Entry information : NtPrx30-1B(Nitab4.5_0003436g0010)
Entry ID 8304
Creation 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-16 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx30-1B(Nitab4.5_0003436g0010)
Name NtPrx30-1B(Nitab4.5_0003436g0010)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx024]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx30-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx30-1A 654 0 1..332 1..332
LePrx59 566 0 3..329 4..330
LePrx40 563 0 1..329 1..330
StPrx73 551 0 1..329 1..330
Literature and cross-references NtPrx30-1B(Nitab4.5_0003436g0010)
EST ref. GenBank:   DW003943.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx30-1B(Nitab4.5_0003436g0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332
PWM (Da):   %s   35870.08  
PI (pH):   %s   5.71
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKKSCNFLFY SQVLILLILF VAVNSQLTTD FYSKTCPNVL KVVRKEVQNA IKNEMRMAAS LLRLHFHDCF VSGCDASVLL DGNSTTSEKF TPANLNSARG FEVIDNIKTA VENACGGVVS  CADILAIAAR DSVLLSGGPF WKVLLGRRDG LAANISGSNT ALPAPFDPLN TIISKFEAVG LNVTDVVSLS GAHTIGLAKC ATFDNRLRNF SGTGAPDTTL DTTLVSELQN LCPLTSDGNN 
TAPLDRNSTD LFDNHYFKNL INGRGLLESD QVLFSSDDAI QTTKTLVETY SNSSQFFFSD FVNSMIKMGN ISPLVGSDGE IRKNCRVVNS NN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic and EST. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 2)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAAAT CTTGCAACTT TCTTTTCTAT TCTCAAGTTT TAATTCTCTT GATCTTGTTT GTAGCTGTGA ATTCTCAGCT AACAACTGAT TTCTACTCTA AAACATGTCC AAATGTCCTT  AAGGTTGTAC GTAAAGAAGT TCAGAATGCA ATCAAGAATG AAATGAGAAT GGCTGCTTCT TTGCTTCGTC TTCATTTCCA CGATTGCTTC GTCAGTGTAA GTTTTTATTA CCTTTTTTTA  TGAATTTTTC ATCCAGTTAA ACTTCCAAAG TTGTACTTAT TATGTTTTAA GTTTAAAAAA AAAAGACCTA AAAGTGTGCC AAAAAGGATA ATATTGTGTT TGCATGCACA CTAATGTCTT  TACAACCGGT TTTATTTCAT TTTTCTATTA TTGGCTTAAA AACTATTTTG TTATCTCAAT CGCCGGTCCT TTTTATCTGT CGTTTAATAT ATTCGCATGC TCATTAAGAA AATTATTTGA  TAGCAATAAT CATAATGAGT ATTTTATGAA GTTATTCTTA TTTTTTCCTT AAATGAGTAA TTAATGATTA TATGCTTTTT GGATTAGTAA GAGTTGAATT GTTAAGAAAA CTACTGCTTT  CTTGACTTTC TAAAGCGACA AATAATGTTT TAGAACTTTC TTTTGGCTAA ATTGACACAC ACACACACAC ACTAGTTCCT CTAGCTAGTT TCTCATGCAC GAGTTCCTCT AGCTAGTTGT  AAGTTCTCTT ATTTGTTTTT AATTGGGGTC CCTAATCTTC TTTGTCTAAT ATTGTAATTT AGAGTTCATA ATTTGTAGGT TAACCTTAGC TTTACAAAGA AAGGTTAGAA CTGATTAAGA  TATATCATTT AAATTTTTTT GATTTATAGG GTTGTGATGC ATCAGTATTA TTGGATGGAA ATAGTACGAC AAGTGAGAAG TTCACACCAG CCAACTTGAA CTCAGCAAGA GGTTTTGAAG  TCATAGACAA TATTAAAACT GCTGTCGAAA ATGCATGCGG TGGAGTTGTT TCTTGTGCAG ATATATTAGC TATTGCTGCA AGAGATTCAG TTCTACTGGT AAAGATCCTA AATCCTAATC  TATGTTGCTC GGACTCTTAA AAATATCATC GCAGTGACGT TGTGTGTCAG TTTTTCCAAA AGTAGTATAT TTTTGGATCC TATGCGTTAG GAGTTTTAGA TGAATCCGAG CAATATAGAT  CCATACATTC TTTAATACGA TAAAAAACTG GATTTTTATA TATCAATGTA TTTTAACTTG CTACCACATA TAATCTGTCT TTATTTTTTA GATTAATAAT ATCACCTTTT ATAGATGGTT  ACATATAATT ATTTTTGGGT TATCTTTAGA TTGATTCATA TCCATATGTT GATTTTCAAA ATGAAGAAAT ATAGGGGACA TGTTGCCATA CTTCATTAAT TATTTTAAGA AATTAATACA  AATTTATTTA TTTATTTTTT GCTCAGAGTG GAGGGCCATT TTGGAAGGTG TTATTAGGGA GAAGAGATGG ATTAGCTGCT AATATTTCTG GATCAAATAC TGCACTTCCA GCACCATTTG  ACCCTCTCAA TACAATCATT TCCAAGTTCG AAGCTGTTGG ATTAAATGTA ACAGATGTTG TGAGCCTATC AGGTAAATAC ACATATGGTA ACTATTAGTT AAGCTATATC TATATGGATT  TAACTTATAT ACTAACATCT TAAATAATTA ATTTTTACAC TAATAATGAA CCTAACCTTT TATAACATGT AACCATTCTT ATTTTCTAGC TCGCTAATCC CATTTTCTGT AGACCAAATC  TTTTTAAGTG ACCTGATAAT GTATACATCT ATAAACTAAT AGTATAAAAG AACTTTAGGC AATCAGGTCA TCTAACAAAT ACACGTATAC TACTTATAAT AAGTGGAACT AGATATATAT  TTGAAAAATA AAACAAACAA CATATTTTTT TATTTTATCC TTCCACCCAG GCTTTCATCT CCTGTGGTGG TGGTGGTGGT GGTGGTGGGG AAACAACATG TTAATGATAA GTTAAAACTT  TTACAGACTG TACATAAATT AAATCCTTTT ATAAAACATA ACTACTCATA ATAATAATAG ATATTGTAAA AAAACTTTAG GCAATCAGGT CATTTATCAG ATACATGTAA CTACTCATAA  TAAGTGAAAC TAGATTTATA CTTGGAAAAT AAAACAAACA ACATATTAAC GACAAGTTAA TTTGAGACGG AGGAAGTATC TTAGCTTGCT AATTCAATTT TTTGTAGACG GGCTTGTAGT  TATCTTTTTA AGTTACATGA TGATGTATAC ATCTATAAAT TAATAGTGTA AAATATTTTT TGGGCAATCA GGTCATCTAA AAGATACATG TAACTATTCA TAATAAGCGG AACTAGATTT  ATACTTAGAA AATAAAACAA ACAACATGTT AACGACAAGT TAAAACTTTT ATACACGACT GTCAGTGTAC ATAAATTAAA TCCTTTTATA AAAGATAATG GTAGATGGTC ATTAATTAAA  CTTTATGCAA GGTTTTCACT AACCCTTTTG AGTGTTTGAA TATATATATG TAGGTGCTCA TACAATTGGA TTAGCAAAGT GTGCAACCTT TGACAACAGA TTAAGAAATT TCAGTGGCAC  AGGTGCACCA GACACAACTC TAGACACAAC TTTAGTGAGT GAACTGCAAA ATTTGTGTCC ATTGACAAGT GATGGAAACA ACACAGCCCC TCTTGATAGG AATTCCACAG ACTTATTTGA  CAATCATTAT TTCAAGAATT TAATCAATGG AAGAGGTCTT CTTGAATCAG ATCAAGTCTT GTTCTCTAGT GATGATGCTA TACAAACAAC TAAAACATTA GTTGAAACTT ATAGTAATAG  CTCTCAGTTT TTCTTTAGTG ACTTTGTTAA TTCTATGATT AAGATGGGAA ATATTAGCCC TCTAGTTGGA TCAGATGGTG AAATAAGAAA GAATTGTAGG GTCGTTAATT CGAATAATTA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAAAT CTTGCAACTT TCTTTTCTAT TCTCAAGTTT TAATTCTCTT GATCTTGTTT GTAGCTGTGA ATTCTCAGCT AACAACTGAT TTCTACTCTA AAACATGTCC AAATGTCCTT  AAGGTTGTAC GTAAAGAAGT TCAGAATGCA ATCAAGAATG AAATGAGAAT GGCTGCTTCT TTGCTTCGTC TTCATTTCCA CGATTGCTTC GTCAGTGGTT GTGATGCATC AGTATTATTG  GATGGAAATA GTACGACAAG TGAGAAGTTC ACACCAGCCA ACTTGAACTC AGCAAGAGGT TTTGAAGTCA TAGACAATAT TAAAACTGCT GTCGAAAATG CATGCGGTGG AGTTGTTTCT  TGTGCAGATA TATTAGCTAT TGCTGCAAGA GATTCAGTTC TACTGAGTGG AGGGCCATTT TGGAAGGTGT TATTAGGGAG AAGAGATGGA TTAGCTGCTA ATATTTCTGG ATCAAATACT  GCACTTCCAG CACCATTTGA CCCTCTCAAT ACAATCATTT CCAAGTTCGA AGCTGTTGGA TTAAATGTAA CAGATGTTGT GAGCCTATCA GGTGCTCATA CAATTGGATT AGCAAAGTGT  GCAACCTTTG ACAACAGATT AAGAAATTTC AGTGGCACAG GTGCACCAGA CACAACTCTA GACACAACTT TAGTGAGTGA ACTGCAAAAT TTGTGTCCAT TGACAAGTGA TGGAAACAAC  ACAGCCCCTC TTGATAGGAA TTCCACAGAC TTATTTGACA ATCATTATTT CAAGAATTTA ATCAATGGAA GAGGTCTTCT TGAATCAGAT CAAGTCTTGT TCTCTAGTGA TGATGCTATA  CAAACAACTA AAACATTAGT TGAAACTTAT AGTAATAGCT CTCAGTTTTT CTTTAGTGAC TTTGTTAATT CTATGATTAA GATGGGAAAT ATTAGCCCTC TAGTTGGATC AGATGGTGAA 
ATAAGAAAGA ATTGTAGGGT CGTTAATTCG AATAATTAGT GA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATATATTCAC ATCATCTTAA GATAAAAATC CAGTATCGCT AAACCATGAA GAAATCTTGC AACTTTCTTT TCTATTCTCA AGTTTTAATT CTCTTGATCT TGTTTGTAGC TGTGAATTCT  CAGCTAACAA CTGATTTCTA CTCTAAAACA TGTCCAAATG TCCTTAAGGT TGTACGTAAA GAAGTTCAGA ATGCAATCAA GAATGAAATG AGAATGGCTG CTTCTTTGCT TCGTCTTCAT  TTCCACGATT GCTTCGTCAG TGGTTGTGAT GCATCAGTAT TATTGGATGG AAATAGTACG ACAAGTGAGA AGTTCACACC AGCCAACTTG AACTCAGCAA GAGGTTTTGA AGTCATAGAC  AATATTAAAA CTGCTGTCGA AAATGCATGC GGTGGAGTTG TTTCTTGTGC AGATATATTA GCTATTGCTG CAAGAGATTC AGTTCTACTG AGTGGAGGGC CATTTTGGAA GGTGTTATTA  GGGAGAAGAG ATGGATTAGC TGCTAATATT TCTGGATCAA ATACTGCACT TCCAGCACCA TTTGACCCTC TCAATACAAT CATTTCCAAG TTCGAAGCTG TTGGATTAAA TGTAACAGAT  GTTGTGAGCC TATCAGGTGC TCATACAATT GGATTAGCAA AGTGTGCAAC CTTTGACAAC AGATTAAGAA ATTTCAGTGG CACAGGTGCA CCAGACACAA CTCTAGACAC AACTTTAGTG  AGTGAACTGC AAAATTTGTG TCCATTGACA AGTGATGGAA ACAACACAGC CCCTCTTGAT AGGAATTCCA CAGACTTATT TGACAATCAT TATTTCAAGA ATTTAATCAA TGGAAGAGGT  CTTCTTGAAT CAGATCAAGT CTTGTTCTCT AGTGATGATG CTATACAAAC AACTAAAACA TTAGTTGAAA CTTATAGTAA TAGCTCTCAG TTTTTCTTTA GTGACTTTGT TAATTCTATG  ATTAAGATGG GAAATATTAG CCCTCTAGTT GGATCAGATG GTGAAATAAG AAAGAATTGT AGGGTCGTTA ATTCGAATAA TTAGTGACTT TCGGAAACAG CTTCTCTACT CCCTCGGAGT  AGGAATAAGA TTTGCGGACA CACTACCTTC CCCAAACCCC ACTAGTAGGA TTTTATTGGG TCGTCGTTGT TGTAGTAGTA GTAAATCTCC CATCAGCCTG AGTGTTGGTT TGATTAAGAA 
AAAATAGTTA GTACGTAGTA TAAGTTGTTG TACTATGATT TCTTGCCTGT GGGGAAAATA TAATTATCTA CTTTGTGAAA AAATTGTATC TAACTTTTTT CTC 

Retrieve as FASTA