Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
142 |
PWM (Da): |
15322.55 |
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PI (pH):
| 8.5 |
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Sequence 189
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MARGHTIGLAKCATFSNRLFNFSGTGAPDATLESNMLSDLQNLCPITGDGNRTTALDRNSTDLFDNHYFQNLLNNKGLLGSDQILFSSNEAVSTTKSIVQSYSSNSKLFLDDFANSMIKMGNIRPLTGSSGQIRKNCRVVN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Partial sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (5' end is missing which can not be found due to the 'NNNNN' in DNA). |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCACGTAATTGCCTATAAAAATATAGCTATTGCAAGTTTAATTGGCCATTATAATCTTATTAGGGTTTCTTCTGTAGCATTTGCAGTGAAGACATGAAGAGTTTAAGCTACTATCAA TATTACCTCTTGTTTGTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTATTTTTGTGAGTGACTTGTATGAAATGGAAGAATTCTCATTAAATAGAAGTCATTTTAATGAGTAGAAACCGAATAAATATATAAAATTCTTGTT ATATTATTGGTACTATCTCAACATTTTGATATCATATAATTATTTCTTATTTGTTTTTTGTGTCAAGTGTAGGTGGTCATACAATTGGTCTAGCAAAATGTGCAACTTTCAGCAATAGAT TGTTCAACTTCTCAGGAACTGGTGCTCCTGATGCTACACTTGAATCTAATATGTTATCTGATCTGCAAAATCTATGTCCAATAACTGGAGATGGAAACAGGACAACTGCTCTTGATCGGA ACTCTACTGATCTTTTCGACAACCACTATTTCCAAAATCTGCTAAACAACAAGGGTCTCCTTGGTTCAGACCAAATCCTATTTTCAAGTAATGAGGCTGTTTCCACTACCAAAAGTATTG TCCAAAGTTACAGCAGCAACAGCAAGCTTTTCTTGGATGACTTTGCTAATTCCATGATCAAAATGGGAAATATTCGTCCACTTACAGGGTCTAGTGGGCAGATTAGGAAGAATTGCAGAG TTGTTAATTCT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGGCACGTGGTCATACAATTGGTCTAGCAAAATGTGCAACTTTCAGCAATAGATTGTTCAACTTCTCAGGAACTGGTGCTCCTGATGCTACACTTGAATCTAATATGTTATCTGATCTG CAAAATCTATGTCCAATAACTGGAGATGGAAACAGGACAACTGCTCTTGATCGGAACTCTACTGATCTTTTCGACAACCACTATTTCCAAAATCTGCTAAACAACAAGGGTCTCCTTGGT TCAGACCAAATCCTATTTTCAAGTAATGAGGCTGTTTCCACTACCAAAAGTATTGTCCAAAGTTACAGCAGCAACAGCAAGCTTTTCTTGGATGACTTTGCTAATTCCATGATCAAAATG GGAAATATTCGTCCACTTACAGGGTCTAGTGGGCAGATTAGGAAGAATTGCAGAGTTGTTAATTCT |
Retrieve as FASTA
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