Sequence Properties
first value : protein second value (mature protein)
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Length (aa): |
282 |
PWM (Da): |
30776.29 |
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PI (pH):
| 4.58 |
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Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
LIVLYVRTYTQGCDGSVLLDGSASGPSEQEAPPNLSLRQQAFKIIDDLRQRVHEECGRIVSCSDIVAIAARDSVALSGGPDYDIPLGRRDGLTFATRNATLANLPAPSSNTSTLLTSLATKNLNATDVVALSGGHTIGISHCTSFEDRLYPTQDPTMDKTFASDLKGTCPTSNYTNTTVLDIRSPDRFDNKYYVDLMNRQGLFTSDQDLYTDTRTRDIVKSFAVNQSLFFEKFVFSMIKMGQLSVLTGTQGEVRANCSVRNSDNTYLVTVVEEDLETLSELR |
Retrieve as FASTA
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Remarks |
Partial sequence from genomic. Incorrect prediction from phytozome (5' end is missing due to the 'NNNNN' in DNA). |
DNA ►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TTAATTGTATTGTACGTACGTACGTACACACAGGGATGTGACGGATCAGTGTTGCTTGATGGATCGGCAAGCGGACCAAGCGAACAGGAAGCGCCGCCCAATCTGAGCTTGCGGCAACAG GCATTTAAGATCATCGACGACCTGCGCCAGCGGGTGCATGAGGAGTGCGGCCGTATCGTCTCTTGTTCTGATATAGTCGCTATTGCCGCTCGCGATTCTGTTGCCCTGGTAAGTTACTTC TCTCATCTCCTTTTATTTTAATTTCTTTTTCTTAATTTCATTGCAGACATATAAGAAGTTTCCTTAACAAATTTTTTTGCCATTTCTTATTGCAAAATGATTTCCTTCTAAAAAGAGAAT GGAATAACAGTATATGCTGTAATTAGAAGGCATTCCATGAATTGCTAATCTAATTGGGCTCGGGGCTGCGGTGATGATTAGATTTAGATAGGGAAAAGGTACAAATAAAGTTTTAAATTA TTTACTAAAATATAATTAAATATTTAAATTTTAAAATAATTTAATTACATCTTTAAAATCCGAGATGTATATTAAATTCAAGTGTGTACCCTTTAAAACTGAAAGGACTTATTACACCTT TTCCAATTGATATATGCATTAAATTGTTCACTTGCACTGATCAGTCTGTTTATACCTAATCTCTAGCGTAAATCAATGAGGGTACTAATGTCAAAAAAGAAATTATTGATGTTGGTGCTC AACCTCTGTTTCACCTCACGAATTAAAGTTATTTTAGTTAAAATTATCAAACTTTAATAACTAGACTATGATCTTTAAGGAGAATATTACTTTGTGGAGATCCTTTAGCATTTTCTTTTA ATTAACTCAGTTACTTGTACCCAAAATATTTGCGGTACAAGCGTGCTACTGCAATGCCTTTTTCTTCAAGTAGATATTAATAGTATACAGTACAAAACTTTTATATGAATTAATAAATAT TAATTCAATAGCGCATAACTGATGGTAAAAATTCTTTTCTAGTTTAACAAGTAAGAGTATATTCTAATTTGATTAAAGTTTTGAGTTCAAATTTTGGATATGCAGTTGTATTAAAACTTT TAAAAAAATATTTTGCCGGTCATGAAAATTTTATCCGATACGTTCTAAATTAATTCTAAATATATATATATAAAATAGATATTTGACTTAGTAATTTAGGGTAAAATTCAAAACTAATTA AATTACTTTTTAAATAATTTTTTTAGAAAAAAAAAAGAAAAAAAATCTTGTAGATGAACTTCAAGTCTTTGGATTGTCTGTCACGTTTAGGACTTTATTATCAAGAACATTGACAATTGA AGGCTTTGCAATATGGCTCTTTATTGTCTTGCTGCCTGTTTCCCACTTTTTGACAGCTTAAATTTGCTGTCTTAACAAAAATTGACTTTACCCAAAGTGATTCCTTCTAATATTCCAAAA TGAAAATAACTCTAAAAAAAAAAAGAAAGAAAAAGAAAGCCTTTACATCCTAATACTAATCATCATGTTAATTTACCTTAATTGACGTAGAGATATTGTAAGTCATCCTTCGTAAGCTTT CCATAAAACTGGATTTTAGTTCATTTCTAATTATAATTTGGATCAACAACCTGTATTTAATTTATAATTTGGTGGAACTAATTACACAATGAATAAATTATCGATTGATTAAGAATATGA TTCAAGACCAAATTACATGATTAGGATGCGTCCACGCCTAATTAGAATATTCTAATACATCTCTAATCTTTGAATATCTTCTATTTACTGAAATTAAAAAATAGTTTATCCGATTAGCTC GTTCTTAATAACAACGGTTAATTATATCATGAAAGTTTTACGGGCATTAGGTCAACTATGGGAGCACTTCAGACTTTGTGCCTAACATTCAAAGTCTGGCATCTGATCATTTTTGAAATT ATAATTATCCATTATTCAAAAATAATGACCTCAATAGATATACATAAATAAAGTCACATATCACTATATAATTAATTTAGTCTATAAATGATATGGTAAACTGAATCTGAAAAATTTCTC TACAGATAAATGATAAAATATAGAGTTTTTTAATTTTATCAGATCATTTAGAACTCATTAGAATTTACTGAAATTAAAGTAAAGATTGAATTATGAAATTATTTTTTTTATTTTTCTTTC TAAACTCTATAAAATTTGACATGCCTAGTATTGGATGAAAGTTAAATTAGTAAGGAGTAGAATAACGGTGAAATCACAACCAATTAGCAATAAATGAATAACAACTATTTAATTAATAAT ATTAATGAATTTAAATTTAAATTATTAATATTTTAATTCTCAAAATACTAAAATATTACAAAAAAAAACACAACATCTTTTATATCAAAAGGCGAAAATATAAGTTCAAATTTTGTACTT TCTTCAATAATTTTTGCATGCCAATCTAACAATTAATACTTATAGCCAGATTTTGTTTAGAAAAGAGAAAAGAAAATTTAGAAGCAGTGTAATATACCAGTTGGCTGCCAGGCATGCTGA TTTTCACCAGCACCAGAACCCAATTGGCTGGACAATTGGGTACACCTCTTGGCGCCCTTACCCAAAGTCCAACTAACTTTCTTTTCTGTCGGTCGGTGTGATTTGAATTCTTATCCATGA CCATTTAGCTTAATTAAAATAAAAACAGATTTTGAAGAATTAAGGCTTATTTAATTCAGCTGCATAGCCGATAAACTTATCAGTGATTATTATTAGTATGTTAAATGACTATTAAATATA TAATTTATTATTAAATATATTCTATTTTATTATATTATATTTAATGATATAAATTAATAAAAATAACTAAAAAATTTATAATTAATTTTATTAGTTCAATTGTATTTATTATTAAAAATA TTAATAAAAATTATTTTAAAAATTTAAATTTAAATTTAAATTTTACTAATTTTAAATATCATAATTTTAAATATTATAATTATTTAAATAATTAAAAATAATTTTAATTTAATAACTATT TGTTTTAAAATATAAAAACTTAATTATATAAAATCAATTTAAAATAAATTATTATTAGTAAATTTTAATAAAAATAATAGTATTCAAATAACTAAAAAATCAAATTAGTTATCAGATAAA AAAAATTCTAAAATAAAACTGATACAATCGACAGCTGATTGAGACTAAATCAGTTATCAACTATTAGTTTTTAAATTTTTATTAAACATTTTAATATGGTTATTCACTAATACATCAAAT TTCTAAATTAAGCACCTTATAATTATATCCCATAAAATTTAGAAAATAATATTTCAACTTAGCCCCATCAAATGATAAATTATGAATCCTATTGTCAATTAGCTAATAGCTATCATTTTC CAGAGACATACACATGCCTATACAGTAATAACCCTCTTGATAGCCACTCACAGTTATTTATAGAGACGTCATTTTCAAACTACCTCATACTAGTTAGTTACCTTAATGAATGACCTTGTG ATGGTCACTATAAAAGTAGGTAAAACAAAGAAGAAAATGGTTGCACTGTGAGCAAAGATAGTCACTCGTGCAAAGTACACACAAGATGGACGACTTTTCTCTCATTGGGCATTACTTACG AGTGAAAACAGATAAATTATTAGTAAAGTATAAAACACCCCCCTCTCTCTCTCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAATATATATATATATATATATAAATTTCCT TAAAATATTTTAGAATATTCTGATTTCTTCCATTTTATTTATTTTTAAGAAAATTAGATATTTATAACTATGTTTGCCACAAGTTAAATTTCTTGTATATATAATGTAAATTCTAGCATA TAATAGGATGTTCTAATGTTTCTTCAAAATTGCATAGTTGCTAATTCTTTTTGTTTTTTTTTCCCTATGCAATGTTTTTTTTTTCCTGGTAATGTTATAGTCAGGTGGCCCTGATTATGA TATTCCACTGGGAAGACGAGATGGACTAACCTTCGCAACGCGAAATGCAACCTTGGCTAACCTGCCAGCACCCAGTTCTAACACTAGCACACTCCTCACTTCCCTAGCCACCAAGAACCT GAATGCCACCGACGTTGTAGCCCTATCCGGCGGCCATACAATCGGTATTAGCCATTGTACCTCTTTCGAAGACCGATTGTATCCAACCCAAGATCCTACAATGGACAAAACTTTTGCTAG TGACCTCAAGGGAACTTGCCCTACATCAAACTACACTAATACTACAGTGTTGGATATTAGATCCCCTGATAGGTTTGACAACAAGTATTATGTTGATCTCATGAATCGCCAAGGTTTGTT TACCTCGGATCAAGATTTGTACACGGACACAAGGACAAGGGACATTGTTAAAAGCTTTGCTGTTAATCAATCCCTGTTCTTTGAAAAGTTCGTGTTTTCAATGATCAAGATGGGGCAGTT GAGTGTGTTGACAGGTACACAAGGGGAAGTTCGTGCCAATTGTTCGGTGAGGAATTCGGACAATACATACTTGGTTACTGTGGTAGAAGAGGATCTGGAGACGTTGTCCGAATTGAGA |
Retrieve as FASTA
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CDS►
Send to BLAST
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.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2 |
TTAATTGTATTGTACGTACGTACGTACACACAGGGATGTGACGGATCAGTGTTGCTTGATGGATCGGCAAGCGGACCAAGCGAACAGGAAGCGCCGCCCAATCTGAGCTTGCGGCAACAG GCATTTAAGATCATCGACGACCTGCGCCAGCGGGTGCATGAGGAGTGCGGCCGTATCGTCTCTTGTTCTGATATAGTCGCTATTGCCGCTCGCGATTCTGTTGCCCTGTCAGGTGGCCCT GATTATGATATTCCACTGGGAAGACGAGATGGACTAACCTTCGCAACGCGAAATGCAACCTTGGCTAACCTGCCAGCACCCAGTTCTAACACTAGCACACTCCTCACTTCCCTAGCCACC AAGAACCTGAATGCCACCGACGTTGTAGCCCTATCCGGCGGCCATACAATCGGTATTAGCCATTGTACCTCTTTCGAAGACCGATTGTATCCAACCCAAGATCCTACAATGGACAAAACT TTTGCTAGTGACCTCAAGGGAACTTGCCCTACATCAAACTACACTAATACTACAGTGTTGGATATTAGATCCCCTGATAGGTTTGACAACAAGTATTATGTTGATCTCATGAATCGCCAA GGTTTGTTTACCTCGGATCAAGATTTGTACACGGACACAAGGACAAGGGACATTGTTAAAAGCTTTGCTGTTAATCAATCCCTGTTCTTTGAAAAGTTCGTGTTTTCAATGATCAAGATG GGGCAGTTGAGTGTGTTGACAGGTACACAAGGGGAAGTTCGTGCCAATTGTTCGGTGAGGAATTCGGACAATACATACTTGGTTACTGTGGTAGAAGAGGATCTGGAGACGTTGTCCGAA TTGAGA |
Retrieve as FASTA
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