Entry information : GrPrx25 (Gorai.011G211400)
Entry ID 959
Creation 2008-11-29 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2015-06-23 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: GrPrx25 (Gorai.011G211400)
Name (synonym) GrPrx25 (Gorai.011G211400)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx042]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Malvaceae Gossypium
Organism Gossypium raimondii    [TaxId: 29730 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type Boll fibers (cotton)
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value GrPrx25
start..stop
S start..stop
GhPrx25 655 0 1..328 1..328
CppPrx06 514 0 17..328 7..317
CclPrx48 513 0 17..328 9..319
CsPrx07 513 0 17..328 9..319
Literature and cross-references GrPrx25 (Gorai.011G211400)
Literature Udall et al., A global assembly of cotton ESTs. Genome Res. 16 (3), 441-450 (2006).
EST ref. GenBank:   CO089954   CO094456 [3' end]
Cluster/Prediction ref. UniGene:   Gra.167
Protein sequence: GrPrx25 (Gorai.011G211400)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (295)
PWM (Da):   %s   35219.14 (31524.2) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   9.53 (9.34) Peptide Signal:   %s   cut: 34 range:34-328
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MIGNKFALTN MAFFRSLLLI ILIVAVSSCQ TNAQLSPNYY SSTCPQALSI VKAEVAAAIK NETRIGASLL RLHFHDCFVN GCDGSVLLDD NSTFIGEKTA VPNNNSARGF NVVDNIKARL  EKACPGVVSC ADILAIAARD SVVRLGGPSW KVRLGRRDST SASRSAANAS IPPPTSNLSA LISSFSAQGL SIKNLVALSG AHTIGLARCT SFRSHIYNDS NIDPSFANSL RRICPRSGND 
SVLAPLDRQT PTCFDNLYHK NLLEKKGLLH SDQEIFNGSS LTDGLVKMYA ADTSLLFKEF AKSMIKMGNI KPLTGNAGEI RINCRKAN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns) and 3 ESTs.
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCTTCCACTT TGTGTAGTTT TTAGTATCCA AAAATAACCA TTTTTTTTCT TTGAGACTTC ACAAGAATGC ATTCCATGGC TAGAGCTTGG TCCTTGTTAC TTCTTCTTAT CATTCTTGTC  TTTGGTGCAT TTGTTGAAGG CAGCCATGGA AGCAAACTCT CTCAAAATTA CTACAAATCG ACTTGTCCCC AAGTTTTGTC CATTGTCAAA GCTAAAACCG AATCCACTTT AAAGAAGAAA  CCAAGGATGG GGGCTTCTTT GCTGCGGTTG CATTTCCATG ACTGCTTTGT TAATGTGAGC ATTGTTTCAT AAACTTTATT TTTTTTTTTT TTTTATGTTT TAGCTTCAAT CTTCTGGCTG  TTTGGTTTAT GAAAATACCT GCAGGGGTGT GACGGTTCGA TATTGTTGGA CGATGACTCG ACTTTTATTG GTGAGAAAAC TGCACTTGCT AACAATAACT CGGCTAGGGG ATTCGAACTT  GTCGACGACA TTAAAGCTGA AGTGGAGAAA ACTTGCCCTG GAGTAGTTTC CTGTGCCGAT ATTCTTGCCA TTGCTGCTCG TGACTCGACT GTCGTAGTAA GTCTGCATTT AAGTAGCAGC  TGCAACGAGA TGTTATGGTC GCTATTTTAT TTTCTTTAAC GTTGATGTTT ATTGTAATTG ACCGCAATGT GACTGTGAAA ATGTCGGACC ACCGCAACTA ATGGCCTTTT TATCATTTGC  AGCTAGGGGG TCCGTCATGG AAAGTTAAAT TGGGGAGGAG GGATTCTATC ACTGCTAGCA GGGCTGATGC AAACAAGTTC ATTCCTGCAC CCAGTTTCAC CTTAAGTGCT CTCAAATCAA  ATTTCCATGC TCAAGGACTC TCATTGAAAG ATTTGGTGGC ACTTTCAGGT AATTAGACTC TTAACTAGGC AAATTCTACA TTGTTTCGAG TTATGTTACT CTGATTTGGG TTTATCCAAT  TTTTATAAGC TTTTTCATGT GTTCCCATAT CTAAAAATGT GTCAATAAAG GTGTTTGATA TGAGTACTTT AAGAATGATG AAGAGTCCAA GTAAAATAGA GAAAGCACCA GAAGGCGTAT  ACTGTTGTTT TGATTAACTA CTGGTTTCAT TTTGGAATGG TATGTAGGTG CACACACTAT TGGCCTGGCA AGGTGCACAA CATTTCGAGC ACACATCTAC AATGACTCCA ACATTGATCC  CTCATTTGCC AAGTCCCTGC AACACAAATG CCCCAGAACC GGAAAAGATA ACATTCATCG ACGCCTTGAC TTACGGACAC CGATTTCTTT CGATAATTTC TACTTTCGAA ACTTGTTGAA  AAAGAAGGGT CTCCTCCGGT CTGATCAAGA GCTCTTTAAC GGCAAATCAT CCGACTCTCT GGTTAAAAAG TATGCCGCAG ATTCTTCCAA GTTTTTCAAA CAGTTCACCA AATCTATGAT  CAAGATGAGC AACATCAAGC CTCTCACAGG AAATTCTGGG CAAATTAGGA TCAATTGCAG AAAAGTCAAC TGAAAAAACA TGGTGTTTTT AAAAGGATTA TAGCCACTAT TTTCGTTACA  ATTATCTGTC TCTTTCAGAA CTTCAACAAT AGCTGCTGTA GAACATCTGG TAAACTTATC AGAAACAGTG AAAACTTACT TTTACTTTCA TGATTTGCTT AAAGATGCCT TCAATTCGAG  TTGTTTATAA CATTGGTTAT ATCTGCAATA GTGATAAATG AGACGGGTCT TTAAGTTTAT TATTGTTTAT CAGTGTAAAA TAAAACTTAC TCAAAGGCAG CATCGGAGGC TAAAGGAACC  TTAAGCTTTC AATAGAAGAT CTTGAAAATT AAGAAAAATA ACGTCACAAC AAACTAAAGT ACGTCAATCA ATAGAAGGAA CTTGGCAACC TACGTTACCT TATTTAATCC TTCCAAGTTT 
TTCCATATCC TTCTGTGATA ATTAACCCAA ATCTTTACGC ATTTACACAC TATAAAAAGG GCCTCATTTC ATTTCCAAT 

Retrieve as FASTA  
Terminator +
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AACATGTTTC CATACTTGCA AGAAATTTTA TTAAAAAAAA GTTATCTGTC TGTTGTTTGA AGTGAGTGAG TGATTGAGAT GTTCATATAA TTTAAATTTG TACTATCCTT TTTTTTTCTC  TCCGTTTTTA ATACAATGAT TATGCAATAA AGGAGCACTT ATACTTGTAA GATATTTGAT TTCAAATAAA AATAATAATT AGAGTTTTTT AATTCGAGTT ATTGAGCAAG TCAAATTTGG  ATATCTCAAT AATTGACTTA AATAGTTGAC GAAACTAGCT GAGGTTTATT TTAGAAGTAT TAGAAAAACT CAATTTAATC TTGACCTGAA AATCAAATAG AAGTAACTAA GTTCGAAGTT  AAATGTGAAA ATCGAACTTA TATTTTATCA AACAAATGAA ATTTAATTGA ACCAAATCAA AGCAATTCAA ACGGCTCAGT TTTTATGTCC GACCAACTTC AAATTTTAGA ATTAGAACTT  ACACCAAATT TTTAAGTTTC AAACTTCTTA TAACTTCACC TTTACATCCC CAATTAAAAA TCAACCCAAA ATCTCAGGTT AACCCATCTT TGAAACAATT GAGCGAACTG AATGTTAGAA  TTTCTCTATC AAAAAAAAAA AGCACGATTA ACTTTTACAG GATCCAACTG ATAGGAAGAT TAGATGAGCA AAATAAGTTT ACTTTGGAAA CTGATGAAGA AAGCAGAAAT ATAATAAAAT  AAAGTAATGT TTTGCTTCAA ATGAGCTCCA GTAACAATCC TTTACTACTT TTATTATAAT AGACAGAAAG GAATAACCCA GAGCCTACTT AGCCTCAGTA TAGGGTAAAA TGCTTCTTTC  TGTAGGCTCC ACCCCTCAAT TCCAAGCAAA CCACAAAGCT ACATATACTT ATAATTAATA TTAAATTTTA AATAAATGTA ATGGCCGACT GGCACAATCA AAATGTTGCT TTGCCCTTTG 
TTGCTTCCAA TTTTCCTTTT CCTAAAGTAT ACTTTCTTTA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTGGCA ACAAATTTGC ATTAACCAAC ATGGCTTTCT TTCGTTCACT GTTACTAATT ATTTTGATTG TTGCTGTTTC TTCATGTCAA ACCAATGCCC AACTCTCTCC TAATTACTAT  TCATCCACTT GCCCGCAAGC TTTGTCTATT GTGAAGGCCG AAGTTGCCGC TGCTATAAAG AACGAAACTC GCATCGGAGC TTCGTTGCTG AGATTACATT TCCACGACTG CTTCGTTAAC  GTGAGTACTC TTCATTTTTC TTGAAATACC TGTGTTTGAC AATCCGACAC TGAGCCTTCA TGATGAACAG GGTTGTGATG GGTCGGTACT TTTGGACGAT AACTCGACGT TTATAGGTGA  GAAAACCGCG GTTCCTAACA ATAACTCGGC GAGAGGGTTC AACGTCGTCG ACAACATCAA AGCTCGGCTG GAGAAAGCGT GTCCTGGAGT TGTATCCTGC GCTGATATTC TCGCCATTGC  TGCTCGTGAT TCGGTTGTTC GGGTAAGTAC ACTTGGTACC TTATTGCAGT CAATAATGTT ATGAATTGAT TATTTTCGTG GTGTATGCAG TTAGGGGGTC CGTCATGGAA GGTAAGGTTG  GGAAGAAGGG ATTCGACAAG CGCTAGCAGA AGTGCCGCAA ATGCCTCTAT TCCACCACCA ACCTCTAATC TAAGCGCTCT TATTTCAAGC TTCTCAGCTC AGGGCCTCTC AATAAAAAAC  CTTGTAGCAC TTTCTGGTAA TCCAAATGTC ATTTTCGGAT AACTCATTTT AGCATAGACA GTTAGACACA TCATGTTTCA TTTTCGGATT CGCAGGTGCA CACACCATTG GCCTCGCCCG  CTGCACATCA TTTCGGTCAC ACATTTACAA CGACTCCAAT ATAGACCCCT CCTTTGCCAA CTCGTTGCGA CGGATTTGCC CGAGAAGCGG CAACGATAGT GTGCTCGCCC CTCTCGACCG  TCAAACACCA ACTTGTTTTG ATAACTTATA CCACAAGAAT TTGTTGGAGA AGAAGGGTTT GCTTCATTCA GATCAAGAGA TCTTCAATGG AAGTTCTTTA ACTGATGGTT TGGTTAAAAT  GTATGCAGCC GATACTTCAT TATTGTTCAA GGAATTTGCC AAGTCTATGA TCAAGATGGG AAACATTAAA CCTCTCACAG GAAATGCTGG GGAAATCAGA ATCAACTGTC GGAAAGCAAA 
TTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTGGCA ACAAATTTGC ATTAACCAAC ATGGCTTTCT TTCGTTCACT GTTACTAATT ATTTTGATTG TTGCTGTTTC TTCATGTCAA ACCAATGCCC AACTCTCTCC TAATTACTAT  TCATCCACTT GCCCGCAAGC TTTGTCTATT GTGAAGGCCG AAGTTGCCGC TGCTATAAAG AACGAAACTC GCATCGGAGC TTCGTTGCTG AGATTACATT TCCACGACTG CTTCGTTAAC  GGTTGTGATG GGTCGGTACT TTTGGACGAT AACTCGACGT TTATAGGTGA GAAAACCGCG GTTCCTAACA ATAACTCGGC GAGAGGGTTC AACGTCGTCG ACAACATCAA AGCTCGGCTG  GAGAAAGCGT GTCCTGGAGT TGTATCCTGC GCTGATATTC TCGCCATTGC TGCTCGTGAT TCGGTTGTTC GGTTAGGGGG TCCGTCATGG AAGGTAAGGT TGGGAAGAAG GGATTCGACA  AGCGCTAGCA GAAGTGCCGC AAATGCCTCT ATTCCACCAC CAACCTCTAA TCTAAGCGCT CTTATTTCAA GCTTCTCAGC TCAGGGCCTC TCAATAAAAA ACCTTGTAGC ACTTTCTGGT  GCACACACCA TTGGCCTCGC CCGCTGCACA TCATTTCGGT CACACATTTA CAACGACTCC AATATAGACC CCTCCTTTGC CAACTCGTTG CGACGGATTT GCCCGAGAAG CGGCAACGAT  AGTGTGCTCG CCCCTCTCGA CCGTCAAACA CCAACTTGTT TTGATAACTT ATACCACAAG AATTTGTTGG AGAAGAAGGG TTTGCTTCAT TCAGATCAAG AGATCTTCAA TGGAAGTTCT  TTAACTGATG GTTTGGTTAA AATGTATGCA GCCGATACTT CATTATTGTT CAAGGAATTT GCCAAGTCTA TGATCAAGAT GGGAAACATT AAACCTCTCA CAGGAAATGC TGGGGAAATC 
AGAATCAACT GTCGGAAAGC AAATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATCTTTA CGCATTTACA CACTATAAAA AGGGCCTCAT TTCATTTCCA ATATGATTGG CAACAAATTT GCATTAACCA ACATGGCTTT CTTTCGTTCA CTGTTACTAA TTATTTTGAT  TGTTGCTGTT TCTTCATGTC AAACCAATGC CCAACTCTCT CCTAATTACT ATTCATCCAC TTGCCCGCAA GCTTTGTCTA TTGTGAAGGC CGAAGTTGCC GCTGCTATAA AGAACGAAAC  TCGCATCGGA GCTTCGTTGC TGAGATTACA TTTCCACGAC TGCTTCGTTA ACGGTTGTGA TGGGTCGGTA CTTTTGGACG ATAACTCGAC GTTTATAGGT GAGAAAACCG CGGTTCCTAA  CAATAACTCG GCGAGAGGGT TCAACGTCGT CGACAACATC AAAGCTCGGC TGGAGAAAGC GTGTCCTGGA GTTGTATCCT GCGCTGATAT TCTCGCCATT GCTGCTCGTG ATTCGGTTGT  TCGGTTAGGG GGTCCGTCAT GGAAGGTAAG GTTGGGAAGA AGGGATTCGA CAAGCGCTAG CAGAAGTGCC GCAAATGCCT CTATTCCACC ACCAACCTCT AATCTAAGCG CTCTTATTTC  AAGCTTCTCA GCTCAGGGCC TCTCAATAAA AAACCTTGTA GCACTTTCTG GTGCACACAC CATTGGCCTC GCCCGCTGCA CATCATTTCG GTCACACATT TACAACGACT CCAATATAGA  CCCCTCCTTT GCCAACTCGT TGCGACGGAT TTGCCCGAGA AGCGGCAACG ATAGTGTGCT CGCCCCTCTC GACCGTCAAA CACCAACTTG TTTTGATAAC TTATACCACA AGAATTTGTT  GGAGAAGAAG GGTTTGCTTC ATTCAGATCA AGAGATCTTC AATGGAAGTT CTTTAACTGA TGGTTTGGTT AAAATGTATG CAGCCGATAC TTCATTATTG TTCAAGGAAT TTGCCAAGTC  TATGATCAAG ATGGGAAACA TTAAACCTCT CACAGGAAAT GCTGGGGAAA TCAGAATCAA CTGTCGGAAA GCAAATTGAA ACATGTTTCC ATACTTGCAA GAAATTTTAT TAAAAAAAAG  TTATCTGTCT GTTGTTTGAA GTGAGTGAGT GATTGAGATG TTCATATAAT TTAAATTTGT ACTATCCTTT TTTTTTCTCT CCGTTTTTAA TACAATGATT ATGCAATAAA GGAGCACTTA 
TACTTGTAAG ATATTTGATT TCAAATAAAA ATAATAATTA GAGTTTTTTA ATTCGAGTTA TTGAGCAAGT CAAA 

Retrieve as FASTA