Entry information : NtPrx[P]67-1B(Nitab4.5_0000682g0080)
Entry ID 8306
Creation 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-22 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx[P]67-1B(Nitab4.5_0000682g0080)
Name NtPrx[P]67-1B(Nitab4.5_0000682g0080)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx022]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx[P]67-1B
start..stop
S start..stop
NtPrx67-1A 636 0 1..343 23..365
NtPrx[P]67-1A 612 0 1..343 23..365
NtPrx95-1B 540 0 1..343 23..359
NtPrx70-1B 518 0 7..342 28..363
Literature and cross-references NtPrx[P]67-1B(Nitab4.5_0000682g0080)
Protein sequence: NtPrx[P]67-1B(Nitab4.5_0000682g0080)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   343 (96)
PWM (Da):   %s   35798.45 (10690.3)  
PI (pH):   %s   4.88 (6.49) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-122
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAAQTESVPG NVSEFRTPLR YDYYEEKCGN VENIVRRMML RIVQLQHNAP AQLLRLLFHD CLFGGCDASV LLADSNSENG TVERDAIPNR TLKGFDFIDM IKDEIEEACP GVVSCSDILV  xxxxxxxxxA GGLYYPVLTG RRDSKESFFD EAMAEIPRPN GNITETLRLF SLRGxxxxxx xxxxGGHNIG KIGCEFIRPR LSNFMGTGLP DPTIPSDFLE ELMQKCPDDN NTINNMFNEH 
TARGLSGSAI SYSEGLSAVS SFGTSFDNHY YKTLTRGRGL LFADQQLMAN EKTAAVVMDY ALDERAIFRT EFAHAMDKLS NIGVLTGFQG EVRHSCSHLN SDQ 

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Remarks Pseudogene sequence from genomic Uncorrect predcition from SGN (missing part and frame shift)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGCGC AAACAGAATC TGTGCCTGGT AATGTGTCTG AATTTCGTAC GCCCCTTCGA TATGATTATT ATGAGGAGAA ATGTGGGAAT GTTGAGAACA TTGTGAGGAG AATGATGCTG  AGAATCGTTC AGCTGCAACA CAACGCCCCA GCACAACTCT TGCGCCTTCT TTTCCATGAT TGTTTATTTG GGTCCGTCTA CTCTCCAGTT CCTGAATCCT TTGATTAAGT ATATTCAATT  TCTTATTTTT TGTTGTTTCT TTCCCAAATT TTAGGTGCTC TTGTATGTGC AATGGTGTTC TTCTGTTCAA ACTTTATATT TAAAATTATT TTTGTCATCT GTTACTGTTT TACTGATTCT  TGATATGTGC ATCGTTCATG AGTTCTTTTT ACTGGCTTTT GTGGGATTGT ATATTATTCA TCTCATTTTC GCATCAGTCT TGGACACATA TTTATCTGTT CATGAATCCA TTGTGCGCAC  ACCTATGTAT AATCGTTTCT TTTAAAAAAT GTAAGCATGA TTACATCTAG AAAAGGATTT AGTACCTTTA ATAATGAAGC AGGGGAAGGG GATTAAAGAG GCTTGCAATC GTATTAAAAG  AGACTAATGT CTTATGCTAT GTACTCTACT GCTGCATTAA TGTTGTTTCA CTTTTAATTT TTGGAAGCAA TTCTAATTCG TATTATCAAG AAAATGATGA TAATTGATCT ATTTTGTGTC  GTTCCTTCTG TTATTTGATG CAGTTCTTAG TTTTTTTAGG TTCTACAATC TCAAGTGCAT GTGACCTCGA TACACAATAT TTTTAGTATT TTTACCGTTT GTCACTACTA TTCCTCTGTT  ACACGTTCCA TGCATGTATC GATTGTGAAT TCATTTTCTG TATTTCTCTT ATAGATTTGT AGACATTTCT TTTATAATTA GCCTTGTGAT ATTTGTTATC TTGCGTCGTG TGAACTTTTC  GTGCGTTGTC TTAGTCTTTT ATGTTAAGTT CCTTAACTGC TTCAATTGGG TCAGTTCCTA TTATCCTCCC AATATTTAGA AGTGTGTTTT TACTGAGTTT CAAATTATTT GCTCTATGCA  GACTTTTTGT CCTGGTCTTG TCCATGTAGA CGTATATTGA CAATACTTGG TGGATTTTTT ATTTCTTATT TGCATTGGTT CCTGATGCGC GCACGTGCAA TTGTACTTCT TTGATGTACT  TGTGGATGCT TCTCTCTTAA TAATTAACCG CGTATCTTGA TTCGTGCATT GTGCACTTGT GATTCTTCAT ATGTTGTCAT GTGTCTTTGT GCCTTGTGTT CGTCGTTTGA TTCAGATGGA  GGTTTTACCA GATCTTGGAT CAGTTGCCTT CTCAGTTTTA TGCTTATTGA GTTCCGAATA TTTTTAATGT ATATTTACCT GTAGTTATAT CCCTCTGTGT ATGTATCCAC ATTCCTTTAC  CCACTTCTCC TTTGGGTAAT AAAAAGAGGG CGGGATGGCA TTACTTCTGA AATAGAGATT AGAGTCCTAA GGGAGTCAAG AAATGATATT TAGCAAACAA GCTAAGGAGC TCAGACTGAT  TGTGAAAACA ACTCCAGACT ATGAAGCTTT TCTTCTTCTT TTTTGATTAG GCAGAGTTTC CGGACAGTGA ATTTACTGTT TCACTAATTT CAGGGTTGTG ATGCATCTGT TCTGCTAGCT  GACAGTAATA GCGAGAATGG GACTGTTGAA CGTGACGCCA TCCCAAATAG GACATTGAAA GGCTTTGATT TCATTGATAT GATAAAAGAT GAGATTGAGG AGGCATGCCC TGGGGTTGTT  TCTTGTTCTG ATATCCTTGT CCATCCTTGT CCTTGCAACA AGAGATGGCA TCGTTCTGGT ATGAATTTCG CCATATCCTT TGTTTCTTAT AATCCAGCAC CTTAAGTTTT TTGCTGATTT  CTTCATTATT ACTCTTAGTA CTTCATTTCT ATTTTACATG GATATATTCT GTGTTCCTGT TCAAGGAGCA ATTGGAGAAT AGAATCTGGC GTGAAATGGA TGTAACTCAT GCACTAGCAT  GCAATCCATC TTTCTTGAAA TAGTTTAGTT AAACGATCCT AGTGCATATT CAGATATTTA ATACATAAAA AAAACATTTT ACACCTTCTA GTGGTATCAT TTACATGTCA ACAGGGCATT  GTTCAGAAAA TATGGGAATA TTCTTAAACA GTGCATTAGG GTATCTTCTA GCTTTGCGGA CCAAATCGGC ATTTCAACTC CAAGTATTAT ATCTTTGAAG TAGTTTAGTT GAATGATCCA  TATTCAGATA TTTACATAAC AGAACATTTT ACACCTCTTA GAGGTATCAT ATATATGTTA ACAGGGTACA ATTCGGAAAG TATGGTACAA TATTTATAAA CAGTGCATTT TAATATCTTC  TAGCTTTGCG AACAAATTGG CACTTTATCG TCAAGTATTA TATCTTTAAG CTTAAGTATA AAAAAGTATT ATATCTTTAA GCTTTCCGTT TCACATGCTG CTTTTGTACA TTTTAGGCCG  GTGGTCTATA TTATCCTGTG CTTACGGGCA GAAGGGACAG TAAGGAGTCA TTCTTTGATG AGGCAATGGC TGAAATTCCA CGACCAAACG GGAATATCAC TGAAACACTT AGGCTGTTTT  CGCTAAGAGG ATTGATGAGA GGGAAACGGT GGCACTACTT GGTAATCTTC TAATCCTATA CTTTAATTTT CATATGGTGG ATTCTGCATC CTTTTTTGGA ACACTTGTAC ATCTTTTGAA  ATTTCTCTTC TGTTTATTTT CTTCATCATC CGAAGGAGGA CATAACATCG GGAAGATTGG TTGTGAATTC ATTCGGCCAA GGCTCAGTAA TTTCATGGGG ACAGGTTTAC CTGATCCAAC  GATTCCTTCT GATTTTCTTG AAGAGTTGAT GCAGAAGTGT CCAGACGATA ACAACACCAT CAACAATATG TTCAACGAAC ATACAGCGAG GGGTCTGAGT GGGTCTGCTA TATCATACTC  CGAGGGACTG TCAGCGGTTT CGTCGTTTGG AACTTCATTT GATAATCACT ATTACAAGAC TCTGACAAGA GGACGAGGGC TGCTGTTTGC TGATCAACAG TTGATGGCTA ATGAAAAGAC  GGCAGCGGTG GTGATGGATT ATGCTTTGGA TGAGAGGGCT ATATTTAGGA CTGAGTTTGC TCATGCCATG GATAAATTGT CAAATATTGG CGTTCTTACT GGATTCCAAG GAGAAGTTCG 
GCACAGTTGC TCCTGCTCCC ATCTCAATTC TGATCAACGA GAACTATCGG TAGGAGTAGC CTAG 

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