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Entry information : AtPrx16 (At2g18980 / PER16 / AtperoxP16 / Atp22a / AtP22)
Entry ID 97
Creation 2006-02-02 (Filippo Passardi)
Last sequence changes 2015-06-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Achraf Jemmat
Last annotation changes 2015-11-05 (Achraf Jemmat)
Peroxidase information: AtPrx16 (At2g18980 / PER16 / AtperoxP16 / Atp22a / AtP22)
Name (synonym) AtPrx16 (At2g18980 / PER16 / AtperoxP16 / Atp22a / AtP22)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx032]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis thaliana    [TaxId: 3702 ]
Cellular localisation N/D
Tissue types Germinating seeds
Mixed tissues
Roots
Rosettes
Inducers Drought
Hormon treatment
Stress treatment
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AtPrx16
start..stop		 S start..stop
AlyPrx16 635 0 1..323 1..323
CagraPrx13 611 0 1..323 1..323
CrubPrx115 606 0 1..323 1..323
NoffPrx16-1A 594 0 1..323 1..323
Gene structure Fichier Exons►
ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize ExonStart..EndSize
N° 1 8235085..8235294 208 N° 2 8234461..8234649 187 N° 3 8233914..8234079 164 N° 4 8233419..8233825 405
complement(join(8233419..8233825,8233914..8234079,8234461..8234649,8235085..8235 294))


exon

Literature and cross-references AtPrx16 (At2g18980 / PER16 / AtperoxP16 / Atp22a / AtP22)
Literature Ada Linkies, Uta Schuster-Sherpa, Stefanie Tintelnot, Gerhard Leubner-Metzger, and Kerstin Müller. Peroxidases identified in a subtractive cDNA library approach show tissue-specific transcript abundance and enzyme activity during seed germination of Lepidium sativum. J Exp Bot. 2010 January; 61(2): 491–502.
Protein ref. UniProtKB:   Q96518
DNA ref. Phytozome 12:   Chr2 (8235294..8233419)
mRNA ref. GenBank:   NM_127455
Cluster/Prediction ref. Phytozome Gene 12:   19641980 UniGene:   At.86
Omic ref. AtProteome:   At2g18980 ATTED-II:   At2g18980 e-FP Browser:   At2g18980 ePlant:   At2g18980 Genevestigator:   At2g18980 TAIR:   At2g18980
Protein sequence: AtPrx16 (At2g18980 / PER16 / AtperoxP16 / Atp22a / AtP22)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   323 (300)
PWM (Da):   %s   35695.28 (33177.9) Transmb domain:   %s   i7-26o (i7-26o)
PI (pH):   %s   10.1 (9.99) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-323
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
MKNQSSFSIVALLLIFFSSSVFAQLQTNFYRKSCPNVETIVRNAV
RQKFQQTFVTAPATLRLFFHDCFVRGCDASILLASPSEKDHPDDKSLAGDGFDTVAKAKQALDRDPNCRNKVSCADILALATRDVVVLTGGPNYPVELGRRDGRLSTVASVQHSLPQPSFKLDQLNTMFARHGLSQTDMIALSGA
HTIGFAHCGKFSKRIYNFSPKRPIDPTLNIRYALQLRQMCPIRVDLRIAINMDPTSPNTFDNAYFKNLQKGMGLFTSDQVLFSDERSRSTVNSFASSEATFRQAFISAITKLGRVGVKTG
NAGEIRRDCSRVN

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic (3 introns), 3 cDNA and 13 ESTs.
Promoter►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGAAATCAAT AATATGTAGT TATATTTTAT GGTTAGATTC ATTTGTAACT CGAAATATCA ATTTATATAT TTCATGTATA AAGCTGATTA TTTATAAAAT TTTAATATTT TCACTTCATA  AATATATATA ACAATAATAT ATGATATTCT GAAAAAATTA TGAGCAACTA TGTTACTTGT GTGATTTAAA ATTTGCCTAA CTCAATTTTA AACTAAATCT TATTTTATGT ACTTCAACAA  CATTGTGATA GGCTCATGAT TAAAATTTGG ATTGACATCA ACTGAACAAG ATTTGAAAAG TATTCGTATG AAAAAATAAA AAGATAACAA AAATTAAATG TCATTTAAGT CAATATTTTT  TGATCTTCTG TCATTGCATA TATCAATATT AGAGAAATGA TCATGTCTTG AATGATTTGA AATTTGTCTA ACTTGATTAT AAATAAACTA TTTCTAGTTT GATGTGTTCA CTTGATATAA  TACTCCAACA ACAGTGTTAT CGACTCATGA TTAAATATAT AGAATTGATA TAAACTGAAC AAGATTTCAA AAGTATTCAT ATGAAAAGAA TTTAAAAAAA AACAAAAATT AAAGCAGCAT  TTAAGTCAAT ACTTTTAGAT CTTCTCTCAT TGCATATATC CATATAACAG AAATGATCGT GTATTAAATT ATTTGATAGG TCTAATGTTT TAAAGGTTTA TTATTTAAAA AAACTTGAAT  GTCAATGTTA TCAAAGACTC AAAATAAAAT TACTAAACTA ATAAGAGGTT TGGTAACGAA CAAGTACAAC ACAAAAAAAT AGTATAATAA AAAGAGTATA GTAAAAGTAG TGCTTAATTT  ATTATCATTA ATTTTTTTTA TTTTTTTTTA TTTTAAAGAA ATCAATTAAG AGTAGGATTG ATGATATATT TAATTTGCTT ATTTAATTTG ATTAATATTT TAATTTAAAA AATATAGAAT  GACACATGTC ATTTTTTTTT GTGATGATGT GTCATTCATT TGGAGAGAGT TGGCCAACTT TCATATATAT GATTTATATT AGTCAATTGG AGAAATTTAC ACATAAAGAC TAATCAACTT  GATTACTGCC TATATCTCAT CCCTCGTGAT GATCTCCAAT TTCATAAGGT TTTTTCAAGT GATCATTCAC TTAATTGCAC AGAAATATAG TAATGTTTGA TCTTTTTATA CTTTAGTATG  GTCCACGTTC ATTATTTTGC AAACTTGCAT GACTTGTCAA CTTATATTGT ATATCATCAA AAATAATGTA TTCCACATAC ACAAAAACTT ACTTTCCATC ACTAGAGTCA ACTTTAAATC  CTATCCTCGT TGTAAACTTA GATCTTGAGA AGGATGTAAT CTGGTAAGAT GGATCAAATC ACATGAGTTC TTCTTCTTAG TCCCTCTTGT TCAAGTAGTT GCTAAGAAGT GGTAACATGG  CTTTGAGTTG GCAAAGATAA GATTAAGATC AATTTAAACT TGACACCGAG ACTGGTTTAG ATTTTGCCTT TGATTAAGAA AATCTGATTA ATGACACAAA ATATACATTT GTTTTTATAA  CTGTAACTAA TTTCTTCATA ATTATAATTT CAGTCAATAC TAGTATACTA CTCTTTAATG CATCATAAAA AAAAACAGCC ATATATTGAG GGTTGAATTA TATTGTACCC AAAATACATG  GTTGAATAAC ACTCTCAAAG AAACATACAT AATCAAAAGT CCTCAATTAA GCAATTATAG CCTATATATA ACAACAGTAT AATAAAATAA AATATTATAC AAATCACTAT GTGAGCCTCA  ACCTAGCCTC ACATCAAACT CGCAAAATAT ATGATTGGAC ATTACAGAGT GTAACAAAGT CATTATCATA ATTGTATTCT TCAAATTATA AAATAAACTA AATTGCATGT ACCATACGTA 
ACCCGTAATT GTAAATTTGA TCAACTCTAT AAATGGAGAC AAAAACACAC ACAATGATCA AAACCTTAAC ATTCTAAGCC 

Retrieve as FASTA  
Terminator +►
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGATTTGTTG TTTCTTTTAT TTAAGAAATT TTGCTTCTTC TTTTTTAAGA TTTGTTTTCT GAATTGTATG GTTCTTTGAC GAAAAAAAAA GAAAAAAAGA AGAATTGTTT CACCACTCTT  ATTCTTATTT CGAACACAAA TTCTCAATAT TGCTAAGGGT TACCACAATT TACAACATAT ACAACGTAAG GTGGAAAGTA CTTACATTGA GAGAAAAATG GCCAAGACTC TTGGCTTAAA  TGAGCTCTCA AAGTTTTATT ATACCTTCTC ATAGGTTAGT GATTCTTTTT TAGAGTTTGA GTATATTTTC CAAAATGGGC TATCCATTTT GCAAGTCATT TTGATCCATT TTGTCTATAT  GAACTTATAA GCCCACTGAT GGGTTACAAA TTTATTGAAA TCAATTCTCG ATTATATAAC TTTCTTGGAA ACTCAATTAT TTTTTCTACG GACGTTTTAG ACTTTCTTTC CTTTTTTGAT  AAAAGATTTT GAATTGTCAA AATCAAAAGA AGAAAAATAA AGAGAAAAAA AATATGTGAA GGAGGATGAG ACTCGTCGTT GCAATTCTAA CCAAAACCTA GAAAATCTGG TCAAACTCTT  CAGTCTCCCT AAAGTATTAC AAACATTAAT GACTTTTTGG CATGGAAGAC AACATCATTC ATTCTTTGAA AGACACCAAC TTTTAACATA TCCAAATCTA AACTAAAATA GTTAGATATT  TGCACTAAAA CCAAAATTGA TCTACTTTCA ATTTAGAATA ACATTCTAAA ACTTCATTGA CGACCTCTTT AACATTGTTG ATATCTTGTA GTTAGATCGT TTAACTATTA CAAGATACTA  CTAATCATTA ATCAAATTGT TTTTAATAAA TTCTTAACTA ATGTGTTTTG ATAATTAACG AATTGTATGG TATATGAAGG AAATAAATGA GGGGTTTAGG AATGTAAAGT TGTAAAGTAA  ATGCACGTGG AGACATTTGT GGAATGCATC CAAATGAAGT ATAAAACAAT GTACTTAACA CAATCCACAT GCTCCTCTTC AATCCAAAAC CATATCTGTG GGTCCCTATT TTTCCAAATT 
ACAT 

Retrieve as FASTA  
DNA ►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAGAACCAAAGCAGCTTCTCCATTGTTGCTCTTCTTCTCATTTTCTTTTCCTCATCTGTCTTTGCTCAGCTGCAGACAAATTTTTACCGGAAGTCATGTCCTAACGTGGAAACTATT
GTCCGCAATGCCGTCCGCCAAAAGTTCCAGCAGACTTTTGTTACGGCTCCGGCCACCCTCCGCCTTTTCTTCCATGATTGCTTCGTCCGTGTAAGTTTTTTTTAAATCGATATATTAGTT
TACATTTTGTAAACGATAATGGGTAGAAAAAGCATATTGTACGTGTTTTTAATGTAAATATAAATATTAAATAAGTAAATAAAAAACATAAATATGAATATATTTGTTTTAAATAAAGTG
TTATTGGTAATTTCATTTGCAAAAAAAAATAATTAAATAGATTTTATTACTTTTTGTCTATGGATTCTATAATGATTTTGTAGTTCTATGAATTTTGAATGTTGTTAAAATAAAGATTTT
AAATTTATAAACTAAAAACTAAACATTCAAAATACTACGAAGTTATCATAATGTTTTAAAAACTTATGAAAAAATAAAGAAATCTCTCCTATATATTAGTATAATGTTTGGCCCGTGTTC
AAAAAAAAAAGTATATATTGTTTGACTATTTAACGTTATATACAGGGGGATGTGATGCTTCGATATTGCTGGCATCACCATCTGAGAAGGATCACCCTGATGACAAGTCACTAGCCGGAG
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ATTTCAATTCTTATATTGATCTTTATCTAATTTCCTTGACACCTTATTCATCTCTTCAAAATTCTATTATTAATGTAGGCTAAAATGAAATGTCCCGAAAGAAAAATCTAGGCTTGAAGG
AATATCTACACTAATTAAGTAACTTGAATTCATTACTGTTTCGTTTACTATGAAGAAACAAAATCATGGAACACGTACGTGTTGATCAACCCGTGAAAAAATGTTCATTACCTAATTAAG
TAAATATAGTAGGATTATTTAGCTAACGTGTCCTAACGATTTGGTTATTATTCCCTTTTTGTGTGATTATATTCTTTTTCATTTTGTGTCATTATTACTAAAAGACTTGTGAAATTAAAG
ATAATAATATATTGTAGACACCGGAGGACCGAACTATCCGGTAGAGCTAGGGAGGAGAGACGGCAGACTATCGACAGTGGCTAGCGTTCAACACAGTCTACCCCAGCCTAGTTTCAAATT
GGACCAACTTAACACTATGTTCGCTCGTCACGGTCTATCCCAAACCGATATGATTGCACTCTCAGGTATTTAAACCGAAGCAAAACCGGAGTAGACGGATTTTAATTTCATATATTATAA
CCAAGTCTAACAGATAATTTTTATGATATGCAGGAGAGCACATACTATAGGATTCGCACATTGTGGCAAGTTTTCGAAAAGAATTTACAATTTTAGTCCTAAACGTCCAATTGATCCGAC
TTTGAATATTCGTTACGCCTTACAATTGAGACAAATGTGCCCCATTCGGGTCGACTTGAGGATCGCAATTAACATGGATCCTACTTCTCCAAATACATTTGACAATGCTTATTTCAAAAA
CCTCCAAAAAGGGATGGGTTTGTTCACGTCAGATCAAGTTTTGTTCTCTGATGAACGATCTAGATCAACTGTCAATTCATTTGCTTCTAGTGAAGCAACTTTTAGACAAGCTTTTATTTC
GGCTATAACGAAGTTGGGTCGGGTTGGAGTTAAAACCGGTAACGCGGGTGAGATAAGACGGGATTGTTCACGTGTTAATTAG

Retrieve as FASTA  
CDS►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
ATGAAGAACCAAAGCAGCTTCTCCATTGTTGCTCTTCTTCTCATTTTCTTTTCCTCATCTGTCTTTGCTCAGCTGCAGACAAATTTTTACCGGAAGTCATGTCCTAACGTGGAAACTATT
GTCCGCAATGCCGTCCGCCAAAAGTTCCAGCAGACTTTTGTTACGGCTCCGGCCACCCTCCGCCTTTTCTTCCATGATTGCTTCGTCCGTGGATGTGATGCTTCGATATTGCTGGCATCA
CCATCTGAGAAGGATCACCCTGATGACAAGTCACTAGCCGGAGACGGGTTTGATACGGTGGCAAAGGCAAAGCAGGCCCTTGATAGGGACCCCAACTGCCGTAACAAAGTCTCATGCGCT
GACATTTTGGCTCTCGCCACTCGTGACGTCGTCGTTTTGACCGGAGGACCGAACTATCCGGTAGAGCTAGGGAGGAGAGACGGCAGACTATCGACAGTGGCTAGCGTTCAACACAGTCTA
CCCCAGCCTAGTTTCAAATTGGACCAACTTAACACTATGTTCGCTCGTCACGGTCTATCCCAAACCGATATGATTGCACTCTCAGGAGCACATACTATAGGATTCGCACATTGTGGCAAG
TTTTCGAAAAGAATTTACAATTTTAGTCCTAAACGTCCAATTGATCCGACTTTGAATATTCGTTACGCCTTACAATTGAGACAAATGTGCCCCATTCGGGTCGACTTGAGGATCGCAATT
AACATGGATCCTACTTCTCCAAATACATTTGACAATGCTTATTTCAAAAACCTCCAAAAAGGGATGGGTTTGTTCACGTCAGATCAAGTTTTGTTCTCTGATGAACGATCTAGATCAACT
GTCAATTCATTTGCTTCTAGTGAAGCAACTTTTAGACAAGCTTTTATTTCGGCTATAACGAAGTTGGGTCGGGTTGGAGTTAAAACCGGTAACGCGGGTGAGATAAGACGGGATTGTTCA
CGTGTTAATTAG

Retrieve as FASTA  
cDNA►
Send to BLAST
.........1.........2.........3.........4.........5.........6.........7.........8.........9.........0.........1.........2
CAAAACCTTA ACATTCTAAG CCATGAAGAA CCAAAGCAGC TTCTCCATTG TTGCTCTTCT TCTCATTTTC TTTTCCTCAT CTGTCTTTGC TCAGCTGCAG ACAAATTTTT ACCGGAAGTC  ATGTCCTAAC GTGGAAACTA TTGTCCGCAA TGCCGTCCGC CAAAAGTTCC AGCAGACTTT TGTTACGGCT CCGGCCACCC TCCGCCTTTT CTTCCATGAT TGCTTCGTCC GTGGATGTGA  TGCTTCGATA TTGCTGGCAT CACCATCTGA GAAGGATCAC CCTGATGACA AGTCACTAGC CGGAGACGGG TTTGATACGG TGGCAAAGGC AAAGCAGGCC CTTGATAGGG ACCCCAACTG  CCGTAACAAA GTCTCATGCG CTGACATTTT GGCTCTCGCC ACTCGTGACG TCGTCGTTTT GACCGGAGGA CCGAACTATC CGGTAGAGCT AGGGAGGAGA GACGGCAGAC TATCGACAGT  GGCTAGCGTT CAACACAGTC TACCCCAGCC TAGTTTCAAA TTGGACCAAC TTAACACTAT GTTCGCTCGT CACGGTCTAT CCCAAACCGA TATGATTGCA CTCTCAGGAG CACATACTAT  AGGATTCGCA CATTGTGGCA AGTTTTCGAA AAGAATTTAC AATTTTAGTC CTAAACGTCC AATTGATCCG ACTTTGAATA TTCGTTACGC CTTACAATTG AGACAAATGT GCCCCATTCG  GGTCGACTTG AGGATCGCAA TTAACATGGA TCCTACTTCT CCAAATACAT TTGACAATGC TTATTTCAAA AACCTCCAAA AAGGGATGGG TTTGTTCACG TCAGATCAAG TTTTGTTCTC  TGATGAACGA TCTAGATCAA CTGTCAATTC ATTTGCTTCT AGTGAAGCAA CTTTTAGACA AGCTTTTATT TCGGCTATAA CGAAGTTGGG TCGGGTTGGA GTTAAAACCG GTAACGCGGG 
TGAGATAAGA CGGGATTGTT CACGTGTTAA TTAGTGATTT GTTGTTTCTT TTATTTAAGA AATTTTGCTT CTTCTTTTTT AAGATTTGTT TTCTGAATTG TATGGTTCTT TGACGAAA 

Retrieve as FASTA