Entry information : NtPrx29-1B(Nitab4.5_0002009g0020)
Entry ID 8292
Creation 2011-04-14 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-14 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-15 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx29-1B(Nitab4.5_0002009g0020)
Name NtPrx29-1B(Nitab4.5_0002009g0020)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx011]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx29-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx29-1A 619 0 1..319 1..319
NtPrx16-1B 573 0 1..319 1..318
StPrx36 562 0 1..319 1..318
NtPrx89-1A 559 0 1..319 1..319
Literature and cross-references NtPrx29-1B(Nitab4.5_0002009g0020)
Protein sequence: NtPrx29-1B(Nitab4.5_0002009g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   319 (246)
PWM (Da):   %s   35006.4 (27055.4) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   5.17 (4.64) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-269
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKNSFLFLH VLAIFSLASM AFSNSLSPYF YDYVCPQALP TIKRVVEDAV TEERRMGASL LRLHFHDCFV QGCDASILLD QTETIDSEKT ARPNNNSIRG FEVIDKIKSE VDKACGHPIV  SCADIVAVAA RDSVVALGGP TWEVQLGRRD STTANRNMAN NDIPPPFLDL PALINNFKNQ GLDEKDLVAL SGGHTLGFAQ CFTFRDRIYN ETNNIDSTFA SQRQADCPRS GDDSNLAPLD 
PTPVLFDTEY FSNLLCKKGL LHSDQALFSG GQTDNLVQIY STNLGTFAKD FAESMIKMGN IKPLTGDQGQ IRVNCRKVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and ESTs. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAAGA ATAGCTTCCT TTTTCTTCAT GTTTTAGCCA TTTTTTCTCT AGCAAGCATG GCATTTTCGA ATTCACTTTC ACCTTATTTC TACGATTATG TTTGTCCTCA AGCTTTGCCA  ACCATAAAAC GGGTTGTTGA GGATGCAGTC ACGGAAGAGA GGCGAATGGG TGCCTCTTTG CTACGTCTAC ATTTTCATGA TTGCTTCGTT CAAGTGAGAT CCTTTCTCTC TTTTCATACG  TCAATTCATC CAACTTTATA AAAAAAGATC TACATTAAAC AATTTCGTCT CATTTTATGT GATATTTTTT GCTTCCCGAG AGTCAATTTG ATTAGTTTTT GAAGCTAAAT TAGATTAGAT  CAACTCAGTA TTTTAAAATT AAAATTTAGA TATGTTACTA ATGTTTCTTG TAAATGAAGG GCTGTGATGC TTCGATTCTT CTTGACCAAA CGGAGACTAT TGACAGTGAA AAGACTGCTA  GACCTAATAA TAATTCTATT AGAGGATTTG AAGTGATTGA CAAAATCAAG TCGGAGGTTG ATAAAGCTTG CGGACATCCT ATTGTATCTT GTGCAGACAT TGTTGCAGTT GCGGCTCGTG  ACTCTGTAGT TGCAGTGCGT ATCGTTCCCT CTCTATCCTC TAGTCAAGTT TTTCCTTTAT TATGATATAT ACTTTCTCCG TCTCAATTTG TTTGATACTA CTCGAATTTC AAGAGTCAAA  CGAGATTTTT TTACCAGGAT TGTTTCATAC GTCTGTTAAT TATGCTGAAT TGTTATTGTG ACTTATACTA CTTTTTATGT AGTTTTTTAA TTTGTAAATA TTATTTAAAA AATTAAAAAA  ATTATGTTTA AATTCGCGAT CAAAATTGAG AAGTTTGACT TCCTAAATCC GAAATATATC AAAAAATTGG GACGAGGAGA ATATTTTTCC ATGGTTAATA TTATACTCAA ATACTATATT  AGTTCAAGTT ATAGTATTAT AAATGCTTAG TGATATGCTA GCTGCAATGG CTACTAATGA ACCCTTAACA ATTAAAGTTA ACTATTAAGT AGTAGTAGAT GGTTTTTAAT TTCATGAACA  GTTAGGTGGA CCAACGTGGG AAGTGCAACT GGGAAGAAGA GACTCCACTA CAGCAAATAG AAACATGGCC AACAACGACA TCCCACCTCC ATTCTTGGAC TTACCTGCAC TTATCAACAA  CTTCAAGAAC CAAGGCTTGG ATGAAAAAGA TCTCGTCGCG CTCTCTGGTG GCCATACACT AGGGTTTGCG CAATGTTTCA CTTTCAGAGA TCGTATCTAT AACGAGACTA ACAACATTGA  CTCAACCTTT GCAAGTCAAC GGCAAGCCGA TTGTCCACGT AGTGGAGATG ATTCCAACCT TGCTCCTCTT GATCCAACGC CAGTTCTTTT TGACACGGAA TATTTTAGTA ACTTGTTGTG  CAAGAAAGGG CTTCTGCACT CTGATCAAGC ACTGTTTAGT GGTGGACAAA CTGATAACCT TGTTCAAATA TATAGTACCA ACCTTGGGAC TTTCGCTAAA GATTTCGCTG AGTCTATGAT 
TAAGATGGGA AATATCAAGC CATTGACCGG GGATCAAGGT CAAATTCGCG TAAACTGCAG GAAGGTGAAC TAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAAGA ATAGCTTCCT TTTTCTTCAT GTTTTAGCCA TTTTTTCTCT AGCAAGCATG GCATTTTCGA ATTCACTTTC ACCTTATTTC TACGATTATG TTTGTCCTCA AGCTTTGCCA  ACCATAAAAC GGGTTGTTGA GGATGCAGTC ACGGAAGAGA GGCGAATGGG TGCCTCTTTG CTACGTCTAC ATTTTCATGA TTGCTTCGTT CAAGGCTGTG ATGCTTCGAT TCTTCTTGAC  CAAACGGAGA CTATTGACAG TGAAAAGACT GCTAGACCTA ATAATAATTC TATTAGAGGA TTTGAAGTGA TTGACAAAAT CAAGTCGGAG GTTGATAAAG CTTGCGGACA TCCTATTGTA  TCTTGTGCAG ACATTGTTGC AGTTGCGGCT CGTGACTCTG TAGTTGCATT AGGTGGACCA ACGTGGGAAG TGCAACTGGG AAGAAGAGAC TCCACTACAG CAAATAGAAA CATGGCCAAC  AACGACATCC CACCTCCATT CTTGGACTTA CCTGCACTTA TCAACAACTT CAAGAACCAA GGCTTGGATG AAAAAGATCT CGTCGCGCTC TCTGGTGGCC ATACACTAGG GTTTGCGCAA  TGTTTCACTT TCAGAGATCG TATCTATAAC GAGACTAACA ACATTGACTC AACCTTTGCA AGTCAACGGC AAGCCGATTG TCCACGTAGT GGAGATGATT CCAACCTTGC TCCTCTTGAT  CCAACGCCAG TTCTTTTTGA CACGGAATAT TTTAGTAACT TGTTGTGCAA GAAAGGGCTT CTGCACTCTG ATCAAGCACT GTTTAGTGGT GGACAAACTG ATAACCTTGT TCAAATATAT  AGTACCAACC TTGGGACTTT CGCTAAAGAT TTCGCTGAGT CTATGATTAA GATGGGAAAT ATCAAGCCAT TGACCGGGGA TCAAGGTCAA ATTCGCGTAA ACTGCAGGAA GGTGAACTAA 

Retrieve as FASTA