The peroxidases and oxidases database
Entry information : ZmDiOx[P]04(Zm00001d046636 )
Entry ID 8566
Creation 2010-12-23 (Marie Brette (Scipio))
Last sequence changes 2011-09-28 (Christophe Dunand)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2023-01-18 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: ZmDiOx[P]04(Zm00001d046636 )
Name ZmDiOx[P]04(Zm00001d046636 )
Class Alpha-dioxygenase    [Orthogroup: DiOx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Monocotyledons Poaceae Zea
Organism Zea mays    [TaxId: 4577 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value ZmDiOx[P]04
start..stop		 S start..stop
ZmDiOx[P]06 431 5e-156 1..227 1..236
ZmDiOx[P]03 426 3e-154 1..227 1..228
ZmDiOx[P]02 425 6e-154 1..227 1..227
ZmDiOx[P]05 424 4e-153 1..227 1..236
Literature and cross-references ZmDiOx[P]04(Zm00001d046636 )
Protein sequence: ZmDiOx[P]04(Zm00001d046636 )
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   234 (320)
PWM (Da):   %s   26214.68 (35004.5)  
PI (pH):   %s   6.25 (5.77) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-347
Sequence 0
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
DDGLLLHEEN GVALLGDVRN SWVGVWILQA LFVKEHNAVC DAIKEEHPNL SDKELYRYAR LVTSVVIAKV HTLDWTVELL KTKTMRARMR ANWYDLLGKK IKDTFGHIGG PTLGGLVGLK 
KPINHGVSYS LTEEFTSVTL KLRDPTDQPD ANNSPPYLKD IDIGELVGLK GEEQLSKIGF EKKILSMGYQ ACGALELWNY PSFFTDLIPQ NLDRTNRSER IDLAALEVAR DRER 

Retrieve as FASTA  
Remarks Pseudogene from genomic. Short part. Incorrect prediction from Phyotozome.
complement(join(96519765..96519784,96575640..96575842,96576147..96576211,96576222..96576357,96576516..96576661,96576833..96576964))
DNA ►
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GATGATGGTC TTCTTTTGCA TGAGGAGAAT GGTGTGGCAT TATTGGGCGA TGTTCGCAAC AGTTGGGTCG GGGTTTGGAT CTTACAAGCT CTTTTTGTTA AGGAACACAA TGCAGTGTGT  GATGCAATAA AGGTAAGAGA AGCATCACTA TTATTATCTA TTTGTTTAGT TTATATGAAG AATTTGATGT TCTTGATTTC TTTCCACCAT ACCGATAAAG TTGTTGTTTA TTAATTACCA  AGACATTAAT TTTTTTATGC TAAAATATGA AGAAACAATT AAAATGTTCT TTTAATATCT CAGGAAGAAC ATCCCAACCT ATCAGACAAA GAATTATATC GGTATGCTAG ATTGGTCACT  TCTGTTGTCA TTGCGAAGGT TCACACTCTT GATTGGACTG TCGAGCTTCT CAAGACTAAG ACCATGAGAG CTAGAATGCG TGCAAATTGG TGAGGATATA TTATCTCATT TTCTCATATT  TGTTGAAAGA AAACAATTAA CGCTGATATT ACTTTTCCAA GTGGAAATTT TATTTACATG TCATATTCAA ATTAATTAAT TAGTGAGATT GTGTACAAAT TTACCTCATT CTAATTCTTT  TGTGAAGGTA TGATTTATTG GGTAAGAAAA TAAAAGATAC ATTTGGTCAC ATAGGAGGAC CGACATTAGG TGGGCTTGTG GGATTGAAGA AGCCGATCAA CCATGGCGTA TCTTATTCTT  TGACTGAAGA GTTTACCAGT GTTTACAGAA TGCACTCTTA AGCTCAGGGA TCCGACCGAC CAACCCGATG CAAATAATTC CCCACCGTAC CTGAAAGAGT GAGTAGACAA TTTATATATG  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CCATCACCGC GACCGTCGGG CCCACCTCGA CGAGAGGGTG CGCCGAGGCT ACCACCCCAG GCGTGGGGGA CGCTACGATA GCGGGGAGGA TCGGAGTCCC TTGCCCGAAC CACCCGGTCC  GCTGGCTTTC AGCCGCGCCA TACGACGGGC GCCGTTCCCG ACCCGGTTCC GACCCCCGAC TACTATCACA AAGTACTCGG GGGAGACGAG ACCGGAACTG TGGCTCGCGG ACTACCGGCT  GGCCTGCCAA CTAGGTGGAA CAGACGATGA CAACCTCATC ATCCGCAACC TCCCCCTGTT TCTCTCTGAC GCCGCTCGCG CCTGGTTGGA GCACCTACCT CCGGGGCAGA TCTCCAACTG  GGACGACCTG GTCCAAGCCT TCGCCGGCAA TTTCCAGGGC ACGTACGTGT GCCCTGGAAA CTCCTGGGAC CTCCGAAGCT GCCGGCAGCA GCCGGGAGAG TCTCTCCGGG ACTACATCCA  GCGATTCTCG AAGCAGCGCA CCGAGCTGCC CAACATCACC GATTCGGATG TAATCGGCGC GTTCCTCGCC GGCACCACCT GCCGCGACCT GGTGAGCAAG CTGGGTCGCA AGACCCCCAC  CAGGGCGAGC GAGCTGATGG ACATCGCCAC CAAGTTCGCC TCTGGCCAGG AGGCGGTCGA GGCTATCTTC CGGAAGGACA AGCAGCCCCA GGGCCGCCCA CCGGAAGACG CCCCCGAGGC  GTCAACTCAG CACGGTGCCA AGAAGAAAGG CAAGAAGAAG TCGCAAACGA AACGCGACGC CGCCGACGCG GACCTTGTCG CCGCCACCGA GTACAAGAAC CCTCGGAAAC CCCCCGGAGG  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