Entry information : NtPrx78-2B(Nitab4.5_0000263g0180)
Entry ID 8336
Creation 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-03 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx78-2B(Nitab4.5_0000263g0180)
Name NtPrx78-2B(Nitab4.5_0000263g0180)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx008]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx78-2B
start..stop
S start..stop
NtPrx78-1A 649 0 1..319 1..319
NtPrx78-1B 646 0 1..319 1..319
LePrx25 608 0 1..319 1..319
StPrx16 606 0 1..319 1..319
Literature and cross-references NtPrx78-2B(Nitab4.5_0000263g0180)
Protein sequence: NtPrx78-2B(Nitab4.5_0000263g0180)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   319
PWM (Da):   %s   34343.29  
PI (pH):   %s   9.1
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASFKTAIVL FFLVSLTGSS SAQLTTGFYS KSCPKLYETV KSVVHSAVQK ETRMGASLLR LFFHDCFVNG CDGSLFLDDT STFTGEKRAQ PNFNSARGFE VIDDIKSAVE KVCPGVVSCA  DILAVTARDS VVILGGPNWD VKLGRRDART ASQAAANSSI PPPTSNLNRL ISSFTAVGLS TKDMVALSGA HTIGQARCTS FRARIYNETN NLDSSLAKTR QNNCPRNSGS GDNNLAPLDL 
QTPTYFDNHY FINLVSKKGL LHSDQQLFNG GSADSIVKSY SDNPNSFAAD FVTAMIKMGD IRPLTGSKGE IRKNCRRIN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Uncorrect prediction from SGB (splicing error of intron 3). Tandem duplication
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCTT TTAAGACTGC CATAGTTTTG TTTTTCCTAG TGAGCTTAAC TGGAAGCTCC TCAGCTCAAC TAACCACTGG CTTTTATTCA AAATCATGTC CTAAGCTCTA TGAAACTGTG  AAATCAGTAG TGCATTCTGC CGTTCAGAAG GAAACCCGTA TGGGTGCTTC CCTCCTTCGC CTATTCTTCC ACGATTGCTT CGTCAATGTA AGCTTCCTTC TTCATTTTTG GCCCTTTTCC  ATATAGATAA TAGTTTAATT CTTTATATCT ACTAACACCA TCGAGTATAT ATGTAGTATA AACACGAGTG CGACTAATTT TTATTTGTCA ATCTCCTGTT GATGATGTAT AGAGACTAGG  CACGAAATGT TAATTATAGA GCATTGTATA TGACCATTAA GGTTAAAGTA TTTTCTGTTG CCAAGTGTCC TAGGATTGAT CGTGATATCG TTTGCAAATC TATGTTTGAC AAGTTGACTA  CTAATTTGTT GCTGAGTCTT TATTAGTAGT AGAAGTTGTC TTTTTATGTC TCCAGGCATT TAGAAGGTCT TGGTCTCGAT TATATCGATA AGTTAGGTTA GTATACCTAA TTGTTAAACT  TTGACTTAGG CATACTCAGA ATTAATTAAT TTGGTCGCGT TTACATTATT TTTTATGCCT TTTGTCTAAA TTGGTTAATG CATTTATTTC AGGGATGCGA TGGATCATTA TTCCTAGATG  ATACATCAAC CTTCACAGGG GAAAAAAGGG CACAACCAAA TTTCAATTCC GCCAGAGGAT TTGAAGTTAT TGACGATATC AAATCTGCCG TTGAAAAAGT GTGCCCTGGG GTCGTCTCTT  GCGCTGATAT TTTGGCCGTT ACTGCTCGAG ACTCTGTTGT CATTGTAAGT TCTTTATGTT AACTAAGTAC AATAATTTTC ATTGTAAACC TCCTTTTGAA TTTTATGCTA ACGCGAATTA  TTGTTGTATA TAATGTAGCT TGGAGGGCCT AATTGGGATG TAAAACTAGG AAGAAGAGAT GCCAGAACAG CAAGCCAAGC TGCTGCAAAT AGTAGCATTC CTCCCCCGAC TTCAAACCTT  AACCGTCTCA TCTCTAGCTT CACTGCTGTT GGCCTTTCCA CCAAGGATAT GGTTGCCTTA TCTGGTTCGT TCTCTTCCCC GGCAACTCTT CGAAAATTAC CTCTTAAACA TAACGAAAAA  GGGTCATGTT TGACGGGTAA TAGGTTACAT CTTTAGGTAT GGGTTGGTTA ATAAACAGAT GCCCTCCACC TGTCCTTTTA AAGGTGGGTC CGGGTTGACC GTTGTAGGTA AAGGTATTTG  AGTTTAAAAG GGTAACGATA TGGGTAAATA ATGTTGAAAA GTATAATATG AGCTAATATG ACCTTTTTGC ATAACTAGAA TAACTTGGTA CAATATACTG ATAGCTGATA GCGTAAAAAA  AATTATATTA TAATCGATGT ATACAAATTA GGTAAATCCT CTCTAATATA TAATTTTGTC GTTATGTTTG TCAGGAGCTC ACACCATTGG ACAAGCAAGG TGCACAAGTT TCAGGGCACG  CATATACAAC GAGACCAATA ACTTGGATTC ATCACTAGCA AAAACAAGGC AAAACAACTG CCCAAGAAAC TCAGGTTCAG GGGACAACAA CTTGGCACCT CTTGATCTTC AGACTCCTAC  ATATTTCGAC AACCATTATT TCATTAACCT TGTAAGCAAA AAGGGTCTAC TCCACTCTGA TCAGCAGCTC TTCAACGGCG GATCCGCCGA TTCAATTGTG AAATCATACA GCGACAACCC 
CAACAGTTTC GCCGCTGATT TTGTGACTGC CATGATTAAG ATGGGTGACA TTCGTCCCCT TACTGGATCT AAAGGAGAGA TCAGGAAGAA TTGCAGGAGG ATCAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCTTCACCAT TCTCAGATTT TGCCACCCTT CAGCAACTGT TTGCAAAGAA AGGCCTAAAT GTCAATGATC TTGTTGCATT ATCAGGTGCT CACACCATTG GTGTTGCTCA TTGTGGAGCT  TTCTCTAGAA GACTCTTCAA TTTCACTGGC AAAGGTGACG TGGATCCATC TTTGAGTTCC ACTTATGCTG AATCTTTGAA ACAATTGTGC CCTAATCCAG CCAACCCAGC CACTACAGTG  GAAATGGACC CTCAGAGCTC AACTTCATTT GACAGCAATT ATTTCAACAT CCTTAAACAG AACAAAGGGT TGTTCCAATC TGATGCAACC CTCCTCACAG ACAAAAAATC AGCTAAAGTT  GTAAAACAAC TGCAAAAAAC TAATGCCTTT TTTTCTGAGT TTGCTAAATC CATGCAGAAC ATGGGAGCTA TTGAAGTTCT TACTGGACAT GCTGGACACA TCAGGAAGAA TTGCCGCGTC 
AGAAACTAAT TCTTGAAAAC CTATGATTAC CTTTATTTCC TATATTTGTA ATCTCTAAAG TGTTCACATC TGGTATTAAC TTCTGTCCAA AAAACATAAT ACACACCAAA CACACC 

Retrieve as FASTA