GTCGATTTTC TAATACTGAA  GTAAATCCAC GCTGAATGAC ATTGTAATAT TCAATACCTT TGCCTAATAT TAAAGGCCGA ATTCAACTAA ATTTTGCATA TATTTACGTT TATTTAATAA ACTTTTTCCT TTCCTTATTT  TATTGAATTG AAACATATAT ATATTCTTCT GGACCAGAAA ACCCATATAT TATTCTCATC TATCTAACCT ATATTATTAT TATTATCATT ATTATTATTA TTATTATTAT TATTATTATT  ATTATTATTA TTATTATTAT TATTATTATT ATTACTACTA CTACTACTAC TACTACTTTA AAAGTTGCTT GTTGTACTTT GTTCATATTC TTTAATAATA ATCACTTTAT AAAACTGGAT  GTTACGTGTT TCATAATTTG TAATGCAAGA CATATTCGTG CAAAGCACGA ACATAGAGAC TAGTATTATA TTAAAAGCAC GAAGCTCCTT AGCGAAATGT CATTTGCGTT TTTTACCCTT  TAAAATTAGA GTTCAGACTA GATAAAATAG TCTTTTAATT ATTATCCTAA TATTTAGGAA TAGTCATTTA ATTATTTTCC TAATATTTAG GAATAATCAT TTAATTATTT TCCTAATATT  TAGGAATAGT CATTTAATTA TTTTCCTAAT ATTTAGGAAT AATCATTTAA TTATTTTTCT AATATTTGGG ACTTTCAAAT TAAATTAAAT TGTCTATATT AAATCTCTTC TTATTCGAAC  TATTTAAAAT TTTAAAATTA AGAAAGATTT ATGAAAACTT TTCATATTTG AATTATATAT ATTAGGACCT TAAAATCAAA ATAAATTATA TATTATATAG AAATATCACG TTAACATATA  GTTTATTTTT TATATATAAC ATACGATTCG ACTGATTTGG TAATTTGCCA TCTTTTTGTC CCATGGTGTA CCAAAATCCA AGGATAGCAT GATTTTCGCT ATGGGTATAA GTAGAAATTT  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CAATGGTCAA GCTTGGAAAT GTTGGTGTTC AAGAAAATGA TGAAGTTAGA CTCAACAGCA GAGCTGTTAA CTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCCTT TGTCTCTCCA CATAATCTTT TCTACAACCA TATTTCTTCT TTTGTTAACA ATCTCTCCGT CTAAAGCAAC TCTTGAAGCT CATTACTATG ATCAAACATG TCCTCAAGCC  GAAGATATTA TCTATCAAGT TGTTCGCAAC GCTTCGTCTT ATGATCCTAA AGTCCCAGCA CGTCTTCTGA GGATGTTCTT CCATGATTGT TTCATTAGAG GATGTGATGC ATCAGTTTTG  TTGGACTCAA CACCAGGAAA CAAAGCAGAG AAAGATGGTC CTCCTAACAT CTCTCTTAGA GCCTTCTACG TGATTGATGA TGCCAAAACT AAGCTCGAAA AGGCTTGCCC AAGAACTGTT  TCTTGTGCTG ATATAGTTGC CATTGCAGCT AGAGACGTCG TGGCTATGTC TGGAGGTCCA CATTGGAACG TACTAAAAGG AAGGAAAGAT GGGAGAATAT CAAGGGCAAA TGAAACAATT  AACTTACCAG CTCCATCATT CAACACGAGC CAATTGATTC AGAGCTTTGC CAAAAGGGGA TTGGGAGTGA AAGATTTGGT TGCTCTCTCT GGTGGACACA CACTTGGATT TTCACACTGC  TCTTCTTTTG AAGCCAGGCT TCGTAACTTC AGCTCAGTGC ATGACACTGA TCCCAGCTTG AATGCAGTGT TTGCAGAGAG CCTAAAGAAG AACTGCCCGA AACCAAATAG AGATAGCAAT  GCAGGACAGT TGTTGGACAC AACTTCATCA GTGTTCGACA ACAACTATTA CAAGCAAATT GTTGCAGGCA AAGGTGTTTT TGCATCAGAC CAGAGTTTGC TGAATGACTA TAGGACTGGT  TGGATTGTTA CAGCATTTGC CAATGACCAA TCTTCCTTCT TCTGGGAGTT CGCGGCTTCA ATGGTCAAGC TTGGAAATGT TGGTGTTCAA GAAAATGATG AAGTTAGACT CAACAGCAGA 
GCTGTTAACT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAATTTCCTA AGGCTTCCCT CTTTTATTGA GTGACTTGAA AGTATTAAAT CTCCATGCAC CAAACACGAA AATTGCTGTT TGTTTATTGC CTCATTCCCA GCTATATATA CCCAATCCTG  TTGCACTATA TATCATATCA TTGTAATTAA ACCCTTAACA TCTACAACTC ATCAGCTTAA TCTTCTTCGA GTTTAGTGTC CAATGGCTCC TTTGTCTCTC CACATAATCT TTTCTACAAC  CATATTTCTT CTTTTGTTAA CAATCTCTCC GTCTAAAGCA ACTCTTGAAG CTCATTACTA TGATCAAACA TGTCCTCAAG CCGAAGATAT TATCTATCAA GTTGTTCGCA ACGCTTCGTC  TTATGATCCT AAAGTCCCAG CACGTCTTCT GAGGATGTTC TTCCATGATT GTTTCATTAG AGGATGTGAT GCATCAGTTT TGTTGGACTC AACACCAGGA AACAAAGCAG AGAAAGATGG  TCCTCCTAAC ATCTCTCTTA GAGCCTTCTA CGTGATTGAT GATGCCAAAA CTAAGCTCGA AAAGGCTTGC CCAAGAACTG TTTCTTGTGC TGATATAGTT GCCATTGCAG CTAGAGACGT  CGTGGCTATG TCTGGAGGTC CACATTGGAA CGTACTAAAA GGAAGGAAAG ATGGGAGAAT ATCAAGGGCA AATGAAACAA TTAACTTACC AGCTCCATCA TTCAACACGA GCCAATTGAT  TCAGAGCTTT GCCAAAAGGG GATTGGGAGT GAAAGATTTG GTTGCTCTCT CTGGTGGACA CACACTTGGA TTTTCACACT GCTCTTCTTT TGAAGCCAGG CTTCGTAACT TCAGCTCAGT  GCATGACACT GATCCCAGCT TGAATGCAGT GTTTGCAGAG AGCCTAAAGA AGAACTGCCC GAAACCAAAT AGAGATAGCA ATGCAGGACA GTTGTTGGAC ACAACTTCAT CAGTGTTCGA  CAACAACTAT TACAAGCAAA TTGTTGCAGG CAAAGGTGTT TTTGCATCAG ACCAGAGTTT GCTGAATGAC TATAGGACTG GTTGGATTGT TACAGCATTT GCCAATGACC AATCTTCCTT  CTTCTGGGAG TTCGCGGCTT CAATGGTCAA GCTTGGAAAT GTTGGTGTTC AAGAAAATGA TGAAGTTAGA CTCAACAGCA GAGCTGTTAA CTGAGAAACC GGCCTTACAT TTGTTGTGTG  TGTTTGAAAA TGAGTGTTTT TTGGACCCTT GTTTGTTTGT TTGTTTGCTT GCTTTTCATG GTTAATAATT CTCTCAATTG TGAGGCTTAA TGCAGAGGTA GCACAGGAAG AATAACTTCA 
TTATCTCTCC TTTTGGTTGT ATTGAATAAA CATGAACTAA CTTCTTTTC 

Retrieve as FASTA