Entry information : NtPrx83-1A(Nitab4.5_0003882g0030)
Entry ID 8335
Creation 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-30 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx83-1A(Nitab4.5_0003882g0030)
Name NtPrx83-1A(Nitab4.5_0003882g0030)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx282]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx83-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx83-1B 594 0 17..333 6..322
NsPrx01 471 1e-168 22..333 10..322
NtPrx76-1A 471 1e-168 22..333 10..322
NtPrx76-1B 467 3e-167 16..333 1..319
Literature and cross-references NtPrx83-1A(Nitab4.5_0003882g0030)
EST ref. GenBank:   FS438189.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx83-1A(Nitab4.5_0003882g0030)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333
PWM (Da):   %s   36487.52 Transmb domain:   %s   o10-32i
PI (pH):   %s   9
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MYNSSYTFYA IFLSPFNYIA MAYASICILL FLSFMQCEAQ LTPTFYENTC PKALSTIQKA VSQAVSRERR MAASLIRLHF HDCFVQGCDA SILLDETSNI TSEKTAVPNQ GSVRGFDVVE  AAKRELEKIC PGVVSCADIL TVAARDASVA VCGPSWKVKL GRRDSRTANR TLANIDIPSP FDNLDTLISR FAKKGLSAKD MVVLSGAHTI GQSQCSSFRN RIYNASDIDA SFASITRRQC 
PKNGGNGTLA PLDLVTDKIF DNNYFKNLMQ KKGLLQSDQV LFSGGLTDSI VSKYSKNNSV FFVDFAKAMI KMADIQPLTG RNGIIRRVCN TVN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. Uncrrect prediction from SGN (start of PS is missing and splicing error intron 1)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTACAACT CCTCTTACAC CTTTTACGCT ATTTTCTTGT CACCTTTTAA TTATATAGCT ATGGCTTACG CATCCATTTG TATTCTGCTA TTTCTTTCAT TCATGCAGTG TGAAGCGCAG  TTAACTCCTA CATTTTATGA AAATACATGT CCTAAGGCGC TTAGCACGAT TCAGAAGGCT GTGAGTCAAG CAGTATCGCG TGAACGTCGC ATGGCAGCTT CACTGATTCG CCTTCATTTC  CACGATTGCT TTGTCCAAGT AACATATATA GTATATATTA ATTCAGTATT TATTTGTCAT ATATTAGAAG CGGATTCCGA ATTTTAAAAT TTTGTGATGT TTAGTATCGT CACATCTTTA  TTTATTTGTT TTGACAATAG AACTTAATTA AAAAAAATTA TCAACTATAC GTATATAGAC AGTGGCAAAT CTGTCTTATG TTTTATAGGT GCTCAAGCAC CCATTACTTT TGGAGCCACG  TACTAATACT TATATAGAAA AACTAGTAAT TCATACAAAT ATATTAATTA GGCACCCAGT CTTAGTAGTA ATTTCTAGAT TAAAAATATT TAAATATCTA TGATTTAAAA ATCTTAAATA  TATATATAAA GAGAGAGCCA ATAACGGACG TGAAAAATAT AGAACCATGC TAACTTGTAG TATGCAAAGG CAGATCCAGG ATTTGAAGTT TATGGGTTCT GAACTTGTCA TCGAACCTAT  TGCACGTCTT AGTTACTGGG TTCACACAAT TAAATAGTTA TACACATTTA GTGAATTCTC TAATATAAAT ACAGGGGCTA AGCAAAAGCT ACTAGGTTCG TCCGAACCCA TAAGTAGTAC  TCTACCTCCG CCCCTGATAG TATGTATGCA TACCTTACCC CTATCTTATG GAGATAAAGA AGCTCTAAGT ATTTCTTTTA ATTTTTTCAT TCTATTTTAG GGGTGTGATG CATCAATCTT  ACTTGACGAG ACTTCAAATA TCACAAGTGA GAAGACAGCA GTACCTAATC AAGGATCTGT AAGAGGTTTT GATGTTGTTG AGGCCGCGAA GAGGGAGCTC GAAAAAATCT GCCCTGGAGT  AGTATCTTGT GCGGACATTT TGACCGTTGC AGCACGAGAT GCTTCTGTCG CTGTAAGTCC ACTAAAATTT CAATAAATAT TAGATCTGAA CTCATATATT TAAAAGGTAA ACACATTAAA  TATTTAAATC TTGAATCCAT CTCTTCTGTG ACTATATAAT GACCTACAGG TTTGCGGTCC ATCATGGAAG GTTAAACTTG GAAGAAGAGA CTCTAGGACA GCAAATCGTA CTCTAGCAAA  CATTGATATT CCTAGTCCCT TTGATAATCT TGACACTCTT ATTTCTAGAT TTGCTAAGAA AGGACTTAGC GCAAAGGACA TGGTTGTCCT GTCAGGTATC TTGAGAAAAT CTAAACAGTT  TATTTATGTT GAATTTAACT TCTATGCACT ACAATTAGAT CATTTATATG GTAATTACAA ATATATTAAT TGATAAGCTA ATAAAAATGG CTGATAGATT AAATTACATT ACTGATAATG  TAAGAAATCT TATATATGTT GTCAGACATA ATTTGTTAAT CAAGGGCATA TTTAGGGGGT TCTTGGGTTC ACCAAAGCCA TGTTCCCCTG CATAGATTAT GTATAGTCAG AGGCAGACCT  ATACATTGCG GTTGTGGTCA CGGGACCCTA TTAGATTCGG CAAAAACTTT ATATATATAT GGAACCTGTT AAATATTTTA GTTGTGCTCC AAACACAATA AAAGCAGGTG AGAGGAATGG  TTTATGTGGA GCGCTTTAGT ACATGGGTTT GAAACTCATC TATAGCTTTT CTCCTCCTTT CTATTTTGTA ATTCTTTGAA TTCAATTATA GTTTGGTATT CATGTGAACT TAATTTATTT  TATTCCTTTT TAAATCCCTC TCTTAAAATT AAAAGCCTCA AATTACAGCT CATCGTTCCA CAAATAGAAA AATATAAATT CTTCTTTAAC AATCACTTTG ACAAAGTAGC GATATTCGTC  TAATTTCGAC CCCGTCAATG GCAACTAAGA GTTTGATACT CTTCTTTAGT TCTTTCACTA TTAATATGCC CATTTTAATT TGAGAAAAAA ATTTAAATTT TAAAGTTTGA AATAGGTTTA  AATCAAACAC CTTCCCTTCT TATTGCATCC ATTTAGCGAA AAAATCTCTC TCTGTTAAGT GTTTTCCCTT TCTTTAGAAC TTCTTTTTGT TTATACTTAG ATGATAATGC ATCACAATCA  TTAAGATTTC AAAGTGTTGC ACGCCAATTT TTTTCTCTAG TAATTAGTGT ACAATGGTGT CCCCGTTGTG CTAAAATCCT TGGTCCGCTT CTGTGTATAG TAATATAATA TATTTTTCAA  ACAAAAAAAA ATGCTATACG TGTGTGTGCG TGCACGCGCT CGCACACCCA AGCTCGCGCG CGCACACTCA AGCTCAAAGA GTCTTGTGGT GCAGTAATAA TTATTGGGTT CAAATTCCAC  GTTTATCTTG CTGTTTTTTC TTTCTTGTTT TAGAATTGAG CTTGAAGTGT AAATTCATGA TAAGAACCTA AAGATTAAAA CAATCAAATA TAAATGTTAG TTCCACCTCT TTAATAGCAT  ATGGTCCACT CATATTCGTA AAATCTTGGA TATGCCTCTG CCGTTAATGC TGGAATATAT GCAGGGCCGA CTCTAATGGT CTAGCTACTA AGGCTTGTGC CTTAGGCTCC AAATTTGGAG  GGCCCCGTTT TTAAAAATAA TAGGTTTATA GGTAAATAAA ATTAAATGTA TAATACTTTT AGTTACAAAA GTAGATTTTT TATATAAAAG GAAAAAAGGA TTTTTAGATA TGTAAATAAA  GTAACCATTT TACTTACTTA AAAATGGATA CTATGAATAT TTTTCCAATG TGTGAATCAA AATTAATTTG ATAAGGAAAA CAGTACAAGT AGAAGATACT ATATACTCAA TCAAATAAAA  AGGCTTGATT CTTTTTCAAA TACTTATATT GTTTTCAAAA TAATGTTAAC ATTTGCTATA ACAGTTATCT CAACAGAAAC AATTTTTTTA AATTTAAAAT TGATAAATCT TAGTAAAGAT  CAATAATGTC TCAAGAAAAA TTAAATGAGT GAAAACATTT TGAATGGAGG AATTTAGGTA AAATCACATT AGGGTTTTAA GCCATGTGAA GAGAACATTT TTCTTCTCTG TATGTAACGA  AAATGAGGGC ACAATATCTG ATGGATCTTT CTAGATCCAT TACTATATAT TTATACAATG TGCCACATCA ATCCGGGTGC CCAATACCCA AGAGACCAAC TAACATACTA ACTAAGAAGG  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TGTCGACATA TCTCATTTTC CAAACAACAA TCTCATTACT TGCCATGAAT CAAACTCAAT TATATGCAGG GGCACACACC ATTGGCCAAT CACAGTGCTC TTCATTTAGG AACAGAATAT  ACAATGCATC AGATATAGAT GCAAGTTTTG CGAGCATTAC AAGACGTCAA TGTCCTAAAA ATGGAGGGAA TGGAACTTTG GCCCCACTCG ATTTGGTCAC AGACAAAATT TTTGACAACA  ATTATTTCAA GAACCTAATG CAGAAGAAAG GTCTACTCCA ATCTGATCAA GTTCTTTTCA GTGGAGGATT AACAGATAGT ATTGTTTCAA AATATAGCAA AAATAATAGT GTGTTTTTTG 
TGGATTTTGC TAAAGCTATG ATTAAAATGG CAGATATTCA ACCTCTAACT GGTCGAAATG GGATCATAAG GAGGGTCTGT AACACTGTCA ACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTACAACT CCTCTTACAC CTTTTACGCT ATTTTCTTGT CACCTTTTAA TTATATAGCT ATGGCTTACG CATCCATTTG TATTCTGCTA TTTCTTTCAT TCATGCAGTG TGAAGCGCAG  TTAACTCCTA CATTTTATGA AAATACATGT CCTAAGGCGC TTAGCACGAT TCAGAAGGCT GTGAGTCAAG CAGTATCGCG TGAACGTCGC ATGGCAGCTT CACTGATTCG CCTTCATTTC  CACGATTGCT TTGTCCAAGG GTGTGATGCA TCAATCTTAC TTGACGAGAC TTCAAATATC ACAAGTGAGA AGACAGCAGT ACCTAATCAA GGATCTGTAA GAGGTTTTGA TGTTGTTGAG  GCCGCGAAGA GGGAGCTCGA AAAAATCTGC CCTGGAGTAG TATCTTGTGC GGACATTTTG ACCGTTGCAG CACGAGATGC TTCTGTCGCT GTTTGCGGTC CATCATGGAA GGTTAAACTT  GGAAGAAGAG ACTCTAGGAC AGCAAATCGT ACTCTAGCAA ACATTGATAT TCCTAGTCCC TTTGATAATC TTGACACTCT TATTTCTAGA TTTGCTAAGA AAGGACTTAG CGCAAAGGAC  ATGGTTGTCC TGTCAGGGGC ACACACCATT GGCCAATCAC AGTGCTCTTC ATTTAGGAAC AGAATATACA ATGCATCAGA TATAGATGCA AGTTTTGCGA GCATTACAAG ACGTCAATGT  CCTAAAAATG GAGGGAATGG AACTTTGGCC CCACTCGATT TGGTCACAGA CAAAATTTTT GACAACAATT ATTTCAAGAA CCTAATGCAG AAGAAAGGTC TACTCCAATC TGATCAAGTT  CTTTTCAGTG GAGGATTAAC AGATAGTATT GTTTCAAAAT ATAGCAAAAA TAATAGTGTG TTTTTTGTGG ATTTTGCTAA AGCTATGATT AAAATGGCAG ATATTCAACC TCTAACTGGT 
CGAAATGGGA TCATAAGGAG GGTCTGTAAC ACTGTCAACT AA 

Retrieve as FASTA