Entry information : NtPrx56-1A(Nitab4.5_0001110g0100)
Entry ID 8278
Creation 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-13 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-27 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx56-1A(Nitab4.5_0001110g0100)
Name NtPrx56-1A(Nitab4.5_0001110g0100)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx028]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Seedlings
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx56-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx56-1B 588 0 21..322 35..336
LePrx56 528 0 2..322 19..341
StPrx26 525 0 4..322 21..341
PpePrx76 476 8e-171 4..322 12..327
Literature and cross-references NtPrx56-1A(Nitab4.5_0001110g0100)
EST ref. GenBank:   AM790800.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx56-1A(Nitab4.5_0001110g0100)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322
PWM (Da):   %s   34959.34  
PI (pH):   %s   5.18
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MEKHKVFFLG FFCLTLFPAY SYSSLSFEFY ALSCPTAEFM VKNTVRSASS MDPTLPGKLL RLLFHDCFVE GCDASILLEG NGTERSDPAN KSLGGFSVIE SAKRVLEIFC PGTVSCADII  ALAARDAVEF AGGPNVQIPT GRRDGKLSLV SNVRSNIVDT SFSIDQMINI FSAKGLSLDD LVILSGAHTI GSAHCNAFSD RFQVDSKGNI SVIDTSLDRE YAAELTKQCP AGANPSITVK 
NDPQTPQLFD NQYYKDLSAH KGLFQSDSVL FSDGRTRKRV MDFADDQNSF FQSWSQSFVR LAGLGIKSVD EGEIRASCSV TN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 2 EST. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 1 and lackk of exon 2)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAGC ACAAAGTTTT CTTTCTTGGT TTCTTTTGTT TAACGCTATT TCCAGCTTAT TCATATTCTA GCCTTTCCTT TGAGTTCTAT GCACTTTCTT GCCCAACAGC TGAATTCATG  GTTAAAAATA CAGTGAGATC AGCTTCTTCT ATGGACCCAA CACTCCCTGG AAAACTTCTT CGTCTCCTTT TCCATGACTG CTTTGTTGAG GTAATTTTGT AATTTGCTAC TACTCATTAT  ATTGAGTCAA CAGCATAATT ACTTTACAAA AAATTGGAAC TTTCCTACTT ATATCCTCTT GTTTTTTTTT TTTAAACGAT ATAGTCTAAA AGATCTTATA ATTTCAGGTA ATTATCCATA  ATAAAATGCA TTTTACGCCT TTGCACTTCA TTTCAAAAAT CAGTTTTTGT ATTAGTACTA TCGTGTTTTT CTCATACTGG AAAACGAAAA AAGATGGTAA TATTATAGAA GCAATAGCAA  TTTTTGGATA GATTGTTTAG CATACAGCAA TATTAAGTTT TATTTTGCTA AATTATAAAA AGTAAAAATT AGTGTCGGTT ATTGACTCAT AGAAGTGTAA TTCAATGAAT CGTCCAACTA  TTTAAACTTG TGTTGAGGGA GTGAGTTTCT TTTATACCAT TAATTAAGTG TAGCGCTACA GTTAAAATAT GCAGTTTCTA TTCTCATCAA CTTTCAATTT GGAATATTGC TCGCACGCCT  AACAGAATTA ACCAAATTAA ACGTGATGAA GACAGTGGCG GAGCCACCTT ATAGGAGGGG TGTCAAATGA CACCCCTTCG CGAGAAAAAT ATACTGTGTA GGTAGGTAAA AAAAAATATA  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GTTAAACTAT GCTCATATGT ATATGTGTGA GAGAGAGATG TTGGGAATGT GATACATTGT TGTATGCCAA AATTGTAGGA GCACACACCA TAGGATCAGC ACATTGCAAT GCATTTAGTG  ATCGTTTTCA AGTGGATTCA AAGGGCAATA TCAGTGTCAT TGACACATCT TTAGACAGAG AATATGCAGC TGAGCTAACA AAGCAGTGTC CAGCAGGAGC AAATCCCTCA ATTACTGTCA  AGAATGATCC TCAAACCCCT CAACTTTTTG ACAATCAGTA TTACAAAGAT TTGTCAGCAC ATAAGGGGCT TTTTCAATCT GATTCTGTTT TGTTTAGTGA TGGTAGAACA AGGAAAAGAG  TGATGGATTT TGCAGATGAT CAGAACAGTT TTTTTCAGAG TTGGAGTCAG TCTTTTGTGA GACTTGCTGG TCTTGGAATT AAGTCTGTGG ATGAAGGAGA GATTAGAGCT TCTTGTTCAG 
TCACTAATTA A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGAGAAGC ACAAAGTTTT CTTTCTTGGT TTCTTTTGTT TAACGCTATT TCCAGCTTAT TCATATTCTA GCCTTTCCTT TGAGTTCTAT GCACTTTCTT GCCCAACAGC TGAATTCATG  GTTAAAAATA CAGTGAGATC AGCTTCTTCT ATGGACCCAA CACTCCCTGG AAAACTTCTT CGTCTCCTTT TCCATGACTG CTTTGTTGAG GGTTGTGATG CATCTATACT TTTAGAAGGG  AATGGAACAG AGAGAAGTGA TCCAGCAAAC AAATCACTTG GAGGATTTTC AGTAATAGAA TCTGCAAAAA GAGTATTGGA AATCTTTTGC CCAGGAACTG TTTCTTGTGC TGATATTATT  GCATTGGCTG CTAGAGATGC TGTTGAATTC GCAGGAGGGC CAAATGTTCA AATTCCAACT GGGAGAAGAG ATGGGAAACT TAGTTTGGTT TCAAACGTGA GATCAAATAT AGTGGACACG  AGTTTCTCAA TAGATCAAAT GATTAATATA TTTTCTGCAA AGGGATTGTC TTTGGATGAC CTTGTTATTT TATCAGGAGC ACACACCATA GGATCAGCAC ATTGCAATGC ATTTAGTGAT  CGTTTTCAAG TGGATTCAAA GGGCAATATC AGTGTCATTG ACACATCTTT AGACAGAGAA TATGCAGCTG AGCTAACAAA GCAGTGTCCA GCAGGAGCAA ATCCCTCAAT TACTGTCAAG  AATGATCCTC AAACCCCTCA ACTTTTTGAC AATCAGTATT ACAAAGATTT GTCAGCACAT AAGGGGCTTT TTCAATCTGA TTCTGTTTTG TTTAGTGATG GTAGAACAAG GAAAAGAGTG  ATGGATTTTG CAGATGATCA GAACAGTTTT TTTCAGAGTT GGAGTCAGTC TTTTGTGAGA CTTGCTGGTC TTGGAATTAA GTCTGTGGAT GAAGGAGAGA TTAGAGCTTC TTGTTCAGTC 
ACTAATTAA 

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