Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein) |
Length (aa): |
349 (316) |
PWM (Da): |
38419.74 (34717.0) |
Transmb domain: |
i13-35o |
PI (pH): |
9.57 (9.66) |
Peptide Signal: |
cut: 34 range:34-349 |
|
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MSLPSFATTSFSFLFTSFFVFFILCGNSSSSLAIHANTTRPPRQLSVSYYAKSCPQVEQLVGSVTSQQFKESPVSGPATIRLLFHDCFVGGCDASILIASKPGSKELAEKDAEDNRDLKV EAFETVRKAKEQVERKCPGVVSCADILVIAARDYVHLAGGPYYQVKKGRWDGKISTASRVASNIPHANSTVDQLIKLFTSKGLTTQDLVALSGAHTIGFAHCKNFVARLYSYRGKAQPDP NMDPKLLHVLRMYCPNFGGNSDIVAPFDATTPFLFDHAYYGNLQKKLGLLASDQTLALDPRTKPIVEDLAKDKQKFFKAFVGAMDKLSLVKVVRGKRHGEKRRDCSMHM* |
Retrieve as FASTA
|
|
Remarks |
Complete sequence from genomic (introns 1 and 2). |
DNA ►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTCTCTCCCTTCTTTTGCTACCACTTCTTTTTCATTTCTATTCACATCTTTCTTTGTTTTCTTCATCTTGTGTGGAAATTCTTCATCTTCCTTAGCAATACATGCCAACACTACACGC CCCCCTCGCCAGCTCTCAGTAAGTTACTATGCCAAATCATGCCCTCAGGTAGAACAGCTTGTTGGCTCAGTCACCTCTCAACAATTCAAAGAATCACCTGTTTCTGGCCCTGCCACCATT CGTCTCCTCTTCCATGATTGTTTTGTAGGAGAGTAAGACCGATTCCAACCCCTCAAAAAATTATTCATCTTTGCACTTGCATGCCTGCGTGGGCGTGTTTTCCTTATTATTTCAAAGAGA AATGCTGACAATATACTTTCTGATACACTTTGGAATAGACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAATAATTGAGTGTTAGAAAATGCATTGCTAGCCCTCTTAAAAAAACTTATTTTCTAGTGTTGATCCACTAGTTAAGTTTTTTTTAGAAAAAAT GTGTCAGTATTCATCCATGTTTGGGGGTGAATTTTGTAGTGGGTTGCTATTTTTTTCTTCTTTGGGGGTATGATAACTCTTGAATGGGTGAGTGCAGGGTTGTGATGCATCAATTTTAAT AGCATCAAAGCCTGGGAGCAAGGAGTTGGCAGAGAAAGATGCAGAGGATAATAGAGACTTGAAGGTGGAAGCTTTTGAGACTGTGAGAAAGGCTAAGGAACAAGTGGAGAGAAAGTGCCC TGGTGTGGTGTCATGTGCGGACATTCTTGTAATTGCAGCCAGAGATTATGTTCACCTGTGGTAAGTTGTTGCAATTCCTATCATGCTTATCATATATTTTAGTTTTGAGTTCAATTTTTA TATAGTGTGAGTGAATTGTAAGTGTAAGAAAGTTTTACACCGTAAACGAATTAAATTCATGATAACGAATAAAATATGACTTTTAGAGTAGTTAGGACAAAAATTTACAAACTAATTATA AATGATATTTATAATTAGATTACAGTGTAAAATTCTTTATATTATTGGTGCATAAACTATTTTCTTTTTTATTTATCTATTATTTTCATTCCACCTCTGCCTTTTGGTTTCTTCCTCTTG ACACATTATAATTCATAGGTATCAGTTCACATGCAATACAAATTCAAAGCATGCCTAATTTTAAAAGTTGATGTAGTGCTCTTTGAAGTAACCAAGTTTGGCCCACTAAAATTGACCGCA GACATCCATATTGTGCTTTTCTAGTTTTATTTTCTGAGTGGTTTCCTTCTCCTTTCACTAGTGCATCTTCTGTGTTTCTTACATAGCAGCTTTGCTTCCATACCGTTTATATAGAAGAAG AAAAAAATGAAAAAACAAGTGTCCACCCTCCTCCCAATTATATTATAGAATTCCAATGCCAAAAAAAGTTATAAAAATTTAGGCGTATAATAGTCTTATGGTACTTGGGAAAAGGTGTCC TAGATTTATTACAGCATATCTGTCTGTCACTTATGATGACATTGGATATTATATAATTTATGTATAAAGAAATTGGATATTAGTTGCTAGAAATAGCTTCTTACACTGTAGAATGAAAAA GGGAAAATTGAGAAAGACAATATGGCCAATTATTTTTTTCTTCCTAAACAAAGACAAAAGAGCTAACGGATTACCTTATGATTGTCAAATAACTCTACTTCTTGATCGAGTATGAGTTTA ATCCCCAAGCCTTAGTATGAAAAAGTATTTTTAAGAAAACTATTCCTTAAAATAATATATTTTAGTATTTTAGGATATTAGTATCTGGTTTTTGGTAAGTTAGTTCGAGTAAAATTGAAT TTGGTCTTTTTAAATAAAATTATAGGTTTAAATTTTTTTGAATGAAAAAAATATGATAAAAAATTAAAAGATACTTTACAATATCATAATGACTAAAAAAGATACTCTTATGTTAATATT TTTATTTTATTTTGCCTAGTAAAAAGGACAGAATGCATTAGGCATTGGGACAGGCTGGTCTCAATTGTAGATTATCCGAAGTCATTTAATTTAGCTCTAGAAAGAGGAAACGGACAAGTT GGTCTTGGTCTAAGTGTTTTCCTACACGAAAATAAGAACATGTCCTTCGTATAATATTAATTGCAGTTTTAAACAGTTAACATAGTGGCTGTTTCGTGTATTGATTCCGCATAAAGTCAA TTTAAATTTGTTTTCACATTGTCATGAATTGCTCAGTATTATTTGGGCATAATGATAGACTCCAAAACAGCTCAACTTTTGTACTTTTATGTTTGGATTATTTGGGCACCAGACACAACG TTGCTTCTTAATCTTAGGTCTAAGTTTTTGTGTTGTCCTTTTCTTCTATGCCATATCATATTGATATATGTAGGAAACTAGGAATCCTGCACCATCAATAATAAATTAGTTATAGTTTTT TTCTATAATTTACATGTTTATGGATAATTATATTTTAACTTAGTATTGTTTTTATTGAATTTTAAAAGTTAATTTATTATTTGGAGGTGAGAGTAGAGCCAAATTTGTGTTTTTCTAAGA AGAAGAAAAAGAGGTCGATAAAAAAAGGCTGACCAAACCAAACTGAATTAATAAAGATTGGTTTTGGTTTTATTTGGTTCTTTAATTATAAACAAATTTATGAATGCCATTGTAGAGAAT TTTGTTAGTTTAGTTTTGATCTTTCCAATTATAACCAAATCACTTTTCCAAATAAAAATTATAACCAAACCAAGCCTGTATCTAATGAATAGTTAAGAAACTTCATCTAAATCTAAATTT AATTAAAAGAGAATGTGGCGGATCCCACCCTGTTATTGTTTATAAAATTGAATGTGAAAAATAATCCCATTCCCACAAATTCTCAGGTCTTCATCTAAATTTGTTGCAATTAAAAATTTT GCTTAATGAAGTTCTGGTTAATAATGAAAGGTTTTCTATTATTCTTTTTCATCAAACTGACAAGTTTGTCATAAAATTTAACTATTCAAATGCAATTACTCATTGTTATTGGTTTTTTTT TTTATGAAAACATTGTCATTGATTTATATGATTGTGAAGTATGATAAAAAAAAAAAAAAGATATCGTCAATCATGTTATTCCTCTACATTTTAAAGACTTGAATTAGATTTTCTTAATAC AGTTAAGAGAATAAAATGAACCCAGCATTGTATAACAAAATGCTTGCTAGTTCTACGGCAAGAACTTTTTTATTATCTGATTGCTACCAAAAGTGACAAGATTGTCACATCAAATTAGTC AACATGTGATTGATTCAAGTAGTACATATTTGATTTTGTTTTAGTCTACAATTCTGTGTACTAATATGTGTGATTTCAAAAAGGAAAAAGAATTACCAGTGAAAAAAGAAAAAGAATTAG TGTCTACTACCAAGTGAAGGGAAATGGGTCTTCTCCATTTCTTTTTTTCCTTCATTTCTTTCATTTCATAAATTTTTAAGATAATAAATAAAATAAAGATGATACATACTTTATAAAAGG TGACATTTATGATCTCAAAAAACTTAGTAATAAAAGAAATTGAGAGAATCTAAATCGCCTGGAAGAAGGGAAGATGAGATCTACAAAGTTATGTAATTTTTAATGAATTTTAATTAATAA TAAAAATATTTTCAAAAAAGAATGTATTAAAAGGATATATTACTATCTTTGTAATGGAAACCAATGATTGATTTGGTGTAATCTGACAAAGGCAGGAGGGCCCTATTACCAAGTGAAGAA GGGAAGATGGGATGGAAAGATATCAACGGCATCAAGGGTGGCCTCCAACATCCCTCATGCAAACTCCACCGTTGATCAACTCATCAAACTCTTCACCTCAAAGGGTCTAACCACACAAGA CCTAGTAGCCCTATCAGGGGCCCACACAATAGGGTTTGCCCACTGCAAGAACTTCGTGGCCCGCCTCTACAGTTACCGAGGCAAGGCTCAACCGGACCCAAACATGGACCCAAAACTATT ACATGTACTTAGAATGTATTGTCCAAACTTTGGTGGAAACTCTGACATTGTTGCCCCTTTTGATGCCACTACCCCATTCCTATTTGACCATGCCTATTATGGTAACTTGCAAAAGAAGTT GGGCTTGTTGGCATCTGACCAGACCTTGGCTTTGGACCCACGAACCAAGCCCATTGTTGAGGATCTTGCAAAGGACAAGCAGAAGTTTTTTAAAGCTTTTGTGGGGGCTATGGACAAATT GAGTTTGGTGAAAGTGGTGAGAGGGAAAAGGCATGGGGAGAAAAGAAGAGATTGTAGCATGCATATGTGA |
Retrieve as FASTA
|
|
CDS►
Send to BLAST
|
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGTCTCTCCCTTCTTTTGCTACCACTTCTTTTTCATTTCTATTCACATCTTTCTTTGTTTTCTTCATCTTGTGTGGAAATTCTTCATCTTCCTTAGCAATACATGCCAACACTACACGC CCCCCTCGCCAGCTCTCAGTAAGTTACTATGCCAAATCATGCCCTCAGGTAGAACAGCTTGTTGGCTCAGTCACCTCTCAACAATTCAAAGAATCACCTGTTTCTGGCCCTGCCACCATT CGTCTCCTCTTCCATGATTGTTTTGTAGGAGGTTGTGATGCATCAATTTTAATAGCATCAAAGCCTGGGAGCAAGGAGTTGGCAGAGAAAGATGCAGAGGATAATAGAGACTTGAAGGTG GAAGCTTTTGAGACTGTGAGAAAGGCTAAGGAACAAGTGGAGAGAAAGTGCCCTGGTGTGGTGTCATGTGCGGACATTCTTGTAATTGCAGCCAGAGATTATGTTCACCTGGCAGGAGGG CCCTATTACCAAGTGAAGAAGGGAAGATGGGATGGAAAGATATCAACGGCATCAAGGGTGGCCTCCAACATCCCTCATGCAAACTCCACCGTTGATCAACTCATCAAACTCTTCACCTCA AAGGGTCTAACCACACAAGACCTAGTAGCCCTATCAGGGGCCCACACAATAGGGTTTGCCCACTGCAAGAACTTCGTGGCCCGCCTCTACAGTTACCGAGGCAAGGCTCAACCGGACCCA AACATGGACCCAAAACTATTACATGTACTTAGAATGTATTGTCCAAACTTTGGTGGAAACTCTGACATTGTTGCCCCTTTTGATGCCACTACCCCATTCCTATTTGACCATGCCTATTAT GGTAACTTGCAAAAGAAGTTGGGCTTGTTGGCATCTGACCAGACCTTGGCTTTGGACCCACGAACCAAGCCCATTGTTGAGGATCTTGCAAAGGACAAGCAGAAGTTTTTTAAAGCTTTT GTGGGGGCTATGGACAAATTGAGTTTGGTGAAAGTGGTGAGAGGGAAAAGGCATGGGGAGAAAAGAAGAGATTGTAGCATGCATATGTGA |
Retrieve as FASTA
|
|