Entry information : LePrx66 (Solyc03g033710.2.1[2.3])
Entry ID 8345
Creation 2011-04-27 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2011-04-27 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2014-08-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: LePrx66 (Solyc03g033710.2.1[2.3])
Name (synonym) LePrx66 (Solyc03g033710.2.1[2.3])
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Solanaceae Solanum
Organism Lycopersicon esculentum (Tomato)    [TaxId: 4081 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value LePrx66
start..stop
S start..stop
LePrx67 560 0 1..333 1..330
NnPrx50 557 0 1..333 1..330
RcPrx17 556 0 1..333 1..330
NnPrx37 551 0 1..333 1..330
Literature and cross-references LePrx66 (Solyc03g033710.2.1[2.3])
DNA ref. GenBank:   AEKE02020923.1 (1812..4658)
Protein sequence: LePrx66 (Solyc03g033710.2.1[2.3])
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   333 (311)
PWM (Da):   %s   37010.71 (34602.4)  
PI (pH):   %s   8.29 (8.18) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-333
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKILSLFIM VTSLLVFSPT LCLSSKTNYY GYLYPQFYDW SCPNAKEIVK SVVAKAVTRE ARMAASLLRL HFHDCFVKGC DVSLLLDSNG PIISEKLSNT NRNSARGFEV IDEIKSALEM  ECPQTVSCAD ILALAARDST VLAGGPSWEV PLGRRDSRDA SISGSNNNIP APNNTFDTIL TKFKLKGLDL VDLVTLSGSH TIGNARCTSF KQRLYNQSGN NLPDYTLDQS YATELRTMCP 
KFGGDQNLFF LDYVTPTKFD NNYYKNLLAS RGLLNSDQIL VTKNQATLEL VKLYAENNEI FFDQFAKSMV KMGNISPLTG YKGEIRKNCR YMN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 3, 3 introns). Cultivar="Heinz 1706".
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAAAA TATTGAGTTT ATTCATCATG GTCACATCTC TTCTTGTTTT TTCACCAACA TTATGTTTAT CTAGCAAAAC CAATTATTAT GGTTACCTAT ATCCACAATT TTATGATTGG  TCATGCCCAA ATGCAAAAGA AATTGTCAAG TCTGTTGTTG CTAAGGCTGT AACTAGAGAA GCTCGAATGG CTGCCTCTTT GCTTAGGCTT CATTTTCACG ATTGCTTTGT CAAGGTAAAT  CATTTTTCGT CTCTTGAAAA GCATATTTGT ACGTTCTTGA TTCAACATAT TTTCACTGTG GTGTTTGAGT AGATACTGTT ACTTTTTCAT GAATCATACA ATTCCTTAAT GACTTAATTA  TTTTCCGTTA TTTGATTGTC TGAAATTATG TTTTACGAAA ATACTTTCCA TAAATTTTTG TAAAAAAAAA AAGAAGGAAA ATATGACTTA CCTCACTTAG CAATTATCTT TTTTTCTTTA  CTTCAAATCA CAAACTATTT TTAGTAATTA ATATTCAAAA GTTCCATCAA ACACAATGTA GTTTGTTATT ACTATTATCA TCAATCTTTG ATACTATTAT TTTAAGAAAA AAGTTATTTT  TCACTCTCTA GCTAAATTCT AGAAAAACAA TTCCTAAAAA GTATAAGTGT TTAGCCAAAA TTTATAAGCT GGTCAAATTA TATTATAAAT ATAGTTTGAG TTTTCAATTA ACCAAAAAAT  CATAAGTCAA TCATTCTCGA TTTATGACTT TTCTAACTTA TAAATGTTTT TAATTTAACT ATTTCTTTTT ATTATTTTAT CAGTTATTTT CAATAAGTTA ACTCAGACGG ATTAACTAAC  TATAATATTT TTTTTATTTT ATGATCATGT AGGGGTGTGA TGTATCATTG CTTCTGGACA GCAATGGACC AATAATAAGT GAAAAATTAT CAAACACCAA TAGAAATTCA GCACGTGGAT  TTGAAGTAAT CGATGAAATT AAATCTGCAC TTGAAATGGA ATGCCCTCAA ACCGTCTCTT GTGCTGATAT ATTGGCCCTT GCTGCAAGGG ATTCTACTGT TTTAGTAAGT ACAACGACTT  TAAACCTAGC AAAAAAAAGT AACCTAACCA AAAGATTTCA ATTTCGATGA GCTCAATAAA GTTTGTTTAA ATTTTATTTT TTTATTAGAA AACCTTTTAA GTATGCATAA ATATATAGTT  ATAAATTCAG TAGTTAAGAC GAGCTATGAA TTCTTGCAGG TAAGTTCAAA AATAATACTA GCGAGACTAT TTTATCTCTC GTTGATGAGT GTTAATAAGT CAATGAAATA CATTTTGTAT  TAAAATAACA GGATAAACTA TTCCCATATT TTATAAAATA TCATGATCTG TTCGATTTCA ATTAAGTTAA AAAAAATTAT ATCCTATATA ATTGTAGTTA TTATCTTGAT AAGATTATGA  GATAATTCTT AATTTATATT ATCAGTATAT AAAATTTAAA CTCGATTATT ATTTATGCAG GCTGGTGGAC CAAGCTGGGA GGTTCCATTA GGAAGAAGAG ACTCAAGAGA TGCTAGTATA  AGTGGCTCCA ACAATAACAT TCCTGCTCCT AACAACACAT TTGATACTAT TCTTACTAAA TTCAAGCTAA AAGGGCTTGA TCTGGTTGAC CTTGTTACTT TATCTGGTAA AATTTACTCG  TCCTAATTTA ACTTTTATAC ATTTAAATGA TAATTACAAA TATTTTGAAT AATTTATATC GAAAAAATAG TATAACTTTA TACCATATCC AATGGGAAAT AACAATTTAT AGGATTATTT  ATTCTTGGAT AAAACAAGTC AAATAACGAA ACTCTCCTTC TATCAAAGTC CTTGCAACTT TAAACTAAGA TCAAGGTTAA AATTGGAACA TAATTTTATT TTTACAATAT AAAATCAAAC  ATATATTTTA GATTATACAT TATGTATATC CAAGTTATCA CATTTTTTAA AAAGAAAATC ATCATAAATG TTAAAAAAAT CCATGAATTA TTAGTATGTA CAACAATCCC TATATAATAT  TGTTCACAAA TCAAATAACC TTTTTAGTAT AATTTTGTTC TATTATCCAT GTGTTATACA TATATAATTT AATTCTTCAT TCGATTTTAA CTAAACTAAT TATCATATCA GGGACGGAGC  TGGATAGAAT GAATTCCTTT AACAAAAAAA ATAATATTTC TATATAAGAT TAATTTTATT TTTTTTTGAA TGTTAAGAGA GGACAATTAC CTCTTGTTTC TGCTCCTCTT TCTTTGCTTT  GGGGAAAAGA GGTCCTGCGA TAGTTAATAA GAGGCACAAA CAAGTTTTAT GTATATATAG TACAAGTTGA ATTTCTTTTG ATTTTTTTGT ATGTTTACTT TTTTATAATT TTAAACCTCA  ATTTAGTAAA AATTCTGACT CGAAAATTGT CTTGTAGGGA GCCACACCAT TGGAAATGCA AGATGCACTA GCTTCAAGCA AAGACTCTAC AATCAATCAG GAAATAATTT ACCAGATTAT  ACACTTGATC AATCATATGC TACAGAATTG AGAACTATGT GCCCAAAATT TGGTGGTGAC CAAAATTTAT TTTTCTTGGA TTATGTCACA CCAACAAAAT TTGATAACAA TTACTACAAG  AACTTGTTGG CTTCAAGGGG TTTGTTGAAT TCAGATCAAA TTCTTGTGAC AAAGAATCAA GCAACATTAG AATTGGTGAA ATTGTATGCC GAAAATAATG AGATTTTCTT CGATCAGTTT 
GCGAAATCTA TGGTTAAAAT GGGAAATATT TCACCTTTAA CTGGATATAA GGGAGAGATT AGGAAGAATT GTAGATACAT GAATTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTAAAA TATTGAGTTT ATTCATCATG GTCACATCTC TTCTTGTTTT TTCACCAACA TTATGTTTAT CTAGCAAAAC CAATTATTAT GGTTACCTAT ATCCACAATT TTATGATTGG  TCATGCCCAA ATGCAAAAGA AATTGTCAAG TCTGTTGTTG CTAAGGCTGT AACTAGAGAA GCTCGAATGG CTGCCTCTTT GCTTAGGCTT CATTTTCACG ATTGCTTTGT CAAGGGGTGT  GATGTATCAT TGCTTCTGGA CAGCAATGGA CCAATAATAA GTGAAAAATT ATCAAACACC AATAGAAATT CAGCACGTGG ATTTGAAGTA ATCGATGAAA TTAAATCTGC ACTTGAAATG  GAATGCCCTC AAACCGTCTC TTGTGCTGAT ATATTGGCCC TTGCTGCAAG GGATTCTACT GTTTTAGCTG GTGGACCAAG CTGGGAGGTT CCATTAGGAA GAAGAGACTC AAGAGATGCT  AGTATAAGTG GCTCCAACAA TAACATTCCT GCTCCTAACA ACACATTTGA TACTATTCTT ACTAAATTCA AGCTAAAAGG GCTTGATCTG GTTGACCTTG TTACTTTATC TGGGAGCCAC  ACCATTGGAA ATGCAAGATG CACTAGCTTC AAGCAAAGAC TCTACAATCA ATCAGGAAAT AATTTACCAG ATTATACACT TGATCAATCA TATGCTACAG AATTGAGAAC TATGTGCCCA  AAATTTGGTG GTGACCAAAA TTTATTTTTC TTGGATTATG TCACACCAAC AAAATTTGAT AACAATTACT ACAAGAACTT GTTGGCTTCA AGGGGTTTGT TGAATTCAGA TCAAATTCTT  GTGACAAAGA ATCAAGCAAC ATTAGAATTG GTGAAATTGT ATGCCGAAAA TAATGAGATT TTCTTCGATC AGTTTGCGAA ATCTATGGTT AAAATGGGAA ATATTTCACC TTTAACTGGA 
TATAAGGGAG AGATTAGGAA GAATTGTAGA TACATGAATT AA 

Retrieve as FASTA