Entry ID | 8373 |
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Creation | 2011-05-12 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2011-05-12 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Marcel Zamocky |
Last annotation changes | 2012-01-18 (Christophe Dunand) |
Name | VcaCP01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Catalase peroxidase [Orthogroup: CP002] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Chlorophyta Chlorophyceae Volvocaceae Volvox | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Volvox carteri [TaxId: 3067 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | N/D |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichier |
Exons►
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Literature | Prochnik S., Umen J., Nedelcu A.M., Hallmann A., Miller S.M., Nishii I., Ferris P., Kuo Al. Mitros T. et al. (2010) Genomic Analysis of Organismal Complexity in the Multicellular Green Alga Volvox carteri. Science 329:223-226. |
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Protein ref. | UniProtKB: D8UCP0 [Incorrect prediction] |
DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_60 (623660..628869) |
Cluster/Prediction ref. | UniGene: Vca.1617 [5' end] Vca.1438 [3' end] |
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence 752 Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequence from genomic (10 introns) and 24 ESTs. Incorrect splicing prediction from Phytozome => confirmed with EST (FD830641.1). | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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