Entry information : CclPrx114 (clementine0.9_034676m)
Entry ID 8675
Creation 2011-06-25 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-01-03 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2012-01-03 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclPrx114 (clementine0.9_034676m)
Name (synonym) CclPrx114 (clementine0.9_034676m)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx039]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclPrx114
start..stop
S start..stop
CclPrx20 628 0 1..347 1..349
CsPrx55 625 0 1..322 1..322
CsPrx53 627 0 1..347 1..349
CppPrx02 614 0 10..347 1..340
Literature and cross-references CclPrx114 (clementine0.9_034676m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_31 (1139771..1132928)
Protein sequence: CclPrx114 (clementine0.9_034676m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   347 (322)
PWM (Da):   %s   37859.48 (35301.1)  
PI (pH):   %s   9.99 (10.05) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-347
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASLRYLLAA ALVVAFVLEG SPSQAQLSPS FYSSTCPNLL NIIEDVLKKA FSSDIRIGAS LIRLHFHDCF VDKFKSSLIP AHTKNIDSEK FAAPNNNSAR GFEVIDNMKA AVEKACPRVV  SCADILTIAA ERSVALSGGP SWAVPLGRRD SRTANRALAN QKLPGPSDTL DVLKSSFRNV GRNDNFDLVA LSGAHRFGRA QCRFFRGRLY DFNNTGKPDP TLDRTLLKQL RELCPQGGNG 
GVLANFDVKT PDVFDNKYFS NLRLRKGLLQ SDQELFSTPG ADTAAIVEDF GRNQNAFFKN FVTSMIRMGN LKPLQEIKGR LNCRRVNGNS NIATRSSSSE GDLVSSF 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (An extra sequence in exon 2 and a short 3' end are missing which have been verified manually).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTTCAC TTCGTTATCT TCTTGCAGCA GCTCTTGTTG TTGCTTTTGT GCTTGAGGGA TCACCATCTC AAGCTCAACT TTCTCCCTCT TTTTATTCTT CCACATGCCC TAATTTATTG  AACATTATCG AGGATGTGCT TAAGAAAGCT TTCTCGTCCG ATATCCGCAT CGGTGCCAGC CTCATCAGGC TTCATTTCCA TGACTGTTTT GTTGATGTAA GCAATCTCTG CTCTCTCATT  TTTCATCTTC TTTACGTTAT CAAGCTCTCT GTCTATTTAC TTATTGATAT AACATAGTTT CAAGTnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nGCGGGTTTG CGGGTACAAT TGCCATCCCT AGTTTCAAGC ATGTCAATGA  ACAGTATCTT TATAATTTTT TGTGTCATTA AACAAAATAT AGAGTTTTCA TTAAGAGTTT GAATATATCA TTTTAATTTC AACAACTTCC AAAACCATTT TCATATATCT TTTTTTTTTC  TCTTTTTCTT TTCTCTTTAC GACAAATTTT TCCTCTCTAA TTCGATGTAC CGAGGACCAT GTAATTCTTT Gnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnGGGGTTTT CATGTACTAG AAATTTAAAT  CTAGCAAAGA TTTGGTCCAA AACAGGAATT CAAATCCACC TCATGGCCTC ATCCCTGCTC AGTGCTTTTA ATGATCATGG GTCCAATATT AATGGTGCAT GGTTGAAAAA AAATCACACT  TGTTTTATAT TCTTCCAACC GAAAATTTTG AATCAACAGG AAATCCTAGT CTTAAAAACA TATGTAATAA TAAGACAATT TAAATAAGAA GAGTTTGCAT TATTTATTTA ATTTTTTTGA  ATTCATGTCC ATAAGATAAG AAGGAATCTA TCTACTTGTT AAAATAACAA TATAATGGAC TGTTAACATA GCAAGTTGTT AACTAATACT ATTTTTTCCG GGGTGTGATG CATCGATTTT  GCTGGACAGC ACTAAAAACA TAGACAGCGA GAAATTTGCT GCGCCAAATA ATAATTCGGC GAGGGGTTTC GAAGTTATTG ATAACATGAA AGCTGCCGTT GAAAAGGCAT GTCCAAGGGT  TGTTTCCTGC GCTGATATTC TTACTATTGC GGCTGAACGA TCCGTTGCTT TGGTATGAAT TTCTTTTACC AACTCCTCTT CCTTATTAAT ATTTTATGCT TAGAAGTAAA TTAnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnCnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnATTTT GTAATGTAAT TATTTTTTAA TCTCAACCAA TAnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnA TTTTGTAATG TAATTATTTT TTTAATTTCA ACTAGTAnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnTAG GAAATAAAAC CGCACTTCGC GCAGTTTTGA AAAAAAATTT  Annnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnTnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnGATGGGT ATCAAAATAA GTGAACAGAA TAATGGTAAA TCTTTGCAGn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnC CCGTAAGTTC AACTTTACCC TTAGAAGAAT ACATTAATTA AATAATTATT CACATAGACC AATGTGCAAG ATCTGAGTCC ACATGTTTAG CCTTTGATTT  AAGTGAAGGG ATTCATAGTT GGACCCATCA TTATTAAATT GGGACGACGC AATGGACTCC ATTATTTAAA AGGCCCGGCT ACAGTGCAAC TGTGATACCG TGCTACAGTT ACATTCAGCC  GTTGGATCCA CTTAGATGAG TGGAGTCTAT TAGAATTTAA TGGCTGGATG CAACAGTAGC ACGGTACCAT ATTTGCACCA CAATTTTTCC CTTATTTAAA AGGGGTGACT TATTGACTAT  GGTGCATCAG CTACACTGTG TGGTACCAAA ATTGCTACAC ATATGTCAAT ATAGTGATTA TTAAGGGATA AATTGTTACT GACAGTGAGA CACTTTTTAC TGCGCTGGTG CATCGTAGCA  AGTCCTTAGT TTTAAACTTA AAAGTTTTCT TCTTTTGTTA TACGACAAAG TTTTGATTCA ACGGCTAGCA AATTAAATAG TCCGCCCCAA ACGCACATCT CTTAAGATTA TTGTTGATTT  TGAGTGAATG GCTTTTGGTT ACAGTCAGGG GGTCCGTCAT GGGCAGTTCC ATTGGGAAGA AGGGACAGCA GAACAGCAAA CAGAGCTCTT GCAAATCAGA AACTTCCAGG ACCATCTGAT  ACTCTTGATG TGCTCAAATC TAGTTTTAGA AATGTTGGCC GCAATGACAA TTTTGATCTT GTTGCACTCT CCGGTAATTA TTAATTGCTT CTGCATCCTT TTAATTACTT GAGTAAAGTT  ATGGGAGTAG ACTTTTAAAA GTCAAAAGAG CATGGTACTA GCAAACCACG CTCAAAAATT AATTTAAGAA ATGAGTGTTA TGCCTTAAAT TTATGTATAC TTAACTCAAA ATTGGGCATG  CATGTTTTTC AGGAGCTCAC AGGTTTGGTA GGGCTCAGTG CCGATTTTTC AGGGGCAGAT TATACGATTT CAACAACACT GGCAAGCCAG ACCCGACACT GGACAGAACC CTGTTAAAGC  AACTGAGGGA ACTATGCCCA CAAGGTGGAA ACGGCGGCGT TCTTGCTAAT TTTGATGTCA AAACACCTGA TGTTTTCGAC AACAAATACT TCTCCAATCT TAGACTCCGC AAAGGCCTTC  TGCAGAGTGA TCAAGAGTTG TTTTCGACTC CTGGTGCCGA TACCGCTGCC ATTGTCGAGG ACTTTGGGAG GAACCAGAAT GCTTTCTTTA AAAACTTTGT GACCTCAATG ATAAGAATGG  GCAATTTGAA ACCACTGCAG GAAATCAAGG GGAGATTAGA TTGnAACTGC AGGAGGGTCA ATGGAAACAG TAATATTGCA ACAAGATCAT CATCATCGGA GGGTGATTTG GTCAGCTCTT 
TCTAA 

Retrieve as FASTA