Entry information : CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Entry ID | 8557 |
|---|---|
| Creation | 2011-07-03 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2011-09-27 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Qiang Li |
| Last annotation changes | 2012-06-13 (Qiang Li) |
Peroxidase information: CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Name (synonym) | CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Cytochrome C peroxidase [Orthogroup: CcP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Chlorophyta Chlorophyceae Chlamydomonadaceae Chlamydomonas | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Chlamydomonas reinhardtii [TaxId: 3055 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Tissue type | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Inducer | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Repressor | N/D |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Best BLASTp hits |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Gene structure Fichier |
Exons►
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Literature and cross-references CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Literature | Grossman,A., Chang,C.-W., Davies,J., Harris,E., Hauser,C., Lefebvre,P., McDermott,J.P., Shrager,J., Silflow,C. and Stern,D. Analyses of the Chlamydomonas reinhardtii Genome: A Model,Unicellular System for Analyzing Gene Function and Regulation in Vascular Plants. Project: 963 |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: chromosome_2 (8824059..8819688) |
Protein sequence: CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
|
||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Sequence 414 Send to BLAST Send to Peroxiscan |
|
||||||||||||
| Remarks | Complete sequence from genomic (Scaffold_35, 10 exons predicted with Softberry) and 14 + 13 ESTs (TC48660 and TC44953). Contig position: 46556-42185. Two other small genomic sequences (scaffold_706 and scaffold_69 from JGI sequencing project). Prediction of 35AA long signal peptide for transport in mitochondria. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
|
||||||||||||
| CDS► Send to BLAST |
|
||||||||||||
