Entry information : NtPrx86-1A(Nitab4.5_0009648g0040)
Entry ID 8339
Creation 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-26 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2022-08-09 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: NtPrx86-1A(Nitab4.5_0009648g0040)
Name NtPrx86-1A(Nitab4.5_0009648g0040)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Nicotiana
Organism Nicotiana tabacum    [TaxId: 4097 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value NtPrx86-1A
start..stop
S start..stop
NtPrx86-1B 647 0 9..331 1..323
LePrx67 635 0 1..331 1..331
NtPrx73-1A 607 0 1..331 1..332
NtPrx35-1B 603 0 1..330 1..330
Literature and cross-references NtPrx86-1A(Nitab4.5_0009648g0040)
DNA ref. GenBank:   ET833589.1 [5' end]
EST ref. GenBank:   EB424758.1 [5' end]
Protein sequence: NtPrx86-1A(Nitab4.5_0009648g0040)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (122)
PWM (Da):   %s   36378.68 (13128.8) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   9.67 (8.21) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:23-144
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVQSLSFFMV IVLLAFAPIC FSTKTYGGYL FPQFYDQSCP QAKEIVKFIV AKAVAKEARM AASLLRLHFH DCFVKGCDAS LLLDSSGSII SEKRSNPNRN SARGFEVIDE IKKALEKECP  QTVSCADILA LAARDSTVLV GGPNWEVPLG RRDSRGASIS GSNNNIPAPN NTFNTILTKF KLKGLDIVDL VALSGSHTIG NARCTSFKQR LYNQSGNSKP DFTLEQSYAA QLRTKCPRSG 
GDQNLFFLDF VSPTKFDNSY FKNLLASKGL LNSDQVLVTK NQESLNLVKQ YAENNGLFFE QFAKSMVKMG NISPLTGSRG EIRKNCRKIN S 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic and 1 EST. Uncorrect prediction from SGN (splicing error introns 1 and 3)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTCAAT CCTTGAGCTT CTTCATGGTT ATTGTTCTCC TTGCTTTTGC ACCAATTTGT TTCTCTACTA AGACTTATGG TGGTTACTTA TTCCCACAAT TTTATGACCA ATCATGTCCC  CAAGCAAAAG AAATTGTTAA GTTTATTGTT GCCAAGGCTG TAGCCAAAGA AGCTCGAATG GCTGCTTCAT TATTGAGGTT GCATTTTCAC GACTGCTTTG TCAAGGTAAA GCTCTCATGT  TATTATATGC ATGTCACGCC TTATTTTATG CAGTATTTAT ATTTGTTAGA GCAATGATAC ATACAATGAT ATATACAAAA AAAAAAAAGA TTATTTCCAT CCTATCGATG AAGGAAATTC  AGTTGAACCC CTTCAGACCA CGTAGCTCGG ACTGACTATT ATTTTCATTG TGTCTGTCAT GTAGGGGTGT GATGCATCTC TGCTTCTTGA CAGCAGTGGA AGCATAATTA GTGAGAAAAG  ATCAAATCCC AACAGGAATT CGGCTCGTGG ATTTGAAGTC ATTGATGAGA TTAAGAAGGC ATTAGAAAAG GAGTGCCCTC AAACAGTCTC TTGTGCAGAC ATCTTGGCAT TAGCTGCAAG  GGATTCAACA GTTTTAGTAA GTTAAATAGC TAGCATGCAT AGGAATAAGA GTTGATCAAA AGAACATTTT TAAGAGACTA TTTAAAACTC ATGACATTTT CATATTTTTG GTTTATACAG  GTCGGTGGAC CAAATTGGGA GGTCCCATTG GGAAGGAGAG ACTCCAGAGG TGCCAGTATA AGTGGCTCCA ACAATAACAT TCCTGCTCCA AACAACACAT TTAATACCAT TCTCACTAAA  TTCAAGTTAA AGGGGCTTGA TATTGTTGAC CTTGTAGCTT TATCTGGTAA AAATTTCTCT TTCTCTTTCC TAGATAAACA ATTTAACTTA TAAACAGTAA CAGTATAAAA GAGCATATTT  TTACACAATC AAACCACCTA AAAAGTAACT GTAGGTAACT TTCTATAATA AGTGAAAGTA CATTTACCTG GAAAAATAAA GCAGGCAACC CTGCTATAAC ATGTTAAATT ACATTTTAAA  TGTTTAGCTA AACTACTTAT CACACATGAA ACCATAGTGT TTAACTTATT TACAATGATA TGTAAAGAGA TCTTACATTA TCAGTGTATC TTAAACTGTT ATAGCAGGTA AGCTGTCTTA  TTTTTAGATG GCCTGATAGA TTTTTTTATA GTGAATTCTA GAGAAGTTAA ACTGTAGGCT AAATAAATTA TCACTTAATT AATGCCAAAA GTTTGTTCTA CAGGGAGCCA CACAATTGGA  AATGCAAGAT GCACCAGCTT CAAGCAGAGA CTCTACAATC AGTCAGGAAA CAGTAAACCA GACTTTACAT TGGAACAGTC ATATGCCGCC CAGTTGCGCA CTAAGTGCCC AAGATCTGGT  GGTGACCAAA ACTTATTCTT CTTGGACTTT GTATCCCCCA CAAAATTTGA CAACAGCTAC TTCAAAAACT TGTTGGCTTC AAAAGGTCTA CTGAACTCGG ACCAAGTTCT TGTTACTAAG  AATCAAGAAT CATTAAACTT AGTGAAACAA TATGCAGAAA ACAATGGGCT TTTCTTTGAG CAATTCGCTA AGTCAATGGT TAAGATGGGA AATATTTCAC CTTTGACGGG TTCCAGGGGA 
GAAATCAGGA AGAACTGCAG GAAGATCAAC TCCTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTCAAT CCTTGAGCTT CTTCATGGTT ATTGTTCTCC TTGCTTTTGC ACCAATTTGT TTCTCTACTA AGACTTATGG TGGTTACTTA TTCCCACAAT TTTATGACCA ATCATGTCCC  CAAGCAAAAG AAATTGTTAA GTTTATTGTT GCCAAGGCTG TAGCCAAAGA AGCTCGAATG GCTGCTTCAT TATTGAGGTT GCATTTTCAC GACTGCTTTG TCAAGGGGTG TGATGCATCT  CTGCTTCTTG ACAGCAGTGG AAGCATAATT AGTGAGAAAA GATCAAATCC CAACAGGAAT TCGGCTCGTG GATTTGAAGT CATTGATGAG ATTAAGAAGG CATTAGAAAA GGAGTGCCCT  CAAACAGTCT CTTGTGCAGA CATCTTGGCA TTAGCTGCAA GGGATTCAAC AGTTTTAGTC GGTGGACCAA ATTGGGAGGT CCCATTGGGA AGGAGAGACT CCAGAGGTGC CAGTATAAGT  GGCTCCAACA ATAACATTCC TGCTCCAAAC AACACATTTA ATACCATTCT CACTAAATTC AAGTTAAAGG GGCTTGATAT TGTTGACCTT GTAGCTTTAT CTGGGAGCCA CACAATTGGA  AATGCAAGAT GCACCAGCTT CAAGCAGAGA CTCTACAATC AGTCAGGAAA CAGTAAACCA GACTTTACAT TGGAACAGTC ATATGCCGCC CAGTTGCGCA CTAAGTGCCC AAGATCTGGT  GGTGACCAAA ACTTATTCTT CTTGGACTTT GTATCCCCCA CAAAATTTGA CAACAGCTAC TTCAAAAACT TGTTGGCTTC AAAAGGTCTA CTGAACTCGG ACCAAGTTCT TGTTACTAAG  AATCAAGAAT CATTAAACTT AGTGAAACAA TATGCAGAAA ACAATGGGCT TTTCTTTGAG CAATTCGCTA AGTCAATGGT TAAGATGGGA AATATTTCAC CTTTGACGGG TTCCAGGGGA 
GAAATCAGGA AGAACTGCAG GAAGATCAAC TCCTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGGAAAGCAA GCCATATAGC CTACTTACAT TCTCAAACTA GTCTCTTATA TACCAAGTTA CCTTATTAAT ACTCTTTAAG TATGGTTCAA TCCTTGAGCT TCTTCATGGT TATTGTTCTC  CTTGCTTTTG CACCAATTTG TTTCTCTACT AAGGCTTATG GTGGTTACTT ATTCCCACAA TTTTATGACC AATCATGTCC CCAAGCAAAA GAAATTGTTA AGTTTATTGT TGCCAAGGCT  GTAGCCAAAG AAGCTCGAAT GGCTGCTTCA TTATTGAGGT TGCATTTTCA CGACTGCTTT GTCAAGGGGT GTGATGCATC TCTGCTTCTT GACAGCAGTG GAAGCATAAT TAGTGAGAAA  AGATCAAATC CCAACAGGAA TTCGGCTCGT GGATTTGAAG TCATTGATGA GATTAAGAAG GCATTAGAAA AGGAGTGCCC TCAAACAGTC TCTTGTGCAG ACATCTTGGC ATTAGCTGCA 
AGGGATTCAA CAGTTTTAGT CGGTGGACCA AAT 

Retrieve as FASTA