Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
202 |
PWM (Da): |
21635.79 |
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PI (pH):
| 6.74 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
MRSIVMSPKKLAAQLCMTSIVIVSFCQIGVHSQLQVGFYANSCSLAEFIVKDAVRNGFNKDRGVAAALVRMHFHDCFVRGCDGSVLIDSTPSNTAEKDSPANNPSLRGFEVIDNAKSRLEALCKGIVSCADIVAFAARDSVEITGGLGYDVPAGRRDGRISLSSETFTNLPPPTFSVNQLTQLFANKGFSQEEMVTLSGEYN |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Partial sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (3' end is missing which has not been found yet). |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGATCCATAGTTATGAGTCCAAAGAAGCTAGCAGCTCAACTATGTATGACTTCAATAGTTATTGTTTCATTTTGTCAAATTGGCGTTCATTCTCAGCTTCAAGTTGGGTTTTATGCA AACTCATGTAGTTTGGCTGAGTTTATTGTTAAAGATGCTGTTAGGAATGGTTTCAATAAGGACAGAGGAGTGGCTGCTGCTCTTGTAAGAATGCACTTTCATGATTGCTTTGTTAGGGTA AGTATTGATATTTCTTAGTTGACTGAATACATTGTTTCCTCTTCAATTTTACTAATCTAACTTATGATACTGTTGGTGTTTTCAATTGATAAAGAAAACTTATAACATTATTTAATTTTA TTTAATTTCGGATATCTCTCAAATCTTTAGATTCTTAACTTTCGGCCTTTTATTCTTTTTACCCCAATAAATATTTTTTTTATTCTTAATTTAAATGAGTAAAATATAAGTATAGAGGTG AAGGAAAATAAAATAAAAATTGGAAAATGTCATAGATCATAAAAAAAAAAATTGTTCAGATGTGTTAAGTGTTAAATTAGTAAAATCTAGGAGTGAAACTATGCATTAGTTAATCCTTTC TTATTTCTAATTCACGTAGTTATTAATTAATATTAATTGGATATCTTATGCGCATGATACAATTAATTATCTAATTTATTGGATTAATTTGAAACTATTTCTCTCTTTTCTGAATTCTTT TTCTTTCCAATTCTTATATATAATTAAAGTTGTATTGCTTCTGATTCAATATACATTACATTTGTTATAGATAACCCATCGTTTATAATTTTTTACTTAAAAAGAACAATTACATGATGC AACTAAACTTTTCTTAGTATTAGAAGGCTTTTAATTTATTTTATTTTATTTTTTTCCTTTTAATCTTGTATTTTGTTTTTCTATATGAACTTGGGCATGCTTAACGTACGTAATGCATAT AGGGATGTGATGGGTCCGTGCTTATCGATTCCACTCCCTCAAACACAGCAGAGAAAGACTCTCCAGCGAATAACCCTAGTCTGAGAGGCTTTGAAGTGATAGACAATGCAAAGTCTAGAC TAGAGGCCCTTTGTAAAGGAATTGTTTCTTGTGCTGATATAGTTGCATTTGCAGCAAGAGACAGTGTTGAGATAGTAAGTAGATGTGTATATATGTACCACCTTCAACTAATTATTTGTT TTACACTTGTTGGAGCATGTAGTTATGGTACATTCAGAATATGAAGAAATATTAGTGAATATAACACATAACTGAAAACCCATTAATTTGACTTAATTAGATTCAAATTATTTTTAATTG TGCCTTAGAACTCATTTACTCTCATGCTATACTTGGTTGAAATCCATAAAAAAGATTCATTTCATTTAAGAAAAAAAGATGAGAAATAAAATAAAATTAAAATGATAAAGTTGAATGAAA TATTTTGGTGTTATAGAATGTATTGACTTACTATATGAAATTCATTTAAAAATTATATCTATTTTGTTAGAATTTAGTTTAACTATAACCAATTCCATACAAATTTGATTATGCAGAATA CTAAATTAGCTTTTTAAAACATATAATTTTAAATTCACAAATGAATTTCATAAACTTTATGGATTGTAACAAAAAATTATGTCAAGTTATACTAGAAAGAGGATCTTGGAGCATGCCTTG TCTCATATTAAGCATATAAAGAAATATAAAAAAAAAAAATCATATAACGTAAAGTCATATTTTATAGTAAAGCCGTAATTACACTTAATTGTTACCCTATTCACACTCTTTTCTTACTTA ACTCTAATTTTACTATATTCTAAATTACATTATACTTGAGGCCATTAGGTTATTTCATATCATTTTGTGTAGACTGGAGGGCTTGGCTATGATGTTCCGGCAGGAAGAAGAGATGGCAGA ATTTCTTTATCCTCAGAGACATTCACAAACTTACCTCCTCCAACATTTAGTGTTAATCAGCTCACTCAGTTATTTGCAAACAAGGGTTTCTCGCAAGAAGAAATGGTTACATTGTCTGGT GAATACAAT |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
ATGAGATCCATAGTTATGAGTCCAAAGAAGCTAGCAGCTCAACTATGTATGACTTCAATAGTTATTGTTTCATTTTGTCAAATTGGCGTTCATTCTCAGCTTCAAGTTGGGTTTTATGCA AACTCATGTAGTTTGGCTGAGTTTATTGTTAAAGATGCTGTTAGGAATGGTTTCAATAAGGACAGAGGAGTGGCTGCTGCTCTTGTAAGAATGCACTTTCATGATTGCTTTGTTAGGGGA TGTGATGGGTCCGTGCTTATCGATTCCACTCCCTCAAACACAGCAGAGAAAGACTCTCCAGCGAATAACCCTAGTCTGAGAGGCTTTGAAGTGATAGACAATGCAAAGTCTAGACTAGAG GCCCTTTGTAAAGGAATTGTTTCTTGTGCTGATATAGTTGCATTTGCAGCAAGAGACAGTGTTGAGATAACTGGAGGGCTTGGCTATGATGTTCCGGCAGGAAGAAGAGATGGCAGAATT TCTTTATCCTCAGAGACATTCACAAACTTACCTCCTCCAACATTTAGTGTTAATCAGCTCACTCAGTTATTTGCAAACAAGGGTTTCTCGCAAGAAGAAATGGTTACATTGTCTGGTGAA TACAAT |
Retrieve as FASTA
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