Entry information : GmPrx[P]258 ( Glyma15g05830.1)
Entry ID 9042
Creation 2011-07-04 (Qiang Li)
Last sequence changes 2011-12-14 (Qiang Li)
Sequence status theoretical translation / pseudogene
Reviewer Christophe Dunand
Last annotation changes 2016-01-12 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: GmPrx[P]258 ( Glyma15g05830.1)
Name (synonym) GmPrx[P]258 ( Glyma15g05830.1)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx197]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Fabaceae Glycine
Organism Glycine max (soybean)    [TaxId: 3847 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GmPrx[P]258
start..stop
S start..stop
GmPrx07 323 6e-112 2..248 29..321
LjPrx21 253 2e-84 3..248 25..321
CanPrx01 233 2e-76 1..248 30..332
RcPrx75 231 2e-75 3..248 29..328
Literature and cross-references GmPrx[P]258 ( Glyma15g05830.1)
DNA ref. Phytozome 12:   Gm15 (4139250..4137432)
Protein sequence: GmPrx[P]258 ( Glyma15g05830.1)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   247
PWM (Da):   %s   26352.59  
PI (pH):   %s   9.02
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKGTCVGFY SSTCPRAVSI GQTLLCDASV LIAGDGGTER TAGPNLNLRG YEVIDDAKAK LEAVCPGVVS CADILTFAAP DSVVLIIFLx SW*VPTGRRD GMVSIGTEAL SLPGRNDNVA  TQKDKFLKKG LNTEDLVILA DTRTFQLNSS NLLQFSPKGT DPSFLPFLRQ NQPTKRVALD TGSQFKFDTS YFVLLWTDSS TRGFNxVQKY LATAPFKVQF GKSMIKMSNI GVKTGSLGEI 
RNKCYAIN 

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Remarks Pseudogene from genomic. Incorrect prediction from Phytozome (5' end is missing and Stop in frame).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAAAG GCACGTGTGT AGGGTTCTAT TCGAGCACAT GTCCACGTGC TGTGTCCATT GGTCAGACCC TACTTTAGCT GGTCCAATAC TTAGGATGCA CTTCCATTTT TGTGACGCGT  CTGTTCTCAT AGCCGGTGAT GGTGGCACTG AGAGAACAGC AGGGCCAAAC CTTAATTTGA GAGGATACGA GGTTATTGAT GATGCTAAGG CTAAGCTCGA GGCTGTGTGC CCTGGTGTTG  TCTCTTGTGC TGATATCCTT ACCTTTGCTG CTCCTGATTC TGTAGTTCTG ATAATTTTTC TCACnTCGTG TACTAATTAT AAGACATAAT TAATTAATTT GTTTATTAAA AAAATTAATT  AGCTTAATTA TTAATATTAA ATTTATCTTT AATTTTAACA AAAATTATTC ATCGTCTTTA ATCATAATTT ATGATATTTT AGTAAAAAAA TAATTAATGA AAAAAAATAT GAAATGATAT  CTTATAACAA GGGATAAAAA AAAATTATTG ACTATGTCTT AGATAGTAAT ATTTATTGAA TTTTTTTTCA AAATATAACT TAATTATCTA ATCATCATGA TATGGAATAA TATTAAAAAT  ATTATACTAG TTAGTATGAG TTATATATAT GTGTTGCATC TTGCATGCAT GCAGAGTGGT GGACGTACTA AGTTGGTAAG TGCCCACTGG ACGCAGAGAT GGAATGGTTT CAATAGGAAC  AGAAGCCTTA AGCTTGCCTG GTCGTAATGA TAACGTCGCA ACCCAGAAGG ATAAGTTTTT AAAAAAGGGT CTTAACACCG AAGACCTCGT CATTCTTGCT GATACTCGTA CTTTTCAATT  AAACTCGAGT AATTTGTTAC AGTTTTCTAT TTTTTTTATA ATTATATCCG CAAATCTATA AAAATAGTTA TTTGTAAAAT AAATTAATCT AAAACACGCA GAAAATCGTT TTCTTGCAAA  TCGATATCCT CATTTATGTT GCACGATTTA AGGCATTTAT AATGAAATAT GATAAAAAAA TACAAGAACA CACAAAAAAT AGTAATTTAA ACCATGCTGC TCCCTATTAA CTTCAACTTC  GAGAGATAAT TTGATTTGTA CTTAATTTAT TAAAATTAAG AAAAATAATT AATTTAATTG ATAATACTAA ATTATCATAG TTTTTAATGT TTTTTTCTTT TTTATATGCA TATTATTATA  ATCTCTTTTT TAATGAGAAA TATTTTTAAT TTAAAAATAA TTAATGCATG AGATAACCTG AATTAAATCT TATATAAAAA AAATTAAAAA AATTATATCT TATAAATAAA ATCAAGAAGT  AGTATAATAA ATAAAAAAAT ATTCTGGATT GGCGTTATAA TTAATAAATA ACATACATAT TACATGAGTG ATGAGAAATC CTAGCCATAC ATATTTTTAA ATATACTTCT TTTAATGCAC  TATTAAATTA TGAGAAAAAA TCATTAATTT CTTACGATTT CTGCATGACT GATATGAAGA CATTAATTTG TGTGATATAG GTGGGCATAC GATAGAATAT ACAAGCCGAA AGGAACTGAT  CCTTCATTTC TTCCATTTCT GCGACAAAAC CAACCAACGA AGCGAGTGGC ACTAGACACT GGTAGCCAAT TCAAATTCGA TACATCATAC TTCGTTCTGC TTTGGACTGA TTCTTCCACA  AGAGGCTTTA ATTTnGTTCA GAAATACTTG GCCACGGCTC CCTTCAAAGT CCAATTCGGA AAGTCTATGA TCAAGATGAG CAACATTGGT GTCAAGACCG GTTCTCTGGG TGAAATTCGC 
AATAAATGTT ATGCTATTAA T 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGAAAG GCACGTGTGT AGGGTTCTAT TCGAGCACAT GTCCACGTGC TGTGTCCATT GGTCAGACCC TACTTTGTGA CGCGTCTGTT CTCATAGCCG GTGATGGTGG CACTGAGAGA  ACAGCAGGGC CAAACCTTAA TTTGAGAGGA TACGAGGTTA TTGATGATGC TAAGGCTAAG CTCGAGGCTG TGTGCCCTGG TGTTGTCTCT TGTGCTGATA TCCTTACCTT TGCTGCTCCT  GATTCTGTAG TTCTGATAAT TTTTCTCACn TCGTGGTAAG TGCCCACTGG ACGCAGAGAT GGAATGGTTT CAATAGGAAC AGAAGCCTTA AGCTTGCCTG GTCGTAATGA TAACGTCGCA  ACCCAGAAGG ATAAGTTTTT AAAAAAGGGT CTTAACACCG AAGACCTCGT CATTCTTGCT GATACTCGTA CTTTTCAATT AAACTCGAGT AATTTGTTAC AGTTTTCTCC GAAAGGAACT  GATCCTTCAT TTCTTCCATT TCTGCGACAA AACCAACCAA CGAAGCGAGT GGCACTAGAC ACTGGTAGCC AATTCAAATT CGATACATCA TACTTCGTTC TGCTTTGGAC TGATTCTTCC  ACAAGAGGCT TTAATTTnGT TCAGAAATAC TTGGCCACGG CTCCCTTCAA AGTCCAATTC GGAAAGTCTA TGATCAAGAT GAGCAACATT GGTGTCAAGA CCGGTTCTCT GGGTGAAATT 
CGCAATAAAT GTTATGCTAT TAAT 

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