Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
306 |
PWM (Da): |
33075.74 |
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PI (pH):
| 7.34 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
RIGHGKGELRMMFYHKTCPQVEEVVKxDITWSKVENNPSMAAKLLRLQYHDCFVRGCDASILLDSTSGNTSEKDARPNLSLSGYEVIDDIKAKLEQECPKTVSCADIVALAARDAVSFQFKRSLWNVVTGRQDGRVSLASEAVRDLPSAGANFTTLQQQFAANGLDVTDLVALSGAHTIGGARCxxFARRLFNFSGKDDIDPSLNSDYANFLIRKCSDRTALVEMDPGSSLLFDTDYFKAVKQNKGLFMSDAALLTNPRSAFIVKLFQNPLLFFSQFGASMQKMGQIKGDDSDGVRLGGVIALLIN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Partial sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (Very short 5' end is missing and frame shift before FHDC). No EST. |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGTCATGGCAAGGGCGAGCTAAGGATGATGTTCTATCACAAGACTTGTCCTCAGGTTGAGGAGGTTGTGAAGGNNGATATTACATGGAGTAAAGTTGAGAATAATCCAAGCATGGCAGCT AAGCTACTGAGGCTGCAATACCATGACTGTTTTGTTAGGGTATGTTCCCTTTTAAATCCTTCTAATCTCTTCAAATTATATATGTAAGAATATATATATAAGTATATTTTGTTGATCCAC AAGTGTTAATCCAGTTGGTAAAGAATGTTCTACATATTTGATCAATTTATATTAATGTATGGAAGTATTGATCCTAGCAGCACCATCTGATGGGTCCATGGGAGTACATTCTTAATTAAA ACTACCAAGAGAAGAACATAGTTTTGGCATGTAGAAGCTGGTTCAAAAGTATTCATACTGCTAGAACAGTACACACACACACGAAAGATACAATATTATTTTGTTAGGCTATGTTTCGCT TGTTTTAACATCAAAAGTTTTTTAGCTTTCTAATCATGATTACTGACTGTCTTATGTGCGTTAATTAGCCAAAAAAATCAATTGTTTCACAGTATACGCGTTCTTGCAGGGATGTGATGC ATCCATATTATTGGATTCAACTAGCGGTAACACATCTGAGAAAGATGCAAGACCAAATCTCTCGTTATCCGGTTACGAGGTCATTGATGACATAAAAGCTAAACTAGAACAGGAATGTCC CAAAACCGTGTCGTGTGCTGATATCGTTGCCTTGGCAGCTCGTGATGCTGTTTCATTTCAAGTAAGATACGGCCAATTATTAACTTTTGATGCTTATGGCAGTGGCACTGGTCTCTAACA TGCATGAATATGTGAACTTATATATGTGTGCGTATGTATATATGCAGTTTAAAAGATCGCTATGGAATGTTGTGACTGGGAGGCAAGATGGAAGAGTTTCACTTGCCTCAGAGGCTGTAA GAGATTTACCATCTGCAGGAGCAAACTTCACCACTCTCCAACAGCAATTTGCAGCTAATGGCCTTGATGTCACAGACCTTGTTGCTTTATCAGGTATTCTTTATTTTATTATATTATGAT TTTTTAATGTTAATTTAGACCTAATTTCGATTACTCTTTAAAAAAATATATTGTTTTTAAATAAAAATATATAAATAAGATAATACATAATCATAATATAACTTTTCAATAAGAATTCAG GTAATGTATAATCTAATTCAAACCTATAAATTCATATGAAGAAATCGTGATGAGATATAAATTTAATTTGTATAGGAGCGCATACAATTGGAGGTGCACGTTGTGCNNNNTTTGCGAGGA GACTATTCAATTTCAGTGGAAAAGATGATATTGATCCTTCATTGAATTCAGACTATGCAAATTTCTTGATAAGAAAATGTTCTGATCGGACGGCGTTGGTGGAAATGGATCCCGGAAGTT CGCTATTGTTTGATACCGATTACTTCAAGGCAGTTAAGCAGAACAAAGGATTGTTTATGTCAGATGCAGCTCTCCTCACTAATCCTCGTTCGGCTTTCATCGTTAAGCTTTTCCAAAATC CTCTACTTTTCTTTTCCCAGTTTGGAGCTTCAATGCAGAAAATGGGTCAAATTAAAGGAGATGATTCTGATGGGGTGAGATTAGGAGGAGTTATCGCTTTGTTAATTAATTAG |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
GGTCATGGCAAGGGCGAGCTAAGGATGATGTTCTATCACAAGACTTGTCCTCAGGTTGAGGAGGTTGTGAAGGNNGATATTACATGGAGTAAAGTTGAGAATAATCCAAGCATGGCAGCT AAGCTACTGAGGCTGCAATACCATGACTGTTTTGTTAGGGTATGTGATGCATCCATATTATTGGATTCAACTAGCGGTAACACATCTGAGAAAGATGCAAGACCAAATCTCTCGTTATCC GGTTACGAGGTCATTGATGACATAAAAGCTAAACTAGAACAGGAATGTCCCAAAACCGTGTCGTGTGCTGATATCGTTGCCTTGGCAGCTCGTGATGCTGTTTCATTTCAAGTAAAAAGA TCGCTATGGAATGTTGTGACTGGGAGGCAAGATGGAAGAGTTTCACTTGCCTCAGAGGCTGTAAGAGATTTACCATCTGCAGGAGCAAACTTCACCACTCTCCAACAGCAATTTGCAGCT AATGGCCTTGATGTCACAGACCTTGTTGCTTTATCAGGTATGCATACAATTGGAGGTGCACGTTGTGCNNNNTTTGCGAGGAGACTATTCAATTTCAGTGGAAAAGATGATATTGATCCT TCATTGAATTCAGACTATGCAAATTTCTTGATAAGAAAATGTTCTGATCGGACGGCGTTGGTGGAAATGGATCCCGGAAGTTCGCTATTGTTTGATACCGATTACTTCAAGGCAGTTAAG CAGAACAAAGGATTGTTTATGTCAGATGCAGCTCTCCTCACTAATCCTCGTTCGGCTTTCATCGTTAAGCTTTTCCAAAATCCTCTACTTTTCTTTTCCCAGTTTGGAGCTTCAATGCAG AAAATGGGTCAAATTAAAGGAGATGATTCTGATGGGGTGAGATTAGGAGGAGTTATCGCTTTGTTAATTAATTAG |
Retrieve as FASTA
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