Entry information : NtPrx79-1A(Nitab4.5_0001815g0020)
Entry ID 8322
Creation 2011-04-20 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-20 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-07-28 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx79-1A(Nitab4.5_0001815g0020)
Name NtPrx79-1A(Nitab4.5_0001815g0020)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx037]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx79-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx79-1B 663 0 1..328 1..328
LePrx23 570 0 1..326 1..321
IaquPrx73 490 2e-176 27..325 26..324
InPrx86 490 3e-176 24..324 28..328
Literature and cross-references NtPrx79-1A(Nitab4.5_0001815g0020)
EST ref. GenBank:   FS426649.1 [5' end]   FS435334.1 [3' end]
Protein sequence: NtPrx79-1A(Nitab4.5_0001815g0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (169)
PWM (Da):   %s   36576.54 (18784.6) Transmb domain:   %s   i5-27o
PI (pH):   %s   5.43 (4.78) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-193
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKSFSSTATL LYATAFFLVA FVSALPFDDI DLPFDYYSLS CPKLEEIVHN KMEEWVKKDY TLAPALMRLH FHDCVVRGCD ASILLDHEGS EKSAKASKTL RGFEVIEDIK REVERVCPRT  VSCADILTVA ARDATLAVGG PFWMVPYGRK DGTVSYAKEA DQLVPTGHEI VTDLLELFQS KGLNVLDLVV LSGAHTIGRT TCESLQYRLY NYNGTRKSDS RLDHLYLNYL ERKCRWASEY 
VDLDAVTPKK FDVQYYKNLQ KGMGLLLTDQ LLYSDPRTAP IVTALATQPD VFENLFAASM VKLGNIQDYL SVDGEVRLSC ASVNSPGY 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence rfom genomic and EST. Uncorrect prediction from SGN (splicing error intron 1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAGTT TTTCAAGTAC CGCCACTTTG CTTTACGCCA CGGCCTTCTT TCTAGTGGCC TTCGTTTCTG CTTTACCATT TGACGATATT GACCTTCCTT TCGATTACTA TAGCCTTAGC  TGTCCCAAGC TTGAGGAGAT TGTACACAAC AAAATGGAGG AATGGGTTAA AAAAGATTAT ACCCTTGCTC CTGCTCTCAT GAGGTTGCAT TTCCACGACT GCGTTGTTAG GGTAAGTAAG  CATATTCGAG AGATAATTTA ACCTTAAATT CTTATTTTAC TTTTAATCAT GCTTTTATAT ATAGCCATAA AAATGTCATA GAATATTTAA AATCACATAT TTAAGAAGTT TTTCTTTCAT  TCTTAAACTT CGTCCTCGAT CAAACACCAT CATATAAATT GAACATAAAT AAGTTGAATT ATAGTTAATA TAACCCCAAA AAGGTCTAGT TTAAAGCTAT ATCTCCACTT TTTGGAATTT  TTATTTGAGT GTACAAGATG TGATACCTAG GTACAAAATG TTCTTTAATT AAGTTTGATA TTGTGTACAT GGATGGTAGG GATGTGATGC TTCAATACTG TTAGACCACG AAGGAAGTGA  GAAGAGTGCC AAAGCAAGTA AGACATTAAG GGGATTCGAG GTAATAGAGG ACATCAAAAG AGAAGTGGAG AGAGTGTGCC CAAGGACAGT GTCGTGTGCT GATATTCTAA CCGTAGCTGC  TCGAGACGCC ACACTTGCTG TAGGTGGTCC ATTTTGGATG GTTCCATATG GTAGGAAAGA TGGTACAGTT TCATATGCTA AGGAAGCTGA TCAATTGGTC CCTACGGGTC ACGAAGTAGT  CACTGATTTG CTTGAACTTT TCCAGTCCAA GGGCTTGAAT GTTCTCGACT TGGTTGTCCT CTCTGGTGAG TCCAACTAGC CACCTAGCTT CTATTTTATA TGACACATTT TTTGTTTTAG  TATGATCCCA AAAGAATTGC ACATTCTCTT ACTTATATAT GAAAACTACG TAACTTAACA TCCATATTTT CGTTTATTGA CATGACTTGT TGGCCGGACT CACTTGATAT AAACGTTCAT  TTTTTTTAAT GATTAAAAAA AGGACATGTG AAATTCTCAC AGACATTCAT TTAATTGGTT AATTTTGACA CCTTACGCAG ATTTGGCTTA CATATCAAAA TTTTCCTTTA ATTTCTTAAA  CTTCATATAT ATTCAGTCAA ACACTTCCAG ATAAACTCAG ACAGGAAGGG TAATCCTTAT CTATGTAGCT ATTTTTGGTT TAATGATCGA TCGGGGATAT CGATGGACTA GATCTACGCC  CATCAAATTA AAGTAGCAAA AAAAGCTATA ACTCAAATTA AGAATTACAG TTGAATATTA GTGTTGGTTT AATTATTTAC GTTATATATG TAGGAGCTCA CACAATTGGA AGAACCACAT  GTGAATCTCT GCAATACCGG CTATACAATT ATAATGGAAC TAGAAAATCA GATTCAAGGC TCGATCATCT CTACTTAAAC TATTTGGAAA GGAAGTGCAG ATGGGCATCT GAATATGTTG  ACCTTGATGC TGTTACTCCC AAGAAATTTG ATGTTCAGTA CTACAAGAAT TTGCAGAAGG GAATGGGACT ATTGTTGACA GACCAATTGC TCTACTCAGA TCCAAGAACT GCACCTATTG  TCACAGCTTT GGCTACTCAA CCAGACGTCT TTGAAAACCT GTTTGCAGCA TCTATGGTCA AGCTTGGAAA TATTCAAGAT TATCTTAGCG TTGATGGTGA GGTCCGACTC AGTTGCGCCA 
GTGTTAATAG TCCTGGTTAT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAAGCAATTC CACTTCATTA TTTCAGTTGA AGCTCCTCTT CCCCAAATTT CAAAGAATGA AGAGTTTTTC AAGTACCGCC ACTTTGCTTT ACGCCACGGC CTTCTTTCTA GTGGCCTTCG  TTTCTGCTTT ACCATTTGAC GATATTGACC TTCCTTTCGA TTACTATAGC CTTAGCTGTC CCAAGCTTGA GGAGATTGTA CACAACAAAA TGGAGGAATG GGTTAAAAAA GATTATACCC  TTGCTCCTGC TCTCATGAGG TTGCATTTCC ACGACTGCGT TGTTAGGGGA TGTGATGCTT CAATACTGTT AGACCACGAA GGAAGTGAGA AGAGTGCCAA AGCAAGTAAG ACATTAAGGG  GATTCGAGGT AATAGAGGAC ATCAAAAGAG AAGTGGAGAG AGTGTGCCCA AGGACAGTGT CGTGTGCTGA TATTCTAACC GTAGCTGCTC GAGACGCCAC ACTTGCTGTA GGTGGTCCAT 
TTTGGATGGT TCCATATGGT AGGAAAGATG GTACAGTTTC ATATGCTAAG GAAGCTGATC AATTGGTCCC TACGGGTCAC GAAATAGTCA CTGATTTGCT TGAACTTTTC CAGTCCAAG 

Retrieve as FASTA