Entry information : HanCIIBA
| Entry ID | 8498 |
|---|---|
| Creation | 2011-09-15 (Christophe Dunand) |
| Last sequence changes | 2011-09-15 (Christophe Dunand) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Christophe Dunand |
| Last annotation changes | 2012-11-07 (Christophe Dunand) |
Peroxidase information: HanCIIBA
| Name | HanCIIBA | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Class | Other class II peroxidase type A [Orthogroup: CIIBA001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Fungi Basidiomycota Agaricomycetes Bondarzewiaceae Heterobasidion | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Heterobasidion annosum (root rot fungus) [TaxId: 13563 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8498' 'complement(join(896882..896894,896951..896975,897039..897078,897135..897245,897297..897361,897417..897445,897501..897616,897671..897724,897776..898016,898070..898148,898208..898249,898303..898316,898372..898430,898486..898494,898547..898563,898624..898644,898693..898735,898792..898899))' |
Exons►
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Literature and cross-references HanCIIBA
| DNA ref. | JGI genome: scaffold_14 (898899..896882) |
|---|---|
| mRNA ref. | JGI transcript: 108376 |
Protein sequence: HanCIIBA
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (17 introns). Intron 13 is not included in a Cintron 897417..897445,897501..897616 | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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