Entry information : NtPrx53-1A(Nitab4.5_0004428g0020)
Entry ID 8274
Creation 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx53-1A(Nitab4.5_0004428g0020)
Name NtPrx53-1A(Nitab4.5_0004428g0020)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx004]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type All tissues
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx53-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx53-1B 658 0 1..327 1..327
StPrx13 584 0 10..327 5..325
LePrx102 583 0 10..327 8..328
IaquPrx62 531 0 4..327 2..329
Literature and cross-references NtPrx53-1A(Nitab4.5_0004428g0020)
EST ref. GenBank:   FS373282.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx53-1A(Nitab4.5_0004428g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (180)
PWM (Da):   %s   36061.57 (19550.4)  
PI (pH):   %s   8.97 (9.02) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:22-201
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATSKFANCC FLISLIFFAF ASNHANGKEL KVGFYHKNCP HLELIVKEVI DDVISRVPSL AAPLLRMHFH DCFVRGCDGS VLLNSPTKQA EKNAIPNLSL RGFQIIDKVK TAVEKYCPGI  VSCADIVALV ARDVTVAVKG PFWEVETGRR DGRVSNITEA LFNLIPPFAN ITSLKQGFLQ RGLSVKDLVV LSGSHTIGIS HCSSFNNRLY NFTGKGDTDP SLDPNYIKRL KMKCSPTDQN 
SIVEMDPGSV RTFDTSYYNL VAKRRGLFTS DSALLDDKET KGYLKEQALN HGSTFFKDFG ESMVKMGRIQ VLTGTQGEIR KVCTKIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 2)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAACCT CAAAATTTGC AAATTGTTGT TTCTTGATTT CATTGATCTT CTTTGCATTT GCTTCAAACC ATGCAAATGG GAAAGAACTC AAAGTAGGTT TTTACCACAA AAATTGTCCT  CATCTCGAGT TGATAGTCAA GGAAGTTATT GATGATGTTA TTTCCAGAGT CCCCAGTCTC GCTGCTCCTT TGTTGAGAAT GCACTTTCAT GATTGTTTCG TTAGGGTATG CATGCAAACA  GAAAAATGAA TTCTTTGATT TTCTTTACCA TTTTAGTATA TGCCGCTGAA GGGGCCTTGG AGCAATTGTA CTGTTGTATC CGTGTGACTT ATAGGTGATT AGTTTCGGTC GTAGTATCAA  CTAGTGACGC TTGTGTTAGG GTAGACTGTC TTTATCATAC CCCTTAGGCG GGGCCCTTCC GGAACCCTTG ATGTGTCCGT GTGACTTACG GGTTACCGGT TCGAGCCGTA GATCAGCCAG  TGACGCTTGT GTTAGGGTAG GTTGCCTATA TCATATCCCT TTGGATGTGG TTTTTTCCCC AACCTGCGTG AATGCGAGAT GTTTCATGCG TTGGATTGCT GTTTTTTTTT AAGCGTAGGA  CATTGGCATT ATATATAATC TAACATGATT TAATATATTC TCTATTGACA GGGTTGTGAT GGCTCAGTTC TGTTGAATTC TCCAACTAAA CAAGCTGAGA AGAATGCAAT CCCAAATTTA  AGCCTTAGAG GATTTCAAAT TATTGATAAA GTGAAGACTG CAGTAGAAAA ATATTGCCCT GGGATAGTTT CCTGTGCTGA TATCGTTGCC CTAGTAGCTA GAGATGTCAC AGTTGCGGTA  AGTGTTAGTT TATATCTTAT ATTTTACCAA CCTGTGTGTG ACCTATAGGT TAGGAGCAGG AGCCGTGGAA ATATTCACTG CCGCTGATGC TTGCATTAGG GTAGGATGCT TGGAGTGCGG  CCCTTCCCAA GATCGCAGGA TGCTTTGTGC ACCGGATTGC CCACATTTTA CCAACCTATT TCCAATTAAC ATTATGCCGC TTAACCTAAT TTTTTATGTA TATATACTAT ATATATTGAA  TCTCCTTGGC TTCTTTATAT ATTTAATGTT TTATGTTTTG ACACCTCCTT AGTAAATATA CTGGCTCCGT CAATGCATAT GAGTGCAATG TGGTATAGCA ATATTTAGTA TAGGATAAAA  TTAAACTACT CTTATTTCCG CATCCATCTT ATTACTGTTC CTTTTGTATT TGCAATTCTC AGGTCAAGGG ACCATTCTGG GAAGTTGAAA CTGGGAGAAG AGATGGAAGG GTCTCAAATA  TAACTGAAGC CTTATTTAAT TTAATTCCTC CATTTGCAAA TATAACATCA TTGAAACAAG GATTCTTGCA AAGGGGATTA AGTGTCAAGG ACCTAGTAGT ATTATCAGGT ATCCTATTAA  TTCTACTACT TTTTCAATGA TACCGTGAAA AATATGATTA TCTCATCTAA AAACTTAAAT TGACAAAACT TTTTTATTTA CTTAATTATA CACATTTCGA AGGGGAGTCT TGGAGCAACG  GTAAAGTTGT CACCGTATGA CCTATAGGTC ACAGGTTACA ACTGTGAAAG TGGCCATTAA TGTTTGCATT AGCCTAGGCT GTCTACATTA CACCCCTTAG GGCGCGACCT TTCTTCGGAG  GGGAATTCTT GGAGCAACAG TAAGGTTATC TCCGCGTGAC GTATAGGTCA CGGGTTCGAG CTGTAGAAGC AGCAACTAAT GCTTGCATCA GGATAGGCTG TCTACATTAC ACCCCTTGGG  GTGCGACCGT TCTTCAGAGG GGAATCTTGG AGCAACAGTA AGGTTATATC CGTGTGACGT GTAGGTCACG GGTTTGAGTT GTGGAAGCAA CAACTAATGC TTGCATTAGA ATAGGTTGTT  TACATTACGC CACGGCCATT ATTCGAACTT TGTATAAATT ACGGAATGTC TTGTGCACCA GACTGTTTTT TTTTTTTTAA ATACACATTT CAACGCTATG ACATGCATGC AAACTAGCTA  ATATTCTAAT TTTGTGTTGT TTTTTTTGGT TGTTGAAAAA CAACTTATAT ATAGGTTCTC ACACAATTGG AATATCTCAT TGCTCATCAT TCAACAATCG TCTATACAAC TTCACTGGGA  AAGGAGATAC AGATCCCAGC TTGGATCCAA ACTATATAAA AAGATTGAAA ATGAAATGTT CTCCAACTGA TCAAAACTCC ATTGTAGAGA TGGATCCAGG AAGTGTTAGA ACATTTGATA  CATCTTATTA TAATCTTGTA GCAAAAAGAA GAGGACTTTT TACGTCTGAT TCTGCTTTAC TTGATGATAA AGAAACCAAG GGTTATCTCA AAGAACAAGC ACTTAACCAT GGTTCAACAT 
TTTTCAAGGA TTTTGGTGAA TCTATGGTTA AAATGGGAAG GATTCAAGTA CTCACTGGTA CTCAAGGTGA AATTAGAAAA GTGTGTACAA AGATCAACTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAACCT CAAAATTTGC AAATTGTTGT TTCTTGATTT CATTGATCTT CTTTGCATTT GCTTCAAACC ATGCAAATGG GAAAGAACTC AAAGTAGGTT TTTACCACAA AAATTGTCCT  CATCTCGAGT TGATAGTCAA GGAAGTTATT GATGATGTTA TTTCCAGAGT CCCCAGTCTC GCTGCTCCTT TGTTGAGAAT GCACTTTCAT GATTGTTTCG TTAGGGGTTG TGATGGCTCA  GTTCTGTTGA ATTCTCCAAC TAAACAAGCT GAGAAGAATG CAATCCCAAA TTTAAGCCTT AGAGGATTTC AAATTATTGA TAAAGTGAAG ACTGCAGTAG AAAAATATTG CCCTGGGATA  GTTTCCTGTG CTGATATCGT TGCCCTAGTA GCTAGAGATG TCACAGTTGC GGTCAAGGGA CCATTCTGGG AAGTTGAAAC TGGGAGAAGA GATGGAAGGG TCTCAAATAT AACTGAAGCC  TTATTTAATT TAATTCCTCC ATTTGCAAAT ATAACATCAT TGAAACAAGG ATTCTTGCAA AGGGGATTAA GTGTCAAGGA CCTAGTAGTA TTATCAGGTT CTCACACAAT TGGAATATCT  CATTGCTCAT CATTCAACAA TCGTCTATAC AACTTCACTG GGAAAGGAGA TACAGATCCC AGCTTGGATC CAAACTATAT AAAAAGATTG AAAATGAAAT GTTCTCCAAC TGATCAAAAC  TCCATTGTAG AGATGGATCC AGGAAGTGTT AGAACATTTG ATACATCTTA TTATAATCTT GTAGCAAAAA GAAGAGGACT TTTTACGTCT GATTCTGCTT TACTTGATGA TAAAGAAACC  AAGGGTTATC TCAAAGAACA AGCACTTAAC CATGGTTCAA CATTTTTCAA GGATTTTGGT GAATCTATGG TTAAAATGGG AAGGATTCAA GTACTCACTG GTACTCAAGG TGAAATTAGA 
AAAGTGTGTA CAAAGATCAA CTAA 

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