Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
330 |
PWM (Da): |
36044.01 |
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PI (pH):
| 8.07 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
IYIGTLATTFLSAFPTANQTCTNLLLLIADCHAQLGVD*HRNTCPNVESTVRSAVEMKLQRKFVTAPATLFFPDCLFMCMCMLDRDVMLLASRNNTSDKDNLINFSLAGDGFDTDQSQGCD*xLDCVGGCHNKVSCADILAMATRDVIALIGGPSYSVELGRLDGRITTKASCLHHLPHPEFKLAQLNQMFASHGLTLTDLVVLSGAHTIGFSHCSKFQTDLQLQKKEKH*SHTSSRVCKTAPTSVSEQPLTWTLLPLGHLITNTTRIFRRKWTLAFNQTLFTHKGPRHLVNLFASNSTAFETSFVSAITKFRRIGVKTGNQGEFSCDCTMAN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Pseudogene from genomic. Incorrect prediction from phytozome (5' end is missing. Gaps in frame. Stops in frame). |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TTTACATTGGAACGCTAGCCACTACATTTTTAAGTGCATTTCCAACTGCAAACCAAACATGCACGAATCTTCTGCTGCTAATAGCTGATTGTCATGCTCAACTTGGAGTTGACTAACATA GGAACACATGTCCAAATGTTGAATCAACTGTACGCAGTGCAGTTGAGATGAAACTTCAACGGAAATTTGTGACAGCTCCTGCTACACTCTTCTTCCCTGATTGTCTAATTGTTAGGGTCA TCACAGTTATTATTTATAGTCTGTATTTTTTTTTTCTTTGTATGCACCCTTTGGCAATAGGTGTTAGTGTTACTAAATTTTATGTGTTTTATGTGCATGTGCATGTTGGACAGGGATGTG ATGCTACTAGCTTCAAGAAACAACACATCAGACAAGGATAATCTCATCAATTTTTCACTAGCTGGTGATGGGTTTGACACTGATCAAAGCCAAGGCTGCGACTGACANCTTGACTGTGTA GGTGGCTGCCATAATAAGGTTTCATGTGCTGACATATTGGCAATGGCAACTAGAGACGTCATAGCATTGGTAAATAAGCAACAATAGCCTTGGCAAAATAGAGAGCTTCCAATTAATATT CATAAATTGGATTCTTTATAAACTAAGTTCATCAATCATAGTATACTAGTTGTCTCTATAATAAGTAACAGTGGGGTAGAATTAGAGAACGCAAAATGAATTAGAATTGGCAATGGCAAC TAGGGATGCTATAGAATTGGTAAATAAGGAATGTCCTTTGCAATAAAGCAAAGCTTACATGCATTTCATTAAGTACTTTTTTTTTAGGAAGATTCCTTCAGTACTTTTGGTACTGTTTTC AAATCAAAATTAGAGTTTCATTGCATTAAAAGTCAACATAAATTACTGAGGTAAAACTCTAAATATGATTTGAAAACNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAAAACAACACCAAAAGTACTTAAGGAAATATCTTCAAGTTTTGCATATACGTAAATTGTATCATCTGTAAAATA AGTTCAATTAAAGTGTAGTAGTTGTCTGAGCATCCACCTCTAGCAAATGCAGCATATCTATACAAGTAATAATGGGGAATTAGACAAGTATTACTATGAGACTATGACCCCTGCGACATC ATATTCTTTTGATTTGTCTTTATAATATTATTTTATATTGGTTAGGTGGAAAATTATATGTAAAATTTTAGTTGTACAATTTAGCTCAATACCAAATGAACATTCACTTGGTTTCAGATA GGAGGGCCATCTTATTCAGTAGAATTGGGAAGGCTAGATGGGAGAATCACTACAAAAGCTAGTGTTTAAGGCTAGATGGGAGAATCACAACAAAAGCTAGTGTTTGCACCATCTACCTCA TCCTGAATTCAAACTAGCACAGCTGAACCAAATGTTTGCTTCACATGGCCTCACCCTTACGGATCTAGTTGTTCTATCAGGTATTTCATTCATAATGAACAAAATACTTGTTAGTTAACC CAAGAGTCTAAGTTCATGTTTGGATATACATTGGCATGGCAAAAACCTACATTCTGCACTAGGGAAGGTAGATATAGCCAATTTCCAACATGTTTGGTTTTATGTTTGAATCAAGTGACA AATGGGATTTTAACTCTAAACTCAATTTTTAGACGTAACAACTAGCAAGTCTTGTGCAAGTTTTGCATTAGGTTGAAAATTTATACTAAGTTTCATTACAAACTTACTTTTAAGATAAAA GTTTCCTCATATAATCACTTCGTCCCAAACTCTTTGGGGAAATCAATTTTACAAGTAAAAAAAAAGACCAAACCAAGTTTGCAATGCCCACCTTTTTTGGAATTGAAATCTGACCTCTTC CAAAAAATGGTTTTACTTACGTGCACCTAAAATCAAACTCCTATCCACATGCTTGAGGAATATGGTTATTTGTCAACCGTACCACACCATGTTTATTTCACTAATGCCTATTTGAACACA CACACTAAGACTTAGTATTGTTGTGTAGTGTACCATTTGGCTTCTTCATCCCCGAAAATTATAATCTAGATTGCAATGAGTGGTTACAGGAGCACATACTATTGGGTTCTCCCACTGCAG CAAGTTCCAAACAGATTTACAACTTCAGAAGAAGGAAAAGCATTGATCACACACTTCATCTCGCGTATGCAAAACAGCTCCAACAAGTGTGTCGGAACAGCCATTGACATGGACCCTATT ACCCCTAGGACATTTGATTACCAATACCACGAGAATCTTCAGAAGGAAATGGACTCTTGCTTTTAATCAAACTCTATTTACTCATAAAGGACCAAGACACTTAGTGAACTTATTTGCATC CAACAGCACAGCCTTTGAAACGTCTTTTGTAAGTGCCATAACAAAGTTCAGGCGGATTGGGGTCAAAACGGGAAACCAGGGTGAATTCAGCTGTGATTGCACAATGGCTAAC |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TTTACATTGGAACGCTAGCCACTACATTTTTAAGTGCATTTCCAACTGCAAACCAAACATGCACGAATCTTCTGCTGCTAATAGCTGATTGTCATGCTCAACTTGGAGTTGACTAACATA GGAACACATGTCCAAATGTTGAATCAACTGTACGCAGTGCAGTTGAGATGAAACTTCAACGGAAATTTGTGACAGCTCCTGCTACACTCTTCTTCCCTGATTGTCTAATTATGTGCATGT GCATGTTGGACAGGGATGTGATGCTACTAGCTTCAAGAAACAACACATCAGACAAGGATAATCTCATCAATTTTTCACTAGCTGGTGATGGGTTTGACACTGATCAAAGCCAAGGCTGCG ACTGACANCTTGACTGTGTAGGTGGCTGCCATAATAAGGTTTCATGTGCTGACATATTGGCAATGGCAACTAGAGACGTCATAGCATTGATAGGAGGGCCATCTTATTCAGTAGAATTGG GAAGGCTAGATGGGAGAATCACTACAAAAGCTAGTTGTTTGCACCATCTACCTCATCCTGAATTCAAACTAGCACAGCTGAACCAAATGTTTGCTTCACATGGCCTCACCCTTACGGATC TAGTTGTTCTATCAGGAGCACATACTATTGGGTTCTCCCACTGCAGCAAGTTCCAAACAGATTTACAACTTCAGAAGAAGGAAAAGCATTGATCACACACTTCATCTCGCGTATGCAAAA CAGCTCCAACAAGTGTGTCGGAACAGCCATTGACATGGACCCTATTACCCCTAGGACATTTGATTACCAATACCACGAGAATCTTCAGAAGGAAATGGACTCTTGCTTTTAATCAAACTC TATTTACTCATAAAGGACCAAGACACTTAGTGAACTTATTTGCATCCAACAGCACAGCCTTTGAAACGTCTTTTGTAAGTGCCATAACAAAGTTCAGGCGGATTGGGGTCAAAACGGGAA ACCAGGGTGAATTCAGCTGTGATTGCACAATGGCTAAC |
Retrieve as FASTA
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