Entry information : NtPrx71-1A(Nitab4.5_0010308g0030)
Entry ID 8307
Creation 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-15 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx71-1A(Nitab4.5_0010308g0030)
Name NtPrx71-1A(Nitab4.5_0010308g0030)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx71-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx72-1B 640 0 1..320 1..320
NtPrx72-1A 634 0 1..320 1..320
NtPrx71-1B 634 0 1..320 1..320
LePrx98 585 0 1..320 1..318
Literature and cross-references NtPrx71-1A(Nitab4.5_0010308g0030)
EST ref. GenBank:   FS392228.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx71-1A(Nitab4.5_0010308g0030)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   320 (155)
PWM (Da):   %s   34770.5 (16730.6) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   8.94 (8.75) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-183
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVPRSCLIA LVFAFALYSS TAVNALSSNY YDNTCPKAES TIKKVVKKAM LNDKTVPAAL LRMHFHDCFV RGCDGSVLLN STRNNKAEKD GPPNISLHAF YVIDAVKKQI EDLCPGVVSC  ADILALAARD AVALSGGPTW DVPKGRKDGR ISKATETRQL PSPTFNISQL QQNFAQRGLS LDDLVALSGG HTLGFAHCSS FQNRIHKFDN NHDTDPTLQT SFAASLQNVC PMHNKVRNAG 
ATMDSTTTLF DNAYYKLLLN GKSLFSSDES LLATTRTKKL VSKYAGSQDE FFKAFANSMI KMSSISGNGQ EVRLDCRFTR 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. Uncorrect prediction from SGN (splicing error, extra exon in 5')
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGTAC CAAGATCATG TCTTATTGCT CTAGTATTTG CTTTTGCATT GTATTCCAGT ACTGCAGTGA ACGCACTAAG CTCCAATTAC TATGACAATA CATGCCCCAA GGCCGAGTCA  ACCATCAAAA AAGTTGTCAA GAAAGCTATG TTGAATGATA AAACTGTTCC AGCTGCGCTT TTAAGGATGC ACTTCCATGA TTGTTTTGTT AGAGTAAATT TCCACTTCTC TAGTTACTTT  GTTTTGTAGC TAATTTTTCC GTGCGCTTCA TTTTATATAT CACTCTTTAC TTTTTAGTCT GTTTCGAAAA GAATGTCATC TTTTTACATT TGGAACTTTT TAGCTTTACA CGTTACGTTT  CTTCTTATCC CGAATGACAT GCTCTTACGG CCACTGAAAT GCATGATGTA TTGTAGACCA CAATTCTAAG GGTAGTTTAG TACGTGCCAT TTGTTTTTCT TCCTTCTTAA GCTCCTAATT  TCCTAGTCAA ACATACTCAT ATAAAATGAA ACGGGAAGTA AATATCAAAC TTCCTATTTT TTCCCTTTCC TGAGGACCAA CAAACACTTC TCATTTATTC AAAACGTGAC TTGCCAATAA  TGTATTTCTT TTTTGTTGTG ATCATTTTGT GTTGTAGCTT TTCTTAGGAG TTATGATGAG TATAATATTA ACTAATTATA TATGGTTTTA TAGGGTTGTG ATGGCTCTGT GCTGCTGAAC  TCAACAAGAA ACAACAAAGC AGAAAAAGAT GGACCCCCTA ACATCTCATT GCACGCATTT TATGTCATCG ACGCTGTTAA GAAACAAATC GAGGATTTGT GTCCTGGAGT TGTCTCTTGT  GCTGATATTT TGGCTCTCGC TGCTCGGGAT GCTGTTGCTC TTGTAAGTTC TATATATCTA CTGCTAAACT ATTCACTGCT GGCAAATAAA TACTATAAAC ATGATATTAC CATTAAAAAT  ATTCCTAGCA ACCAAAAAAG AAAGCCAATA TCACTTCTCC ATTAATATGT GAAATTATTC ATTGGGCATA TGTATTGTGT CCAGTCTGGA GGTCCTACTT GGGATGTGCC AAAAGGTAGA  AAAGATGGAA GAATCTCCAA AGCCACTGAA ACGCGACAAC TACCTTCTCC CACCTTCAAC ATTTCTCAAC TGCAACAGAA CTTTGCCCAA AGAGGCCTTT CTTTGGATGA TTTGGTTGCA  CTTTCAGGTA AGCAACTCCA TGTTCTTCTA TTGGTCGCAT TCATGGCTCT CAATTTGAAC TATATATAAT TCCTCTTCTA TCTACTTGCC TCAAGGAAAA ATTTAATATC TCCTAGACTG  GTTTCAGCGA CTCAAGATTT TTCTTTGTTA ACAAATTAAA GCTCTTTCTT ACTCTGTTAA CAGGAGGGCA CACTCTTGGA TTCGCTCATT GTTCTTCCTT CCAAAACAGA ATCCACAAGT  TCGACAATAA TCACGACACT GATCCAACAC TACAAACATC ATTTGCAGCC AGTCTTCAGA ATGTTTGCCC CATGCACAAC AAGGTCAGAA ATGCAGGTGC CACCATGGAT TCTACTACAA  CTTTATTCGA CAACGCCTAC TATAAGCTTC TACTGAATGG AAAGAGCCTT TTCTCTTCTG ATGAATCTTT GCTCGCTACT ACAAGGACCA AAAAACTAGT TTCAAAGTAT GCTGGCTCTC 
AGGATGAGTT CTTTAAAGCA TTTGCCAATT CTATGATCAA GATGAGTAGC ATAAGTGGTA ATGGACAAGA AGTTAGACTG GACTGCAGAT TTACTAGATG A 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGTAC CAAGATCATG TCTTATTGCT CTAGTATTTG CTTTTGCATT GTATTCCAGT ACTGCAGTGA ACGCACTAAG CTCCAATTAC TATGACAATA CATGCCCCAA GGCCGAGTCA  ACCATCAAAA AAGTTGTCAA GAAAGCTATG TTGAATGATA AAACTGTTCC AGCTGCGCTT TTAAGGATGC ACTTCCATGA TTGTTTTGTT AGAGGTTGTG ATGGCTCTGT GCTGCTGAAC  TCAACAAGAA ACAACAAAGC AGAAAAAGAT GGACCCCCTA ACATCTCATT GCACGCATTT TATGTCATCG ACGCTGTTAA GAAACAAATC GAGGATTTGT GTCCTGGAGT TGTCTCTTGT  GCTGATATTT TGGCTCTCGC TGCTCGGGAT GCTGTTGCTC TTTCTGGAGG TCCTACTTGG GATGTGCCAA AAGGTAGAAA AGATGGAAGA ATCTCCAAAG CCACTGAAAC GCGACAACTA  CCTTCTCCCA CCTTCAACAT TTCTCAACTG CAACAGAACT TTGCCCAAAG AGGCCTTTCT TTGGATGATT TGGTTGCACT TTCAGGAGGG CACACTCTTG GATTCGCTCA TTGTTCTTCC  TTCCAAAACA GAATCCACAA GTTCGACAAT AATCACGACA CTGATCCAAC ACTACAAACA TCATTTGCAG CCAGTCTTCA GAATGTTTGC CCCATGCACA ACAAGGTCAG AAATGCAGGT  GCCACCATGG ATTCTACTAC AACTTTATTC GACAACGCCT ACTATAAGCT TCTACTGAAT GGAAAGAGCC TTTTCTCTTC TGATGAATCT TTGCTCGCTA CTACAAGGAC CAAAAAACTA  GTTTCAAAGT ATGCTGGCTC TCAGGATGAG TTCTTTAAAG CATTTGCCAA TTCTATGATC AAGATGAGTA GCATAAGTGG TAATGGACAA GAAGTTAGAC TGGACTGCAG ATTTACTAGA 
TGA 

Retrieve as FASTA