Entry information : NtPrx55-1A(Nitab4.5_0001417g0090)
Entry ID 8277
Creation 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx55-1A(Nitab4.5_0001417g0090)
Name NtPrx55-1A(Nitab4.5_0001417g0090)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx007]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type All tissues
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx55-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx55-1B 625 0 7..326 3..322
LePrx65 543 0 7..326 3..323
InPrx44 524 0 20..326 17..323
VvPrx47 523 0 24..326 22..324
Literature and cross-references NtPrx55-1A(Nitab4.5_0001417g0090)
EST ref. GenBank:   FS398909.1 [5' end]   AM782285.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx55-1A(Nitab4.5_0001417g0090)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326
PWM (Da):   %s   35224.04  
PI (pH):   %s   8.14
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGNTILNLCF VFLFMSMVLP VLGQGGLKTG FYSSSCSKAE SIVRSTVEAE FNKDPTIAAA LLRLHFHDCF VQGCDGSILI SGTSAERNAV TNLGLRGFEV IDNAKKQLET SCPGVVSCAD  ILALVARDAV DLSGGPSWGV PTGRRDGRIS SSSEALNLPS PLDTIDVQRK KFTAKGLDDH DLVTLVGAHT IGQTECRFFN YRLYNFTTTG NADPSINVAF LAQLQTLCPK GGDGLKKVAL 
DKESQLNFDV SFFKNVRDGN GILESDQRLL GDPSTRRIVE NYAGNVRGLL GLRFNFNFPK AMIKMSSIEI KIGTQGEIRK VCSKFN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 ESTs. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron3).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAATA CCATTCTAAA CTTGTGTTTT GTTTTTCTTT TTATGTCTAT GGTTTTGCCT GTTCTTGGCC AAGGAGGACT AAAAACCGGG TTTTATTCAT CGTCATGCTC AAAAGCCGAG  TCTATAGTAA GATCAACCGT TGAAGCAGAG TTTAATAAAG ATCCTACGAT TGCTGCAGCT TTACTTAGGC TTCATTTCCA TGATTGTTTT GTTCAGGTAA GTATTCACAG TATAGAGTTT  TTCTAATTAT TTTCTACTTT GCTATTATGA AAAGATAATT GCTTTATAGG GTTGTGACGG TTCTATTTTG ATATCGGGAA CTTCTGCTGA GAGAAATGCA GTGACTAATT TGGGACTAAG  AGGATTTGAG GTGATTGATA ATGCAAAAAA ACAGCTTGAG ACTTCATGTC CTGGTGTTGT TTCCTGTGCT GACATCCTAG CATTAGTTGC TCGTGACGCT GTAGACTTGG TAACTACTTC  AACTTTGCTT TGACAACTTA CAATGATTAT AGATTAGAAC GAGTAATTTT ATTGAGTCTC ACATGTCAAA GTCATACTTG TGTATTGCCA GGGGCGGAGC TAGCCCATGA GATACGGGTT  CGGGCGAACC TAATAGTTTT GGTCCAAACC CTTTATTTAT CTTACGAAAT TTATTGAATA TGTATTAATT ATTAATTTAG AACCCAGTAA CCTAAAATGA TTAGAACTCC AAACTCATAA  TATTCAAATC CCGACTCCGC CTCTATGTAT TGCTCGTGAC TATGTATACT TGGTAACTAC TTCAACTTTG CTTTCACATA TTATATTACA ATCATTATAG ATTAGAACTT TTCATCTTAT  ATATAGCACT TTTTTTTTCT ATTCTGTTTA AAAGCAAGGA GACCCTTCAA TATTAAGAAT TACTTTGAAT TTCCTATTTT AACATTAATG ACAAGCTATG TTCTAACCGT AGTTTTGGTA  TGTGAAAAAA GTTTATTTGT CCAGTCAAAA CACTTTTGTA TAAAATGAAA TAGATGGAGG GAGTAGTTTT AATCAATCAT ATGCAAAACA TATTTTTTCC ATCATTTTTC CTTCGTACTA  GTCATCAAAA GAGAAAACTT ACTTGTGTAT GCATTTTAAA GTATATGTAG TGAAAATATA ACGTTTGTGA TAAATTTTTG ATGAATAACG AGACTATTAA TATTTGATCT TGTTGCATGT  TACTTAGAGT GGAGGTCCAA GCTGGGGAGT GCCTACTGGA AGAAGAGATG GTAGGATCTC TTCATCGTCA GAGGCCTTAA ATTTACCTTC ACCGTTGGAT ACAATTGATG TCCAAAGGAA  AAAGTTTACA GCCAAAGGCC TAGATGATCA TGATCTTGTC ACCCTTGTTG GTATATTCTC ATTTTTGTTA TACTATTACT ATTATTATGC TTGCTCGGTT TCGATTTGTT TGAACCTTTT  CAGAGTACGA GCGTCAATTG ATTAATATTC GGTGTGAATT CGGACATGAA TTCTTTAAGT ATTTTAAAAT AAAATTTATA TATTTATAAA CTGTATAAAA AGTACTATAA GTTAAAATAG  TTGACAATTC AAAATATTTA AAAATTATTT ACAAAAAGAT ATGGCAAAAA AAATCTTATT TGACTCCCCA AATAGTAAAA ATGTTCATTA TTTTTGAAGC GGATGGAGTA TATAACTATT  TGCTGACTGA CTAAGCTAGA CCATTGGAGC GGAGAATAAC GAAAAAGTAA TTTAAAAATA TAAATCAATA AAAGGTGGAG TATAGTACAG TATTTAAAAA AGATACTTTT ATAGAAAAGA  TTTTCATTTC AAGGATAAAA AAGTAATAAA TTTCCATATA TAACTTGGAC AGTGGCTGCC CACTATTTAA TATAACACCA TACATTGTTG CGTGATAACT GATAAAAGAA AAACAAAAAA  CTGTATTTGA ACATAAGTTA GTCCATATAT CAGGGGACAA GCAAATTCCT ATGCAAATAC GACGCATAGT CTAAAAAGAA AAACATAAGG GATATGTGTT TTAAGACAAA GAGAATGATA  AATTTTCTAG AACTAAACTG TAATTACTTA TAATTACCCT TCAGAAAAGA ATTTAAACTG CCACTTTCTT GAAATGTATG TAGGTGCACA TACAATTGGC CAGACAGAAT GCAGATTCTT  TAATTATCGA CTATACAACT TCACAACAAC AGGAAATGCA GATCCAAGCA TAAACGTAGC ATTCTTGGCA CAATTACAGA CTCTATGCCC CAAAGGTGGC GATGGTTTGA AAAAGGTAGC  TTTAGACAAA GAAAGCCAGT TGAATTTTGA TGTAAGTTTT TTCAAGAATG TAAGAGATGG AAATGGAATT CTTGAGTCAG ACCAGAGGCT GTTGGGTGAC CCTTCCACAA GAAGGATTGT  GGAAAATTAT GCAGGGAATG TAAGGGGATT GCTAGGATTG AGATTCAATT TTAACTTTCC AAAGGCTATG ATCAAAATGA GCAGCATTGA GATTAAGATT GGCACTCAAG GGGAGATCAG 
AAAAGTTTGT TCCAAGTTCA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAAATA CCATTCTAAA CTTGTGTTTT GTTTTTCTTT TTATGTCTAT GGTTTTGCCT GTTCTTGGCC AAGGAGGACT AAAAACCGGG TTTTATTCAT CGTCATGCTC AAAAGCCGAG  TCTATAGTAA GATCAACCGT TGAAGCAGAG TTTAATAAAG ATCCTACGAT TGCTGCAGCT TTACTTAGGC TTCATTTCCA TGATTGTTTT GTTCAGGGTT GTGACGGTTC TATTTTGATA  TCGGGAACTT CTGCTGAGAG AAATGCAGTG ACTAATTTGG GACTAAGAGG ATTTGAGGTG ATTGATAATG CAAAAAAACA GCTTGAGACT TCATGTCCTG GTGTTGTTTC CTGTGCTGAC  ATCCTAGCAT TAGTTGCTCG TGACGCTGTA GACTTGAGTG GAGGTCCAAG CTGGGGAGTG CCTACTGGAA GAAGAGATGG TAGGATCTCT TCATCGTCAG AGGCCTTAAA TTTACCTTCA  CCGTTGGATA CAATTGATGT CCAAAGGAAA AAGTTTACAG CCAAAGGCCT AGATGATCAT GATCTTGTCA CCCTTGTTGG TGCACATACA ATTGGCCAGA CAGAATGCAG ATTCTTTAAT  TATCGACTAT ACAACTTCAC AACAACAGGA AATGCAGATC CAAGCATAAA CGTAGCATTC TTGGCACAAT TACAGACTCT ATGCCCCAAA GGTGGCGATG GTTTGAAAAA GGTAGCTTTA  GACAAAGAAA GCCAGTTGAA TTTTGATGTA AGTTTTTTCA AGAATGTAAG AGATGGAAAT GGAATTCTTG AGTCAGACCA GAGGCTGTTG GGTGACCCTT CCACAAGAAG GATTGTGGAA  AATTATGCAG GGAATGTAAG GGGATTGCTA GGATTGAGAT TCAATTTTAA CTTTCCAAAG GCTATGATCA AAATGAGCAG CATTGAGATT AAGATTGGCA CTCAAGGGGA GATCAGAAAA 
GTTTGTTCCA AGTTCAATTA A 

Retrieve as FASTA