Entry information : MePrx118 (cassava4.1_030325m)
Entry ID 9076
Creation 2011-07-01 (Qiang Li)
Last sequence changes 2016-01-06 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2016-01-06 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: MePrx118 (cassava4.1_030325m)
Name (synonym) MePrx118 (cassava4.1_030325m)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx037]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Euphorbiaceae Manihot
Organism Manihot esculenta (cassava)    [TaxId: 3983 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value MePrx118
start..stop
S start..stop
PtPrx62 495 5e-177 33..344 87..398
PpePrx71 491 5e-176 21..345 26..351
LjPrx50 487 1e-174 34..345 41..350
MtPrx100 480 5e-172 27..345 28..343
Literature and cross-references MePrx118 (cassava4.1_030325m)
DNA ref. Phytozome 12:   scaffold11216 (18149..15068)
Protein sequence: MePrx118 (cassava4.1_030325m)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   347 (328)
PWM (Da):   %s   38329.35 (36237.2)  
PI (pH):   %s   4.96 (4.86) Peptide Signal:   %s   cut: 20 range:20-347
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKSVNSFILL FLAFPLISAS DYNSAGNNEN EAPSLIVPTL LDSLPSEDDL LSFVYYHQRC PEAEAIINRK VREWVNKDYT LAASLLRLHF HDCAVRGCDA SILLNYEGSE RTADVSKSLR  GFDVIDDIKA EIEKKCPKTV SCADILTAAS RDATVFLGGP YWTVPYGRKD GKISIDKEAQ LVPMGLENIT TLIEFFQSQG LDVLDLVVLS GAHTIGRATC GTIQHRLYNF EGTGKPDPSL 
DAKYLNFLTR KCRWASEYVE LDGITPKTFD AEYYNNLQKN MGLLSTDQLL FSDPRTAPLV NTFASAPSVF YHQFGVSMAK LGNILVPSVQ DQGEIRTICS SVNSYTN 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (chromo 16, introns 1 and 3).
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAATCAG TCAATTCCTT CATCCTCCTC TTTCTTGCTT TTCCTTTGAT TTCAGCCTCA GATTATAACT CTGCTGGAAA CAATGAAAAT GAAGCACCAT CCCTTATTGT TCCGACATTG  CTGGATAGCT TACCTTCAGA AGATGACTTG CTGTCTTTTG TTTACTATCA TCAAAGATGT CCTGAAGCTG AAGCCATCAT CAATAGAAAA GTTAGAGAAT GGGTTAACAA AGACTACACC  CTTGCTGCCA GTCTCCTCAG GCTTCACTTT CATGATTGTG CTGTTAGGGT AAGACACTAA ATTAAAGATT TCATCCAACA GAATTTTATG ATTACATATT AGATTGCTGC ACTGTTTAAT  TTTTGTTACT AAATTAAATA CTTATCTCTA GATTTATGCT GTAATTTTTT TTTTTTTAAA TTCTTCTGTA CTTATTATAC ACATTTTAAT TAATTTTATA TAATATTTCA AAATAAAATT  TTAATTTAAT AACTATTGAG CTCTTTCCAT ATGAAATGGA AAATGTTTTT CATGATAAAA ATTAATTTTT TTAGGTGTTA GGTGGTGGTA TTGCTGGTTT TTTAATTTTT ATTTTATTTT  CAAAAATTAA ATTTTAGAAC AAAATATTGA GATTTTATCC TAATCTTTTA ACACAGTAAA ATTTTCTTTT TAACAGCCAA CTAAAGGGTA TACCTTGGGC CCAGGGGCCG ATACACTACC  CCTAAAAAAA TTCTTAATAA TTATTTTTAT ATGTAGGGAT GCGATGCCTC CATTCTCTTG AACTATGAGG GAAGTGAAAG GACGGCAGAC GTAAGCAAAA GCCTAAGAGG ATTCGACGTG  ATTGACGATA TCAAAGCAGA GATTGAGAAG AAATGCCCGA AAACGGTCTC CTGTGCCGAC ATTCTTACAG CAGCTTCTAG GGATGCTACA GTTTTTCTTG GAGGTCCTTA CTGGACGGTG  CCGTATGGAA GGAAAGATGG GAAGATTTCT ATTGACAAGG AAGCCCAATT GGTGCCAATG GGTCTAGAAA ACATTACTAC TCTCATCGAG TTCTTCCAAT CTCAGGGCCT TGATGTGCTT  GACTTGGTCG TTCTCTCAGG TGATTCCTCA ACCTCATCCC ATATATAGCT TTATAATTAT ATGCCTCTCA AGCTAAAGAT TTCTCGGATT TTGCTTGGAG TAGTTTATTT CCCTATAAAA  AATTTTAAAT AATTACATAT GATTTTTATT TATTTTCAAA TGAATTTTTT TAAAATTAAA AATAATTAAT TATTTTGTTT TAAATATAAA ATTAAAATAA TCTATTAAAT TAAATACTTA  TAAACTTTTT TTTTATTTCA AATAAGAATA CAATTAGCAA AGTTTATAGC ACAATAAGAA ATATTTGTGA TTAATATTTT TACTTTTCCT TAAAAATTAT CAATAATATA ATAAATTTAT  ATTTAATTGA TATAAATTTT TACAAGTTGC AATGTAAATA GCTTAAAATT TTAGTTTAAA CACTCAATGC GTTAATTTCA ATTAATATAG AGATGTAAGT ATATATTTAA CTATTAATTT  ATTCTTAAAA ATGAGATAAA AGATAAAAAT TATGTCCTTT AATAAAAAAT TTTGCGTTTA ATTTTTGAAT ATGCAGTTCA TATTTTAAAT TTGAAAGAGA GCGCTTTATC TTTTAATGAG  ATTATATATC ATAAATCCAT ATTAAACGAG TATCGTGAAT TTCAAATTTT GAATAGTATT TGCCAAAAAA TGTAAATATA TTAATTTAAT GGGTAATTTA TATGAATATT TCTTAGATTT  GATAAAATTT ACATAATAGT CCCTTATTAA ATTTTCAGTA ATAAATTAGT TCCTAAATTT AATTTTTATC TAACAAAATA GTTTTTCATT AATAGAAGAT ATAATTTTTA TTAGTTGACC  ATTAATTTTA ATAACCAAAA TATAAAGAAT TGGTCAATTT TTTAATTAAA AGTTATTTTT ATTTATTATT TTAATAGTAA AAATTAAAAA TTACTATTTT AAAATTTGAA AATTAGTGAA  TATATGAGTT TTATTTATTA TTTTTTTAAT TGTTATTATA GTAAATAATT TAAATTTTTA AAATACAAAA TTAATATTTT GCATAAAAAT TAATAATGAA TAATTTTAAT TTTTCTTAAA  AATTAATTTT TATATTATGT AAGTATAAAA ATGACAGATT TAAAAATTAA AAATTAATTT TTATATTTAA TTAAAAATTA AAAATTAATT TTTATATTTA ATTAAAAATT AATTTTTATA  TTTATATATT TAATTAAAAA ATAAAAAATT AATTTTTATG TTTACAAGTC CGTCTAAATT GAATTTTATG CGTATAAAAT TTTTTATACT TAACTAAAAT TAAAAATTGA TTTTTATACT  TACATATTAT AATTGGAATG TGTCTAAATT GATTTTTACA AGTGTAAAAT TTTTTATACT ATAGAATATC AATTTTATAT TTTAAAAATT AAAATAATTT ATAATGATAA TAGATAAAAA  AAATAGTAAT AGATAATAAT CATAAATTCA TTAATCTTTA AAAATTAAAA TAAAAATTTT TCAAATTTTT ATTATTAAAA TAATAAATAA AAATAACTTT TTATTAAAAA AATATTAACC  AATTAAAAAA TTATTTTAAT CATTAAAAAG ATAAAAACTC TATTCAATAG TTAACTAATA TCAATTTGTA CTTTTTATTT ACAAAAGAAT TATTTTATTA AACAGAAATT AAACTTAAAA  ATTAATTTAT TATTGAAAAT TTAATAAAAA AATTATTGTG GGTTTTGCAA ATGTCAGAGA GATTCATGGA AATTATACTA ATTTAATAAT ATTGGAGTAG TAGTATGGAC TATGGGGCTA  TTTCTTAAGT CGTGTTGAAA TTTAATAAAG AAGGGTAAGA ATTGCAATAT TATAGTAATT GGTAATAAGT ATTTAAAATT CGTCTCTCAG GAGCACATAC CATTGGGAGG GCCACGTGTG  GAACAATACA ACATCGGCTA TATAACTTTG AAGGAACAGG AAAACCAGAT CCATCTCTTG ACGCCAAGTA TTTAAACTTC TTGACAAGGA AATGCAGATG GGCCTCTGAG TACGTTGAGC  TTGATGGCAT AACTCCGAAG ACCTTTGATG CTGAGTACTA CAACAATCTC CAGAAAAACA TGGGACTTCT CTCCACAGAT CAATTGCTAT TTTCTGATCC AAGGACTGCT CCTCTTGTTA  ATACTTTTGC TTCTGCACCT TCTGTCTTCT ATCATCAGTT TGGGGTTTCC ATGGCCAAGC TTGGCAATAT TCTTGTCCCT TCTGTTCAAG ACCAAGGAGA AATTCGAACC ATTTGCTCTT 
CCGTCAATTC TTACACAAAC TAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAATCAG TCAATTCCTT CATCCTCCTC TTTCTTGCTT TTCCTTTGAT TTCAGCCTCA GATTATAACT CTGCTGGAAA CAATGAAAAT GAAGCACCAT CCCTTATTGT TCCGACATTG  CTGGATAGCT TACCTTCAGA AGATGACTTG CTGTCTTTTG TTTACTATCA TCAAAGATGT CCTGAAGCTG AAGCCATCAT CAATAGAAAA GTTAGAGAAT GGGTTAACAA AGACTACACC  CTTGCTGCCA GTCTCCTCAG GCTTCACTTT CATGATTGTG CTGTTAGGGG ATGCGATGCC TCCATTCTCT TGAACTATGA GGGAAGTGAA AGGACGGCAG ACGTAAGCAA AAGCCTAAGA  GGATTCGACG TGATTGACGA TATCAAAGCA GAGATTGAGA AGAAATGCCC GAAAACGGTC TCCTGTGCCG ACATTCTTAC AGCAGCTTCT AGGGATGCTA CAGTTTTTCT TGGAGGTCCT  TACTGGACGG TGCCGTATGG AAGGAAAGAT GGGAAGATTT CTATTGACAA GGAAGCCCAA TTGGTGCCAA TGGGTCTAGA AAACATTACT ACTCTCATCG AGTTCTTCCA ATCTCAGGGC  CTTGATGTGC TTGACTTGGT CGTTCTCTCA GGAGCACATA CCATTGGGAG GGCCACGTGT GGAACAATAC AACATCGGCT ATATAACTTT GAAGGAACAG GAAAACCAGA TCCATCTCTT  GACGCCAAGT ATTTAAACTT CTTGACAAGG AAATGCAGAT GGGCCTCTGA GTACGTTGAG CTTGATGGCA TAACTCCGAA GACCTTTGAT GCTGAGTACT ACAACAATCT CCAGAAAAAC  ATGGGACTTC TCTCCACAGA TCAATTGCTA TTTTCTGATC CAAGGACTGC TCCTCTTGTT AATACTTTTG CTTCTGCACC TTCTGTCTTC TATCATCAGT TTGGGGTTTC CATGGCCAAG 
CTTGGCAATA TTCTTGTCCC TTCTGTTCAA GACCAAGGAG AAATTCGAAC CATTTGCTCT TCCGTCAATT CTTACACAAA CTGA 

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