Entry information : AcoPrx01 ( AcoGoldSmith_v1.004682m)
Entry ID 8571
Creation 2011-07-03 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-01-18 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-01-18 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AcoPrx01 ( AcoGoldSmith_v1.004682m)
Name (synonym) AcoPrx01 ( AcoGoldSmith_v1.004682m)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx039]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Ranunculaceae Aquilegia
Organism Aquilegia coerulea     [TaxId: 218851 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AcoPrx01
start..stop
S start..stop
AfpPrx12 872 0 1..462 1..453
VvPrx89 536 0 155..462 39..352
NnPrx57 535 0 149..462 34..347
EglPrx192 533 0 161..463 45..347
Literature and cross-references AcoPrx01 ( AcoGoldSmith_v1.004682m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_7 (2652830..2651086)
Protein sequence: AcoPrx01 ( AcoGoldSmith_v1.004682m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   462 (444)
PWM (Da):   %s   47010.97 (45012.9)  
PI (pH):   %s   7.31 (7.24) Peptide Signal:   %s   cut: 19 range:19-462
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
*.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAILFFSASL TIAHPGLNFN WGDYFGGNGG QGGFGGNGGQ GGFGGNGGQG GFGGNGGQGA FGGNGGQGTV GGNGGQGTVG GNSGQGAFGG NGGQGAVGGN GGQGAVGGNG GQGAFGGNGG  QGVVGGNGGQ GAVGGNGGQG AVGGNGGQGA DGGNGGRFVG LFPEFYQYSC PQANDIVMSV LQKAIANEPR MAASLLRLHF HDCFVQGCDA SVLLDDTTTI RSEKQSGPNK NSLRGFEVVD  EIKAKLEAAC PDVISCADIL ALAARGSTVL SGGPNWELPL GRRDSKTASL SGSNRNIPAP NSTLQNLVTF FNRQGLDEVD LVALSGSHTI GVARCVTFRQ RLYNQNGNNQ PDETLERNYY 
QGLKTVCPKS GGDNIISPLD LASPVKFDNT YFKLILWGRG LLNSDEVLLT GKGGKTTELV KRYAEDEGIF FQQFAQSMVK MGNISPLTGY NGEVRKNCRR IN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns and extra intron in 5'). Very long PS confirmed with ESTs from Aquilegia formosa x Aquilegia pubescens.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTATAC TTTTCTTCTC TGCCAGTCTA ACCATAGCAC ACCCTGGTCT CAATTTTAAC TGGGGTGATT ACTTTGGTGG AAATGGTGGC CAAGGTGGTT TTGGTGGAAA TGGTGGCCAA  GGTGGTTTTG GTGGAAATGG TGGCCAGGGT GGTTTTGGTG GGAATGGTGG CCAGGGTGCT TTCGGTGGAA ATGGCGGACA GGGTACTGTT GGTGGCAATG GTGGACAGGG TACTGTTGGT  GGGAATAGTG GCCAGGGGGC TTTTGGTGGA AACGGCGGCC AGGGTGCTGT TGGTGGAAAC GGTGGCCAGG GTGCTGTTGG TGGAAACGGT GGCCAGGGTG CTTTTGGTGG CAATGGCGGC  CAGGGTGTTG TTGGTGGCAA TGGCGGCCAG GGTGCTGTTG GTGGAAATGG TGGCCAGGGT GCTGTTGGTG GCAATGGCGG CCAGGGTGCT GATGGTGGGA ATGGTGGCAG ATTTGTTGGA  CTATTTCCAG AGTTTTATCA ATATTCATGT CCTCAAGCTA ATGACATTGT CATGTCAGTC CTACAGAAGG CCATTGCAAA CGAGCCTAGA ATGGCCGCCT CTTTGCTTAG GCTTCACTTC  CATGACTGCT TTGTGCAGGT AGGAAAATAT GGCTATAAGA ACAAAATTCT ATTTTCAAAA CAATAAAACA GCTGATTATT TGTTCTTAAT ACTGCTTTTC TTTCACTAGA ATAGTTTTGT  TTCTACCAAC CTCGGATTTA TGGATGTGAC TTCACTAATG AATTATCCAT TTCAGGGTTG TGATGCATCA GTGTTGTTAG ATGATACCAC GACAATACGC AGTGAGAAGC AATCAGGTCC  AAATAAGAAT TCTCTTCGAG GATTTGAAGT TGTCGATGAG ATCAAGGCCA AGTTGGAAGC GGCATGCCCA GACGTTATAT CTTGTGCAGA CATTCTTGCA CTTGCAGCTA GAGGCTCCAC  TGTATTGGTA ATTTATTGGC CTCTTGACAG CAAACTCTCT TAAATTTGCA TTAAGATTAT CCTAACTAAG ATCTGGTGCA TATAATAAAC ACAGAGCGGG GGACCCAATT GGGAGTTACC  ATTGGGAAGA AGGGACTCAA AGACAGCAAG CCTCAGTGGC TCCAACAGAA ACATTCCTGC ACCGAATTCT ACTCTCCAAA ACCTCGTAAC CTTCTTCAAC CGCCAAGGTC TTGATGAGGT  AGACCTTGTA GCACTATCAG GTGAGTTAAT CTCAGCTCTA CTTATCAATA AGCCAACAAG GCATTTTAAT CCGCAACTTA GTACAATGGC ATGTTCTTGC AGGGAGTCAT ACTATTGGAG  TGGCAAGGTG TGTGACCTTC AGGCAAAGGC TGTACAACCA GAATGGAAAT AACCAGCCAG ATGAGACTCT TGAGAGGAAT TATTATCAAG GCTTAAAAAC AGTTTGTCCT AAATCAGGGG  GTGATAACAT CATATCTCCT CTGGATTTGG CCTCCCCTGT CAAATTCGAT AATACCTACT TCAAGCTGAT ATTGTGGGGG CGAGGGCTTC TTAATTCTGA TGAAGTGCTA TTGACAGGCA  AAGGAGGGAA AACTACAGAA TTAGTTAAAA GGTATGCAGA AGATGAAGGC ATCTTCTTCC AGCAGTTTGC TCAATCAATG GTTAAAATGG GGAACATTAG TCCCCTCACA GGTTACAATG 
GGGAAGTCCG AAAGAACTGT CGCCGAATAA ACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTATAC TTTTCTTCTC TGCCAGTCTA ACCATAGCAC ACCCTGGTCT CAATTTTAAC TGGGGTGATT ACTTTGGTGG AAATGGTGGC CAAGGTGGTT TTGGTGGAAA TGGTGGCCAA  GGTGGTTTTG GTGGAAATGG TGGCCAGGGT GGTTTTGGTG GGAATGGTGG CCAGGGTGCT TTCGGTGGAA ATGGCGGACA GGGTACTGTT GGTGGCAATG GTGGACAGGG TACTGTTGGT  GGGAATAGTG GCCAGGGGGC TTTTGGTGGA AACGGCGGCC AGGGTGCTGT TGGTGGAAAC GGTGGCCAGG GTGCTGTTGG TGGAAACGGT GGCCAGGGTG CTTTTGGTGG CAATGGCGGC  CAGGGTGTTG TTGGTGGCAA TGGCGGCCAG GGTGCTGTTG GTGGAAATGG TGGCCAGGGT GCTGTTGGTG GCAATGGCGG CCAGGGTGCT GATGGTGGGA ATGGTGGCAG ATTTGTTGGA  CTATTTCCAG AGTTTTATCA ATATTCATGT CCTCAAGCTA ATGACATTGT CATGTCAGTC CTACAGAAGG CCATTGCAAA CGAGCCTAGA ATGGCCGCCT CTTTGCTTAG GCTTCACTTC  CATGACTGCT TTGTGCAGGG TTGTGATGCA TCAGTGTTGT TAGATGATAC CACGACAATA CGCAGTGAGA AGCAATCAGG TCCAAATAAG AATTCTCTTC GAGGATTTGA AGTTGTCGAT  GAGATCAAGG CCAAGTTGGA AGCGGCATGC CCAGACGTTA TATCTTGTGC AGACATTCTT GCACTTGCAG CTAGAGGCTC CACTGTATTG AGCGGGGGAC CCAATTGGGA GTTACCATTG  GGAAGAAGGG ACTCAAAGAC AGCAAGCCTC AGTGGCTCCA ACAGAAACAT TCCTGCACCG AATTCTACTC TCCAAAACCT CGTAACCTTC TTCAACCGCC AAGGTCTTGA TGAGGTAGAC  CTTGTAGCAC TATCAGGGAG TCATACTATT GGAGTGGCAA GGTGTGTGAC CTTCAGGCAA AGGCTGTACA ACCAGAATGG AAATAACCAG CCAGATGAGA CTCTTGAGAG GAATTATTAT  CAAGGCTTAA AAACAGTTTG TCCTAAATCA GGGGGTGATA ACATCATATC TCCTCTGGAT TTGGCCTCCC CTGTCAAATT CGATAATACC TACTTCAAGC TGATATTGTG GGGGCGAGGG  CTTCTTAATT CTGATGAAGT GCTATTGACA GGCAAAGGAG GGAAAACTAC AGAATTAGTT AAAAGGTATG CAGAAGATGA AGGCATCTTC TTCCAGCAGT TTGCTCAATC AATGGTTAAA 
ATGGGGAACA TTAGTCCCCT CACAGGTTAC AATGGGGAAG TCCGAAAGAA CTGTCGCCGA ATAAACTGA 

Retrieve as FASTA