Entry information : CclPrx116 (clementine0.9_034857m)
Entry ID 8677
Creation 2011-06-25 (Qiang Li)
Last sequence changes 2012-01-04 (Qiang Li)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2011-12-05 (Qiang Li)
Peroxidase information: CclPrx116 (clementine0.9_034857m)
Name (synonym) CclPrx116 (clementine0.9_034857m)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx014]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Rutaceae Citrus
Organism Citrus clementina    [TaxId: 85681 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CclPrx116
start..stop
S start..stop
GhPrx05 500 1.3e-180 5..322 6..323
CpapPrx59 495 2.15e-178 1..322 1..322
PpePrx24 491 1.09e-176 1..321 1..323
GmPrx03 487 3.68e-175 1..322 1..323
Gene structure Fichierperl './assets/cgi-bin/draw_exon.pl' '8677' 'complement(join(992142..992563,1008436..1008598,1008719..1008901,1009032..1009232))' Exons
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 1009032..1009232 199 N° 2 1008719..1008901 181 N° 3 1008436..1008598 161 N° 4 992142..992563 420
complement(join(992142..992563,1008436..1008598,1008719..1008901,1009032..100923 2))


exon

Literature and cross-references CclPrx116 (clementine0.9_034857m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold_78 (1009232..992142)
Protein sequence: CclPrx116 (clementine0.9_034857m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322 (302)
PWM (Da):   %s   34523.51 (32263.3)  
PI (pH):   %s   5.03 (4.91) Peptide Signal:   %s   cut: 21 range:21-322
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MALFYALLFALVFLIRYSAGQLKIGFYSETCPEAESIVSSVVQDA
VVSDPNLAAVLLRLHFHDCFVE
GCDGSILIENGPNAEKHAFGHQGVGGFEVVEKAKARSEDACPGVVSCADIVALAARDAIALSNGPSYQVPTGRRDGEVSNVTLADDMPDVSDSIQQLKTKFLHKGLSEKDLVLLSAAHTI
GTTACFFMTKRLHNFFPGGGSDPGINPSFVVELKATCPQNGDVNVRLPIDRGSERVFDKQILQNIKDGFAVLESDSRLNDDIITNAIIDSYLGILNPIFGPSFEADFVESIVKMGHIGVK
TGQQGHVRRLCAAFS

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome(Exon 1 and exon 2 are missing which have been completed).
DNA
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCCCTATTTTATGCATTGCTGTTTGCATTAGTATTTTTAATCCGCTACTCTGCTGGGCAGCTCAAAATCGGCTTTTATTCTGAAACATGCCCTGAAGCAGAGTCTATTGTCAGTAGT
GTAGTTCAAGATGCAGTTGTCTCAGACCCCAACTTGGCCGCAGTCTTGCTTAGGCTCCATTTCCATGATTGCTTCGTTGAG
GTCTTCTGTAACCATAATTATTTCTGCCTGTCTTTTTTC
TTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTAAACTGTTTGCTAGGGGGGTGCGATGGATCAATTCTAATAGAG
AACGGTCCAAATGCTGAGAAGCATGCATTTGGTCACCAAGGTGTTGGAGGGTTTGAAGTAGTAGAAAAAGCCAAGGCCCGCTCGGAAGATGCATGCCCAGGAGTTGTGTCTTGTGCAGAT
ATTGTGGCCTTGGCAGCTCGAGATGCTATAGCTCTA
GTTTGTTTAACTCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATCTAATTTCTTTACATTTAAGCTATCGTACGTACGCTATCGTCAA
TTAAAGATTAATATAATTAATAATTGATGAATGCAGTCTCAAATGGACCGAGCTACCAGGTTCCAACCGGGCGCAGAGATGGTGAAGTTTCAAATGTTACGCTGGCAGATGATATGCCCG
ATGTTAGTGATTCAATTCAGCAACTCAAGACTAAGTTTTTGCACAAAGGGCTATCGGAGAAGGATCTAGTACTTCTTAGCG
GTATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNATGCATCTCTAATGACAATATGGTTGGTGGACACTCTGATTAAAATGATCAGGTATCATTAAGGCCAATTCTAAATATATGCATGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNG
AAAGTTAGAATAATCGCATTATAAAAAATCTCAGAAAATTACAAGTAAATTCCGATGGAAAAATTGTCATCCATACAAAAGAATCAGAATAACACAAAATTTACTGCTCACAACTAAGAC
ATGACAAATACAAAAAACCGACTTTGGCACTATGCATATAACGAATCTGATTTGATAATTAATAGAGATAAATCAAACTAACTAGCAATTCGTAAGCCAAAGGCAAGACCACCGCCTCAC
CGAAAGTAACATCATTCAAATAGTTATCTGAAAAGTTCATACAAAGACCGACACTACTGGGCCATTAAATCTCCAAGCACTTCCATTGGAGTCGACCCAACCGCCTCCAACACGAGTGTA
TCATCCCAATTCGAACACTAAAGTTGAAAGAATTGAGGGAGAAAAGAGGACATGCCTCGGCCCATTGTTGATTTAAAGCCCAGGTCCTCACTTGTTCGGGAAAATTTCCAACCCAATTAT
TTTTAACAGTTAAACAAAAATTTATTTTGAAATGTTTTGGTGGCCGTATGAATTGTGTTGATTAGAACTAGAAATGGATGTATTTAGAAAAAAAAAAGATAAAAATTAAAAACTAGGCTT
AGGCCATAGTATCTTCTCTGGTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCCCACTCATTGTGGTGGGAAAAGCTATTTATGGTACGACAAAATTATAACAATAAAATCAC
ATCAAAATCCAACATTATTATGACCGTTCAGTGCTAGACCTATATGAATATTTTTTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGCATCA
TCACTAAATCAATCATCATATTGAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGCATAGTGAATTTGGTTTAATGAATGAAAATAATAACAAATCCCAAATTTA
CTATGCTGACACAAAATTGAATTGAATCACCCAAATCCTCTAACTACCACTGAGATTTGTCACCAACAATACAATATTGCAATATGCTTAATCCCAATCACTAACATGATCGGCATGTGT
TTGTAGCTGTTTGCACGTGTTACAACCCAATAAGTATCTGCTTGTGATAGTAAAATTGTTTGCATCTCGCTGCTTACATGCACGCAATGTTAGATTCTCACAATGATTTAAGATCTCATT
GCTTGCGATTGTTTTTGGAGGAAGTTTCCTTTCACTATTTTTCTCTCTCTAATACCCCCGAGATGGTAGGGTTAGGTTGGATCCCTGCTTCTAATACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNGAGGGACATAATCCAATACCTTCAACTCCAAGAGTAGATACAAGGAAAATGTATAAAAGCTCACCGAGAAGAAAAAGATAATAAAACAATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNGCATGTCTCCTAATATGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAAACCTTAAGAAAAGAANNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTATTCCCTTAAAAGTTTAGG
AGATGCCTATCTTCTGAATTATCATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATAATATTAAAATTCCCTCTCATAAT
CNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCAAGCCATCCATATTATCAATCATTGCATCATAAGGGGCAGAGGTTCGATTCTCCTCAGAAACAAACAAAAATCATGCA
TCCTCCCCTAATTCATCCGAAAAGCTGCAACTGTATCAAATATAGACAAACCTAAACGATTGTCACTTTCCTCAAAACCCAAAATTGTAGTCACTACCCTAAAAAACATCATAAAAAATA
TAGTACAGTGCAAATTGAGGGCCATCTGCAACTGCACAGTATACTCAATGAGCATTGTACATGCACCTTAGTCAATCATGACAACATTGCTATCAGTAGCCATAGAAACTCAAGTCTGGG
CAATTAATTCAGTCTCCGTGTCCTGATCAGAAGGAATATGAGTAAAAGTATACAAAGAAACCTCACTAGAAACCATAAGCCCCAACAATCGGATCTCCTTAGTAGGATTAATCTGCAAAC
CAGACCCAAAATTCTATACCTAAACCAAAACAAGTTGTGCACTAGGCCCCTGAGATTTATTTTCAGCAATAACAACATGTTGAGGAATATGAACCACTCAACAGCATCAAAAGTAGGCTT
CATCACATTATCCATAAACACTTTATCCTAAGGTTCATAAAATAGGCTATTGGGCCCTCTGCAGCCCAAGGTTATTCAGATAACAAGCTCAAGAAAAGTAACTGAGGTACTATAAGAGGG
TACCTCTTTAAAAATAACATTATCCTAAAATCTAAAGTTGATTTTACTAACCCATAGAAGTGGTAATAAAGAACACAAAACGTCGTATTCAACCAAAACTTTAGCAACAGATGACCTATC
ACAAAGGCTGCAACGTGATCTACATGTAATGACTTTTCAATAACTGAAGCAATCGAGAATAGAGCGATTTCATAATTAATAAAATGAATAGGTAAATATAGAAAAGATATTGAAATTAGC
ACAATCGAAGATACCTCAGAACATTAAAAATCAGTTATCCACTTAAAAAGATGCATACCTCTACTATTAATGTACAAGGTATGCCAAATCCAAATTTTGGAATAATCTTCTTCCATCTCA
AGCTTGATAATAATATATCCATTATCCAACAAGGAAACTTGGGAGTTTCCCTTTAACTTAAAAAGACATAAAAAACTTGTGAATGATATCCATTGCTGGTGGCCAAAGGAGGACTTACGA
ACAAGTGATAATTTATAAGCTTTTACCATGGACCAAATTTTCTTAGTTGAAAAGTGAATAGCAAATTCTCCCCAGTAGAGCAGAATTGACTCAATAGGGGTGAAAGGAGCTGAACAGACG
GCAACAATATCAATAAAGGATTTTGAAGGGCGATTTCAGGCATTGTGACAAAAGATAGATGCAGGATTAACTACAAAGGTGTATAAAGGTTTGAGAAGAGTGCGGTTTTGATGACTGGTA
GCTATTGATTGATTTTGAGCGGTCGTTTTTTCTTTCTTTTTAGAAGACCACCATGGGACCCCTACCTGTAATATAGATTATTAACTGACAAATACAAATAGAGAGAGTATAAACTAAAAC
CTCAAAGTCATCTAAGAGAAATACAATAGAGTATAAAAAATCCAAGAGCAAGAATCAAATGCGAACTAGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCTCTTAACATGAGGGTTTTCCTGCGCGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGGCCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTTTATTTTTTAGACTAGGAGTGAAGAGTGTGAATTCTTTCTATTCCAATATTTGCTTTAAT
AAATTAAGAAAGAATTAAGAATCTCACTCTATGAGCCCCACTCATTTTTTGAGTGGGGAGTGAGAGTGGGACTGCCGTGAGGAGAGGTGGGAGTCCACTCCCTCCTCTTCTTTTTCTACC
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCTTCTTT
TTATTAAATTTACTATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATTAACTTTGTAATTAAAAACTATAATTCTTTAAATAAGG
ATAAAATTGTAATTTAAAACTATTTACTCCCGATTCAAGACAAAGTAAACACATAAATTGGATTATGATCTCCATTCCATGCTTCCATTATAGTGCAAGTAAACAACCTACTCTCACTCT
CATTTCACACTCTCAATCCTAGGATTCCCACTTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCATGAAATTACCACCAAAGC
TTTAACTCGAGAGCCTTAGACAAATTAGCAAATGATGAAAAGCCCAAACCACCCTTTTTAACCAGATAACAAATTGAGCCATCTATCTCTTAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNATATATATANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGGTT
GAGATTAAAAAAATAATTACATTACAAAATNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNTGGTTGAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTATATTAGAAAAAAAAAAGTTAATTACCCAGT
TTGATTCAACAAGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCAAAAAAAACTCATTAATTGCACTTAGATGTAACTTTTTATAATGTTTTCTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAGTA
GGGGTAACAATATATTTTATAACTAATTTTAGGGATAGAAATGTCATTTAATAATTAATTGTAGGGGTAAAAATGTTATTTTGTAATTAATTTATTGTCCTCGTTAAAGTTAACAACAAA
GTTAACGGATTGTCACCTGATCAAGTATTTTAAAAAAACGTGTCACCTTTTAAAAATTTGTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGGGGTGGGTAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCATGAGAATAAAAACGATCTGAACCCCATAAAGAAACTTAGCAGTCATAATAAACAAGCATATGAAA
AGAGGACCACCCTACCCTACCCAAGATCATCTTGAGATTGGAAAAATCAGTGGCTAACCTAATTCACCACCATCGAGCACCGGGCCTAAAAATAACTCTTTGAATCAGAGAAATCCGCTG
CTCTAAGAATCCAAAACACCTTAACATCTGTATAATAGAAGACTAGGACAACCGATCATACGCTTTGGCCTTCCAACTTCAGCACCACATTGCTCCTCCAAGAACAATGGTTCAAGTCGT
GTGATGCTGAAGCTTCAGCTGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCAAGAGTAATTTTGAAAATAGTAGGGGCTTGTGAGATTATTTGAGGTTCAAATATCATTGT
TAGTTTCGAAAAGGGATTTTCCTTTTTTTTTTTTCCCTTAAAAAAAGTGATTTCAGTTGTGAGTGGTGTCACTGGCAGCCCATCTAGTTTCCTTAAATCATCCCACCCCATGCACCCAGC
CCATCCCCTCCCATTCACGAGTACACCTTGTGATAAAAAAATTATTAATGGAAACAAATGAAAGACATTTTCTATAGGAAAGAATATAGATTTTTTATGAAAACAATTAATGTAGATGAA
TGAAGAATATTGCAAAGGAATTTATCAATGAGAAGCTTCATTTGGTTGACTTGTGACGTGCTGGTTGTGAGCAATGGATTTTACTAAATTAATAGCATTGGGCTTGTGTACGGAATGTCA
CAATTGGTTTTCTTTAAATACAGGAATGTTGGGTCTCATGATTTTCCTTAAGCTTCGAAGATTTTTTTTTTTTCTTGTTCGGTTAACATTAGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAATATTCTTATTGCAGATTTTTTTATCATGC
TGTCCTTAGTACATCTCTAATTGTGCCGTGTTTTTAAGGCCCGCGTGTCTAAAATTTTAGAGCCGTGTTGTGCCCTGTACCTCACTGAAACATGCTCGTGTCGTGCCATACTGTATGGAC
ATGAGCCGTGCCACGTGTTGTTCGGCCTATTGGCCATCTCTAGGTAACATTGATGGATGGACAAAGTCCAAATCATTTTTTTAACCCATATTTTTTTTTTCAAAAACCACTAACTCGACC
CCTTAAAGCTCTTCGATGACAAACATGATCATATCATACTAATAATCCTCATAAATTGCATTAGTTGTTGTAAGACTACAGGAATTTAATATAATTCAATATAAAGGGAAGGTTCCTTAA
TTTAGAGTTTTTCTTTTAAAAAATAACTTAATTTTTATCCATTAAATTTACTGAATCTTAAGGTAGATGGATGAAACATAAATACAATTTTTAAATTTAAACCGTTTATTTAGTTGNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGTCATTATTTGATTGATATAAGTGAATTATTTCAACTGAGTAGATACAACATAACTCTATGTAAAATACATGAAAT
ATCAAGTTACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCAAGGGAATCTCATAACATAAAAAAGAGATTTAGGTGGAACTTTTCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTTTTCAGCTCTGCG
CATACTATTGGAACCACCGCATGTTTCTTCATGACGAAACGGCTTCACAATTTTTTCCCTGGTGGCGGATCCGATCCCGGAATCAACCCTAGCTTCGTTGTAGAGCTAAAAGCAACTTGC
CCTCAGAACGGCGACGTTAATGTACGATTACCAATTGATCGTGGAAGTGAGAGGGTATTTGACAAGCAGATTTTGCAAAACATTAAGGATGGCTTCGCTGTTCTGGAATCTGATTCTAGG
CTCAATGATGACATAATTACCAATGCCATAATTGACTCCTACTTAGGGATTCTAAACCCAATATTTGGTCCATCTTTTGAGGCTGATTTTGTTGAGTCAATTGTGAAGATGGGCCACATT
GGTGTCAAAACAGGGCAGCAAGGTCACGTGAGACGCCTTTGTGCTGCTTTCAGCTGA

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGGCCCTATTTTATGCATTGCTGTTTGCATTAGTATTTTTAATCCGCTACTCTGCTGGGCAGCTCAAAATCGGCTTTTATTCTGAAACATGCCCTGAAGCAGAGTCTATTGTCAGTAGT
GTAGTTCAAGATGCAGTTGTCTCAGACCCCAACTTGGCCGCAGTCTTGCTTAGGCTCCATTTCCATGATTGCTTCGTTGAG
GGGTGCGATGGATCAATTCTAATAGAGAACGGTCCAAAT
GCTGAGAAGCATGCATTTGGTCACCAAGGTGTTGGAGGGTTTGAAGTAGTAGAAAAAGCCAAGGCCCGCTCGGAAGATGCATGCCCAGGAGTTGTGTCTTGTGCAGATATTGTGGCCTTG
GCAGCTCGAGATGCTATAGCTCTA
TCAAATGGACCGAGCTACCAGGTTCCAACCGGGCGCAGAGATGGTGAAGTTTCAAATGTTACGCTGGCAGATGATATGCCCGATGTTAGTGATTCA
ATTCAGCAACTCAAGACTAAGTTTTTGCACAAAGGGCTATCGGAGAAGGATCTAGTACTTCTTAGCG
CTGCGCATACTATTGGAACCACCGCATGTTTCTTCATGACGAAACGGCTTCAC
AATTTTTTCCCTGGTGGCGGATCCGATCCCGGAATCAACCCTAGCTTCGTTGTAGAGCTAAAAGCAACTTGCCCTCAGAACGGCGACGTTAATGTACGATTACCAATTGATCGTGGAAGT
GAGAGGGTATTTGACAAGCAGATTTTGCAAAACATTAAGGATGGCTTCGCTGTTCTGGAATCTGATTCTAGGCTCAATGATGACATAATTACCAATGCCATAATTGACTCCTACTTAGGG
ATTCTAAACCCAATATTTGGTCCATCTTTTGAGGCTGATTTTGTTGAGTCAATTGTGAAGATGGGCCACATTGGTGTCAAAACAGGGCAGCAAGGTCACGTGAGACGCCTTTGTGCTGCT
TTCAGCTGA

Retrieve as FASTA