Entry information : PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
Entry ID | 8470 |
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Creation | 2011-08-18 (Christophe Dunand) |
Last sequence changes | 2011-08-18 (Christophe Dunand) |
Sequence status | complete |
Reviewer | Qiang Li |
Last annotation changes | 2011-11-28 (Qiang Li) |
Peroxidase information: PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
Name (synonym) | PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Class | Ascorbate peroxidase [Orthogroup: APx2004] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Salicaceae Populus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Organism | Populus trichocarpa (Western balsam poplar) [TaxId: 3694 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Cellular localisation | N/D |
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Tissue type | Leaves |
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Inducer | N/D |
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Repressor | N/D |
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Best BLASTp hits |
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Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8470' 'complement(join(14661631..14661741,14661934..14662068,14662196..14662333,14662685..14662791,14662938..14663068,14663496..14663536,14663648..14663713,14663847..14663881,14663965..14664049,14664439..14664537,14664645..14664740))' |
Exons►
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Literature and cross-references PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
DNA ref. | Phytozome 12: scaffold_5 (14664740..14661631) |
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Omic ref. | ePlant: Potri.005G161900 |
Protein sequence: PtAPx10 (POPTR_0005s17350 / Potri.005G161900)
Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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Remarks | Complete sequecne from genomic and 8 ESTs. Incorrect prediction from Phytozome (first intron is not predicted) | ||||||||||||
DNA ► Send to BLAST |
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CDS► Send to BLAST |
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