Entry information : CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Entry ID | 8557 |
|---|---|
| Creation | 2011-07-03 (Qiang Li) |
| Last sequence changes | 2011-09-27 (Qiang Li) |
| Sequence status | complete |
| Reviewer | Qiang Li |
| Last annotation changes | 2012-06-13 (Qiang Li) |
Peroxidase information: CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Name (synonym) | CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Class | Cytochrome C peroxidase [Orthogroup: CcP001] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Taxonomy | Eukaryota Viridiplantae Chlorophyta Chlorophyceae Chlamydomonadaceae Chlamydomonas | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Organism | Chlamydomonas reinhardtii [TaxId: 3055 ] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Cellular localisation | N/D |
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| Tissue type | N/D |
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| Inducer | N/D |
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| Repressor | N/D |
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| Best BLASTp hits |
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| Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8557' 'complement(join(8819688..8819753,8820078..8820122,8820446..8820551,8821027..8821111,8821401..8821500,8821827..8821968,8822213..8822305,8822772..8822944,8823222..8823344,8823874..8824059))' |
Exons►
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Literature and cross-references CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Literature | Grossman,A., Chang,C.-W., Davies,J., Harris,E., Hauser,C., Lefebvre,P., McDermott,J.P., Shrager,J., Silflow,C. and Stern,D. Analyses of the Chlamydomonas reinhardtii Genome: A Model,Unicellular System for Analyzing Gene Function and Regulation in Vascular Plants. Project: 963 |
|---|---|
| DNA ref. | Phytozome 12: chromosome_2 (8824059..8819688) |
Protein sequence: CreCcP01 (Cre02.g139650.t1.1)
| Sequence Properties first value : protein second value (mature protein) |
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| Sequence Send to BLAST Send to Peroxiscan |
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| Remarks | Complete sequence from genomic (Scaffold_35, 10 exons predicted with Softberry) and 14 + 13 ESTs (TC48660 and TC44953). Contig position: 46556-42185. Two other small genomic sequences (scaffold_706 and scaffold_69 from JGI sequencing project). Prediction of 35AA long signal peptide for transport in mitochondria. | ||||||||||||
| DNA ► Send to BLAST |
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| CDS► Send to BLAST |
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